Chapitre 1-7 Flashcards
Qu’est-ce qui est particulier avec le carbone?
Il posède 4 électrons de valence pour former des liens covalents. Ceci fait en sorte qu’il est la base de toutes les molécules organiques.
Quelle type de liaison est présent dans la molécule d’eau?
Liaison covalente
Comment sont placées les charges dans la molécule d’eau?
L’extrmité de l’atome d’oxygène a une faible charge négative et l’extrémité des atomes d’hydrogène a une faible charge positive.
Quel atome est le plus électronégatif entre l’oxygène et l’hydrogène? Et qu’est-ce que cela crée?
L’oxygène est le plus électronégatif. Il attire donc plus les électrons mis en commun. Ceci fait en sorte que la molécule d’eau est polaire (les atomes n’ont pas les mêmes attractions sur les électrons qu’ils partagent).
Quel mot est utilisé pour décrire des liens qui n’exercent pas la même attraction sur les électrons qu’ils partagent?
Lien asymétrique
Quels sont des exemples de liaisons polaires?
C=O
O-H
N-H
Quel est le contraire d’une liaison polaire? Donne un exemple.
Liaison non polaire (symétrique)
C-H
Quelles molécules se dissolvent dans l’eau entre les polaires et les non polaires?
Les molécules polaires se dissolvent dans l’eau.
Qu’est-ce qui est spécial entre deux molécules polaires? Qu’est-ce qui est particulier par rapport à cette spécialité?
Elles peuvent s’attirer entre elles et créer des liaisons hydrogènes (ponts H). Ces ponts H sont des liaisons faibles et souvent transitoires.
Qu’est-ce que la cohésion?
C’est la capacité d’une substance à être attirées par d’autres molécules semblables.
Qu’est-ce que la cohésion crée dans les molécules d’eau?
L’attraction crée des ponts qui eux crée une forte tension superficielle. Ceci permet, entre autre, aux insectes de marcher sur l’eau et le transport de l’eau des racines vers les feuilles.
Qu’est-ce que l’adhérence?
C’est l’attirances entre deux substances polaires différentes.
Que fait l’adhérence chez les molécules d’eau?
Elle fait que l’eau adhère fortement à toute surface chargée électriquement. Par exemple, l’eau s’attache aux vaisseaux de la feuille, ce qui leur permet de rester humides et pouvoir ainsi absorber le CO2 nécessaire à la photosynthèse.
Que peuvent expliquer la cohésion et l’adhérence?
La capillarité de l’eau, c’est-à-dire sa capacité de monter dans un morceau de papier poreux ou de s’infiltrer.
Quelles sont les propriétés thermiques de l’eau?
Elle a une chlaleur spécifique élevée (Qté de chaleur nécessaire pour passer à ébulition). Ceci permet aux organismes d’éviter les changements trop rapide de leur température interne lorsque le milieu change.
Il y a aussi le refroidissement par évaporation. Lorsque les ponts H se rompent, l’eau s’échappe dans l’air. C’est l’évaporation. En se faisant, les molécules entrainent une partie de l’énergie avec elles, ce qui refroidit la surface.
Pourquoi est-ce que l’eau est un excellent solvant?
Car les molécules polaires et les ions s’y dissolvent facilement. Les molécules d’eau s’assemblent autour des solutés, ce qui les disperse dans le solvant.
Qu’explique le degré de solubilité dans l’eau?
Comment les différentes molécules sont transportées dans l’organisme.
Les composés ioniques (Na+ et Cl- ) et le glucose sont transportés dans le plasma sanguin.
Les acides aminés ont parfois des radicaux hydrophobes, mais ils sont tous assez solubles pour être transportés par le plasma.
Est-ce que l’oxygène est transporté dans le plasma sanguin?
Non
Comme l’oxygène est non polaire, il se dissous donc mal dans le plasma. La majeure partie de l’O2 est transportée par l’hémoglobine contenue dans le globules rouges.
Est-ce que les lipides sont dissous dans le plasma?
Non, pour qu’ils le soient, ils doivent être entourés d’un complexe lipoprotéique, consitué d’une seule couche de phospholipides dont les têtes hydrophiles sont tournées vers l’extérieur, avec les queues hydrophobes vers l’intérieur, avec les lipides à transporter.
Qu’est-ce qu’un monomère?
C’est une petite molécule (glucides, lipides, acides aminés, etc.) pouvant s’unir avec d’autres semblables pour former des polymères, molécules plus complexes.
Ex:
Glucose –> Amidon
Monomère –> Polymère
Quelle est le nom de la réaction où deux monomères s’attachent ensemble? Qu’a-t-elle de spécial?
La condensation. Lorsque les monomères se lient, il y a la perte/création d’une molécule d’eau.
Comment se nomment l’ensemble des réactions métaboliques qui forment des molécules plus complexe en liant des molécules plus petites (par condensation)?
Anabolisme
Quelle est la réaction inverse à la condensation? Qu’a-t-elle de spécial?
L’hydrolyse. Comme la condensation a comme l’un de ses produits une molécule d’eau, l’hydrolyse ne peut PAS se faire sans l’ajout d’une molécule d’eau.
Comment se nomment l’ensemble des réactions de dégradation des molécules complexes en molécules plus simples (ex: digestion)?
Catabolisme
Quelles sont les trois utilisations des glucides?
Source d’énergie
Réserves d’énergie
Éléments structuraux
Quels éléments composent les glucides? Et à quel ratio/formule?
C, H, et O
Ration suivant: (CH2O)n
Quels sont les trois monosccharides?
SAVOIR LES DESSINER
Glucose alpha
Glucose beta
Ribose (à la base de l’ARN)
Comment sont obtenus les disaccharides?
Réaction de condensation entre 2 monosaccharides
Quel est la fonction des disaccharides?
Transport d’un endroit à l’autre
Quels sont les trois disaccharides?
Sucrose (saccharose): condensation entre glucose et fructose
Maltose: condensation entre deux glucoses
Lactose: condensation entre glucose et galactose
Quels sont les trois polysaccharides?
SAVOIR LES RECONNAITRE
Amidon
Glycogène
Cellulose
Quel et le rôle et la composition de l’amidon?
L’amidon est composé d’amylose (condensation de 1-4 glucoses alpha) et d’amylopectine (condensation de 1-4 glucoses alpha mais avec 1-6 embranchements).
Il sert à l’entreposage des glucides chez les plantes.
Quel et le rôle et la composition du glycogène?
Le glycogène est composé de 1-6 glucoses alpha.
Il sert à l’entreposage des glucides chez les animaux. Il permet aussi une utilisation rapide des réserves.
Quel et le rôle et la composition de la cellulose?
La cellulose est constituée de glucose beta et sert de matériau de structure chez les plantes. (Constituant de la paroi cellulaire) Celle-ci donne une solidité/rigidité à la cellule végétale.
Comment se nomme la liaison entre deux glucoses beta? Quel est le type de liaison?
C’est une liaison covalente qui s’appelle glycosidique.
Quelle est LA caractéristique commune au groupe hétérogène (avec bcp de différences) des lipides?
Ils ne se dissolvent pas dans l’eau dû à une présence importante de liaisons non polaires C-H.
Quels types de lipides ont comme base les acides gras?
Les tryglycérides (huiles et graisses) et les phospholipides (constituant des membranes plasmiques).
Quelle est la composition des acides gras?
Ils sont composés de C, H et O, comme les glucides, mais possèdent beaucoup moins de O.
Quelle est la différence entre un acide gras saturé et insaturé?
SAVOIR DESSINER LES DEUX
Un acide gras insaturé est insaturé en H. C’est-à-dire que l’un ou plus des carbones manque un H, créant un coude. Le coude est créé par les atome H qui se repoussent. Comme les saturés n’ont pas ce coude, ils sont solides à la température de la pièce. Les insaturés sont liquides à la température de la pièce.
Quelle est la différence entre un acide gras monoinsaturé et un polyinsaturé?
Le monoinsaturé ne manque qu’un seul H alors que les polyinsaturés en manquent deux ou plus.
Quelle est la différence entre les acides gras polyinsaturés trans et cis?
Naturellement, dans un polyinsaturé, les coudes sont tous du même côté. Lorsque c’est le cas, cela s’appelle “cis”.
Artificiellement, des polyinsaturés trans ont pu être créés. C’est-à-dire qu’ils manquent tout de même deux ou plus H, sauf qu’ils sont de côtés opposés. Ils n’ont donc aucun coudes et sont solides à la température de la pièce.
De quoi sont formés les triglycérides?
Ils sont formés par la condensation entre trois acides gras et une molécule de glycérol. Il contiennent du C, H et O.
Qu’est-ce qui est spécial par rapport aux phospholipides?
Ce sont des lipides de structure, c’est-à-dire qu’ils ne sont pas impliqués dans l’énergie de l’organisme.
De quoi sont composés les phospholipides?
Triglycérides où l’un des acides gras et remplacé par un groupement phosphate, lui-même lié à un groupement amine. Ils contiennent donc du C, H, O, P et N.
Quelle est la particularité des stéroïdes?
Ils sont des lipides mais ne sont pas à base d’acide gras.
De quoi sont formés les stéroïdes?
Ils sont formés de quatre cycles carbonés (?) qui contiennent peu de liaisons polaires. Ils ne se dissolvent donc pas dans l’eau.
Quel est le nom du polymère de glucose chez les animaux et celui chez les plantes?
Animaux: glycogène
Plantes: amidon
Quels sont les avantages des glucides par rapport aux lipides?
Les glucides, même s’ils contiennent moins d’énergie, celle-ci se libère beaucoup que celle des lipides en énergie réutilisable.
Quels sont les avantages des lipides par rapport aux glucides?
Les lipides dégagent plus que 2x l’énergie des glucides pour le même poids. (C’est 6x pour le glycogène car il est toujours associé à l’eau).
Autre que l’entreposage de l’énergie, quelles sont les fonctions des graisses (lipides)?
Isolement thermique (gras périphérique)
Absorption des chocs (gras autour des reins)
Entreposage des vitamines liposolubles (autre que B et C)
Entreposage des produits toxiques
Comment se nomment les monomères à la base des protéines? De quoi sont-ils formés?
SAVOIR LES DESSINER
Acides aminés
Ils sont formés de C, H, O, N et parfois du S
Comment se nomment les éléments de structure de acides aminés?
Groupement carboxyle (il peut être ionisé (COO-) ou non ionisé (COOH)) Radical (il y en a 20 différents) Groupement amine (formé de H et de N) Un carbone (au centre)
Quels sont les trois types d’acides aminés?
Polaires (vont se trouver près de l’eau)
Non polaires (enfouies loin de l’eau)
Chargés
Qu’est-ce qu’un dipeptide?
C’est une molécule obtenue à la suite de la condensation entre deux acides aminés.
Qu’est-ce qu’un polypeptide?
C’est une molécule obtenue à la suite de réactions de condensation successives entre des acides aminés.
Comment se nomment les liaisons reliant les acides aminés dans un dipeptide ou un polypeptide?
Liaisons peptidiques
Quelle est la différence entre une protéine et une chaine polypeptidique (polypeptide)?
Une protéine, contrairement au polypeptide est fonctionnelle.
La protéine ce définit donc de cette façon: un composé fonctionnel formé d’une ou plusieurs chaines polypeptidiques).
Qu’est-ce que la structure primaire d’une protéine?
Une séquence linéaire d’acides aminés (chaines polypeptidiques).
Quelles sont les deux structures secondaires de la protéine possibles? Comment “tiennent”-ils?
L’hélice alpha et le feuillet plissé beta. Ils sont causé par les ponts H entre le groupement carbonyle (C=O) d’un a.a. et le groupement amine d’un autre a.a. :
rapprochés (alpha)
ou
éloignés (beta)
Par quoi est causée la structure tertiaire de la protéine?
Les diverses interactions chimiques entre les radicaux des a.a. Par exemple, les a.a. non polaires vont être au centre de la protéine. Ceci se nomme les interactions hydrophobes.
Quels sont les deux liaisons trouvées dans la structure tertiaire de la protéine?
Ponts H Liaisons disulfures (liaison covalent S-S très solide)
Structure quaternaire (pas le gout de faire une question)
Lol
En quoi consiste la dénaturation des protéines?
C’est la perte de la “conformation tridimensionnelle” de la protéie causée par le bris des liaisons faibles (ponts H).
En ce faisant, la protéine perd ses propriétés biologiques.
Quelle est la fonction de l’insuline?
Hormone qui retire les quantités excédentaires de glucose dans la circulation sanguine.
Quelle est la fonction de l’immunoglobine?
Ce sont les anticorps qui nous protègent contre une multitude d’éléments pathogènes en se liant à des antigènes spécifiques
Quelles est la fonction du collagène?
Protéine de structure qu’on retrouve dans les os, la peau, les vaisseaux sanguins.
De quoi est constitué le collagène?
Trois polypeptides qui, en s’enroulant l’un autour de l’autre, confère une grande solidité aux tissus.
Quelle est la fonction de la rhodopsine?
Pigment qu’on retrouve dans les bâtonnets de la rétine. En changeant de forme à la lumière, un signal et envoyé au cerveau.
Quelle est la fonction de la Rubisco?
Enzyme à la base de la fixation du carbone atmosphérique lors de la photosynthèse.
Qu’est-ce qu’une enzyme?
C’est une protéine (ou rarement de l’ARN) qui catalyse une réaction chimique sans modifier son résultat.
Quel suffixe est utilisé pour nommer une enzyme?
-ase
Comment fonctionne une enzyme?
Abaisse l’énergie d’activation de la réaction
Rapproche les molécules de substrat, ce qui augmente le nombre de collisions en les orientant de façon favorable
Qu’est-ce que le site actif?
Cavité que contient l’enzyme où les substrats se fixent et où la réaction est catalysée.
Quelles sont les trois particularités des enzymes?
Le site actif a une affinité chimique pour les substrats, en plus d’une complémentarié physique.
Les enzymes sont spécifiques à un type de liaison chimique et non à un certain substrat (ex: les lipases brisent n’importe quel acide gras).
Les enzymes sont modifiés temporairement dans la réaction qu’elles catalysent. Elles peuvent donc catalayser la réaction plus d’une fois.
Qu’est-ce que la dénaturation des enzymes?
C’est la perte de la “conformation tridimensionnelle” de la protéie causée par le bris des liaisons faibles (ponts H).
En ce faisant, l’enzyme perd ses propriétés biologiques. Elle peut être réversible ou irréversible.
Quels sont les trois facteurs affectant l’activité enzymatique?
Température
pH
Concentration de substrat
Comment la température affecte-elle l’activité enzymatique? Y a-t-il un maximum?
Plus elle augmente, plus les molécules bougent (+ énergie cinétique). Il y a donc plus de collisions, et donc la réaction se déroule plus rapidement.
À un certain point, les collisions seront tellements rapides qu’elles vont briser les ponts H et dénaturer l’enzyme.
Comment le pH affecte-il l’activité enzymatique?
Lorsque le pH change, la complémentarité chimique entre le site actif et le substrat est perdue, cela fait donc baisser l’activité enzymatique.
Comment la concentration de substrat affecte-elle l’activité enzymatique? Y a-t-il un maximum?
Plus il y a de substrat, plus il y a de collisions entre celui-ci et l’enzyme.
À un certain point, chaque enzyme disponible sera occupé, la réaction ne pourra donc pas être plus rapide. Ce plateau s’appelle vitesse maximum (Vmax)
SAVOIR RÉTRO-INHIBITION
Pas le goût de faire de questions
Quels sont les avantages d’immobiliser (fixer à un plus gros support) une enzyme?
Elles sont plus stables et peuvent donc être utilisées de façon continue.
Comme elle sont plus grosse, il est facile de les séparer/retrouver pour les réutiliser.
On augmente la concentration de l’enzyme, donc la vitesse de réaction augmente aussi.
Lactase et lactose
SAVOIR
Pas le goût de faire de question
Quelles sont les 4 classes majeures de composés organiques?
Glucides
Lipides
Protéines
Acides nucléiques
Que forment les acides nucléiques?
Les gènes, les unités de l’hérédité.
De quoi sont responsables les acides nucléiques?
Ils sont responsables de la reproduction des protéines à partir de l’information contenue dans les gènes.
Comment se nomment les unités de bases des acides nucléiques?
SAVOIR DESSINER
Nucléotides (monomères)
Quelles sont les deux catégories de bases azotées? Quels bases font partie de quelles catégories?
Purines (deux cycles):
Adénine
Guanine
Pyrimidines (un cycle):
Thymine / Uracile
Cytosine
De quoi sont formés les nucléotides?
Groupement phosphate
Glucide (ribose ou désoxyribose) Le glucide à 5 carbones se nomme pentose
L’une des 5 bases azotées
Lorsque les nucléotides se lient, quelles parties de celui-ci se lient et par quel type de réaction? Quel est le nom de cette liaison?
Suite à une réaction de condensation, le sucre d’un nucléotide et le groupement phosphate d’un autre se lient et forment une liaison phosphodiester. Les bases azotées restent sans liaison sur le côté.
Qu’est-ce que l’ARN? (nom)
Acide ribonucléique
Qu’est-ce que l’ADN? (nom)
Acide désoxyribonucléique
Quelles sont les différences entre l’ADN et l’ARN?
Nombre de chaines de nucléotides
ARN: 1 (monocaténaire)
ADN: 2 (bicaténaire)
Pentose
ARN: ribose
ADN: désoxyribose
Bases azotées:
ARN: A, G, C et U
ADN: A, G, C, et T
Comment se lient les bases azotées dans l’ADN?
Par des ponts H
Quelles bases azotées se lient entre elles? Combien y a-t-il de ponts H?
A-T (2 ponts H)
C-G( 3 ponts H)
Quelle est la forme de l’ADN?
SAVOIR DESSINER AVEC LES NUCLÉOTIDES EN FORMES
Une hélice torsadée
Les deux chaines de l’ADN sont antiparallèles. Qu’est-ce que cela veut dire?
Elles ne “vont” pas dans le même sens. Par exemple, si nous avons 10 paires de nucléotides, les extrémités s’arrangeraient de cette façon (les chiffres représentent le numéro du carbone à l’extrémité):
3—5 (brin 1)
5—3 (brin 2)
Combien de paires de nucléotides y a-t-il dans un tour complet de spire?
10
Quel est le modèle de la réplication de l’ADN? En quoi cela consiste-t-il?
Semi-conservatif. Les deux brins d’ADN se séparent et chacun vas “créer” un deuxième brin. Les deux nouveaux brins seront donc 50% anciens et 50% nouveaux
SAVOIR LA RÉPLICATION DE L’ADN AU COMPLET!!!
IMPORTANT!!!
Quelles sont les 5 enzymes jouant un rôle dans la réplication de l’ADN? Les nommer dans leur ordre d’apparition.
1) Hélicase
2) ADN primase
3) ADN polymérase III
4) ADN polymérase I
5) Ligase
Dans quel sens est-ce que l’ADN polymérase code (agit)?
5 vers 3 du nouveau brin (3 vers 5 de l’ADN)
Quel est le problème causé par l’antiparralélisme de l’ADN? Comment cela est-il arrangé? Y a-t-il un nom spécial à cette solution?
Comme elle n’agit que du 5 vers 3, un brin sera codé sans problème. L’autre par contre, sera plus problématique car il est en sens opposé. La solution est que l’ADN sera codé dans le bon sens, mais par petits fragments. Ces fragments se nomment “fragments d’Okazaki”.
