Chapitre 4 - Compartiments intracellulaires et tri des protéines Flashcards
Quelle est la fonction d’un endosome?
Compartiment vésiculaire contenant matériel ingéré par endocytose en route vers les lysosomes et les exosomes.
Qu’est-ce qu’un exosome?
Vésicule remplie de particules membranaires.
Rôle du lysosome?
Contient des enzymes digestives qui dégradent les organites morts et le matériel de l’extérieur ingéré par endocytose.
Rôle du peroxysome?
Compartiment vésiculaire contenant des enzymes utilisés dans réactions d’oxydation.
Quel pourcentage de la cellule occupent-ils les compartiments entourés des membranes?
50% - ce qui requiert la synthèse de membrane pour les fabriquer.
Comment ont été formés les compartiments entourés de membrane?
Invagination et séparation par pincement à partir de la membrane plasmique = noyau RE + organites.
Vrai ou faux: Les mitochondries qui possèdent une double membrane, restent isolées du transport vésiculaire intense qui relie les autres organites.
Vrai
Comment communiquent les organites entre eux?
Par le biais de vésicules de transport qui bourgeonnent d’un organite et fusionnent avec un autre ou vers extérieur de la cellule.
Quelles sont les 4 familles de compartiments cellulaires des cellules eucaryotes?
- Par les Gates - Noyau et le cytosol (communiquent par les portes nucléaires)
- Par vésicules - Organites de la voie sécrétoire et endocytaire (RE, Golgi, endosomes, lysosomes, vésicules de transport, exosomes, peroxysomes)
- Par transporteurs - mitochondries et peroxysomes
- Les plastes (plantes)
Qu’arrive-t-il si une protéine n’a pas de signal de tri (séquence en AA) ?
Elle reste dans le cytosol.
Quels sont les 3 mécanismes permettant d’expédier les protéines contenant un signal de tri?
- Transport par systèmes de vannes (gated transport)
- entre le noyau et le cytosol en continuité par les pores nucléaires - Transport transmembranaire
- par des translocateurs protéiques, ex : cytosol aux mitochondries - Transport vésiculaire
- Par des vésicules de transport, issue de la lumière du 1er compartiment, se fusionnent avec un 2e compartiment.
Quel est le rôle des stations intermédiaires dans l’expédition des protéines avec signal de tri?
À chaque station intermédiaire, une décision est prise pour savoir si une protéine doit rester là, retourner ou continuer ailleurs.
Par quoi sont reconnus les signaux de tri?
Par des récepteurs protéines complémentaire.
- souvent reconnues par des peptidases de signal qui les éliminent une fois le tri terminé.
De quoi sont composés les signaux de tri et ou se situent-ils sur la protéine?
Ils sont composés de séquences de 15-60 AA et se retrouvent plus souvent sur la partie N-terminale de la protéine.
De quoi sont composés les patch signal? fonction?
Multiples séquences AA, réparties sur la protéine imposant une structure 3D, celles-ci ne sont pas éliminés.
Vrai ou faux concernant les signaux de tri: Les séquences en AA varient fortement, mais les séquences des protéines de même destination sont fonctionnellement interchangeables.
Vrai
Vrai ou faux: Les propriétés physiques, soit l’hydrophobicité sont moins importants que la séquence primaire dans un signal de tri.
Faux, ce sont les propriétés physiques (charge, hydrophobicité) qui sont plus impliqués que la séquence en a.a dans un signal de tri.
Quel est le rôle des récepteurs protéiques complémentaires? De quelle manière fonctionnent-ils? Ou vont-ils après leur livraison?
- Guident les protéines vers leur destination et les déchargent
- Fonctionnent de façon catalytique = retournent au point d’origine et sont réutilisés
Vrai ou faux: Les récepteurs protéiques complémentaires reconnaissent une espèce donnée de protéines.
Faux, ils reconnaissent une classe de protéine et pas une espèce donnée.
Quel enzyme se débarrasse du signal de tri une fois arrivé à destination?
La peptidase signal
Vrai ou faux : La cellule ne peut pas synthétiser de nouvelles membranes sans un gabarit (membranes préexistantes)
Vrai
De quoi est composée l’enveloppe nucléaire?
2 membranes concentriques traversées par des portes
- Membrane nucléaire interne: protéines = site d’encrage pour chromatine et lamina nucléaire (réseau protéique = soutien structurel de la membrane)
- Membrane nucléaire externe : Entoure la membrane interne, continue avec le RE, garnie de ribosomes dont protéines sont transportées dans l’espace périnucléaire.
Vrai ou faux: le transport entre le cytosol et le noyau est bidirectionnel.
Vrai
Quelle est la fonction des complexes du pore nucléaire (CPN)?
Elle perfore l’enveloppe nucléaire de tous les eucaryotes et permet le transport entre le cytosol et le noyau.
Quelles sont les 3 classes de protéines constituant les CPN? fonction?
Rôle de fibrilles?
- Anneau transmembranaire - traverse la membrane et ancre la CPN à l’enveloppe.
- Protéines d’échafaudage : Structure en anneau (certaines déforment la bicouche, stabilisent la courbure de la membrane)
- Nucléoporines: Tapissent le pore
* *Les fibrilles dépassent du CPN sur les 2 faces et sur la face nucléaire, les fibrilles convergent pour former une cage et sur la face cytosolique, elles capturent les protéines à être transportées. **
Vrai ou faux: Les CPN permettent le passage par diffusion passive de petite molécules.
Vrai - elles permettent le passage de molécules sous 5kDa par diffusion rapide et au dessus de 60kDa l’entrée est plus difficile.
- Le centre du CPN possède une structure fibrillaire enchevêtrée qui bloque le passage aux grosses molécules.
Que sont les NLS et les NES?
- Ce sont des récepteurs spécifiques pour le transport de plus grosses molécules.
NLS = nuclear localizing signal se situent sur les protéines nucléaires et assure leur sélectivité pour le transport vers le noyau
NES = Nuclear export signal, signal d’exportation nucléaire.
De quoi sont composés les NLS et NES et ou se situent-ils sur la molécules à transporter?
- composés de 1-2 courtes séquences riches en AA chargés positivement (Lys et Arg)
- Situés n’importe ou dans la séquence
- ou sur une seule sous-unité d’un complexe multimérique
Vrai ou faux: les protéines qui passent par les CPN sont transportées dans leur conformation dépliée.
Faux, elles sont transportées dans leur conformation repliée. (peroxysomes aussi)
-Dans les autres organites (mito,RE), les protéines doivent être largement dépliées - sauf peroxysome.
Vrai ou faux: Groupes de protéines avec NLS différents lient des récepteurs différents.
Vrai - chaque protéine réceptrice de la famille (récepteur d’importation nucléaire) est spécialisée envers une groupe de protéines avec des NLS semblables.
- ce sont des protéines cytosoliques solubles = lient NLS et protéines du CPN.
Vrai ou faux: Certains récepteurs d’importation nucléaire forment les fibrilles du CPN et s’étendent jusque dans le cytosol.
Vrai
Quel est l’avantage de l’utilisation combinée de récepteur d’importation et d’adaptateurs?
Augmente l’efficacité, permettent aux adaptateurs de reconnaitre différents récepteurs d’importation nucléaire et donc moins de récepteurs d’importation nucléaires différents sont nécessaires.
- grand éventail de protéines pour même récepteur d’importation.
Que lient les récepteurs d’importation nucléaire sur les protéines du CPN?
Ils reconnaissent les répétitions de Phe-Gly (FG repeat)
Donc, répétitions FG servent de sites de liaison pour les récepteurs d’importation.
- à l’intérieur du noyau, les récepteurs larguent le cargo et retournent au cytosol.
Comment se déplace le récepteur-cargo?
Avec association et dissociation répétitives sur les répétitions adjacentes des fibrilles
Comment l’énergie pour l’import et l’export des protéines au noyau est-elle fournie?
Par l’hydrolyse du GTP par Ran, une GTPase monomérique présente au noyau et dans le cytosol.
Existe sous 2 conformations : Ran-GDP ou Ran-GTP
Quelles sont les 2 protéine régulatrices de Ran et ou se situent-elles?
GAP, dans le cytosol = GTPase activating protein transforme Ran-GTP en Ran-GDP + énergie (hydrolyse GTP)
GEF, dans le noyau = guanine exchange factor : Échange Ran-GDP pour Ran-GTP
Comment la localisation nucléaire de Ran-GTP impose-t-elle la direction, d’importation vers le noyau? 3 étapes
- Ran-GTP lie les récepteurs d’importation à leur arrivé au noyau causant ainsi le largage du cargo
- Ran-GDP dans le cytosol ne lie pas les récepteurs d’importation chargés, donc largage seulement dans le noyau
- Une fois libre, les récepteurs d’importations liés à Ran-GTP sont transportés au cytosol ou Ran-GAP hydrolyse Ran-GTP en Ran-GDP et le cycle recommence.
Comment fonctionne l’exportation hors du noyau? 2 étapes
- Ran-GTP au noyau favorise la liaison du cargo (NES) au récepteurs d’exportation
- Une fois au cytosol, Ran-GAP hydrolyse GTP et le récepteur relargue le cargo et le Ran-GDP.
Comment le transport entre le noyau et le cytosol peut-il être régulé? (rôle du Ca2+)
Une augmentation du Ca2+ cause la déphosphorylation de la protéine = expose NLS et bloque NES donc translocation vers le noyau
Une diminution du Ca2+ = phosphorylation = expose NES et bloque NLS = retour au cytosol.
Expliquer le principe de régulation du transport entre le noyau et le cytosol avec SREBP.
Lorsqu’il y a présence de cholestérol, SREBP est ancrée au RE avec SCAP
Lorsqu’il y a absence de cholestérol, formation de vésicules de transport vers le Golgi, protéases coupent partie cytosolique avec SREBP qui lui migre vers le noyau et active la transcription du cholestérol.
Vrai ou faux: les protéines destinées aux mitochondries sont d’abord synthétisées sous forme de protéines précurseurs non repliées (liées à des chaperonnes)
Vrai
Quelles sont les 2 composantes des complexes TOM et TIM?
- Récepteurs agissant
2. Forment des canaux
Quelles sont les fonctions de: 1. TOM 2. Complexe TIM23 3. Complexe SAM 4. Complexe TIM22 5 Complexe OXA
- TOM = transporte protéines dans l’espace intermembranaire à travers la membrane externe
- TIM23 = Transporte protéines dans la matrice et aide insertion dans la membrane interne.
- SAM = Replie certaines protéines dans la membrane externe
- TIM22 = Aide à l’insertion de certaines protéines dans la membrane interne
- OXA = aide à l’insertion dans la membrane interne de protéines synthétisées dans la mitochondrie.
Quelle est la séquence d’évènement pour l’import des protéines dans la mitochondrie? 3 étapes
- Séquence signal est reconnue par récepteurs TOM puis protéines est entraînée dans le canal de translocation
- Protéine est transloquée à travers TIM23 et traverse les 2 membranes.
- Protéine entre dans matrice ou reste insérée dans la membrane interne
Le transport des protéines vers la mitochondrie nécessite de l’énergie. Quelles sont les 2 type d’énergie fournie?
- Hydrolyse ATP à l’extérieur de la mitochondrie et dans la matrice
- Potentiel de membrane au niveau de la membrane interne.
Étapes de l’insertion de protéines dans le mitochondrie avec énergie nécessaire? 3 étapes
- ATP nécessaire pour libérer les protéines précurseurs des chaperonnes (hsp70)
- Après insertion de la séquence signal dans TOM puis dans TIM, le gradient d’électrons (impliqué dans la synthèse d’ATP) est requis pour la translocation à travers TIM.
- Hsp70 agit comme moteur pour tirer le cargo dans la matrice en raison de son affinité pour protéine native ceci nécessite ATP également
Quel est le rôle des porines? et comment est ce que celles-ci sont intégrées à la membrane externe?
Porines permettent passage des ions et des métabolites à travers la membrane externe de la mitochondrie.
- Les protéines formant les porines sont importées dans l’espace intermembranaire par TOM et le complexe SAM les intègre à la membrane externe puisque TOM ne peut pas le faire.
Quelles sont les 3 manières dont les protéines sont importées dans la membrane interne de la mitochondries? et expliquer le fonctionnement de chacune.
- Par TIM23 - sans passer par la matrice
- séquence signal entre dans la matrice
- séquence d’arrêt de transfert (hydrophobe) stop la translocation
- séquence signal est coupée dans la matrice et séquence hydrophobe libérée par TIM23 reste attachée à membrane interne. - Par OXA - via la matrice
- TIM23 transporte toute la protéine dans la matrice (ou pour protéines synthétisées dans mitochondrie)
- Séquence signal est coupée dans la matrice
- Séquence hydrophobe guide la protéine vers OXA qui l’insère dans la membrane interne. - Par TIM22 - pour former une famille de transporteurs de petits métabolites
- Protéine possède une séquence signal interne
- travers TOM sous forme de boucle
- Prise en charge par chaperonnes qui la dirige vers TIM22
- Insérée dans la membrane avec énergie fournie par gradient électrons.
Comment les protéines sont-elles importées dans l’espace intermembranaire? 2 manières
- Elles sont libérées de la membrane interne par une protéase.
- Oxydation par Mia40 (protéines à motif Cys), utilisent le gradient d’électrons comme énergie
- Protéines traversant TOM sont oxydées en formant des ponts disulfure avec Mia40 (réduit)
- Cela aide à tirer la protéine à travers TOM
- Protéine est relâchée sous forme oxydée
- Mia est réoxydée par la chaîne respiratoire.
Quelle est la composition du peroxysome?
- Membrane simple, pas d’ADN ni de ribosomes.
- Acquiert les protéines par importation du cytosol et en partie par le RE.
- C’est un site majeur d’utilisation de l’O2, contient différentes enzymes oxydatives = catalase, urate oxydase, etc.
- Enzyme utilisent O2 pour éliminer hydrogène de substrats potentiellement toxiques = génère H2O2
- H2O2 utilisé par catalase pour oxyder des molécules toxiques (ex. EtOH)
Quelles sont les 2 réactions importantes effectuées dans les peroxysomes?
- Réaction oxydative majeure = dégradation des molécules d’acide gras par B-oxydation pour donner acétyl-coA dans le cycle de l’Acide citrique
- Fonction biosynthétique majeur = 1er réaction de formation des plasmalogènes (phospholipides abondants dans la myéline)
maladies peroxysomiques = maladies neurologiques.
Comment les protéines sont-elles importées dans les peroxysomes? Quel est le signal d’import spécifique? rôle des peroxines?
Signal d’import = séquence Ser-Lys-Leu
- 23 peroxines participent à l’imoportation des protéines - sous forme repliée**
- 6 peroxines forment un translocateur (pore)
- Complexe - Pex5 (récepteur) + cargo s’insère dans la membrane au niveau de protéines d’amarrage (peroxines) = formation pore membranaire duquel le cargo est libéré dans la matrice
- récepteur Pex5 mono-ubiquitiné et recyclé au cytosol
Qu’est-ce qui cause le syndrome de Zellweger?
C’est une maladie héréditaire humaine
- Anomalie des protéines d’importations (Pex5 et Pex7)
- Donne des cellules avec peroxysomes vides donc anomalies du cerveau, du foie et des reins, patients meurent après naissance.
De quoi est formée la lumière du RE ou citerne du RE?
Du RE et de la membrane nucléaire qui forment un feuillet continue formant un seul espace interne.
Quelles sont les 4 fonctions du RE?
- Biosynthèse des protéines et des lipides
- Réservoir de Ca2+ = signalisation
- Site de production de toutes les protéines et lipides transmembranaires des organites
- Protéines sécrétées à l’extérieur de la cellule + celles destinées à la lumière du RE, du Golgi et des lysosomes passent toutes par la lumière du RE.
Quelle est la différence entre le processus d’importation co-traductionnel et post-traductionnel dans le RE?
- Les protéines sont importées dans le RE pendant leur synthèse dans le cas de co-traductionnel (ribosomes liés à la membrane du RE)
- les protéines sont importées dans le RE après leur synthèse dans le cas de post-traductionnel. (protéine libérée du ribosome avant translocation)
Dans quelles cellules le RE lisse est-il abondant? 3 types
- Cellules qui synthétisent les hormones stéroïdiennes, le RE accueille les enzymes de la stéroïdogenèse
- Hépatocytes (foie) : site de production des lipides composant les particules de lipoprotéines utilisées pour transporter les lipides dans le sang.
- RE lisse contient les cytochrome P450, des enzymes impliquées dans la détoxification des produits toxiques et des médicaments.
Qu’est ce qu’un microsome?
Petite parties du RE obtenues en laboratoire = petites vésicules.
Quelles sont les 2 types de protéines en cours de synthèse co-traductionelle?
- Transmembranaire : partiellement transloquées, restent enchâssées dans le RE = actives dans le RE ou ailleurs.
- Hydrosolubles : complètement transloquées et libérées dans la lumière du RE pour sécrétion ou pour être envoyés vers la lumière d’un organite.
Ou se situe la séquence signale pour les protéines transloquées dans le RE et comment est-elle clivée?
Une séquence signal en N-terminal dirige la protéine vers le RE sur un translocateur qui forme un pore à travers lequel le polypeptide est transloqué, puis séquence signal est coupée par une signal-petidase située dans le RE.
Rôle du pore aqueux du translocateur et composition
- centre du translocateur appelé complexe Sec61 pourvu d’une vanne : s’ouvre de façon transitoire quand la protéine travers la membrane.
- Complexe peut aussi s’ouvrir sur son côté, accès latéral au cœur hydrophobe qui permet la libération du peptide signal coupé ou l’insertion de protéines membranaires.
Qu’est-ce que le SRP et comment est-il reconnu?
- SRP = particule de reconnaissance du signal qui fait la navette entre le RE et le cytosol, se fixe sur la séquence signal.
- Récepteur SRP : dans la membrane du RE reconnait la SRP.
Que fait la SRP pour éviter la traduction dans le cytosol?
Elle s’enroule autour de la grande sous.u ribosome, lie une de ses extrémités à la séquence signal émergente et l’autre bloque le site de liaison du facteur d’élongation (sur ribosome) ce qui arrête synthèse protéique, donne le temps au ribosome de fixer le RE avant de terminer la synthèse et éviter que la protéines ne soit libérée dans le cytosol.
Quelles sont les étapes de la co-translocation des protéines dans le RE? (5)
- SRP empêche repliement de la protéine dans le cytosol avant qu’elle n’atteigne le RE, évite les dégâts que pourraient causer par exemple les hydrolases lysosomales destinées au lysosome.
- Complexe SRP-ribosome se lie au récepteur SRP = protéine de translocation insère la protéine dans la membrane (hydrolyse GTP)
- Libération de la SRP et du récepteur de la protéine de translocation
- Transfert du peptide en formation à travers la membrane.
- Une fois séquence signal libérée de la SRP, elle déclenche ouverture du pore dans la protéine de translocation (qui est normalement fermé sans présence de ribosome)
Quels sont les 3 types de protéines qui vont être transloquées via le SRP-récepteur-translocateur?
- Protéines solubles du RE (résidentes, pour sécrétion)
- Protéines à un seul domaine transmembranaire
- Protéines à multiples domaines transmembranaires
Quelle est la manière dont les protéines solubles sont transloquées à travers le RE?
En liant une séquence signal du RE en NH2 (signal du début du transfert), le translocateur ouvre son pore et permet le transfert du peptide.
- signal peptidase coupe la séquence signal. Une fois la protéine transloquée, le pore se ferme et le translocateur s’ouvre latéralement libérant la séquence signal dans la membrane ou elle est dégradée.
Comment les protéines trans-membranaires à 1 seul domaine sont-elles insérées dans le RE? 3 étapes avec signal hydrophobe.
Certaines parties du peptide sont transloquées alors que d’autre ne le sont pas.
- Séquence signal initie translocation
- Segment hydrophobe (signal) provoque arrêt du transfert
- Signal d’arrêt ancre la protéine dans la membrane après que la séquence signal ait été libérée du translocateur et coupée.
* *N-terminal du côté luminal et C-terminal du côté cytosol**
Comment les protéines trans-membranaires sont-elles libérées dans le RE grâce à une séquence interne?
- Séquence signal interne reconnue par SRP, peptide + ribosome transféré au RE
- Translocation initiée et complétée
- # Séquence signal interne reste dans la membrane, pas de signal d’arrêt.
De quoi dépendant l’orientation d’un protéine transmembranaire à signal interne?
- Elle dépend de la distribution des AA chargés + avant ou après le cœur hydrophobe de la séquence signal.
- La séquence signal peut se fixer dans 2 orientations ce qui détermine quelle extrémité du peptide sera transporté du côté luminal. (N-term ou C-term)
- Le positif reste toujours au niveau du cytosol et le négatif au niveau du lumen.
Comment les protéines à multiples domaines transmembranaires sont-elles intégrées au RE?
- Une séquence signal interne sert de signal de début de transfert et initie translocation.
- Jusqu’à ce qu’un séquence de fin de transfert soit atteinte
- Dans protéine à double passage, le peptide est alors libéré dans la membrane, mais dans protéines qui traversent membrane plusieurs fois, une 2e séquence de début de transfert réinitialise la translocation, etc…
Comment est ce qu’on peut différencier une séquence de début ou de fin de signal dans la translocation des protéines transmembranaires à multiples domaines?
Selon leur ordre relatif. 1er = début, 2e = fin
Qu’en est-il des protéines intégrées aux membranes par un hélice alpa situé en C-term.?
4 étapes
Pas de SRP puisque la séquence signal est en C-term
La majeure partie de la protéine demeure dans le cytosol
1. Un complexe capture le C-term hydrophobique à sa sortie du ribosome.
2. Le transfert sur GET ATPase
3. GET ATPase se lie à Get1-Get2 sur la membrane du RE
4. Get1-Get2 hydrolysent ATP ce qui permet l’insertion de la protéine à la membrane.
Vrai ou faux: Le mode d’insertion d’un protéine dans le RE détermine son orientation dans toutes les autres membranes?
Vrai
À quoi servent les signaux de rétention dans le RE et sur quels types de protéines les retrouve-t-on?
Servent à garder la protéine dans le RE pour qu’elle soit exportée à l’extérieur de la cellule ou dans un autre organite.
ex. Enzymes responsables de la synthèses des lipoprotéines qui sont destinées au Golgi
ou
Protéine chaperonnes
Vrai ou faux: La membrane du RE est symétrique, les domaines exposés d’une côtés sont les mêmes que les domaines exposés de l’autre.
Faux, la membrane du RE est asymétrique. Les domaines exposés d’un côté sont différents des domaines exposés de l’autre.
- toutes les copies d’une même chaîne protéique ont la même orientation dans la bicouche (diff des 2 côtés)
Quel pourcentage des protéines eucaryotes sont glycosylées?
55% - l’Addition des sucres sur les protéines est l’une des fonctions majeures du RE
Comment un oligosaccharide est-il ajouté à une protéine dans le RE?
- oligosaccharide maintenu en place dans la membrane par le dolichol, un complexe lipidique par une liaison pyrophosphate qui donne énergie à réaction de glycosylation
- transféré sur le NH2 de la chaîne latérale d’une Asn (liaison N-osidique ou lié à l’Asn)
- Réaction catalysée par oligosaccharyl transférase située sur le RE côté luminal.
quels sont les rôles des protéines chaperonnes calnexine et calretriculine?
- Elle se lient sur les sucres de protéines qui ne contiennent qu’un seul glucose terminal et qui ne sont pas complètement repliées, les retenant ainsi au RE.
- Avec élimination du dernier glucose par la glucosidase, la protéines se dissocie des chaperonnes et peut quitter le RE.
Comment la calnexine et la calrétriculine peuvent-elles différencier les protéines correctement repliées de celles qui ne le sont pas?
Grâce à la glucosyltransférase qui continue d’ajouter un glucose sur oligosaccharides ayant perdu leur dernier glucose. Elle le fait seulement sur les protéines non repliées.
Étapes de la glycosylation des protéines?
- Transfert du bloc oligosaccharides (lié au dolichol) sur protéine
- Glucosidase enlève 3 derniers glucoses
- Glucosyltransférase rajoute immédiatement un glucose sur les protéines qui ne sont pas correctement repliées.
- 2 chaperonnes (calnexine, calrétriculine) peuvent donc retenir la protéine dans le RE.
- Élimination du glucose terminal par glucosidase libère la protéine de la calnexine
- Glucosyltransférase transfère un nouveau glucose si la protéine n’est pas correctement repliée ce qui renouvelle affinité de la protéine pour la calnexine.
(Jusqu’à ce que la protéine soit correctement repliée)
Quel est l’enzyme crucial qui détermine si la protéine est correctement repliée?
Glucosyltransférase.
Quel pourcentage des protéines sont mal repliées? et qu’arrive-t-il à ses protéines
Jusqu’à 80% des protéines transloquées dans le RE ne se replient pas correctement, elles sont donc exportés du RE dans le cytosol par mécanisme de rétro translocation ou elles sont dégradées par protéasome ou par autophagie.
Quelles sont les étapes de la rétrotranslocation?
- Les protéines mal repliées interagissent avec des chaperonnes du RE (bloques séquence terminal protéine), une disulfide isomérase (lient 2 extrémités par lien disulfure) et des lectines (bloquent sucres), puis exportées par un transporteur.
- Associées à une ubiquitine ligase à la membrane
- ATPase tire la protéine à travers le pore
- N-glycanase enlève les oligosaccharides
- Chaîne poly-ubiquitinée guide protéine vers protéasome.
Comment la cellule fait pour savoir lorsqu’il est temps de dégrader une protéine mal repliée? Quelles molécules sont impliquées dans le processus?
- Les oligosaccharides liés à l’Asn (asparagine) facilitent cette distinction en mesurant le temps passé par une protéine dans le RE.
- Le lent élagage d’un mannose sur l’oligosacchardie par une mannosidase crée une nouvelle structure reconnue par l’appareil de rétrotranslocation.
Vrai ou faux : Les protéines qui se replient et sortent après l’action de la mannosidase échappent à la dégradation.
Faux! Ce sont les protéines qui se replient et sortent du RE plus vite que l’action de la mannosidase qui échappent la dégradation.
- Une protéine qui prend trop de temps à se replier, donne l’opportunité à la mannosidase d’agir ce qui enclenche le processus de sa rétrotranslocation et sa dégradation.
Qu’est-ce qui arrive lorsqu’une protéine mal repliée arrive dans le cytosol?
Ces protéines non fonctionnelles déclenchent une réponse de choc termique.
Qu’est-ce qui arrive lorsqu’il y a une accumulation de protéines mal repliées dans le RE?
La cellule déclenche une réponse aux protéines dépliées, réponse de stress.
Comment les protéines mal repliées au RE transmettent-elles le signal au noyau?
Par l’activation de facteurs de la transcription contrôlant la transcription des gènes qui :
- Augmentent la capacité de repliement des protéines du RE
- Augmentent la transcription des gènes des chaperonnes et des protéines impliquées dans la rétrotranslocation et la dégradation.
Quelles sont les étapes de la voie de régulation de l’épissage dans la réponse aux protéines repliées? (7)
- Activation d’une kinase par la liaison d’une protéine mal repliée ce qui permet au domaine kinase de se dimériser et de s’autophosphoryler
- Activation d’un domaine endonucléase
- Coupure d’un ARN pour retirer un intron
- Création d’un ARNm : ligation des 2 exons
- Traduction de l’ARNm en facteur de transcription
- Migration du facteur de transcription au noyau et activation génique
- Synthèse dans le RE de nouvelles chaperonnes aidant le repliement correct des protéines.
