Chapitre 4 Flashcards

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1
Q

Que contient la phase solide organique du sol?

A

La partie vivante,

que ce soit les végétaux incluant les racines des plantes, les vertébrés, les insectes et autres invertébrés et les microorganismes;

La partie morte, qui comprend :

Les débris végétaux et animaux ou encore les matières organiques fraîches qui ont sensiblement la même composition que les tissus vivants dont ils proviennent;
Les produits transformés (dégradés);
La fraction stabilisée par différents processus.

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2
Q

Qu’est ce que la litière?

A

C’est la matière organique composée de résidus de plantes (pailles, feuilles, brindilles et matériel ligneux) dont les structures originales sont conservées et qui se retrouve à la surface du sol.

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3
Q

Qu’est ce que la fraction légère ?

A

Matériel d’origine végétale et animale plus ou moins décomposé que l’on retrouve dans le sol et qui peut être séparé par flottaison. La litière incorporée au sol devient la fraction légère.

Le contenu d’un sol en fraction légère varie selon la saison. Il augmente fortement après l’incorporation des résidus de culture.

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4
Q

Qu’est ce que la Biomasse microbienne?

A

C’est la matière organique présente sous forme de tissus microbiens vivants qui sert d’agent de décomposition des résidus et de source d’éléments nutritifs. Entre 1-3% du carbone organique des sols provient de la biomasse.

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5
Q

Qu’est ce que les Substances non humiques?

A

Ce sont des composés provenant de la destruction d’organismes morts (végétaux, animaux, microbiens).

Bien qu’ils puissent se fixer temporairement sur la fraction minérale du sol, ces composés sont continuellement renouvelés (minéralisés, absorbés par des organismes vivants, stabilisés par des interactions avec d’autres molécules organiques ou avec des minéraux du sol, éliminés par drainage).

Ils sont classés dans les catégories suivantes : hydrates de carbone, composés azotés, lipides, lignine et composés dérivés, acides organiques, enzymes, vitamines et antibiotiques, graisses, cires, résines, tannins.

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6
Q

Qu’est ce que les substances humiques?

A

Le terme est utilisé comme un nom générique pour décrire la fraction stable de la matière organique du sol.

La nature même de ces substances est incertaine.

Certains pensent que ce sont de nouvelles molécules complexes synthétisées à partir des substances non humiques, alors que d’autres croient que ce sont des agrégats de substances non-humiques liées ensemble par différents types de liaisons.

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7
Q

Qu’est ce que l’humus?

A

C’est l’ensemble des produits obtenus par la décomposition intense de la matière organique.

Cela comprend tous les composés organiques des sols, excepté les tissus végétaux et animaux non-décomposés, leurs produits de décomposition partielle (donc n’inclue pas la fraction légère) et la biomasse du sol.

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8
Q

Qu’est ce que les organismes biophages?

A

les biophages se nourrissent de tissus végétaux vivants (consommateurs primaires, régime alimentaire herbivore) ou d’animaux vivants (consommateurs secondaires, régime alimentaire carnassier).

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9
Q

Comment nomme-t-on les organismes qui se nourrissent de tissus végétaux vivants (consommateurs primaires, régime alimentaire herbivore) ou d’animaux vivants (consommateurs secondaires, régime alimentaire carnassier).

A

Les organismes biophages

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10
Q

Qu’est ce que les organismes saporophage?

A

les saprophages se nourrissent de substances organiques végétales mortes (décomposeurs primaires, régime alimentaire détrivore) ou de substances organiques animales mortes (décomposeurs secondaires, régime alimentaire nécrophage).

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11
Q

Comment nomme-t-on les organismes qui ​se nourrissent de substances organiques végétales mortes (décomposeurs primaires, régime alimentaire détrivore) ou de substances organiques animales mortes (décomposeurs secondaires, régime nécrophage)

A

Les saporophages

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12
Q

Nommer les 4 groupes qui séparent la faune du sol selon la grosseur des organismes. (Du plus petit au plus grand)

A

La microfaune (plus petite que 2mm)
La mésofaune (2mm à 4mm)
La macrofaune (4mm à 80mm)
La mégafaune (80mm et plus)

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13
Q

Quel est le role mécanique de la faune du sol?

A

Elle permet la formation d’agrégats stables, améliorant ainsi la porosité du sol.

Les animaux du sol fragmentent les matières organiques =» augmente la surface spécifique favorise l’attaque bactérienne =» augmente la vitesse de décomposition.

Elle permet aussi un brassage et d’un malaxage qui contribuent à la construction d’agrégats stables et améliorent la porosité du sol, favorisant ainsi la circulation de l’air et donc de l’oxygène.

Ils contribuent également au transport et à la dissémination des matières organiques dans tout le profil.

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14
Q

Qu’elle est le role chimique de la faune du sol?

A

Il est principalement due aux vers de terre qui remontent en surface des éléments qui avaient été lessivés, notamment le calcium.

Ils peuvent donc limiter, dans une certaine mesure, la décalcification.

Les vers peuvent aussi transformer des minéraux non assimilables avec leurs enzymes digestives en elements nutritifs pour les plantes (potassium, phosphore et magnésium assimilables).

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15
Q

Quel est le role biologique de la faune du sol?

A

La faune du sol consomme des bactéries, des algues et des champignons, et joue donc un rôle de sélection qui rajeunit et stimule la flore microbienne.

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16
Q

Quelles sont les trois classes de vers de terres?

A

Les épigés
Les endogés
Les anéciques

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17
Q

Décrire et donner le role des vers de terre épigés?

A

Ce sont les vers de petite taille (< 5,5 cm) qui vivent dans les horizons riches en matière organique à la surface du sol.

Leur rôle principale est de briser la litière au sol. Ce sont de bons décomposeurs.
(recyclage et detoxification)

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18
Q

Décrire et donner le role des vers de terre endogés?

A

Les espèces endogées sont des vers de taille moyenne (< 5,6 cm à 11,0 cm) qui consomment plus de matières minérales que les espèces épigées.

En mélangeant les horizons minéraux et organiques ils participent bcp à la formation d’agrégats. (maintient de la structure)

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19
Q

Décrire et donner le role des vers de terre anéciques?

A

Ce sont des vers de grande taille (11,1 cm à 30 cm) qui creusent de profonds tunnels verticaux, s’alimentent principalement de litière de surface, incorporent cette litière dans le sol et transportent à la surface des particules minérales d’horizons plus profonds. Ils creusent des galeries verticales dans les sols pouvant aller jusqu’à 5 ou 6 m. Ils représentent 80% de la biomasse des lombriciens.

(Les pores aident à réguler l’écoulement de l’eau.

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20
Q

Quels sont les 7 facteurs influençant l’activité des vers de terre?

A

Les conditions du milieu.
La nourriture.
La présence de calcium, essentiel
Le gel.
La présence de prédateurs (taupes, souris, mites et certains mille-pattes)
L’application d’insecticides (carbamates, dont le carbaryl) et d’engrais ammoniacaux
Les pratiques culturales et le travail du sol .

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21
Q

Résumer les conditions optimales pour les vers de terre.

A

Ils préfèrent des sols bien aérés, humides, ayant une température autour de 10°C et un pH entre 5,5 et 8,5.

ils n’aiment pas les conditions anaérobies.

Le compactage des sols diminue les populations de vers de terre.

Ils n’aiment pas le sable car il est abrasif pour eux.

ils ont besoin de matière organique fraîche non décomposée.

Ils ont besoin de calcium pour le bon fonctionnement de leurs glandes.

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22
Q

Qu’est ce que les nématodes?

A

Les nématodes sont de petits vers ronds (0,1 à 1 mm), peu visibles, dont maintes espèces parasitent les racines des plantes.

Ils peuvent être saprophages (se nourrissent de débris végétaux morts), phytophages (se nourrissent de végétaux vivants) ou prédateurs (se nourrissent de proies vivantes de la faune du sol, comme champignons, bactéries, algues, protozoaires et larves d’insectes).

On tente d’ailleurs d’exploiter ces derniers pour contrôler certains insectes nuisibles. En conditions adverses (ex : manque d’eau), ils forment des kystes pour survivre. Souvent de très petite taille, leur nombre peut atteindre 6 millions par m2. Plus de 1000 espèces de nématodes sont connues, dont plusieurs sont phytophages et peuvent causer des dommages considérables aux racines des plantes cultivées. Les nématodes du genre Heterodora peuvent infecter les racines de pratiquement toutes les espèces et causer des baisses de rendement notamment dans la culture du soya et des arbres fruitiers.

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23
Q

Qu’est ce que les protozoaires?

A

Mobiles et unicellulaires, les protozoaires sont les plus nombreux et les plus variés des organismes constituants la microfaune. Ils regroupent entre autres les amibes, les ciliés et les flagellés. Plus de 250 espèces ont été isolées dans le sol. On en retrouve parfois 40 à 50 dans un même échantillon.

Ils affectionnent les sols humides et bien drainés. Ils se maintiennent en surface, près des racines (rhizosphère). Leur rôle en est un de prédateur (bactéries).

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24
Q

Qu’est ce que la microflore du sol?

A

La microflore du sol est constituée des microorganismes (algues unicellulaires, mycètes et bactéries (incluant les actinomycètes et les cyanobactéries).

Leur rôle est complémentaire à celui de la faune du sol et intervient plutôt en bout de chaîne, après la fragmentation entreprise par la faune du sol.

Ces microorganismes seront les agents directs de la minéralisation et de l’humification. La population bactérienne représente sans nul doute la plus grosse part de cet ensemble. On estime que la microflore est responsable de 60 à 80% du métabolisme du sol.

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25
Q

Quels sont les deux types de microflore?

A

La microflore de décomposition

Elle représente l’ensemble des microorganismes impliqués dans la décomposition de la matière organique fraîche. On constate que tant que le nombre de cellules bactériennes de cette flore de décomposition reste élevé, la germination des graines est inhibée.

La microflore d’assimilation

Lorsqu’au bout de plusieurs semaines ou de plusieurs mois de l’apport du fumier frais, il y a décroissance du nombre de cellules microbiennes, deux situations peuvent se présenter :

En l’absence de végétation: les substances organiques et minérales issues de la décomposition du fumier restent retenues dans le complexe argilo-humique du sol. Le sol se repose.
En présence de plantes: les radicelles émises dans le milieu enrichi, mais au repos, à la suite d’une intense prolifération d’une nouvelle microflore, sont entourées d’une véritable gaine bactérienne. On y rencontre quelques espèces de champignons, des actinomycètes et surtout un grand nombre de bactéries.
Le nombre de microorganismes dans le sol se remet à croître. Ces microorganismes semblent favoriser la croissance des racines, contrairement à ce qui se passe dans les premiers stades de décomposition du fumier.

Dès que la plante issue d’une graine est capable de synthétiser des sucres et autres substances organiques, elle dirige certaines de ces substances vers ses racines, où elle les excrète au profit des bactéries, qui à leur tour, semblent fournir à la plante d’autres substances organiques et minérales utiles à son développement. Les bactéries qui vivent ainsi en association avec les racines, formant autour d’elles la rhizosphère, appartiennent à des espèces diverses; les plus typiques appartiendraient aux genres Pseudomonas et Arthrobacter. Elles aideraient donc les plantes à assimiler certains éléments ou composés bénéfiques à la croissance des plantes.

26
Q

Qu’est ce que les bactéries nitreuses?

A

Bactéries qui transforment l’ammoniaque (NH3) en acide nitreux (HNO2) et en nitrites (NO2-).

27
Q

Qu’est ce que les bactéries nitriques?

A

Bactéries qui transforment l’acide nitreux et les nitrites en acide nitrique (HNO3) et en nitrates (N03-).

28
Q

Qu’est ce que les bactéries réorganisatrices?

A

Bactéries qui transforment l’azote gazeux en azote organique.

29
Q

Qu’est ce que les bactéries réorganisatrices?

A

Bactéries qui transforment l’azote gazeux en azote organique.

30
Q

Que font les cyanobactéries?

A

Bactéries qui fixent l’azote atmosphérique.

31
Q

Bactéries qui transforment l’acide nitreux et les nitrites en acide nitrique (HNO3) et en nitrates (N03-).

A

bactéries nitriques?

32
Q

Bactéries qui transforment l’azote gazeux en azote organique.

A

bactéries réorganisatrices

33
Q

Bactéries qui fixent l’azote atmosphérique.

A

cyanobactéries

34
Q

Bactéries dénitrificatrices

A

Bactéries qui transforment les nitrates (NO3-) en Azote gazeux.

(lorsqu’il y a un manque d’oxygène)

35
Q

Bactéries dénitrificatrices

A

Bactéries qui transforment les nitrates (NO3-) en Azote gazeux.

(lorsqu’il y a un manque d’oxygène)

36
Q

Bactéries qui transforment les nitrates (NO3-) en Azote gazeux.

(lorsqu’il y a un manque d’oxygène)

A

Bactéries dénitrificatrices

37
Q

Qu’elles sont les facteurs qui influencent les bactéries?

A

L’aération (besoin d’O2)

La teneur en eau du sol (si trop=> anaérobie, si pas assez, faible activité. Idéal= 60% de la capacité au champs)

La température (21 à 38 degrés C)

Le pH (entre 6 et 8)

La présence de calcium échangeable pour neutraliser les acides produits.

La matière organique, qui est source de carbon pour les bactéries hétérotrophes.

38
Q

Qu’est ce que les actinomycètes?

A

Ce sont des bactéries (pas de vrai noyau cellulaire, taille de 1 à 1,5 μm) mais d’aspect ramifié comme les champignons, donc de forme mycélienne. Le genre le plus fréquent est celui des Streptomycètes. Les actinomycètes se composent de plusieurs hyphes qui contiennent des chromosomes et ont une forme d’organisation primitive de pluricellulaires. Hétérotrophes, ils vivent en milieu humide, chaud et aéré, sur la matière organique en décomposition ou sur des composés produit par les plantes. Ils sont sensibles à l’acidité (pH optimum : 6 à 7,5) et tolèrent de fortes températures (50°C). Ils dégradent des matières organiques difficilement décomposables (cellulose, lignine, humus stable, chitine et phospholipides). Plusieurs produisent des antibiotiques (actinomycine, néomycine, streptomycine) qui détruisent d’autres microorganismes, ainsi que des vitamines. Il est important de noter qu’une grande partie de l’azote des écosystèmes forestiers provient de la transformation de l’azote atmosphérique en ammonium (N2 → NH4+) par les actinomycètes (association symbiotique Frankia - aulne).

39
Q

Qu’est ce que les archées?

A

C’est le groupe de microorganismes le moin connu. Ce sont des procaryotes unicellulaires dont la taille ressemble à celle des bactéries (peut etre plus gros). Ils possèdent toutefois des caractéristiques uniques qui les distinguent des bactéries (différences au niveau génétique et au niveau de la paroi cellulaire)

40
Q

Qu’elle est le role des archées?

A

Les archées sont impliquées dans différents cycles biogéochimiques, comme ceux du carbone et de l’azote. Bien que plusieurs de ces implications se produisent dans des milieux extrêmes, il a été démontré que les archées jouent aussi un rôle dans ces cycles dans les sols forestiers et agricoles.

41
Q

Comment classe-t-on les mycètes (la flore fongique)?

A
  1. Selon la taille

Macromycètes: visibles à l’œil nu par leur appareil reproducteur (champignons à chapeau).
Micromycètes: souvent peu visibles à l’œil nu (rouilles, levures et moisissures).

  1. Selon les spores

Basidiomycètes: spores formées à l’extrémité de cellules spécialisées, les basides [Ex: champignons à chapeau (cèpes, bolets, agarics)].

Ascomycètes: spores formées à l’intérieur d’asques (cellules reproductrices) [Ex : morilles, truffes, levures (boulangerie) et certaines moisissures].

42
Q

Qu’est ce que les mycorhizes?

A

Les mycorhizes sont non spécifiques et peuvent coloniser différentes plantes. Elles produisent un réseau d’hyphes qui peut augmenter la surface de contact racine-sol d’environ 400 fois. Elles sont de deux types (figure 4.5) soit :

Endotrophes (mycorhizes à vésicules): Elles pénètrent à l’intérieur des cellules corticales des racines de plusieurs espèces d’herbacées (légumineuses sauf le lupin, graminées, oignons, poireaux).

À noter qu’elles sont non utilisables avec les crucifères et les chénopodiacés (betterave, épinard) qui forment peu ou pas de symbiose mycorhizienne.

Ectotrophes: Elles forment des manchons mycéliens autour des radicelles des arbres forestiers

43
Q

Qu’est ce que les algues microscopiques?

A

Les algues microscopiques sont unicellulaires alors que les formes géantes sont multicellulaires et s’apparentent aux plantes supérieures. Les algues contiennent de la chlorophylle et sont capables de photosynthèse (algues vertes). Elles ont donc besoin de lumière et sont plus abondantes près de la surface du sol (0-2 cm). Les algues interviennent dans la fixation du CO2 (39 mg de C/m2/h) et de l’azote (28 kg/ha/an). Elles se répartissent dans le sol en trois groupes :

Les algues vertes ou chlorophycées (sol acide et humide);
Les algues jaunes vertes (xanthophycées);
Les diatomées (sol bien drainé et riche en matière organique).

44
Q

Qu’est ce que l’humus?

A

L’humus comprend tous les composés organiques simples ou complexes, isolés ou associés entre eux ou avec la phase solide minérale. Ces composés organiques d’origine végétale, animale ou microbienne sont aussi en transformation perpétuelle. Il faut cependant préciser que dans les sols cultivés, l’apport végétal (racines, paille, résidus, engrais verts, fumier) constitue la plus grande partie de cette matière organique.

45
Q

Qu’est ce que la cellulose?

A

La cellulose contenue dans les résidus végétaux se décompose assez facilement et représente environ 2% de la matière organique totale dans le sol. Cependant, elle constitue 15 à 30% du feuillage et 30 à 50% du tronc et des branches des plantes supérieures. Elle se compose de chaînes parallèles (aliphatiques) constituées d’une succession de molécules de glucose et reliées par des liaisons hydrogènes. Ces chaînes se combinent et forment des microfibres qui ralentissent la dégradation microbienne. La cellulose se décompose assez facilement, à condition que les conditions d’aération, de pH, de température et de contenu en azote soient optimales.

46
Q

Qu’est ce que l’hémicellulose?

A

On parle des hémicelluloses (au pluriel) parce que c’est un groupe hétérogène de composés, qui sont des polymères de sucres autres que le glucose, comme des hexosanes [hémicelluloses avec hexoses (sucres à 6 carbones) → mannose, galactose], et des pentosanes [hémicelluloses avec pentoses (sucres à 5 carbones) → xylose, arabinose].

47
Q

Qu’est ce que la lignine?

A

Les lignines font partie des composés aromatiques d’importance dans les sols. On parle encore ici de lignines (au pluriel) parce que leur composition varie selon la source (bois dur ou bois mou). L’unité de base de la lignine est le phényle propane, dont la structure générale est

48
Q

Qu’est ce que les lipides?

A

Les lipides sont facilement dégradés dans les sols. Ce sont des composés solubles dans les solvants organiques ou dans un mélange de solvants organiques, mais très peu solubles dans l’eau. On retrouve des lipides simples (ex: acides gras) et des lipides complexes (ex: stérols, terpènes, hydrates de carbone polyaromatiques, chlorophylle, gras, cires, résines). Traditionnellement, le contenu en lipides de la matière organique est déterminé par la méthode de Waksman: extractions séquentielles avec de l’éther (gras et cires) et de l’alcool (résines)

49
Q

Qu’est ce que la minéralisation?

A

C’est la fragmentation de la matière organique fraiche par la microfaune et la microflore.

Il y a d’abord une phase de croissance microbienne (dégagement de chaleur, de Co2)

Il y a ensuite une phase de décroissance microbienne et les elements nutritifs organiques ou minérals sont relachés sous forme de molécules simples.

50
Q

Qu’est ce que l’humification?

A

C’est l’ensemble des processus qui permet de stabiliser la matière organique et de créer un humus stable. Ce sont les deux théories de l’huminication qui permettent d’expliquer pourquoi la matière organique s’accumule dans les sols.

Une des théories implique la formation de macromolécules humiques, qui seraient des molecules très complexe dont on ne connait pas la structure et qui seraient difficilement dégradable.

L’autre théorie indique plutôt que la stabilisation de la matière organique est causé par la formation d’agrégats de biomolécules simples.

51
Q

Qu’est ce que l’acide humique?

A

= Fraction extraite avec une solution alcaline qui précipite à pH < 2.

52
Q

Qu’est ce que l’acide fulvique?

A

Fraction extraite avec une solution alcaline et qui reste en solution même en conditions acides

53
Q

Qu’est ce que l’humine?

A

Fraction qui ne peut pas être extraite.

54
Q

Qu’elles sont les différences entre l’acide humique et fulvique?

A

L’acide humique a une plus forte teneur en carbon

L’acide fulvique a une plus haute teneur en oxygène

L’acide fulvique est plus acide

Les acides humiques ont une plus grande taille

55
Q

Quel est l’avantage et le défaut du modèle d’agrégation (humification)?

A

il permet de ne pas avoir affaire avec des molécules mystérieuse.

Il ne permet pas de montrer pourquoi les substances humiques sont très résistantes à la dégradation (les macromolécules humiques explique ca). Par contre, on peut remédier à ce problème si on considère que la dégradation de la fraction humique du sol est causé par l’environnement biotique et abiotique de ce sol.

56
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’humus?

A

Il peut retenir jusqu’a 15 fois sa masse en eau.

Les groupes fonctionnels acides crées des charges variables negatives qui contribuent à la CEC

Des groupes fonctionnels basiques peuvent aussi parfois créer des charges positives qui contribuent à la CEA.

L’humus protège les argiles (particules fines) contre la dispersion et stabilise la structure du sol en formant avec les argiles, un ciment qui permet la construction d’agrégats solides résistants à la dégradation par l’eau. Les argiles et l’humus, étant tous les deux électronégatifs, forment un complexe par l’intermédiaire des ions Ca2+, Fe3+, etc., et par fixation directe de l’humus sur certaines charges positives des argiles. C’est ce qu’on appelle le complexe argilo-humique

57
Q

Pourquoi est ce que le rapport C/N est important?

A

Si le contenu en azote total est faible, les microorganismes manqueront d’azote et entreront en compétition les uns avec les autres, mais aussi avec les plantes, pour la faible quantité d’azote assimilable qui reste dans le sol. C’est ainsi que l’apport de fumier frais contenant beaucoup de paille (C/N ~ 80) peut engendrer une carence en azote, que l’on peut éviter en apportant simultanément de 6 à 12 kg d’azote par tonne de paille enfouie.

Si le rapport C/N est très faible, il y a une forte minéralisation de l’azote car il est en abondance ( pas tout consommé par les microorganismes)

Si le rapport C/N est très élevé, les c’est la situation expliqué plus haut. L’azote est immobilisé par les microorganismes et il est peu disponible pour les plantes.

58
Q

Qu’est ce que le coefficient isohumique?

A

Il correspond au rendement d’un produit en humus par rapport à sa matière sèche.

Il permet de connaître la quantité d’humus qui résultera de l’épendange d’un certain engrais organique.

59
Q

Le rapport C/N de l’humus varie entre quoi et quoi?

A

Entre 10 et 12

60
Q

Combien y a t il d’espèces de vers connues sur terre?

A

1800