Chapitre 10 - La transcription

Question 1

Les 3 variants de promoteur

Answer 1

1) élément up = augmente l’affinité de l’ARN pol. pour le promoteur en ajoutant 1 site de liaison
2) Extension de la séquence -10 = Absence de séquence -35 et plus longue séquence -10, fournit 1 contact supplémentaire
3) Séquence discriminatrice = Modifie l’affinité entre l’ARN pol. et le promoteur

Question 2

Qui reconnaît les séquence -10 et -35 chez E.Coli ?

Answer 2

Les facteurs sigma 2 et 4 respectivement

Question 3

Que reconnaît les facteurs sigma 3 et 1 ?

Answer 3

La séquence -10 allongé et la séquence discriminatrice, respectivement

Question 4

Qui reconnaît l’élément up ?

Answer 4

C’est pas un facteur sigma, mais le domaine carboxy-terminal (αCTD) de la sous-unité alpha de l’ARN pol.

Question 5

Comment se nomme la transition du complexe fermé vers le complexe ouvert ?

Answer 5

L’isomérisation

Question 6

Comment fonctionne l’isomérisation ?

Answer 6

Changement structurels de l’ARN pol. et du promoteur pour permettre l’ouverture locale de la double hélice et isoler le brin matrice

Question 7

Où à lieu l’isomérisation ?

Answer 7

entre les position -11 et +3 (au site du facteur sigma 2)

Question 8

Les 5 canaux divisés en 2 entrées et 3 sorties ?

Answer 8

Entrées = 
- ADNdb (avant transcription)
- Ribonucléotides
Sortie = 
- Brin ADN non transcrit
- Brin ADN transcrit
- Brin ARN

Question 9

Les 2 rôles de sigma 3.2 ?

Answer 9

1) La stabilisation des 2 premiers nucléotides

2) Mimer l’ARN à son canal de sortie

Question 10

Qu’elle est l’hypothèse d’initiation la plus vraisemblable ?

Answer 10

La compression = l’ADN est aspiré dans l’enzyme

Question 11

Qu’est-ce que l’initiation abortive ?

Answer 11

La synthèse de fragments courts d’au maximum 9 ribonucléotides qui sont ensuite relâchés

Question 12

Quand est-ce que la la phase d’élongation commence-t-elle ?

Answer 12

Lorsque la taille du fragment synthétisé dépasse 10 ribonucléotides

Question 13

Que ce passe-t-il lorsque le complexe passe de ouvert vers élongation ?

Answer 13

Les interactions entre la polymérase, le promoteur et les protéines de régulation cessent

Question 14

Lors de la phase d’élongation, l’ARN polymérase….

Answer 14

1) Est très processive

2) corrige ses erreurs

Question 15

Que ce passe-t-il pendant l’élongation au site actif ?

Answer 15

• Séparation des brins
• Sortie précoce du brin non transcrit
• Synthèse d’ARN: seuls 8 à 9 ribonucléotides restent accrochés au brin matrice
• La double hélice se reforme

Question 16

Les 2 fonction correctrices du site actif ?

Answer 16

1) Correction pyrophospholytique = ajoute un pyrophosphate

2) Correction hydrolytique = La polymérase recule de 1 ou plusieurs nucléotide et coupe le fragment correspondant

Question 17

Qu’arrive-t-il si l’ADN est endommagé sur un gène très exprimé ?

Answer 17

CATASTROPHE, toutes les ARN Pol. se rentrent dedans et la machinerie cellulaire retire l’enzyme bloqué avec la protéine TCRF et fait appel à un mécanisme de réparation

Question 18

Comment fonctionne TCRF ?

Answer 18

Elle se lie à l’ADN double brin en aval de l’ARN Pol. et utilise son ATP pour décoincer l’enzyme

Question 19

Comment TCRF décoince-t-elle l’enzyme ?

Answer 19

Elle lui rentre dedans:

• Soit l’ARN Pol. recule et recommence la transcription en aval
• Soit elle se fait envoyer promener

Question 20

Qu’est-ce que déclenche les séquences de terminaisons ?

Answer 20

1) Le retrait de l’ARN Pol. de l’ADN

2) Le largage du brin transcrit

Question 21

Qu’est-ce qui induit la terminaison de la transcription ?

Answer 21

La protéine Rho en utilisant sont activité ATPase

Question 22

Où se lie les protéines Rho ?

Answer 22

Sur les ARN qui sont transcrit au delà de la région traduite

Question 23

Quand commence la traduction chez les bactéries ?

Answer 23

Aussitôt que le brin d’ARN commence à sortir de la polymérase

Question 24

Quels sont les 2 éléments dont ont besoins les séquences de terminaison Rho (séquence de terminaison intrinsèque) ?

Answer 24

1) 1 séquence répétée et inversée de 20 bases

2) Suivie d’une région de 8 appariement A:T