Chapitre 13: l'épissage de l'ARN Flashcards

1
Q

La taille des introns varie entre _____ et _______ pb

A

60 et 800 000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelle est le nb d’introns par gène chez l’homme?

A

entre 7 et 8

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Que reconait le spliceosome majeur?

A

di nucléotide en GU en 5’ et AG en 3’, et séquence consensus YNYURAY et Y(…)Y

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Décrivez la réaction de lasso du spliceosome et introns du groupe 2

A

Deux réactions de trans estérification: OH-2’ du pts branchement (A) attaque le G en 5’ et alors le OH-3’ de l’exon libéré attaque le Phosphate en 5’ du second exon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Spliceosome majeur est constitué de _____ protéines et de _____ ARN. L’épissage est sous la dépendance des _____ (_____) et demande de ______ pour le réarrangements (pas catalyse)

A

150, 5, snRNP (PRNpn)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Donnez l’ordre d’apparition des complexes du spliceosome majeur. (Nommez les complexes)

A
  1. U1 (se lie à GU)
  2. U2AF (reconnait Y(….)Y)
  3. 35
  4. BBP
    COMPLEXE E
  5. U2 remplace BBP en ne liant pas A
    COMPLEXE A
  6. U2AF et 35 s’en vont et U6-U5-U4 viennent
    COMPLEXE B
  7. U6 éjecte U1, U4 part et lien U6-U2 (POCHE)
    COMPLEXE C
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Sur quelles types de pairages sont basés les intéractions du spliceosome majeur et mineur

A

ARN::ARN

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Que requiert la premiere réaction de trans-estérifiacation des introns de groupe 1?

A

le OH-3’ d’un G libre ( GMP, GDP, GTP, … ou G en 3’ D’ARN)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quesqu’y dicte le site d’épissage au cours de la premiere réaction et le site sur l’intron libéré pour le clivé? et pourquoi le cliver?

A

séquence guide interne

pour inactiver son activité ribozyme (réaction inverse)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quesqu’une ribozyme?

A

Les ribozymes sont des ARN qui possèdent la propriété de catalyser une réaction chimique spécifique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Quelles sont les dinucléotides reconnues par le splice mineur? et quelle complexes est différents et son équivalence avec le splice majeur?

A

AU et AC
U11=U1
U12=U2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Quelles sont les deux types d’erreurs pour l’épissage?

A

non reconnaissance d’un site

reconnaissance d’un pseudo site

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quelles méchanismes assurent la fidèlité de l’épissage?

A
  1. Facteurs sur le CTD reconnaissant le 3’ et 5’ de l’introns (transféré sur l’ARN lors l’élongation)
  2. Séquences sur exons (ESE) sont reconnue par p. SR qui eux lient U2AF et U1 (aux extrémitées)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

_____% des gènes humains subissent un épissage alternatif

A

75

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quelles techniques mènent à une épissage alternatif? et quelle est la plus commune?

A
  1. saut d’un exon
  2. extension d’un exon par épissage d’un intron
  3. absence d’épissage d’un intron
  4. exclusion mutuelle (PLUS COMMUNE)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quelle sont les méchanismes de l’exclusion mutuelle?

A
  1. encombrement stérique
  2. site d’épissage pour le spliceosome mineur Et majeur
  3. Dégradation des ARNm avec codons STOP interne
17
Q

En quoi est riche la protéine SR?

A

arginine et sérine

18
Q

Des ‘activateurs d’épissage’ (splicing enhancers) se liant soit à l’exon (___) ou à l’intron (__) et des répresseurs ou
‘silencers’ (__ pour l’exon; __ pour l’intron) régulent
l’épissage alternatif en étant présent ou absent dans certains tissus
Ces activateurs ou répresseurs sont recrutés par les _____ ___

A

(ESE), (ISE), (ESS), ISS, protéines SR

19
Q

Quelles sont les ISS et ESE chez la drosophile (détermination du sexe)?

A

Sxl est un répresseur d’épissage (ISS)

Les protéines Tra sont des activateurs d’épissage(ESE)

20
Q

Quesqu’y favorise la production d’une protéine fonctionnelle Sxl chez la femelle drosophile?

A

détermination du sexe de la drosophile.
Les activateurs de transcription sis-a et sis-b en double copie chez les femelles favorisent l’utilisation du promoteur Pe et la production d’une protéine Sxl fonctionnelle

21
Q

Quesqu’y assure le choix des exons 6 pour le gène Dscam chez la drosophile?

A

méchanisme::

pairage séquence d’ancrage avec séquence séléctrice

22
Q

Quels méchanismes assurent l’édition de l’ARN après syntèse?

A
  1. Ajout et délétion d’uracile

2. Modification par substitution ( désamination de C en U ou A en I)

23
Q

Quelles sont les 3 observations proposant que inrons favorisent évolution?

A
  1. exon = 50 pb = 1 domaine = 1 fonction
  2. plusieurs gènes ont évolué par duplication exon
  3. gènes similaires codent protéines rôles variés
24
Q

Pourquoi même si petit organisme peu complexe , a plus de 50% plus de gène que nous?

A

épissage alternatif : 75% gènes humains le font

25
Q

Quelle groupe est comme le spliceosome ?

A

Groupe 2

26
Q

À quoi servent les protéines dans les introns de groupe 1 et quelle expérience le prouve?

A

masqué charge - des gr phosphate

marche avec sels

27
Q

Quelles sont les deux hypothèses majeures pour l’évolution des introns chez les procaryotes et chez les
eucaryotes? Quelles sont les preuves supportant chacune des possibilités?

A

Les introns pourraient être apparus chez les bactéries d’abord, mais auraient disparus pour éviter
l’expansion du génome et les contraintes associées à la vitesse de réplication de l’ADN pour un
organisme qui se divise rapidement.
Ex. levure (eucaryote) se divise rapidement et n’a que peu de gènes contenant un intron et les
introns sont très petits)
Les introns sont apparus tardivement dans l’évolution.