Chapitre 1 - Révision Flashcards
Définition du protoplasme
Substance constituant les cellules, comprend le cytoplasme et nucléoplasme mais exclut la paroi cellulaire
Définition du cytoplasme
Tout le contenu cellulaire, molécules et organelles, sauf le noyau
Définition du Cytosol
Substance fluide constituant le cytoplasme sans les organelles
Définition du nucléoplasme
Substance liquide du noyau, inclut la chromatine et les autres molécules nucléaires
(enzymes, ions, etc)
Définition de l’incorporation co-traductionnelle
- Protéines qui ne restent pas dans le cytosol
- Sont destinées à plusieurs organelles différentes
(REG, golgi, lysosomes, membrane plasmique)
Définition de l’incorporation post-traductionnelle
- Protéines qui sont synthétisées dans le cytosol mais sont destinées aux
peroxysomes, mitochondries, chloropastes et au noyau. - Sont synthétiser par des polysomes libres dans le cytosol
- Étape après la traduction, protéines ont une séquence signal indiquant leur appartenance
Définition de l’enveloppe nucléaire
- Structure constituée de 2 membranes du type mosaique fluide nommées membrane nucléaire interne et externe
- Les 2 membranes sont séparées par un espace intermembranaire
- En contact par des pores nucléaires qui facilitens la circulation des molécules entre le nucléoplasme et le cytosol
Description de la membrane nucléaire externe
- En continuité avec le REG
- Contient des ribosomes sur le feuillet cytoplasmique
Description de la membrane nucléaire interne
- En contact avec le nucléoplasme et la lamina
- N’a pas de ribosomes en train de produire des protéines
- Pas de granulation
- Sert de point d’encrage pour les chromosomes
(filaments intermédiaires qui tapissent la membrane interne, les molécules d’ADN s’acrocchent)
Description de l’espace périnucléaire
- Sépare les 2 membranes dans le noyau et est en continuité avec la lumière (espace dans la cavité) du REG
Description du nucléole
- Région du noyau densément colorée
- Site d’assemblage des ribosomes (sous-unités)
- Contient la chromatine (ensemble de chromosomes)
Nommez les organelles dans la cellule eucaryote
- REG
- Le golgi
- Lysosomes
- Endosomes
- Milieu extra cellulaire
Définition de la sécrétion cellulaire
- Exportation vers le compartiment extracellulaire de protéines synthétisées par une cellule
- La vesicule cytoplasmique s’en va d’une organelle à une autre
- Fusion membranaire
Définition des vesicules cytoplasmiques
- Compartiment relativement petit, séparé du cytosol par au moins une bicouche lipidique (similaire à la membrane cytoplasmique).
- Fait partie du cytoplasme, et circule dans le cytosol où elle peut stocker, transporter ou encore digérer des produits et des déchets cellulaires.
- Sont formées dans l’appareil de Golgi, dans le réticulum endoplasmique ou bien à partir de la membrane cytoplasmique.
Description du réticulum endoplasmique
- Ensemble de saccules ou tubules membranaires portant ou non des ribosomes sur les feuillet cytoplasmique
- Deux sortes :
1) Lisse: Contient des enzymes pour la synthése des lipides et du cholestérol.
Ne contient pas de ribosomes
2) Granulaire: (REG), contient des ribosomes
Description de l’appareil de golgi
- Centre de tri
- Contient deux poles face cis (réception des vésicules de transport) et face trans (expedition des vésicules de sécrétion)
- Dans l’ensemble est responsable de la maturation des protéines
- Formé d’un seul ou plusieurs golgiosomes qui pourraient être réliés entre eux par des tubules
- Joue un role dans la glycosylation des protéines lors de la sécrétion cellulaire, celle-ci décore les protéines avec des gènes d’oligosaccharides (chaîne de sucre)
- Ne contient pas de ribosomes
- Les protéines se déplacent par voie vesiculaires
Description de la séquence signal du RE
- Séquence (PSIT) qui permet au ribosome de reconnaître un ARNm destiné au RE
- Adresse contenu dans les acides aminés de la protéine
- Le ribosome restera collé sur la membrane du RE et va incorporer la protéine dans celle-ci en même temps que sa traduction
- Une fois son objectif atteint, n’a plus d’utilité. L’enzyme peptidase-signal la coupe et l’enlève.
Décrire la procedure de la particule de reconnaissance de signal
1- SRP reconnait le signal
- Arrêt de la traduction
- Ribosome se fixe à l’organelle (RE)
- La traduction continue et translocation commence
Description des lysosomes
- Sont des vesicules qui sont remplit d’enzymes destinés à la digestion (destruction) cellulaire
- faible pH de 5
- Phase ultime de la digéstion cellulaire
- Produites par le REG puis transférées séparément dans l’appareil de golgi qui par la suite vont fussionner avec des endosomes pour digérer leur contenu
- Lors du processus d’endocytose (membrane plasmique capture des molécules extracellulaires) aussi vont se fusionner avec le lysosome pour y digérer leur contenu
- Servent aussi à recyler les organites défecteux. Leur l’éclatement peut provoquer l’autolyse. (dégradation de la cellules par ses propes enzymes)
Définition de l’endosome
- Les endosomes sont des sous compartiments de la cellule, ou organelles sur lesquels les vésicules d’endocytose s’accrochent et fusionnent pour relarguer leur contenu
- La fusion avec des vésicules golgiennes contenant des hydrolases acides (enzymes digestives) produisent des lysosomes
- Endosome précose, retourne à la membrane les protéines leur appartenant
- Endosome tardif, va maturer pour devenir un lysosome ou fusionnera avec celui-ci
Nommez les sortes d’endocytoses
- Phagocytose (mange gros morceaux)
- Autophagie (digère ses propres cellules)
- Pinocytose (boit des échantillons)
- Endocytose récepteur (veut une molécule spécifique)
Décrire le mécanisme d’incorporation post-traductionnelle dans le noyau
- En gros volume, ces protéines ne peuvent pas passer par le passage habituelle des pores nucléaires, les petites molécules solubles peuvent par contre passer.
- Grâce à une séquence signal qui permet d’ouvrir le pore nucléaire, une protéine peut pénétrer dans le noyau en conservant sa structure tertiaire, permettant ainsi d’y faire accéder uniquement les protéines autorisées.
- Séquence signal n’est pas excisée car elle permet de repatrier les protéines perdues dans le cytosol.
Décrire le mécanisme d’incorporation post-traductionnelles chez les peroxysomes, mitochondries et chloroplastes
- Les protéines dans leur structure tertiaire ne peuvent pénétrer, sans en être modifiées, à travers la membrane mosaique fluide qui delimite ces organelles
- Des protéines nommées Chaperonines déroulent les protéines en une séquence lineaire d’acides aminés (structure primaire)
- ATP fournit l’énergie pour stabiliser la protéine dans cette structure
- Contiennent une séquence signal qui se détruit une fois le processus terminé
- D’autres protéines permettent à la protéine de reprendre sa forme tertiaire une fois dans l’organelle
Description des peroxysomes
- Organelles oxydatifs
- Doivent leur nom à la formation du peroxyde d’hydrogène (H2O2)
- Décomposent les acides gras des lipides pour source d’énergie lors de la respiration cellulaires dans les mitochondries
- Ont une rélations étroites avec les autres organelles
- L’enzyme catalase convertit le peroxyde en eau et oxygène pour le rendre non toxique
- Détoxiquent l’alcool dans les cellules hépatiques
Description des mitochondries
- Responsable, avec les chloroplastes, de la production de l’ATP
- Sont la centrale énergetique de la cellule
- Possedent une ultrastructure singulière
- Autonomie limitée
- Origine endosymbiotique: Bactérie était leur ancêtre; similitude avec les bactéries gram -
- Deux membranes:
Externe: Perméable, contient des porines
Interne: Plus importante, non parallèle avec l’externe, contient des plis, F0F1-ATPases - La matrice contient de l’ADN sous forme circulaire, fermé en boucle, contient gènes pour synthèse des protéines (ARN, ribosomes, enzymes, etc)
Code 5% des protéines michondriales, 95 % viennent du cytoplasme
Description des chloroplastes
- Responsable de la photosynthèse chez les végétaux
- Production de matière organique (sucres) à partir de matière minérale (CO2, H2O) par photosynthèse
- Étaient des bactéries phototrophes
- Plus gros que les mitochondries, possède une 3ème membrane et un 3ème compartiment
- Membrane externe poreuse et membrane interne perméable paralleles
Stroma (=matrice) contient l’ADN - Contient des thylakoides (disques empilés), ce sont des sacs membranaires, est le 3ème compartiment, C’est ici que tout se passe, système photosynthètique. (photons, ATP synthétase)
- Code aussi 5% de leur protéines
Définition du cytosquelette
- Sont synthétiser par des polyribosomes (polysomes) libres
- Ensemble de filaments et de tubules responsable de la forme de la cellule eucaryote et des changements de cette forme
Décrire la composition du cytosquelette
- Réseau de fibres qui organise les structures et les activités de toutes les cellule (route)
- Composés d’actine, microtubules et filaments intermédiare
- Responsable du soutien et changement de la forme et mobilité de la cellule (allongement, locomotion, division cellulaire, etc.)
Décrire la structure microtubulaire
Microtubules: hétérodimères (par deux) de tubulines a et b en forme de tube
- Ont pour origine le centre cellulaire et sont responsables de la forme de la cellule ainsi que la disposition des organelles. Kinésine (- vers +), dynéine (+ vers -)permettent aux organelles de se déplacer le long des microtubules. (Transport axonal)
- Constituent le fuseau mitotique responsable de la séparation des chromosomes dans les cellules filles lors de la mitose.
Plusieurs formes précises
- cils et flagelles: 9 doublets et 1 paire au centre (9+2)
- centrioles et cinétomes: 9 triplets sans centre
Nommez les composantes du cytosquelette
1) Microtubules
2) Les structures microtubulaires
3) Les microtubules simples (responsable de la forme, sont polarisés)
4) Les filaments d’actine (se polymériser et dépolymériser rapidement)
5) Les filaments intermédiaires (stables, renforcent)
Description des moteurs protéiques
- Permettent aux organelles et vésicules de se déplacer, alimenter par l’ATP, le long des microtubules immobilisé
- Kinésine (va à droite)
Dynéine (va à gauche)
Grands principes de la théorie cellulaire
4 grands principes de la théorie cellulaire
- La cellule est l’unité structurale et fonctionnelle des organismes vivants
- L’activité d’un organisme dépend de l’activité des cellules
- Les activités biochimiques des cellules sont déterminées par des structures sous-cellulaires spécifiques
- Le maintien de la vie dépend de la cellule
Description de la membrane plasmique
- Bicouche de molécules amphipathiques qui entourent la cellule. Modèle de la mosaique fluide.
Composition: - Lipides ( phospholipides, glycolipides (pas de PO4) et cholestérol)
- Protéines (enchâssées, ancrées et périphériques)
- Le glycocalyx (zone externe contenant des composés glucidiques), devien empreinte (réponse immunitaire, groupe sanguin)
Transport passif
- Transport passif : Aucune protéine n’est réquise
a. Filtration: Déplacement spontané le long d’un gradient de pression hydrostatique (Poids de l’eau)
b. Diffusion: Déplacement spontané le long d’un gradient de concentration, du plus concentré au plus dilué
b1. Simple : passe tout droit ( Liposolubles, gras, stéroides, gaz respiratoires)
b2. Facilitée: Besoin d’une protéine de transport (Hydrosolubles, fructose)
Transport actif
- Transport de molécules ou d’ions par une protéine transmembranaire avec hydrolyse d’ATP. Dépense d’énergie. (contre le gradient de concentration, non spontané)
- Pompe sodium/potassium: Ions K+ plus concentré ds la cellule et diffuse vers l’extérieur, inverse avec Na+.
1. Na+ s’installeront dans les sites de liaison de la pompe stimulant le phosphorylation par l’ATP, ce qui provoque le changement de conformation de la pompe et expulse le Na+ vers l’extérieur.
2. Permettant la liaison avec le K+ extracellulaire qui s’installera dans les sites de liaison opposés. Cette liaison libère le groupement phosphate et occasione le rétablissement de la pompe. Le K+ est ensuite libérer à l’intérieur.
Transport vésiculaire
- Pas de lien avec les protéines
- Rôle important dans exocytose, phagocytose, pinocytose
- Ces mécanismes nécessitent de l’ATP
Décrire les types des protéines membranaires
- Enchâssées: Dans la bicouche de phospholipides, leurs extrémités sont exposées à la face intérieure ou extérieur de la cellule. Si la protéine traverse de part en part = protéine transmembranaire.
- Ancrées: Rattachées à la membrane de phospholipides par un acide gras. Se situent d’un seul côté de la membrane.
- Péripheriques: Ne sont pas ancrées dans la membrane plasmique donc ne pénétrent jamais la bicouche de phospholipides. Se rattachent par des faibles forces hydrostatiques ou des liens H.
Différent rôles des protéines
- Enzymatique: Protéine intramembranaire (ancrée face interne), catalyseur biologique qui transforme la structure moléculaire, Site actif exposé aux substances de la solution adjecente. (Substrate)
Récepteur: Protéine transmembranaire donc la partie en contact avec l’extérieur peut porter un site de liaison dont la forme épouse un messager chimique qui favorise un changement de configuration de la protéine.
- Adhérence: Protéine enchassée de cellules adjecentes peuvent se lier et unir ces deux cellules (jonctions serrées)
- Fixation: Des microfilaments d’actine ou d’autres éléments du cytosquelette peuvent se lier à des protéines membranaires. Leur fonction est de maintien de la forme cellulaire et la stabilité de la protéine.
Structures particulières des membranes
- Jouent un rôle de protection ou de reconnaissance
1. Paroi de peptidoglycane des bactéries: Ferme et souple, empêche les bactéries d’éclater en milieu hypotonique (dilué). Ne protège pas contre un milieu hypertonique (salé)
2. Paroi cellulosique des végétaux: Paroi rigide mais poreuse de cellulose, protection mécanique, empêche les cellules d’éclater suite à l’entrée osmotique de l’eau
- Enveloppe ceinturant les ovules:
- Chez l’oursin: la gangue gétanineuse attire les spermatozoides et la couche vitelline permet l’accrochage de ceux-ci.
- Chez les mammifères: la zone pellucide protége l’ovule dans les trompes utérines et permet l’accrochage sélectif des spermatozoides. Déclenche la réaction de l’acrosome
Les filaments intermédiaires
- Très stables, renforcent la charpente et la forme cellulaire
diméres - tétramères - protofilaments - filaments intermédiaires
- Sont dans le cytoplasme des cellules animales multicellulaires, alors que FI nucléaires (lamines) sont dans le noyau des cellules eucaryotes
Les filaments d’actine
- Se polymérisent et depolymérisent rapidement
- Constituer d’une protéine globulaire nommée Actine-G
- 2 Rangées de perles enroulées
- Entrecroisés forment un gel , alignés parallèlement peuvent glisser les uns contre les autres avec des protéines qui hydrolysent l’ATP (mécanisme de la contraction musculaire, division cellulaire). Des organelles peuvent se déplacer le longs de ces dernières.
Le noyau
- Poste de commande de la cellule
- Molécules d’ADN utilisés pour assembler les protéines sont situées dans le noyau.
- Protège les longues molécules d’ADN des tensions causés par les filaments du cytosquelette
Chromatine
Chromatine: Ensemble de chromosomes (longue molécule linéaire d’ADN bicaténaire) associée à des protéines basiques jouant des rôles structuraux ou enzymatiques.
Les ribosomes
1) - Particule constituées de 2 sous-unités qui à pour rôle de faciliter l’appariement entre les codons et anticodons
- Les 2 sous-unités ne sont ensemble qu’un moment de la synthèse d’une protéine
2) - les polyribosomes (polysomes) est un ensemble de ribosomes, qui peuvent traduire simultanément une molécule d’ARNm
Synthèse protéique
- Polysomes libres: Flottent librement dans le cytoplasme, sont destinées au cytoplasme ou certaines organelles par post-trad. (peroxysomes, mitochondries, noyau)
- Polysomes fixés sur le REG: Libres au début de la traduction se fixent au REG pour faire pénétrer le polypeptide dans la lumière de RE par co-trad.(voir image)
