Chapitre 10 - La transcription Flashcards
Les 3 variants de promoteur
1) élément up = augmente l’affinité de l’ARN pol. pour le promoteur en ajoutant 1 site de liaison
2) Extension de la séquence -10 = Absence de séquence -35 et plus longue séquence -10, fournit 1 contact supplémentaire
3) Séquence discriminatrice = Modifie l’affinité entre l’ARN pol. et le promoteur
Qui reconnaît les séquence -10 et -35 chez E.Coli ?
Les facteurs sigma 2 et 4 respectivement
Que reconnaît les facteurs sigma 3 et 1 ?
La séquence -10 allongé et la séquence discriminatrice, respectivement
Qui reconnaît l’élément up ?
C’est pas un facteur sigma, mais le domaine carboxy-terminal (αCTD) de la sous-unité alpha de l’ARN pol.
Comment se nomme la transition du complexe fermé vers le complexe ouvert ?
L’isomérisation
Comment fonctionne l’isomérisation ?
Changement structurels de l’ARN pol. et du promoteur pour permettre l’ouverture locale de la double hélice et isoler le brin matrice
Où à lieu l’isomérisation ?
entre les position -11 et +3 (au site du facteur sigma 2)
Les 5 canaux divisés en 2 entrées et 3 sorties ?
Entrées = - ADNdb (avant transcription) - Ribonucléotides Sortie = - Brin ADN non transcrit - Brin ADN transcrit - Brin ARN
Les 2 rôles de sigma 3.2 ?
1) La stabilisation des 2 premiers nucléotides
2) Mimer l’ARN à son canal de sortie
Qu’elle est l’hypothèse d’initiation la plus vraisemblable ?
La compression = l’ADN est aspiré dans l’enzyme
Qu’est-ce que l’initiation abortive ?
La synthèse de fragments courts d’au maximum 9 ribonucléotides qui sont ensuite relâchés
Quand est-ce que la la phase d’élongation commence-t-elle ?
Lorsque la taille du fragment synthétisé dépasse 10 ribonucléotides
Que ce passe-t-il lorsque le complexe passe de ouvert vers élongation ?
Les interactions entre la polymérase, le promoteur et les protéines de régulation cessent
Lors de la phase d’élongation, l’ARN polymérase….
1) Est très processive
2) corrige ses erreurs
Que ce passe-t-il pendant l’élongation au site actif ?
- Séparation des brins
- Sortie précoce du brin non transcrit
- Synthèse d’ARN: seuls 8 à 9 ribonucléotides restent accrochés au brin matrice
- La double hélice se reforme
Les 2 fonction correctrices du site actif ?
1) Correction pyrophospholytique = ajoute un pyrophosphate
2) Correction hydrolytique = La polymérase recule de 1 ou plusieurs nucléotide et coupe le fragment correspondant
Qu’arrive-t-il si l’ADN est endommagé sur un gène très exprimé ?
CATASTROPHE, toutes les ARN Pol. se rentrent dedans et la machinerie cellulaire retire l’enzyme bloqué avec la protéine TCRF et fait appel à un mécanisme de réparation
Comment fonctionne TCRF ?
Elle se lie à l’ADN double brin en aval de l’ARN Pol. et utilise son ATP pour décoincer l’enzyme
Comment TCRF décoince-t-elle l’enzyme ?
Elle lui rentre dedans:
- Soit l’ARN Pol. recule et recommence la transcription en aval
- Soit elle se fait envoyer promener
Qu’est-ce que déclenche les séquences de terminaisons ?
1) Le retrait de l’ARN Pol. de l’ADN
2) Le largage du brin transcrit
Qu’est-ce qui induit la terminaison de la transcription ?
La protéine Rho en utilisant sont activité ATPase
Où se lie les protéines Rho ?
Sur les ARN qui sont transcrit au delà de la région traduite
Quand commence la traduction chez les bactéries ?
Aussitôt que le brin d’ARN commence à sortir de la polymérase
Quels sont les 2 éléments dont ont besoins les séquences de terminaison Rho (séquence de terminaison intrinsèque) ?
1) 1 séquence répétée et inversée de 20 bases
2) Suivie d’une région de 8 appariement A:T
