Chapitre 18 - Les virus d'eucaryotes Flashcards
Bref survol de l’ensemble du cours
1) Différences en terme de morphologie, de cycles comparés au phages.
2) Similarités dans la x: adsorption, pénétration, réplication ANv, synthèse des protéines virales, assemblage des capsides et libération de virus, altérations de membranes, inclusions
3) Infection: rapide ou chronique, latentes, parfois mettent des années avant de se développer
4) Cancer: introduction d’oncogènes, ou des éléments interférant sur le processus de régulation de la transcription qui stimulent des oncogènes ou transformer des cellules normales en cellules cancéreuses.
5) Virus végétaux: virus à ARN la plus part. Les insectes sont les agents de transmissions de maladies végétales.
6) Virus à insectes: promesse dans la lutte contre les insectes?
7) Agents plus simple que les virus:
a) Viroïdes: courte chaîne d’ARN infectieux: maladies végétales
b) Virusoïdes: ARN infectieux a besoin d’un virus pour pouvoir pénétrer dans une cellule.
c) Prions: particules protéiques associées à des neuropathies dégénératives humaines et animales.
Introduction
- On a vu Virus des bactéries et archés: importants dans le domaine de la biologie moléculaire la génétique.
- Ici virus des eucaryotes avec emphase sur les virus de vertébrés du fait de l’implication des virus dans de nombreuses maladies humaines.
- Agents infectieux moins connus encore plus simple que les virus: viroïdes, virusoïdes et prions.
Classification des virus d’Eucaryotes
-Des 6000 virus connus la plupart infectent des Eucaryotes
-Classement: Comité international de taxinomie des virus (CITV ou ICTV) basé sur:
I) La structure du génome (diversité de génome, acides nucléiques simple, double brin circulaire, ou linéaire)
II) La morphologie (virus nus ou enveloppées)
III) La stratégie de réplication
IV) La parenté génétique
Voir fig.18.1, 18.2, 18.3
ADNdb
- Adénoviridae
- Asfarviridae
- Poxviridae
- Iridoviridae
- Herpesviridae
- Polyomaviridae
- Papillonmaviridae
ADNdb (RT)
-Hepadnaviridae
ADNsb
- Circoviridae
- Paroviridae
ARNdb
- Réoviridae
- Birnaviridae
ARNsb (-)
- Orthomyxoviridae
- Rhabdoviridae
- Paramyxoviridae
- Bornaviridae
- Arenaviridae
- Bunyaviridae
- Filoviridae
ARNsb (RT)
-Rétroviridae
ARNsb (+)
- Caliciviridae
- Picornaviridae
- Nodaviridae
- Togaviridae
- Astroviridae
- Flaviviridae
- Coronaviridae
- Arteriviridae
ADNdb, envéloppée, iscosahédral formé dans noyau
Famille Herpesviridae
- Varicella-zoster (chicken pox)
- Epstein-Barr
ADNdb, envéloppée, complex, formé dans le cytoplasme
Famille Poxviridae
- Orthopoxvirus (smallpox)
- Avipoxvirus (poules)
ADNdb, envéloppé, helical formé dans le noyau
Famille Baculoviridae
ADNdb, nue, iscosahédral, formé dans le noyau
Famille Papovaviridae
-Papillomavirus
-Polyomavirus
Famille Adénoviridae
ADNdb, nue, iscosahédral, formé dans le cytoplasme
Famille iridoviridae
-Virus “African swine/fièvre”
ADNsb, nue, iscosahédral, formé dans le noyau
Famille Paroviridae
-Parovirus
ARNdb, nue, iscosahédral, formé dans le cytoplasme
Famille Reoviridae
-Rotavirus (diarrhée)
ARNsb, (+), envéloppée, iscosahédral, formé dans le cytoplasme
Famille Togaviridae
- Flavivirus (yellow fever)
- Rubivirus (humains, rubella)
- Pestivirus (cochons)
ARNsb, (+), envéloppée, helical, formé dans le cytoplasme
Famille coronaviridae
-Bronchitis
ARNsb (+), nue, iscosahédral formé dans le cytoplasme
Famille picornaviridae
- Enterovirus (polis)
- Rhinovirus (cold)
- Hepatovirus (Hepatitis A)
Famille Calciviridae
- Exanthema vasculaire des cochons
- Virus Norwalk
- Hepatitis E
ARNsb, (+), formation d’un intermédiaire durant réplication, envéloppée, iscosahédral, formé dans le cytoplasme
Famille retroviridae
-VIH
ARNsb, (-), envéloppé, Hélicoidale, formé dans le cytoplasme
Orthomyxoviridae -La grippe Rhabdoviridae -Lyssavirus (la rage) Bunyaviridae -Virus encephalite de californie Arenaviridae -Virus lassa (fièvre hémarrogie) Paramyxoviridae -Paramixovirus (infections respiratoires (mumps) -Pneumovirus (pneumonie) -Morbillivirus (measles)
Multiplication des virus de vertébrées
- Adsorption de virions
- Pénétration et décapsidation
- Réplication du génome et la transcription de la synthèse protéique des virus à ADN
- Réplication du génome et la transcription de la synthèse protéique des virus à ARN
- Synthèse assemblage des capsides virales
- Libération de virions
Adsorption
- Résultat d’une interaction entre l’hôte et le virus. Il y a une spécialisation hôte-virus (appelé le tropisme).
- Les récepteurs de l’hôte servent à plusieurs fonctions physiologiques normales (voir tableau 18.1)
- Superfamille des Immunoglobulines (impliquées dans les réponses immunitaires) et les interactions cellulaires: ex récepteur CD4 du virus du SIDA.
- Des fois le virus peut avoir 2 ou plusieurs récepteurs
La rage
-La virus a besoin de passer à travers la peau. Transmis si l’animale est mordu. Plus commun chez les carnivores. -N’attaque pas les chats, donc peut-être ceci se fait à partir d’une spécialisation/comportement des chats (isolé). -Théoriquement transmis par les animaux à sang chaude.
Diversité-Ecologie microbiennes: Le spectre d’hôte du SRAS-CoV (spicules protéiques )
SARS
- Syndrome respiratoire aigu sévère
- Éclaté en 2002 à Guandong, China
- Grand troubles respiratoires (pneumonie)
- 25 pays à travers la planète ont été frappées (incluant l’ontario)
- Liaison au récepteur humain de SRAS ACE2
2003-2004
- Mutation dans la virus qui a fait qu’un changement de conformation ne laisse pas la liaison au récepteur humain. Présence de T487S (chez SRAS originale) ainsi que L472P (mutant). L472P fait une liaison médiocre.
- Chez clivet (animale carnivore), présence de N479K et T487S. Ne peut pas lier à l’humain.
La pénétration et la décapsidation
- Traverser la membrane et pénétration du virus
- Puis expression et réplication commence.
- Certains virus perdent certaines ou toutes les protéines de la capsides: décapsidation alors que d’autres restent encapsidés.
- Pénétration et décapsidation varient en fonction des virus: nus ou enveloppés,
- Certains injectent seulement les acides nucléiques alors que d’autres viennent aussi avec une ARN ou une ADN polymérase.
- Plusieurs modalités (fig. 18.4)
Entrée d’un virus enveloppé par fusion avec la membrane plasmide
- Se fait par paramyxoviridae et retroviridae
- Spicules se lient au récepteurs du membrane plasmique.
- Enveloppe devient partie de la membrane plasmique
Entrée d’un virus enveloppé par endocytose
- Virions non enveloppés et certains virus enveloppés: endocytose médié par un récepteur tapissé de CLATHRINE.
- Les vésicules remplis de virus peuvent fusionner avec des endosomes à pH acide qui facilite la décapsidation.
Entré d’un virus nu par endocytose
- Picorna virus, polio virus
- Injecte leur acide nucléique depuis le vésicule endocytique via un pore (picornavirus) ou suite à une rupture de la paroi (adénovirus)
- Injecter leur acide nucléique à travers une membrane tapissée
- Cavéole (invagination de la membrane plasmique) en forme de bouteille avec du cholestérol et des protéines. Ceci forme des vésicules cavéolaires.
La réplication du génome et la transcription des virus à ADN - PAROVIRUS
- Gènes précoces (premature): pour la synthèse des ARN et ADN viraux.
- Certains virus paralysent le système de l’hôte alors que d’autres les stimulent.
- La réplication a généralement lieu dans le noyau à l’exception des poxvirus dont la réplication se fait dans le cytoplasme.
- Plusieurs exemples
- Parovirus: génome très petit. Utilise les enzymes de la cellule hôte pour toutes les biosynthèses.
- L’ADN viral est répliquée durant la phase S du cycle cellulaire de l’hôte.
- Le repliement aux deux extrémités du génome permet une amorce de réplication reconnue par l’ADN polymérase qui assure la réplication.
La réplication du génome et la transcription des virus à
ADN - HERPESVIRUS
- Herpesviridae est un virus icosaédrique enveloppé avec ADN linéaire à double brin, avec 50 à 100 gènes.
- Réplication du virus par une ARN polymérase de l’hôte débute dans le noyau qui dirige par la suite la synthèse de protéines précoces.
- Réplication du génome par une ADN polymérase spécifique du virus débute dans le noyau (4h) .
- La synthèse de l’ADN baisse et peut entraîner la mort cellulaire mais il y a des cas où il n’y a pas de mort cellulaire.
- Protéines alpha stimulent transcription des gènes précoces
- Protéines béta pour réplication de l’ADN
- Protéines gamma pour assemblage du virion