Chapitre 20: ARN régulateur

Question 1

Qu’est-ce que des RNAs?

Answer 1

small RNA

Question 2

Expliquer l’exemple de l’ARN 6S (comment et quand?).

Answer 2

Chez E.Coli, il se fixent au facteur sigma70.

Effet sur les gènes:
Diminution de l’expression, car sigma70 ne sera pas plus dispo. C’est une séquestration du facteur sigma.

Quand:
[6S] augmentent en situation de stress (comme en phase stationnaire de croissance, moins de nutriments et arrêt de croissance cellulaire) pour garder le plus d’énergie possible -> ne pas produire toutes ses protéines

Question 3

De quelles manières les ARNs peuvent-ils réguler?

Answer 3

1. Destruction ARNm
2. Inhiber initiation traduction
3. Stimuler traduction

Question 4

Vrai ou faux: les ARNs agissent en trans.

Answer 4

Vrai.

Question 5

Expliquer l’inhibition et la stimulation de la traduction par les riboswitch.

Answer 5

Lieu de liaison des ribosomes: séquence RBS (ribosome binding site) sur ARNm pour initier traduction

Inhibition: quand RBS est dissimulée par autre ARNs -> inhibition traduction
Stimulation: quand un ARNs se lie à une partie du ARNm qui autrement se lierait au RBS et le dissimulerait, donc RBS dévoilé

Question 6

Quel composé aide la fixation des ARN?

Answer 6

Protéine Hfq permet de stabiliser interactions entre ARN régulateurs et séquences où ils se fixent (parce que complémentarité des bases n’est pas à 100%)

Question 7

Qu’est-ce qu’un riboswitch?

Answer 7

Type d’ARN régulateur agissant principalement en cis et dont la structure est en tige-boucle. Inhibent ou activent.

-Stimuli: changement de [ ] de petites molécules

Fonctionnement

1. Fixent les petites molécules
2. Changement de conformation (structure secondaire)
3. Peut aller réguler son gène cible -> inhiber ou activer

Question 8

Où sont retrouvés plus fréquemment les riboswitch?

Answer 8

Dans la région 5’ utr (untranslated region) -> région non codante avec plusieurs séquences régulatrices

Question 9

De quoi sont composés les riboswitch?

Answer 9

1. Région aptamère: qui lie petite molécule (ligand)

2. Plateforme d’expression: contient séquence RBS

Question 10

De quelles manières les riboswitch régulent-ils?

Answer 10

1. Atténuation: terminaison de la transcription par la production d’une terminateur (tige-boucle amenant terminaison précoce)
2. Initiation de la traduction: séquestration de RBS

Question 11

Qu’est-ce que l’opéron tryptophane?

Answer 11

5 gènes (noms et rôles pas importants) qui synthétisent le tryptophane.

Question 12

Quelle est la régulation la plus courante chez les opérons?

Answer 12

Atténuation.

Question 13

Quelles sont les régulations chez l’opéron tryptophane?

Answer 13

Double régulation: atténuation et répression.

Question 14

Quel est le répresseur de l’opéron trp?

Answer 14

TrpR. Il est actif lorsque les niveaux de tryptophane sont élevés.

Question 15

Que se passe-t-il lorsque les niveaux de trypto sont élevés?

Answer 15

Atténuation (pas par un riboswitch)

1. Ribo passe vite sur 1-2 (car ARNt chargés par trypto sont abondants)
2. Formation tige-boucle entre 3-4: terminateur

Résultat: pas de transcription

Question 16

Que se passe-t-il lorsque les niveaux de trypto sont faibles/limitants?

Answer 16

Traduction complétée.

1. Pas d’ARNt chargés de trypto alors ribosome fait une pause à région 1
2. Cela laisse le temps 2 et 3 de se lier -> antiterminateur

Résultat: synthèse des enzymes pour trypto

Question 17

Pour quoi code la séquence leader?

Answer 17

Un peptide (pas prot, pas d’activité: un ORF (open reading frame). La séquence contient 2 codons tryptophane qui se suivent

Question 18

Quelles sont les combinaisons possibles dans la séquence leader?

Answer 18

1-2: pause transcription
2-3: formation antiterminateur
3-4: formation terminateur

Question 19

Où se situe la séquence leader?

Answer 19

Entre le promoteur et le 1er gène de l’opéron.