Chapitre 10,11 & 12- Cellule Eucaryote Flashcards
Que possède la cellule eucaryote
Noyau, organites,ribosomes et cytosquelette
Dans quels règnes se trouve la cellule eucaryote
Unicellulaires: protistes
Pluricellulaires: Mycètes,plantes et animaux
Qu’est-ce que le nucleoplasme
-Substance liquide dans laquelle baigne la chromatine (ADN + histones) et les autres molécules nucléaires
-délimité par l’enveloppe nucléaire
Qu’est-ce que le cytoplasme
Région entre l’enveloppe nucléaire et la mb plasmique dans laquelle baignent les molécules,organites et autres constituants
Comment se nomme la partie liquide du cytoplasme qui est entre les organites
Cytosol
Quels sont les composantes du cytosol
Ectoplasme: zone périphérique du cytoplasme,pauvre en organites mais riche en cytosquelette
Endoplasme: région interne du cytoplasme riche en organites
Quels sont les composantes du noyau
Enveloppe nucléaire,nucleoplasme,nucléole et chromatine
De quoi l’enveloppe nucléaire est elle composée
-Membrane nucléaire interne: en contact avec le nucleoplasme,tapissée de filaments,accrochage des molécules d’ADN sur celle ci
-Membrane nucléaire externe: continue avec le REG et couvertes de ribosomes
-Espace intermembranaire: entre les deux membranes
-Pores nucléaires: où les 2 membranes sont en contact (transport entrant et sortant)
Quel serait l’hypothèse sur l’origine du noyau de la cellule eucaryote
A partir d’une cellule procaryote, une invagination de la mb plasmique aurait entouré le chromosome
Des ribosomes étaient deja présents sous la mb plasmique pour la synthèse des protéines
De quoi est composé le complexe du pore nucléaire
-2 bagues protéiques octogonales en image miroir
-protéines retenant le CPN dans l’enveloppe
-filaments protéiques: guident les macromolécules qui traversent le pore
Comment fonctionne le transport des molécules par le pore nucléaire
-Petites molécules: transport passif par diffusion
-Grosses molécules: transport actif
1)le signal de localisation nucléaire (SLN) de la protéine se fixe a des récepteurs (importines) contenues dans le cytosol qui se fixent aux filaments
2)le complexe glisse le long des filaments des bagues et aboutit dans le noyau
3)protéine est libérés mais SLN non excisée
Quel système utilisent les protéines voulant aller du noyau au cytoplasme
Même système que pour les protéines voulant rentrer mais utilisent SEN comme séquence d’exportation et se fixent aux récepteurs exportines
Qu’est-ce que le nucleoplasme
Liquide du noyau dans lequel baigne les molécules: ADN,ARN et protéines nucléaires (histones,lamine,enzymes…)
Qu’est-ce que le nucléole
Région dense dans le noyau,souvent au centre et la plus colorée au microscope
Quels sont les 4 parties du nucléole
Pars fibrosa: lieu de transcription du gène 45S en ARNr 45S
Pars granulosa: lieu d’assemblage des ARNr et protéines en sous unités ribosomales
Pars chromosoma: partie chromosomique continue avec la chromatine du reste du noyau
Pars amorpha: entre les autres parties
Quelle est la composition des ribosomes des cellules eucaryote (80s)
ARNr,protéines ribosomales et deux sous unités ribosomales: petite sous unité (40s) et grosse sous unité (60s)
Ou est produit l’ARNr
Les copies du gène 45s sont trancsrites en ARNr 45s dans la pars fibrosa du nucléole
Quels sont les 4 types d’ARNr
ARNr lourds (28s,18s et 5,8s): passent a la pars granulosa
ARNr léger (5s): est transcrit ailleurs dans le noyau puis vas a la pars granulosa
Ou sont produites les protéines ribosomales
Les 80 transcrits d’ARNm sont codés par l’ADN hors nucléole, passent du noyau au cytosol (SEN),se lient aux récepteurs exportine et sont traduites sur des ribosomes libres
-—>si elles veulent revenir au noyau (SLN + importines) et vont dans la pars granulosa
Ou sont produites les sous-unités ribosomales
Dans le pars granulosa:
-30 protéines ribosomales+ARNr 18s—> petite sous unité
-50 protéines ribosomales+ARNr 5s,5,8s et 28s—> grosse sous unité
Elles sont ensuite exportées au cytosol via SEN
Quand se passe l’amplification
-niveau pré transcriptionel: amplification du gène
-niveau transcriptionel: amplification de l’ARN,un gène code plusieurs molécules d’ARN
-niveau traductionnel: une molécule d’ARNm sert a coder plusieurs exemplaires de la protéine
Différence entre chromatine et chromosomes
Chromosome: 1 molécules d’ADN+ histones et sont en paires
Chromatine: ensemble de chromosomes
En terme d’adressage quels sont les 3 types de protéines
-protéines destinées au cytosol: non incorporées à une organite
-protéines destinées au noyau,mitochondries,chloroplaste,peroxysomes et protéines ribosomales: incorporation post-traductionnelle a ces organites
-protéines destinées au REG,golgi,lysosomes,mb plasmique et sécrétion: incorporation co-traductionnelle (au REG)
Quels sont les deux types de réticulum endoplasmique
Lisse et granulaire
Quelles sont les différences entre les deux types de RE
REL:saccules membranaires,contient des enzymes pour la synthèse des lipides,site de réserve et régulation de Ca++
REG:saccules membranaires,recouvert de ribosomes, continu avec la membrane nucléaire externe du noyau,rôle dans la sécrétion cellulaire
Qu’est-ce que l’exocytose
Fusion de vésicules cytoplasmiques à la membrane plasmique pour expulser leur contenu dans le milieu extracellulaire
-elle sert aussi au renouvellement des lipides et protéines membranaires
Quel est le mécanisme de l’incorporation co-traductionnelle d’une protéine destinées à la sécrétion
1)un transcrit d’ARNm passe du noyau au cytosol et s’associe à un ribosome->début de traduction
2)le peptide en construction a une séquence signal (PSIT) à son extrémité NH2,le PSIT permet au ribosome de se fixer sur la membrane du REG
3)PSIT se lie au PRSΔ, provoque l’arrêt de la traduction
4)le PRSΔ se lie à un récepteur sur la membrane du REG,un canal s’ouvre dans le REG
5)la traduction recommence grâce à PRSΔ-récepteur, la chaine peptidique s’allonge et pénètre le REG
6)l’enzyme peptidase du signal coupe le PSIT et le PRS Δ redevient libre
7)la protéine adopte sa structure tertiaire dans le REG
Quel est le mécanisme de glycosylation d’une protéine
1)un oligosaccaride est ajouté le long de la chaine d’a.a en élongation dans la lumière du REG
2)les oligosaccharides sont synthétisés dans le dolichol (lipide membranaire du REG)
3)Catalysé par l’enzyme glycosyltransférase
Quels sont les avantages de glycosylation des protéines
-protéger la membrane sans empêcher l’exocytose et l’endocytose
-permet l’adhérence intercellulaire
Quels sont les 4 types d’oligosaccharides ajoutés au protéines
-phosphorylés (protéines destinées aux lysosomes)
-riches en mannose
-complexes (protéines destinées aux vésicules de sécrétion ou mb plasmique)
-intermédiaires entre ces 2
De quoi est composé le Golgi
Composé de 1 ou plusieurs golgiosomes reliés entre eux par tubules
Quel est la différence entre le Golgi et le RE
-pas de ribosomes ni de lipides associés au golgi
-ses saccules sont régulièrement espacés
-leur empilement est ordonné
Quelle est la morphologie du golgi
Face cis (près du REG) et face trans
Quel est le rôle du golgi
-modification des glycoprotéines qui leur confère une adresse
-tri des protéines selon leur destination (routage)
Comment s’effectue la modification des glycoprotéines dans le golgi
1)les glycoprotéines quittent le REG dans des vésicules de transition et arrivent a la face cis du golgi et fusionnent a la membrane du réseau cis-golgien
2)les protéines vont de la face cis a la face trans du golgi
3)des enzymes dans les saccules golgiens modifient les oligosaccharides des glycoprotéines en modifiant leur région terminale
4)la modification de la glycosylation confère une adresse aux protéines
Comment s’effectue le tri et le routage des protéines
Rendues dans le trans-golgi,les protéines ont acquis leur adresse, elle sont triées,emballées dans des vésicules et prennent la route vers leur destination finale:
-vésicules de sécrétion acheminée a la mb plasmique et y fusionnent (exocytose)
-vésicules contenant hydrolases acides se dirigent vers endosomes,fusionnent (les hydrolases acides digèrent le contenu des endosomes)
Quel est l’autre fonction du Golgi
Capture des protéines du REG qui se sont échappés vers le Golgi mais qui doivent rester dans la lumière du REG (possèdent une séquence KDEL a leur extrémité COOH non excisée)
Quels sont les deux types de sécrétion cellulaire
Sécrétion constitutive et sécrétion contrôlée (régulée)
Qu’est-ce que la sécrétion constitutive
-système par défaut de la cellule eucaryote
-non soumise a un système de contrôle
-les vésicules de sécrétion provenant du golgi vont vers la mb plasmique et y fusionnent
-expulsent leur contenu hors de la cellule (exocytose)
Qu’est-ce que la sécrétion contrôlée
-sur demande selon les besoins de la cellule
-les vésicules de sécrétion provenant du golgi sont acheminés vers la mb plasmique
-ne fusionnent pas directement (attendent un signal externe pour le faire)
Qu’est-ce qui contribue au renouvellement de la mb plasmique
L’exocytose,en contribuant à renouveler les lipides et protéines constituant la mb plasmique
Quels sont les types de protéines membranaires
Protéines intrinsèques: enchâssés,ancrées
Protéines extrinsèques: -intracellulaire: dans l’ectoplasme et rattaché a une protéine intrinsèque
-extracellulaire: dans le milieu extracellulaire et rattaché a une protéine intrinsèque
Qu’est-ce que la digestion intra-cellulaire
-dans la cellule,accomplie par les lysosomes
-la cellule hydrolyse des grosses molécules en molécules plus simples
-grâce a des enzymes hydrolases acides
Qu’est-ce la digestion extracellulaire
-accomplie par les lysosomes
-la cellule secrète des hydrolases acides dans le milieu externe
-pour dégrader de grosses molécules en petites molécules (puis les ingérer ou pour se défendre)
Quelle est la différence entre l’hétérophagie et l’autophagie
Hétérophagie: la cellule ingère des éléments externe (pour se nourrir ou se défendre),commence par le processus d’endocytose
Autophagie:la cellule digère ses propres constituants (pour éliminer les organites usées ou des macromolécules endommagées),pas d’endocytose
—> les 2 sont grâce aux lysosomes
Quelles sont les étapes de l’hétérophagie
1) manger par endocytose:
- la membrane plasmique s’invagine
- capte des substances extracellulaires
- l’invagination se renferme en vacuole et se détache de la membrane plasmique
2)digérer grâce aux Lysosomes
-la vacuole fusionne a un lysosome directement ou à un endosome puis un lysosome
-le lysosome digère le contenu
Quels sont les 4 types d’endocytose
Phagocytose:ingestion de cellules entières ou gros fragments
Pinocytose:ingestion de molécules solubles
Micropinocytose:ingestion de molécules plus petites que celles de la pinocytose
Endocytose par l’entremise de récepteurs:nécessite des récepteurs membranaires pour lier le ligand
Quelles sont les caractéristiques des lysosomes
Vésicules d’apparence finement granuleuse
-membrane typique mais renferme des pompes a protons (H+) qui maintient l’intérieur acide
-matrice contient des enzymes hydrolases acides (traduites et glycolysées sur le REG et elles acquièrent l’adresse M6P dans le golgi,les vésicules trans golgiennes sont envoyés à des vésicules acides et fusionnent —> lysosome,M6P excisée)
Comment se passe l’heterophagie par les lysosomes
-après fusion d’une vacuole d’endocytose à un lysosome,les hydrolases acides fragmentent les macromolécules en petites molécules
-traversent ensuite la mb lysosomale et gagnent les cytosol pour que la cellule les utilisent
Comment se passe l’autophagie par les lysosomes
-destruction des organites usés,défectueux par lysosomes puis élimination (digestion)
-destruction de macromolécules dénaturés ou défectueuses
Que deviennent les lysosomes apres avoir accompli la digestion
Elles deviennent des corps résiduels qui contiennent (molécules non hydrolysées ou les hydrolases denaturees) et qui peuvent fusionner à la mb plasmique pour rejeter ces résidus dans le milieu extracellulaire ou demeurer tels quels dans la cellule
Quelles sont les 3 fonctions principales des lysosomes
-digestion hétérophage et autophage
-sécrétion et renouvellement de la mb plasmique
-sacs à ordures de la cellule temporaires
Quelles sont les caractéristiques des endosomes
-saccules dans l’ectoplasme de la cellule
-provenant du golgi
-la membrane des endosomes contient des pompes a protons (H+) et matrice légèrement acide
-utilisés seulement lors de l’endocytose par l’entremise des récepteurs
Quelles sont les étapes de l’endocytose par l’entremise de récepteurs
-des récepteurs de la membrane plasmique lient le ligand (molécule à ingérer)
-la protéine clathrine (présente dans l’ectoplasme) se polymérise autour de la vacuole en formation puis force la mb plasmiqueà s’invaginer
-la vacuole d’endocytose rendue dans l’ectoplasme perd sa ceinture de clathrine
-la vacuole fusionne avec un endosome (endosome précoce)
-l’acidité sépare les ligands des récepteurs membranaires puis l’endosome se sépare en 2 parties ( 1 vésicule contient les ligands et fusionne avec un lysosome et 1 vésicule contient les récepteur = endosome de recyclage)
quel est l’exemple d’un cas particulier d’hétérophagie
Virus de la forêt de semliki en ouganda
-présent en Afrique centrale de l’est et du sud
-transmission à l’humain par des moustiques
-virus à ARN (pas un rétrovirus)
-cas d’endocytose par l’entremise de récepteurs (mais le ligand est un virus), donc la vacuole fusionne à un endosome mais l’arn du virus n’est pas détruit et l’endosome ne fusionne pas à un lysosome
Quelles sont les caractéristiques des peroxysomes
Organites vésiculaires,de courte durée (4 à 5j) et détruites par autophagie par les lysosomes
Quelles est l’origine (biogenèse) des peroxysomes
-incorporation co-traductionnellle des protéines traduites sur le REG et qui migrent vers la membrane du REL (ajout de lipides à leur membrane)
-incorporation post-traductionnelle d’autres protéines (membranaires et enzymatiques de la matrice)
-quelques vésicules précurseurs fusionnent —> peroxysomes
Quelles est le fonctionnement des protéines peroxysomales
1) certaines protéines ont la séquence signal de 3a.a (PTS1) à leur extrémité COOH,PTS1 est ensuite fixé au récepteur cytosolique PTS1R et la protéine est ensuite transportée vers un peroxysome,PTS1R se fixe sur la protéine membranaire Pex14P et l’enzyme pénètre le peroxysome (PTS1 non excisée)
2) d’autres protéines des peroxysomes ont la séquence PTS2 à leur extrémité NH2, PTS2 se fixe à PTS2R puis PTS2R se fixe sur la protéine membranaire Pex14P et l’enzyme pénètre le peroxysome (PTS2 excisée)
Quelles sont les fonctions des peroxysomes
-leurs oxydases brisent par oxydation les chaînes d’acides gras et d’autres molécules organiques en petites molécules (produit du H2O2 toxique)
-leurs catalases et leur peroxydases permettent d’utiliser le H2O2 pour métaboliser d’autres molécules organiques