Chapitre 2B - Cycles biogéochimiques : le carbone Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’un cycle biogéochimique?

A

Circulation des éléments d’un milieu à l’autre et d’une forme à l’autre, influencé par des processus biologiques, chimiques et géochimiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quels sont les éléments faisant partie des molécules complexes essentielles à la vie?

A
Carbone
Azote
Phosphore
Fer
Soufre
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quels sont les réservoirs du cycle du carbone?

A
Atmosphère
Océans (hydrosphère)
Roches calcaires
Carbone fossile
Biomasse morte, humus
Biomasse
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quel est le réservoir le plus important de carbone?

A

Lithosphère

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Sous quelle forme se trouve le carbone dans les roches calcaires?

A

Carbonate de calcium

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quel est le 2e plus important réservoir de carbone et sous quelle forme est le carbone dans ce réservoir?

A

Océans et carbone pour forme H2CO3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quel réservoir de carbone est le moins important, mais est aussi celui qui a le plus d’échanges?

A

Atmosphère

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quel échange de carbone n’est pas supposé exister, mais existe à cause des humains?

A

Échange à partir du carbone fossile vers l’atmosphère

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Qu’est-ce qu’un réservoir?

A

Endroit où s’accumule la plus grande quantité de la molécule du cycle biogéochimique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quelles sont les réactions aérobies de dégradation des composés carbone?

A

Respiration

Méthanotrophie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Quelles sont les réactions anaérobies de dégradation des composés carbone?

A

Méthanotrophie
Fermentation
Accumulation (lipides et autres, pas vraiment une réaction en soi?)
Méthanogenèse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

En quoi est fixé le CO2?

A

En matière organique (biomasse)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quel type d’organismes font la fixation du carbone?

A

Autotrophes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Qu’est-ce que la production primaire?

A

Fixation de CO2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vrai ou faux : dans la plupart des environnements, il y a à peu près autant de fixation que de respiration?

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quel environnement se démarque des autres en respirant plus qu’il ne produit?

A

Forêt tropicale

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Quel environnement se démarque des autres en fixant plus qu’il ne produit?

A

Plateaux continentaux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Est-ce que les microorganismes ont un rôle important dans la fixation par rapport aux plantes?

A

Oui, en milieu océanique, la fixation se fait presque uniquement par des microorganismes et la fixation en milieu océanique compte pour environ 50% de la fixation totale de carbone

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Sur un environnement terrestre, est-ce que ce sont les plantes ou les bactéries qui fixent plus de carbone?

A

Plantes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Quel est le ratio de fixation de carbone des environnements terrestres vs environnements océaniques?

A

Environ 50/50

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vrai ou faux : Les microorganismes en milieu océaniques sont plus efficaces que les plantes pour fixer du carbone.

A

Faux : ils sont moins efficace

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Pourquoi la fixation par des microorganismes en milieu océanique compte pour 50% de la fixation totale de carbone s’ils sont moins efficaces que les plantes?

A

Car ils prennent beaucoup plus d’espace, les océans recouvrent 70% de la surface terrestre, ce que les microorganismes perdent en efficacité, ils le gagnent en espace (abondance de microorganismes)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Qu’est-ce que la respiration anaérobie?

A

Production de CO2 suite à la consommation de molécules organiques par les hétérotrophes (consommateurs)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Comment nomme-t-on les microorganismes qui font de la respiration anaérobie?

A

Consommateurs et décomposeurs (organismes supérieurs et microorganismes hétérotrophes)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Qu’est-ce que la minéralisation?

A

Dégradation complète d’un substrat en molécules inorganiques (ex : CO2 et H2O)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Une molécule organique est-elle déminéralisée si à la fin de ;a dégradation, il ne reste que du CO2 (ou CO) et de l’eau?

A

Oui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Nommer les étapes globales du processus de respiration aérobie, avec substrats/produits et nom des réactions.

A

Carbohydrates dégradés en monosaccharides (glucose) –> Monosaccharides transformés en pyruvate et acétyl-CoA par la glycolyse –> Pyruvate et Acétyl-CoA transformés en CO2 par cycle de Krebs (CAC) et chaîne de transport des électrons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Qu’est-ce que la méthanogénèse?

A

Production de méthane (CH4) à partir de matière organique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Quels organismes font la méthanogénèse?

A

Archées anaérobies obligatoires

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Quels sont les 3 types de réactions menant à la méthanogénèse?

A
  1. Autotrophe (fixation du CO2 à l’aide de H2)
  2. Substrat : méthanol
  3. Substrat : acétate
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Donner la réaction chimique de méthanogénèse autotrophe.

A

4 H2 + CO2 –> CH4 + 2 H20 + énergie via force proton motrice (environ 1 ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Donner la réaction chimique de méthanogénèse ayant comme substrat le méthanol.

A

4 CH3OH –> 3 CH4 + CO2 + 2 H2O + énergie via force proton motrice (environ 4 ATP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Quelle molécule est utilisée comme accepteur final d’électrons lorsque la méthanogénèse est autotrophe et en quoi cette molécule est-elle réduite?

A

CO2

Réduit en CH4+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Donner la réaction chimique de méthanogénèse ayant comme substrat l’acétate.

A

Acétate- + H+ –> CO2 + CH4 + énergie via force proton motrice (peu)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Quelle réaction de méthanogénèse donne le plus d’énergie (ATP)?

A

Méthanogénèse ayant comme substrat le méthanol

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Les archées méthanogènes peuvent-elles utiliser d’autres substrats que le méthanol et l’acétate?

A

Non, elles sont limitées par ces petits substrats organiques

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Le méthanol et l’acétate sont-elles des molécules que l’on retrouve souvent dans l’environnement?

A

Non

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Puisque les molécules d’acétate et de méthanol ne sont pas des molécules que l’on retrouve souvent dans l’environnement, comment les archées se procurent-elles ces composés?

A

Elles vivent en association avec d’autres microorganismes qui vont dégrader les substances (faire le gros de la job) (mo qui dégradent glucose en anaérobie qui libère petites molécules organiques comme acétate : acétate utilisé par les archées vivant en communauté avec ces mo)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Où a lieu la méthanogénèse?

A

Dans des niches spécifiques : marais, zones humides, décharges, rumen
(endroits riches en composés carbone et anaérobies)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Pourquoi le rumen des vaches est-il un environnement parfait pour la méthanogénèse?

A

Car c’est un environnement anaérobie et on y retrouve plusieurs produits de dégradation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Sur quel phénomène environnemental important le méthane a-t-il un grand effet?

A

Réchauffement climatique : 2e gaz en importance et capte 22 fois + la chaleur que le CO2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Pourquoi une décharge peut-elle être potentiellement dangereuse?

A

Car même si elle est couverte, les processus de fermentation et dégradation sont toujours en cours
Il peut y avoir beaucoup de méthanogènes et relâchement de méthane
Méthane explosif à une concentration de 5% : il peut y avoir une explosion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Qu’est-il important de faire à une décharge pour qu’elle n’explose pas?

A

Bien l’aérer avec puits de ventilation pour que le méthane produit puisse ventiler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Qu’est-ce que la méthanotrophie?

A

Utilisation du méthane comme source de carbone et d’énergie par les méthanotrophes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Quels sont les 2 types de microorganismes méthanotrophes?

A

1 : bactéries aérobie strictes

2 : archées (en consortium avec des bactéries)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Comment les bactéries aérobies strictes font-elles la méthanotrophie?

A

Elles oxydent le méthane par l’oxygène

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

Nommer la réaction de méthanotrophie par les bactéries aérobies strictes.

A

CH4 + O2 –> CH3OH –> HCHO –> HCOOH –> CO2 + H2O

1 niveau d’oxydation de plus à chaque étape

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

Quelle est la première enzyme de la réaction de méthanotrophie par les bactéries aérobies strictes?

A

Méthane oxygénase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

Pourquoi la méthane oxygénase est-elle particulière?

A

Elle peut aussi dégrader des composés chlorés comme le trichloroéthène (TCE) : polluant retrouvé dans les sources d’eau
Enzyme intéressante pour la bioremédiation!

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

Qu’est-ce que le AOM?

A

Utilisation (oxydation) anaérobie du méthane

Anaerobic oxydation of methane

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

La AOM fait-elle beaucoup d’énergie?

A

Non

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

Où retrouve-t-on la AOM?

A

Sédiments marins

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

Quels organismes font la AOM?

A

Archées (AMME) en consortium avec des bactéries (qui utilisent autres accepteurs finaux d’électrons que oxygène)

54
Q

Quelle molécule est utilisée comme accepteur final d’électrons lors de la méthanotrophie par les AMME? (en quoi cette molécule est-elle réduite?)

A

Sulfate (réduit en HS-)

55
Q

Nommer la réaction de méthanotrophie par les AMME.

A

CH4 + SO4(2-) + H+ –> CO2 + HS- + 2 H2O

56
Q

Pourquoi la méthanotrophie par les AMME serait-elle importante?

A

Car elle est responsable d’une grande partie de la consommation de méthane produit par les méthanogènes
Ces microorganismes sont collés : échanges facilités

57
Q

Qu’est-ce que la méthylotrophie?

A

Utilisation de composés à 1C (incluant le méthane) : particulièrement le CO

58
Q

Vrai ou faux : les méthylotrophes peuvent aussi être méthanotrophes parfois.

A

Vrai

59
Q

Le CO est excessivement toxique et relâché en grande quantité dans l’environnement, pourquoi cela ne pose-t-il pas de problème?

A

Car sa destruction biotique et abiotique est efficace (ce qui fait que le CO atmosphérique n’augmente pas)

60
Q

Comment détruit-on le CO de façon abiotique?

A

Par des réactions photochimiques dans l’atmosphère (rayons UV détruisent le CO / le rendent instable)

61
Q

Comment détruit-on le CO de façon biotique?

A

Par les bactéries méthylotrophes aérobies ou anaérobies : utilisent le CO malgré sa toxicité

62
Q

Quelles sont les 2 réactions de la méthylotrophie? (et les décrire)

A
  1. Oxydation du CO en CO2 pour synthétiser des molécules organiques (effectuée par chimioautotrophes)
  2. Réduction du CO en méthane (CH4 : méthanogènes anaérobies)
63
Q

Est-ce qu’on peut considérer la biomasse et la biomasse morte comme du sucre pour les bactéries?

A

Non, il peut y avoir des molécules extrêmement difficiles à digérer

64
Q

Où retrouve-t-on des composés biologiques récalcitrants (difficile à dégrader)?

A

Chez les plantes

65
Q

Quels composés difficiles à dégrader retrouve-t-on dans la plante?

A

Lignine
Hémicellulose
Cellulose
Protéines et acides nucléiques

66
Q

Quel polymère dans la plante est le plus facile à digérer?

A

Cellulose

67
Q

Décrire la cellulose.

A

Structure linéaire de glucose tous liés entre eux par des liens bêta 1 –> 4 : structure super stable et homogène

68
Q

Quelles enzymes un microorganismes a-t-il besoin pour digérer la cellulose?

A

Endoglucanases
Exoglucanases
bêta-galactosidases (fragmente oligomères en plus petits fragments

69
Q

Comment nomme-t-on 2 glucoses liés ensemble par un lien bêta 1 –> 4 issus de la dégradation de la cellulose ?

A

Cellobiose

70
Q

La cellulose est insoluble et beaucoup trop grosse pour entrer dans la cellule, comment s’y prend-on pour la dégrader?

A

Excrétion des enzymes pour le dégrader de façon extracellulaire en premier et ainsi glucose, cellobiose et petits oligosaccharides peuvent être inclus dans la cellule : reste de réactions se produisent dans bactéries ou mo eucaryotes

71
Q

Décrire l’hémicellulose.

A

Composée de monosaccharides variés, structure branchée (liens peuvent être différent de bêta 1–> 4), forme irrégulière
Exemple : pectine

72
Q

Pourquoi dégrader de l’hémicellulose est plus difficile que la cellulose?

A

Car ça prend beaucoup d’enzymes (puisque chaque enzyme a sa spécialité et l’hémicellulose est constituée de monosaccharides divers)

73
Q

Pourquoi est-il utile d’avoir une communauté de microorganismes pour digérer l’hémicellulose?

A

Car plusieurs enzymes peuvent être mises en commun dans la communauté puisque les mo sécrètent des enzymes différentes de façon extracellulaire

74
Q

Décrire la lignine.

A

À base de phénylpropène : composé cyclique fait à partir de phénylalanine et tyrosine
Pas homogène : plein de sortes de liens

75
Q

Pourquoi la lignine est-elle beaucoup plus difficile à digérer?

A

Beaucoup de cycles aromatiques avec liens C plus difficiles à digérer

76
Q

Est-ce qu’il existe une enzyme qui peut dégrader entièrement la lignine?

A

Non, seulement partiellement

77
Q

Quels microorganismes peuvent dégrader la lignine?

A

Champignons de pourriture blanche

78
Q

Quelles enzymes contiennent les champignons de pourriture blanche?

A

Lignine peroxydase
Manganese peroxydase
Laccase

79
Q

Pourquoi la dégradation de la lignine par les champignons de pourriture blanche font-elle la réaction en aérobie seulement?

A

Car processus dont la molécule réactive est le peroxyde d’hydrogène (H2O2)

80
Q

Comment la lignine peroxydase clive-t-elle le lien entre 2 unités de phénylpropène?

A

En oxydant le lien à l’aide du peroxyde

81
Q

Pourquoi la lignine peroxydase nécessite-t-elle l’action d’une oxydase?

A

Pour former le peroxyde d’hydrogène nécessaire à la réaction d’oxydation

82
Q

La réaction de dégradation de la lignine produit-elle de l’énergie?

A

Non

83
Q

Pourquoi les champignons dégradent-ils la lignine si cela ne produit pas d’énergie?

A

Pour aller chercher sucres, acides aminés, etc. à l’intérieur du bois

84
Q

Pourquoi la dégradation de la lignine est-elle un exemple de co-métabolisme?

A

Car on fait la réaction, mais cela ne donne pas d’énergie, ne nourrit pas le microorganisme

85
Q

Qu’est-ce que l’humus?

A

Polymère formé durant la décomposition de biomasse
Matière nutritive riche
Plus gros réservoir de carbone des organismes vivants
Structure bordélique

86
Q

Quelle est la première étape de formation du humus?

A

Génération de monomères réactifs (suite à dégradation de lignine par exemple) qui vont polymériser ensemble pour faire du humus

87
Q

Où retrouve-t-on le humus?

A

Dans les sols de surface (entre 1 à 5% : 1% et moins dans climats arrides et jusqu’à 5% dans sols avec bcp plantes)

88
Q

Quel pourcentage du humus est consommé par des mo par année? Quel pourcentage est formé?

A

2 à 5% consommé et aussi 2 à 5% formé : il y a un équilibre

89
Q

Décrire brièvement le processus de dégradation du humus.

A

Semblable au processus de dégradation de la lignine

90
Q

Que sont les mo autochtones? Quel est leur lien avec le humus?

A

Mo avec stratégie de croissance lente, qu’on retrouve toujours dans le sol
Ce sont eux qui dégradent le humus (car réactions lentes qui ne favorisent pas une croissance rapide)

91
Q

Que veut dire BTEX?

A

Benzène, toluène, éthyl benzène, xylene

92
Q

Pourquoi la dégradation de la lignine est un phénomène intéressant à étudier si on veut dégrader des polluants (tels des les HAP (hydrocarbures aromatiques polycycliques) et les BTEX)?

A

Car ces composés ressemblent à la lignine : on pourrait utiliser le processus de dégradation de la lignine pour dépolluer des endroits

93
Q

Quels sont les mo les plus efficaces pour dégrader les substances polluantes ressemblant à la lignine?

A

Champignons de pourriture blanche (réactions de co-métabolisme)

94
Q

Quels sont les deux types de dégradation des contaminants organiques récalcitrants?

A

Contaminant ressemble au substrat normal des réactions
et/ou
Les enzymes de dégradation sont non spécifiques

95
Q

Lorsque le contaminant ressemble au substrat normal des réactions, il sera :
A) Utilisé pour fournir de l’énergie
B) partiellement dégradé par accident et ne fournira pas d’énergie

A

A

96
Q

Lorsque les enzymes qui dégradent le contaminant sont non spécifiques, ce contaminant sera :
A) Utilisé pour fournir de l’énergie
B) partiellement dégradé par accident et ne fournira pas d’énergie

A

B

97
Q

Quels sont les contaminants organiques récalcitrants?

A

HAPs
Biphényles polychlorés
BTEX

98
Q

À quoi peut mener une dégradation incomplète d’un contaminant? Pourquoi la dégradation est souvent incomplète?

A

Peut mener à accumulation de produits de dégradation qui peuvent être toxiques (ou non) dans l’environnement
Dégradation souvent incomplète, car la dégradation nécessite plusieurs enzymes à la fois, si les mo commencent la dégradation, mais ne possèdent pas certaines enzymes : arrêt de la dégradation

99
Q

Quels sont les facteurs limitant la dégradation des contaminants organiques dans un écosystème?

A
Potentiel génétique de la population
Toxicité du composé
Biodisponibilité (dans eau et sol)
Structure du contaminant
Facteurs environnementaux
100
Q

En quoi le potentiel génétique de la population microbienne limite la dégradation des contaminants organiques?

A

Il faut que communauté microbienne encode pour les enzymes de dégradation appropriées et que les gènes de ces enzymes soient exprimées

101
Q

En quoi la toxicité du composé limite la dégradation des contaminants organiques? Donner un exemple.

A

Le contaminant pourrait tuer la population microbienne avant qu’il soit dégradé
Exemple : hydrocarbures qui nuisent à la membrane : nuit à bonne santé microbienne
***Notion de toxique est en rapport avec la concentration (si elle est trop élevée)!!

102
Q

Qu’est-ce que la biodisponibilité du contaminant?

A

Accessibilité du contaminant par les microorganismes

103
Q

Vrai ou faux : les contaminants solubilisés dans l’eau sont biodisponibles, accessibles sans problème.

A

Vrai

104
Q

Comment les mo vont-ils chercher les contaminants insolubles dans l’eau pour les dégrader?

A

Par contact direct (bactérie vient s’attacher dessus pour le dégrader)
Utilisation de biosurfactants (liquides non-polaires : permettent de solubiliser dans l’eau)

105
Q

Comment les mo peuvent-ils avoir accès aux contaminants dans le sol?

A

Contact direct

Utilisation de substrat solubilisé (eau solubilise contaminant)

106
Q

De quoi dépend beaucoup la décontamination dans les sols?

A

De la présence d’eau pour solubiliser les contaminants pour que la bactérie y ait accès

107
Q

Pourquoi la structure chimique limite-t-elle la dégradation des contaminants organiques?

A

Des structures peuvent être plus difficiles à dégrader : si c’est ramifié/branché
(beaucoup d’encombrement stérique, enzymes ne peuvent pas se rendre pour faire leur action et le transport à l’intérieur de la cellule est difficile)

108
Q

Pourquoi les facteurs environnementaux limitent la dégradation des contaminants organiques?

A

Car plusieurs facteurs environnementaux favorisent le métabolisme optimal des mo (ex : pH, température, nutriments, etc)

109
Q

Qu’est-ce qu’un composé xénobiotique?

A

Composés de synthèse produits par l’homme, inconnus des microorganismes

110
Q

Donner des exemples de composés xénobiotiques. Lesquels ne peuvent pas se faire dégrader par les mo?

A
Pesticides
Colorants alimentaires
Solvants de nettoyage
Antibiotiques
Explosifs
Nylon *
Polystyrène *
Téflon *
* = peuvent pas se faire dégrader par mo
111
Q

Quelles sont les adaptations possibles des mo aux composés xénobiotiques?

A

1 : Mutations aléatoires qui leur permet de devenir résistantes aux composés
2 : Mutations qui augmentent la capacité des mo de décomposer le composé
3 : Acquisition de gènes d’autres membres de l’environnement : permet d’établir une voie de dégradation (mo vont chercher d’autres enzymes par transfert horizontal de gènes)

112
Q

Dans quels cas la dégradation des composés xénobiotiques pourrait être un avantage?

A

1 : éliminer la pollution
2 : éliminer les substances dangereuses
3 : bioremédiation

113
Q

Est-ce que la structure chimique permet de dire si un composé xénobiotique sera dégradé?

A

Non, par exemple : DDT et 2,4,5-T se ressemblent chimiquement, mais DDT n’est pas dégradé et 2,4,5-T l’est

114
Q

Quelle enzyme est importante pour enlever les atomes de chlore (ou atomes halogènes) souvent présent dans les composés xénobiotiques?

A

Déhalogénase : enlève des atomes halogènes (dont le chlore)

115
Q

Dans quel cas la dégradation de composés xénobiotiques est un inconvénient?

A

Dans les cas ou le composé xénobiotique est un médicament

116
Q

Nommer deux composés xénobiotiques dont la dégradation est un inconvénient.

A

Digoxin

Irinotécan

117
Q

Expliquer pourquoi la dégradation de la digoxin est un inconvénient.

A

Allolactone dans la structure du composé est essentiel à la fonction de la molécule, mais la bactérie Eggerthella lenta (bactérie dans flore intestinale de 5% des gens) réduit l’allolactone et rend la thérapie non fonctionnelle

118
Q

Expliquer pourquoi la dégradation de l’Irinotécan est un inconvénient.

A

Médicament de traitement pour le cancer
Médicament donné sous forme inactive (CPT11), activé dans les tissus (SN-38)
Dans le foie, ajout d’un acide glucuronique : rend Irinotécan inactif (SN-38-G)
Irinotécan inactif (SN-38-G) se rend dans l’intestin et bactéries de système digestif enlèvent acide glucuronique et rend la molécule active : donne grande concentration de molécule chimique active dans intestin : tue cellules épithéliales de l’intestin

119
Q

Comment peut-on remédier au problème avec l’Irinotécan?

A

Donner un antibiotique qui diminue la flore intestinale (diminue effet sur la molécule)
Inhibiteur des glucuronidases (qui clivent acide glucuronique)

120
Q

Quels types de réactions sont effectuées sur les molécules xénobiotiques?

A

Utilisés comme accepteurs d’électrons : ils sont réduits (ex : digoxin)
Utilisés pour fournir de l’énergie : ils sont hydrolysés (ex : Irinotécan)

121
Q

Complétez la phrase avec «bactéries» et «mycètes» : Généralement, les communautés dominées par les oligotrophes sont formées par des ______ (1) et les communautés dominées par des copiotrophes sont dominées par des ______ (2).

A

(1) : mycètes

(2) : bactéries

122
Q

Que se passe-t-il si le niveau de CO2 augmente?

A

1 : on augmente la biomasse des plantes

2 : augmente carbone relâché par les plantes dans le sol

123
Q

Si l’azote est limitant dans le sol, les communautés seront dominées par les oligotrophes (car si N limitant, on ne peut pas pousser vite). Que se passera-t-il avec le carbone dans le sol avec ces communautés?

A

Le carbone sera séquestré, car les mycètes font des structures (ramifications structurées) qui retiennent le carbone (entre dans structure des champignons) et les mycètes ne l’utilise pas tant pour le respirer (donc plus retenu)

124
Q

Si l’azote n’est pas limitant dans le sol, les communautés seront dominées par les copiotrophes (car si N pas limitant, on peut pousser vite). Que se passera-t-il avec le carbone dans le sol avec ces communautés?

A

Grand relâchement de CO2 dans atmosphère car mo respirent bcp : diminue la séquestration de carbone

125
Q

Est-ce que l’on peut prédire la séquestration du carbone dans les sols seulement en sachant si les sols sont riches ou pauvres en azote?

A

Non, beaucoup d’autres facteurs entrent en jeu

126
Q

Quels sont les autres impacts des changements climatiques? (à part l’augmentation de CO2 dans l’atmosphère)

A

(1) Augmentation de la température : température augmente donc généralement mo + actifs : + de respiration : cela affecte les communautés à long terme, les mo moins adaptés à une hausse de température vont s’en aller alors que d’autres vont plus se développer : difficile de prédire la séquestration du carbone car on sait pas si la nouvelle communauté va respirer plus ou moins
(2) Variations au niveau des précipitations : comment cela va affecter les communautés? Dûr à prédire…

127
Q

L’augmentation de méthane dans l’atmosphère est dûe aux microorganismes. Pourquoi en fait, elle serait plutôt indirectement dûe aux humains?

A

Car les mo sont attribuables à l’humain (ils sont là à cause de l’humain)
Exemple : mo dans cultures de riz qui sont des gros producteurs de méthane ou dans les élevages d’animaux

128
Q

Est-ce que les méthanotrophes arrivent à tout transformer le méthane en CO2?

A

Non, il y en a quand même beaucoup qui est relâché dans l’atmosphère

129
Q

À quels endroits y aura-t-il augmentation de la méthanogénèse avec l’augmentation de la température puisque les enzymes seront plus actives?

A

Marais et pergélisol

130
Q

Dans les sols secs, il y a plus d’oxygène (puisqu’il y a moins d’eau), quel sera l’effet sur la méthanogénèse et la quantité de méthane libéré et pourquoi?

A

Diminution de la méthanogénèse car c’est un processus anaérobie (mais plus de méthanotrophie) et donc moins de méthane libéré

131
Q

Le réchauffement climatique aura quel effet sur la quantité de méthane dans l’atmosphère?

A

On ne peut pas prédire (comme avec le CO2) si on regarde la biosphère au complet, car des endroits vont libérer plus de méthane avec l’augmentation de la température (pergélisol qui font, marais, etc) et d’autres endroits vont libérer moins de méthane puisqu’ils sont plus secs et mieux oxygénés