Chapitre 13: l'épissage de l'ARN Flashcards
La taille des introns varie entre _____ et _______ pb
60 et 800 000
Quelle est le nb d’introns par gène chez l’homme?
entre 7 et 8
Que reconait le spliceosome majeur?
di nucléotide en GU en 5’ et AG en 3’, et séquence consensus YNYURAY et Y(…)Y
Décrivez la réaction de lasso du spliceosome et introns du groupe 2
Deux réactions de trans estérification: OH-2’ du pts branchement (A) attaque le G en 5’ et alors le OH-3’ de l’exon libéré attaque le Phosphate en 5’ du second exon
Spliceosome majeur est constitué de _____ protéines et de _____ ARN. L’épissage est sous la dépendance des _____ (_____) et demande de ______ pour le réarrangements (pas catalyse)
150, 5, snRNP (PRNpn)
Donnez l’ordre d’apparition des complexes du spliceosome majeur. (Nommez les complexes)
- U1 (se lie à GU)
- U2AF (reconnait Y(….)Y)
- 35
- BBP
COMPLEXE E - U2 remplace BBP en ne liant pas A
COMPLEXE A - U2AF et 35 s’en vont et U6-U5-U4 viennent
COMPLEXE B - U6 éjecte U1, U4 part et lien U6-U2 (POCHE)
COMPLEXE C
Sur quelles types de pairages sont basés les intéractions du spliceosome majeur et mineur
ARN::ARN
Que requiert la premiere réaction de trans-estérifiacation des introns de groupe 1?
le OH-3’ d’un G libre ( GMP, GDP, GTP, … ou G en 3’ D’ARN)
Quesqu’y dicte le site d’épissage au cours de la premiere réaction et le site sur l’intron libéré pour le clivé? et pourquoi le cliver?
séquence guide interne
pour inactiver son activité ribozyme (réaction inverse)
Quesqu’une ribozyme?
Les ribozymes sont des ARN qui possèdent la propriété de catalyser une réaction chimique spécifique.
Quelles sont les dinucléotides reconnues par le splice mineur? et quelle complexes est différents et son équivalence avec le splice majeur?
AU et AC
U11=U1
U12=U2
Quelles sont les deux types d’erreurs pour l’épissage?
non reconnaissance d’un site
reconnaissance d’un pseudo site
Quelles méchanismes assurent la fidèlité de l’épissage?
- Facteurs sur le CTD reconnaissant le 3’ et 5’ de l’introns (transféré sur l’ARN lors l’élongation)
- Séquences sur exons (ESE) sont reconnue par p. SR qui eux lient U2AF et U1 (aux extrémitées)
_____% des gènes humains subissent un épissage alternatif
75
Quelles techniques mènent à une épissage alternatif? et quelle est la plus commune?
- saut d’un exon
- extension d’un exon par épissage d’un intron
- absence d’épissage d’un intron
- exclusion mutuelle (PLUS COMMUNE)
Quelle sont les méchanismes de l’exclusion mutuelle?
- encombrement stérique
- site d’épissage pour le spliceosome mineur Et majeur
- Dégradation des ARNm avec codons STOP interne
En quoi est riche la protéine SR?
arginine et sérine
Des ‘activateurs d’épissage’ (splicing enhancers) se liant soit à l’exon (___) ou à l’intron (__) et des répresseurs ou
‘silencers’ (__ pour l’exon; __ pour l’intron) régulent
l’épissage alternatif en étant présent ou absent dans certains tissus
Ces activateurs ou répresseurs sont recrutés par les _____ ___
(ESE), (ISE), (ESS), ISS, protéines SR
Quelles sont les ISS et ESE chez la drosophile (détermination du sexe)?
Sxl est un répresseur d’épissage (ISS)
Les protéines Tra sont des activateurs d’épissage(ESE)
Quesqu’y favorise la production d’une protéine fonctionnelle Sxl chez la femelle drosophile?
détermination du sexe de la drosophile.
Les activateurs de transcription sis-a et sis-b en double copie chez les femelles favorisent l’utilisation du promoteur Pe et la production d’une protéine Sxl fonctionnelle
Quesqu’y assure le choix des exons 6 pour le gène Dscam chez la drosophile?
méchanisme::
pairage séquence d’ancrage avec séquence séléctrice
Quels méchanismes assurent l’édition de l’ARN après syntèse?
- Ajout et délétion d’uracile
2. Modification par substitution ( désamination de C en U ou A en I)
Quelles sont les 3 observations proposant que inrons favorisent évolution?
- exon = 50 pb = 1 domaine = 1 fonction
- plusieurs gènes ont évolué par duplication exon
- gènes similaires codent protéines rôles variés
Pourquoi même si petit organisme peu complexe , a plus de 50% plus de gène que nous?
épissage alternatif : 75% gènes humains le font
Quelle groupe est comme le spliceosome ?
Groupe 2
À quoi servent les protéines dans les introns de groupe 1 et quelle expérience le prouve?
masqué charge - des gr phosphate
marche avec sels
Quelles sont les deux hypothèses majeures pour l’évolution des introns chez les procaryotes et chez les
eucaryotes? Quelles sont les preuves supportant chacune des possibilités?
Les introns pourraient être apparus chez les bactéries d’abord, mais auraient disparus pour éviter
l’expansion du génome et les contraintes associées à la vitesse de réplication de l’ADN pour un
organisme qui se divise rapidement.
Ex. levure (eucaryote) se divise rapidement et n’a que peu de gènes contenant un intron et les
introns sont très petits)
Les introns sont apparus tardivement dans l’évolution.
