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Protéines Examen 2 > Chapitre 4 > Flashcards

Chapitre 4 Flashcards

1
Q

Les cellules sont dynamiques.

Elles sont capables de faire quoi?

A

Changer de forme
Bouger
Réarranger leur composants internes

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Q

Définition de cytosquelette

A

système de filaments protéiques dans le cytoplasme qui donne la forme et la capacité à se déplacer aux cellules.

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3
Q

Quelques rôles des cytosquelettes (7)

A

Séparation lors de la mitose
Division lors de la cytokinèse
Supporte la membrane plasmique
Permet à des cellules à se déplacer et contracter
Guides des transports vésiculaires
Guides les organites de dans la cellule
Apporte les liens qui permet les jonctions et la commu.

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4
Q

3 types de filaments dans le cytosquelette et leur rôle

A
  • Filaments intermédiaires force mécanique, entoure l’enveloppe nucléaire, permettent jonction cellulaires, allongent axones, forment ongles et cheveux
  • Microtubules: détermine position et dirige le transport, fuseau mitotique
  • Microfilaments: détermine forme pour la locomotion, contraction musculaire, division cellulaire
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5
Q

Comment les filaments sont liés entre eux et à d’autres composants?

A

Des centaines de protéines accessoires pour permettre le mouvement, la division, etc…

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6
Q

Exemple de protéine accessoire

A

Protéines motrices : convertissent ATP ou GTP en énergie mécanique, qui facilite le mouvement des filaments et des organites

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7
Q

Filaments compris dans les cellules épithéliales intestinales

A

Microfilaments d’actine (augmente surface de la cellule)
Jonctions adhérentes (actine)
Filaments intermédiaires : hemidesmosomes et desmosomes (maintiennent cellules ensemble)
Microtubules (transportent vésicules ou organites avec l’intermédiaire de protéine motrice).

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8
Q

Filaments d’actine - structure? on les retrouve ou?

A

7-8 nm épaisseur
Structure polarisée (+et -)
Polymères constitués de monomères d’actine
Abondantes dans les fibres musculaires striées et cellules épithéliales.

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9
Q

Les différentes textures des microfilaments (6)

A
  • Faisceaux serrés, structures digitiformes microvillosités
  • Bande d’adhésion: jonctions adhérentes
  • Reseau de soutien: cortex cellulaire
  • Cellules migratrices: filopodes ou lamellipode
  • Fibres de stress: mouvement
  • Anneau contractile: division cellulaire.
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10
Q

Monomères d’actine G et F - explication

A

Monomère G (globulaire) s’assemble en polymères F (fibreuse).
Chaque monomère G à un site de liaison à l’ATP (sous forme F: site de liaison ADP).

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11
Q

Caractéristiques des microtubules (5)

A
  • Constitués de ss-unités tubuline
  • 25 nm de diamètre (très grand)
  • Structure polarisée (+ et -)
  • Impliqués dans l’organisation cellulaire, ségrégation, circulation des vésicules
  • Protéine globulaire très conservée au niveau évolutif.
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12
Q

2 types de tubulines

A

a et B qui s’associent par liaison non-covalente pour former un hétérodimère
a et B peuvent s’associer à GTP, mais seulement B peut l’échanger pour de l’GDP.

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13
Q

caractéristiques des filaments intermédiaires (3)

A
  • Épaisseur variable
  • Pas formés de protéines globulaires: molécules spécifiques aux cellules
  • Assemblage sans apport d’énergie
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14
Q

Les monomères des filaments intermédiaires

A

Molécules allongées avec un domaine en hélice a.

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15
Q

Les filaments du cytosquelette sont dynamiques et adaptable. Ceci permet quoi?

A

Ca permet de construire une grande variété de structures à partir de ces 3 filaments, selon les signaux cellulaires.

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16
Q

Les trois filaments sont constitués de sous-unités. Qu’est-ce qui est différent au niveau de la vitesse entre les ss-unités et le filament total?

A

Sous-unités: déplacent très vite dans le cytoplasme.

Filaments ne peuvent pas, une fois assemblés.

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17
Q

Pourquoi il y a-t-il des différentes dans la stabilité et les propriétés des filaments?

A

Différences de structures des sous-unités

Différences de forces leur permettant de s’associer

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18
Q

La différence entre l’assemblage des monomères de microtubules et microfilaments vs. Filaments intermédiares.

A

Microfilaments et microtubules:

  • ss-unités = protéines globulaires.
  • Le bout des filaments sont dynamiques: permettent l’ajout ou la perte de sous-unités.

Filaments intermédiaire:

  • Longues structures polypeptidiques.
  • Difficile à casser.
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19
Q

Principe de la nucléation

A

Pendant l’assemblage des monomères, les sous-unités doivent s’assembler à un agrégat intial qui peut s’allonger rapidement par l’addition de nouvelles sous-unités (élongation)

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20
Q

Quelle est l’étape limitante de l’assemblage des monomères?

A

L’assemblage du noyau. Ceci prend du temps.

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21
Q

Définition d’élongation

A

Ajout rapide de sous-unités au noyau.

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22
Q

Définition d’équilibre

A

Le taux d’addition au bout des filaments est le même que le taux de dissociation à l’autre bout.

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23
Q

Cc = ?

A

Concentration critique: [monomères] lorsque la phase d’équilibre est atteinte (vitesse association = vitesse dissociation)

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24
Q

Au dessus de Cc = ?

A

polymérisation en filaments (ajout ss-unités)

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25
Q

Au dessous de Cc = ?

A

dépolymérisation des filaments (perte ss-unités)

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26
Q

Le taux de croissance est-il égale au côté + et au côté - ?

A

NON, partie + plus rapide

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27
Q

Hydrolyse des nucléotides (ATP-GTP) - Deux types de filaments?

A 
Forme T (ATP-GTP) : partie +
Forme D (ADP-GDP): partie -
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28
Q

Hydrolyse des nucléotides ATP et GTP - Les sous-unités d’actine et de tubuline font quoi?

A

Quand le sous-unités est ajouté au filament, il y a hydrolyse de ATP (actine) et GTP (tubuline). Phosphate libre est relâché et diphosphate reste

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29
Q

Pourquoi les enzymes ne peuvent pas faire de l’hydrolyse à l’extrémité + (forme T)?

A

Parce que l’addition est plus rapide que l’hydrolyse donc un coiffe de ATP et GTP se forme.

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30
Q

La concentration des monomères pour l’assemblage doit-il être plus grane au côté + ou -?

A

-

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31
Q

La tapis roualnt est surtout dans quel filament?

A

Microfilaments

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32
Q

Principe du tapis roulant

A

Si la concentration de monomères est entre les deux concentrations critiques, il va y avoir ajout de sous-unités à la partie + en même temps qu’il va y avoir perte de sous-unités à la partie-.

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33
Q

Concept de l’instabilité dynamique dans les microtubules

A

Il y une rapide conversion entre croissance et rétrécissement

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34
Q

Catastrophe = ?

A

Le changement de l’état de croissance à l’état de rétrécissement. Hydrolyse du GTP plus rapide que l’ajout de ss-unités : coiffe perdue

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35
Q

Récupération = ?

A

Le changement de l’état de rétrécissement à l’état de croissance. Ajout de ss-unités T rapide, coiffe se reforme.

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36
Q

Protofilament linéaire (tubulines)?

A

Les ss-unités tubulines lisant le GTP sur le monomère B.

Contact fort entre eux.

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37
Q

Qu’est-ce qui arrive au protofilament intermédaire de tubuline lorsqu’il y a hydrolyse de GTP?

A

Il y a un changement de conformation et il y a une courbe dans les protofilaments et les courbes se cassent

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38
Q

L’hydrolyse de GTP (protofilaments tubuline) cause l’effeuillage. Ceci veut dire quoi au niveau de la structure?

A

Les anneaux et oligomères courbes de tubuline de forme D (liant le GDP) doivent être à l’extrémité des microtubules.

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39
Q

Toxines qui affectent les microfilaments

A

Phalloidine
Cytochalasine
Swinholine
Latrunculine

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40
Q

Toxines qui affectent les microtubules

A

Taxol

Cholchicine

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41
Q

Protéines associés à la dynamique des microfilaments

A 
Cofiline
Profiline
Thymosine
Gelsodine
Coiffes
42
Q

Protéines associées à la structure des microfilaments

A 
Fimbrine
a-actinine
Filamine
Spectrine
ERM
43
Q

Protéines associées à l’assemblage des microfilaments

A

Complexe ARP

Formine

44
Q

Le tapis roulant est influencé par quoi?

A

Profiline et Cofiline

45
Q

Profiline

A

Lie à actine G et empêche la nucléation, favorise l’échange d’ADP à ATP: contrôle croissance.

46
Q

Cofiline

A

Lie à l’actine F à l’extrémité -, forme ponts entre 2 ss-unités qui cause une torsion

47
Q

Thymosine B4

A

lie à l’actine G-ATP en inhibe l’ajout de ss-unités à la partie +

48
Q

Coiffes

A

CapZ (+) et Tropomoduline (-)

49
Q

Nucléation régulée par 2 classes de protéines. Lequelle?

A

Les formines : 2 domaines FH1 et FH2
Complexe Arp2/3: ramification des microfilaments, utilise polymérisation de l’actine pour se déplacer d’une cellule à l’autre.

50
Q

Listeria monocytogènes

A

Pathogène d’origine alimentaire qui provoque la listériose.

Symptômes gastro-intestinaux

51
Q

Exemple de protéine qui active complexe Arp2/3

A

Protéine ActA à la surface de la bactérie.

Amplifie l’assemblage et le confine à l’arrière de la bactérie.

52
Q

Rôle des protéines motrices

A

Convertir ATP en énergie mécanique

53
Q

3 familles de protéines motrices

A

Myosines: déplacent sur microfilaments
Kinésines: déplacent sur microtubules
Dynéines: déplacent sur microtubules

54
Q

Étapes de la conversion de l’ATP - protéines motrices

A
  • Liaison d’un ATP
  • Hydrolyse d’ATP en ADP - déplacement du moteur (changement conformation)
  • Séparation de l’ADP et du moteur.
  • Fixation d’un nouvel ATP.
55
Q

Rôle des myosines

A

Interagissent avec filaments d’actine pour permettre la contraction musculaire

56
Q

6 polypeptides dans les myosines

A

2 chaines lourdes
2 chaines légères régulatrices
2 chaines légères essentielles

57
Q

3 domaines dans la myosine

A

Domaine globulaire : tête
Domaine allongé: queue
Domaine souple: cou

58
Q

Rôle de tête de myosine

A

fixe l’actine et l’ATP : moteur de la protéine

59
Q

3 classes de myosines

A

Myosine I: Association à une membrane, transport
Myosine II: contraction
Myosine V: transport d’organites

60
Q

La queue de myosine détermine quoi?

A

les différentes cargaisons

61
Q

Les myosines se déplacent vers quelle extrémité? Et exception?

A

Extrémité + des filaments d’actine.

Exception: Myosine VI (-)

62
Q

Changement de conformation dans la tête de myosine permet le mouvement. Étapes?

A
  • Liaison ATP: têtes se détachent du filament
  • Hydrolyse ATP: rotation de la tête
  • Myosine armée se fixe à l’actine
  • Couplage de la libération de Pi avec la libération de l’énergie élastique
  • Tête reste fixée quand l’ADP est libéré.
63
Q

Fimbrine

A

dans les microvillosités, filopodes: compactage des microfilaments

64
Q

a-actinin

A

fibres de stress, filopodes, lignes musculaire Z: permet contraction en laissant la place à la myosine

65
Q

Spectrine

A

Cortex cellulaire: réseau sous la membrane plasmique

66
Q

Filamine

A

fibres de stress, filopodes: protéine de réticulation, interconnexion entre fibres sous forme de maillage

67
Q

Tropomyosine

A

permet de stabiliser les filaments d’actine
2 ss-unités en hélice
intéragit avec troponine pour réguler la contraction musculaire.

68
Q

Protéines associées au nucléation des microtubules

A

y-TuRC

MTOC

69
Q

Protéines associées à la structure et dynamique des microtubules

A

MAPs
Tau
+TIP

70
Q

Protéines associées au démontage des microtubules

A

Kinésine 13
Stathmine
Katanine

71
Q

Rôle des MTOC

A

Nucléation. Le bout - du microtubule est ancré dans le MTOC, bout + s’éloigne

72
Q

MTOC principal est quoi?

A

Centresome: permet formation du réseau de microtubules qui servent de rails pour le transport des vésicules et des organites..
Constitué d’une paire de centrioles (9 ensembles de triplets de microtubules)

73
Q

Rôle de y-TuRC

A

ammorce la formation des microtubules à partir du MTOC (donc microtubules grandissent avec y-TuRC au bout -).

74
Q

Tubuline a et B vs. y

A

a et B: constituent les microtubules

y: impliqués dans la nucléation (formation de noyau de monomères).

75
Q

MAPs

A

stabilisent microtubules, garde coiffe GTP et empêche le désassemblage

76
Q

Tau

A

Régulent les microtubules par phosphorylation/déphosphorylation.
Agrégats insolubles

77
Q

Qu’est-ce qui arrive s’il y a une accumulation de Tau hyperphosphorylées?

A

Formation d’enchevêtrements neurofibrillaires.

Tau ne peut plus stabiliser les microtubules

78
Q

Importance des Tau

A

Alzheimer: accumulation d’agrégats protéiniques: Tau hyperphosphorylées et peptides Amyloides B.
Abondance de Tau est relié au dégénerescence des cellules nerveuses.

79
Q

Kinésine 13

A

Augmente taux de catastrophe: elles se lient à l’extrémité des microtubules et ouvre les protofilaments (courbe), donc diminue énergie pour effeuiller la microtubule.

80
Q

Stathmine

A

Lie deux dimères de tubuline: ne peuvent plus se lier.

Augmente catastrophe.

81
Q

Protéines de stabilisation - Microtubules

A

CapZ
Tropomoduline
Titine
Nébuline

82
Q

Rôles des kinésines et dyénines

A

Assurent le transport le long des microtubules, ATP dépendantes.

83
Q

Qu’est-ce qui se passe pendant une contraction musculaire?

A

Filaments myosines et filaments actine glissent l’un sur l’autre.
Sarcomère est réduit de 70%
Hyrolyse de l’ATP: tête de myosine bouge vers le disque Z (+).

84
Q

Kinésines - caractéristiques

A

2 chaines lourdes, associées à une chaine légère

Se déplacent vers l’extrémité + (sauf kinésine 14)

85
Q

Domaines des kinésines

A

Têtes: activité motrice
Lien: déplacement en avant
Tige: dimérisation des chaines lourdes
Queue: Liaison aux cargaisons

86
Q

Qu’est-ce qui se passe lorsqu’on échange l’ADP pour l’ATP (kinésines)

A
  • Tête arrière avec ADP fixe au microtubule
  • Tête avant lie l’ATP: changement conformation et pousse tête vers l’avant
  • Faible liaison de la tête-ADP
  • Libération d’ADP (tête avant) : hydrolyse ATP de tête arrière
  • Libération de Pi, la liaison s’affaiblit.
87
Q

Caractéristiques des dynénies

A

2 grandes ss-unités, 2 intermédiaires et 2 petits.

Déplacent vers l’extrémité - des microtubules

88
Q

Domaines des dynénies

A

Tiges: s’attachent à la cargaison par dynactine
Tête: domaine liaison ATP
Pédoncule: domaine liaison microtubule

89
Q

Transportation cargaison: Kinésine vs Dynénies

A

Kinésines: tout seul

Dynénies: avec l’aide de la dynactine

90
Q

Étapes - dynénies

A
  • Dynéine fixe au microtubule sans ATP
  • ATP se lie, dyénine détache du MT
  • Changement de conformation de la tête
  • Permet la dynéine de faire un bond vers l’avant
  • Rattachement au MT, hydrolyse de l’ATP en ADP
  • Cargaison tirée par un changement de conformation de la tige.
91
Q

Caractéristiques des cils

A 
Courts
Abondant
Battement coordination successive
Déplacement perpen. à l'axe des cils
Tractus respiratoire, trompes de Fallopes
92
Q

Caractéristiques des flagelles

A

Longs
Pas abondant
Battement ondulatoire
Déplacement parallèle à l’axe du flagelle
Spermatozoides, algues unicellulaires, protozoaires.

93
Q

Qu’est-ce qui permet le mouvement des cils et flagelles?

A

Torsion de l’axonème (noyau): microtubules + protéines accessoires
Dynéine

94
Q

Étapes du mouvement des cils et flagelles

A

Domaine moteur de dynéine activé
Saut le long des microtubules adjacents
Doublets glissent l’un par rapport à l’autre

95
Q

Structure des microtubules qui permettent le mouvement des cils et flagelles

A

9 doublets en un cercle autoure d’un autre doublet
Doublet avec microtubules A (complet) et B (incomplet)
Gaine centrale
Bras radiaires
Ponts de nexines
Dynéines interne et externes (moteurs)

96
Q

Bras radiaires et ponts de nexines font quoi?

A

Exercent une résistance qui cause une courbure des doublets, et donc un battement ou ondulation.

97
Q

Comment permet-on la courbure des bras et ponts dans les deux sens?

A

Dynéines activent d’un côté et inactivent d’un autre côté.

98
Q

Cooperation et coordination des filaments du cytosquelette - exemples

A

1) Fuseau mitotique à la base des microtubules détermine le site d’anneau contractile (microfilaments)
2) Les mélanocytes contiennent mélanosomes qui contient mélanine.

99
Q

Mélanocyte - explication (cooperation et coordination

A
  • Les pigments sont transportés vers les extrémités pour exocytose vers les kératinocytes: Kinésine = longue distance
  • Capture et transmisson : Myosine V = courte distance.
100
Q

Les trois phases de l’assemblage

A 
Lag phase (nucléation)
Élongation
Équilibre

Protéines Examen 2 (3 decks)

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