Chapitre 16 : La régulation génétique chez les procaryotes Flashcards
Quelle étape est la plus régulée? initiation, élongation ou terminaison?
initiation
Quelles séquences régulent (chez procaryotes) l’initiation et quesqu’y s’y lie?
site de liaison à l’activateur – activateur
opérateur (chevauche promoteur)— répresseur
Comment est la transcription lorsqu’il n’y a ni répresseur, ni activateur
niveau de base soit très faible
Que peut produire la liaison à un activateur? et quelle est le plus commun?
- facilité le recrutement de l’ARNpol au promoteur (demande souvent contact) LE PLUS COMMUN
- favorise isomérisation complexe fermé vers ouvert (régulation par isomérisation)
Que se passe t-il si les activateurs sont trop loin du site promoteur?
Des protéines architecturales viennent plié l’ADN pour créer un contact
Quesqu’un opéron?
comment ce nomme les ARN produient?
plusieurs gènes régulés par un promoteur et les même régulateurs, donne 1 ARNm mais plus d’une protéines (souvent 3 procaryotes)
ARN polycistromique
Pourquoi les gènes de stress ont une réponse si rapide?
L’ARNpol est toujours fixé au promoteur mais ne peut passer du complexe fermé à ouvert. L’activateur le fait passer au complexe ouvert
Comment un répresseur empêche la transcription?
2 méchanismes procaryotes
- par emcombrement stérique (opérateur sur promoteur et ARNpol ne peut se lier)
- empêche de passer complexe ouvert ou encore empêche de quitter le promoteur
OPÉRON LACTOSE expliquer à quoi servent : Lac Z (B-galactosidase) Lac Y (permease) Lac A (transacétylase) Lac I et comment sont synthétisés ceux-ci
Lac Z= pour hydrolyser lactose
Lac Y= entrée du lactose dans la cellule
Lac A= mystère
Lac I=répresseur dynamique (en amont et son promoteur)
OPÉRON LACTOSE
Que ce produit-il s’il y a beaucoup de lactose a métaboliser? S’agit-il d’un système inductible? si oui quel est l’inducteur?
le lactose se lie à Lac I et modifie sa structure empêchant ainsi Lac I de se lier au promoteur de l’Opéron
OUI, lactose
OPÉRON LACTOSE qu'en est t-il si: 1. Glucose et lactose 2. Glucose et PAS lactose 3. PAS glucose et lactose
- Glucose et lactose:
l’activateur CAP ne peut se lier car avec le glucose, il y a peut d’AMPc. Le répresseur Lac I ne peut se lier car il y a du lactose :::TRANSCRIPTION DE BASE - Glucose et PAS lactose
Comme glucose, il y a peu d’AMPc et donc CAP ne peut se lié. Et comme pas de lactose, LacI se lie :: PAS DE TRANSCRIPTION - PAS glucose et lactose
Comme pas de glucose, l’AMPc est en bonne quantité et donc CAP se lie et comme lactose, Lac I ne peut se lier::
HAUTE TRANSCRIPTION
À quoi servent CAP et Lac I (OPÉRON LACTOSE)?
Comment se lie CAP à l’ARN pol?
CAP est l’activateur de la transcription de l’opéron lactose et ne fonctionnent qu’en absence de glucose
Lac I (allolactose) est le répresseur de la transcription de l’opéron lactose, il n’est lié que s’il n’y a pas de lactose
CAP se lie au CTD
Que veut dire que Lac I soit diffusible?
Qu’Il peut agir sur d’autre gène que celui dont il provient
Que veut dire Oc?
Mutation au site opérateur
L’expression des gènes peut être contrôlé par un succession de facteurs _____
sigma
RÉGULATION DE L’AZOTE
Si le milieu est pauvre en azote, un signal phosphoryle l’activateur _____ et se lie à un site à distance et en se liant à l’ARNpol il stimule par _______
Ntrc
allostérie
Détoxification du mercure
les boites -10 et -____ sont trop ______ (____pb et demande 17 pb). S’il n’y a pas de mercure, MerR est lié mais ne fait rien. Mais s’il y a du mercure, MerR se lie autrement (MerR-Hg2+) et provoque_______________ et ______ ainsi les boites
-35 éloignées 19 pb torsion de l'ADN rapproche
OPÉRON TRP (semblable aux autres acides aminés)
Demande beaucoup d’énergie car opérons de ____ gènes. TrpR est un peu comme lac I (dynamique).
Décrivez comment est atténuée la transcription…
5
Il y a une séquence dite atténuante sur Trp L (1er gène) où l’ARN pol fait une pause si il y a peu de tryptophane. Ainsi, le brin 2 lie le brin 3.
Si trop de tryptophane, il n’y a pas de pause et alors le brin 3 lie le brin 4 et il y a arrêt de la transcription
(épingle à cheveux)
Pourquoi l’atténuation de l’opéron trp n’est pas possible chez les eucaryotes?
car la transcription et la traduction ne sont pas couplés
Quand le glucose est présent, les gènes lac ne sont pas exprimés pleinement, même en présence de l’inducteur, ceci est appelé la répression __________.
catabolique
I- P+ O+ Z+ Y- / I+ P- Z+ Y+
LacI est produit donc la synthèse de lacZ est réprimée. Puisque lacY ne peut être synthétisé la synthèse de lacZ ne peut pas être induite par le lactose (lacY est le transporteur du lactose extracellulaire !)
I- P+ Oc Z+ Y- / I+ P+ O+ Z- Y+
lacZ est produit de façon constitutive
lacY est inductible
I - P+ Oc Z+ Y+/ I- P+ O+ Z+ Y+
lacZ est produit de façon constitutive
lacY est produit de façon constitutive
I + P- Oc Z+ Y+ / I- P+ Oc Z- Y-
aucune production de lacZ et lacY
Quels sont les deux niveaux de régulation contrôlant l’expression des enzymes qui agissent dans la biosynthèse du tryptophane?
Répression ET atténuation
OPÉRON ARABINOSE
en présence d’arabinose, AraC se lie aux site I1 et I2 et intéragissent avec CAP se qui _______la transcription.
Mais si pas d’arabinose, AraC se lient entre eux et ________ la transcription (en empêchant CAP de se _____)
stimule
empêche
lier
Les protéines Lac I, NtrC, MerR, TrpR et AraC peuvent être modifié par_____ même si leur mode de d’activation peut être par _______ ou ____________
allostérie
allostérie
recrutement