Chapitre 1 Flashcards
Nommer des milieux extrèmes ou l’on peut retrouver des virus
grotte, désert (cachés des UV), froid
Vrai ou faux, la complexité d’un virus dépend de sa taille
faux
vrai ou faux, les vieux virus ont moins de gènes que les plus nouveaux
Faux
nommer la principale flore commensale virale de l’Homme
dans le sang
qu’est-ce que la susceptibilité?
le fait que certains individus dans une population soit plus apte a développer une infection virale que d’autre
Qu’est-ce que le virome? Que comprend-il?
C’est l’ensemble de tous les virus qu’un organisme possède. Comprend :
- infections virales persistantes et les infections virales aigues
- les nouvelles particules virales et de bactériophage
- les bactériophages (permet contrôle des populations bactériennes et de l’échange de gènes de résistance)
Qu’est-ce qu’une séquence virale fossile?
Séquence endogène provenant de rétrovirus que l’organisme a conservé et utilise
Que cause la variété des virome d’un individu à l’autre?
= transcription différente des gènes des individus
Quel sont les types de virus de la cellule eucaryote?
Symptomatique
Asymptomatique
Qu’est-ce que la morbidité?
à quel point un individu infecté à des symptômes
De quoi dépend la santé intestinale du point de vue de la virologie?
de l’équilibre virome et microme en terme de diversité, sinon peut causer maladie de Crohn
Quelles sont les fonctions des virus endogènes?
- Expression du virus originale ou recombinant
- Effets sur l’expression des gènes (Ex.: amylase salivaire avec promoteur viral)
- Création de protéines essentielles à la vie (ex.: protéine env)
Quels sont les effets de la protéine env?
permet internalisation du virus = cellules multinuclées au niveau placentaire ce qui augmente la tolérance de la femme sur le foetus
Pourquoi il a été difficile de découvrir les virus?
- technologies d’observation et d’analyse limitées
- incultivables hors cellules
- pas de gènes spécifique
- peu de matériel
- pas de banque de données
Quel est la différence entre un virion et un virus?
virion : particule infectieuse complète
Virus : l’agent infectieux à tous stades
Que compose un virus nu?
Génome et capside = nucléocapside
Que compose un virus enveloppé?
Génome, capside et enveloppe
À part la composition, qu’est-ce qui différencie les virus enveloppés des virus nus?
- Sortie, nus ont tendance à faire éclater la cellule VS enveloppés la font bourgeonner
- Résistance, nus plus résistant dans l’environnement
Vrai ou faux : le génome d’un virus peut coder pour la synthèse d’ATP
FAUX
pour quoi code un virus?
protéines de structure, enzyme de réplication ou protéines de régulation
Que permet un génome d’ARN+ comparé à un génome ARN-?
D’être transcrit directement par la cellule (dans le bon sens pour les ribosomes)
Comme aucune RdRp n’est présente chez la cellule eucaryote, comment doit s’adapter un virus à ARN?
- doit coder pour RdRp ou doit l’avoir pas loin
Que compose le capside?
Sous unités protéiques
Quelles sont les fonctions du capside?
protéger et aider la fixation du virus sur la cible
Comment s’assemble le capside?
Majoritairement par auto-assemblage par symétrie sinon doit coder / trouver des enzymes pour l’assemblage (protéines d’échafaudages)
Quand le capside s’assemble, quelles sont les sous-structures formées?
Protomère - capsomère - capside
Quel est le nom de la structure permettant d’encastrer les acides nucléiques dans le cas d’un virus hélicoidale?
RIGOLE
Quels sont les 5 paramètres qui définissent le capside hélicoidale?
- nb de sous-unité / tour
- pas de l’hélice
- angle psi
- nb d (distance entre 2 sous-unités)
- longueur d’hélice
Quel signal permet que le génome se loge dans le capsomère puis que chaque morceau dans le cas d’un virus hélicoidale?
signal pac
Combien de face à un virus icosaédrique?
20 faces, 12 sommets et 30 arrêtes
dans le cas d’un virus icosaédrique, à combien de faces est lié chaque sommet?
5 faces (donc 12 pentamères par virion)
Combien d’unité compose un virion?
12 sommets * le nombre de capsomère qui touche le sommet = (minimum de 60)
Qu’est-ce que l’hexamère?
chaque arrête ou face est entouré de 6 capsomères, donc la quantité dépend de la taille du virus
Qu’est-ce que le nombre de triangulation?
nombre de structure composant un sous-triangle de chaque versant
Nommer un virus à symétrie complexe
bactériophage
Que compose l’enveloppe?
Phopholipides et des fois glycoprotéines
D’ou peut provenir l’enveloppe?
membrane cytoplasmique, nucléaire, R.E.
Mise à part le génome, le capside et l’enveloppe, de quoi peut être formé un virus?
- protéine limitant le mouvement de l’enveloppe sur le capside
- Enzyme : protéase, polymérase, intégrase, de modification, polyA polymérase et topoisomérase
- Structure permettent le sabotage ou camouflage
- Composantes cellulaires
Quelle est la classification de Baltimore
- ADN db : transcrit = ARN+
- ADN sb : répliquer - transcrit = ARN+
- ARN db : transcrit ARN- = ARN+ (RpRd)
- ARN sb + : direct
- ARN sb - : transcrit = ARN + (RpRd)
- ARN sb + : transcriptase inverse = ADN db
- ADN db mais un des brins est segmenté
Quelles sont les grandes étapes du modèle d’infection viral?
- Stade initial : entrée du virus
- Période d’incubation et dissémination du virus dans l’hôte
- Multiplication du virus
- l’organisme infecté
- dissémination du virus vers individus sains
Que permet le réservoir?
une réplication dynamique du virus afin que celui-ci demeure capable d’initier une infection productive
Le vecteur peut être un réservoir ou un réservoir secondaire
Le vecteur peut être un réservoir ou un réservoir secondaire
Quel sont les modes de transmission possible?
- Voies respiratoires
- Féco-orale
- Parentérale (injection / sang)
- Sexuelle
- Mère-enfant
- Via des vecteurs
- Zoonose
- Iatrogène (médicale)
De quels facteurs dépend la sévérité d’une infection?
- état immunologique
- quantité de l’inoculum
- état physique
- niveau économique (traitements)
vrai ou faux : plus un pathogène est virulent, moins il a tendance à être propagé
vrai (plus les symptomes sont graves, moins on se déplace)
Que signifie avoir un génome efficace?
possibilité de cpmléter un cycle de multiplication puis d’être disséminé.
Que cause la grande multiplicité d’infection des virus?
- favorise les mutations, donc la virulence varie, après un cycle ce n’est pas tous les virions qui sont infectieux, rend encore plus difficile la quantification de virus
Quelles sont les moments possibles de transmettre un virus de la mère au foetus?
- Prénatale
- Périnatale
- Postnatale
Quelles sont les portes d’entrées de l’organisme?
Muqueuses, plaies, orifices quelconque
Quel est le but de la période d’incubation?
Former assez de descendants pour continuer l’infection
Par quel moyen un virus dans l’hôte peut se propager plus loin dans l’organisme?
- Contact cellule-cellule
- Voies lymphatiques
- Voies Sanguines
- Trajets nerveux
À quoi correspond la dissémination au niveau clinique?
L’apparition des symptômes
Qu’est-ce que le tropisme?
préférence du virus envers un types cellulaires, souvent due aux récepteurs de la cellules (compatible avec virus)
Quel est le patron de réplication d’un virus au niveau de la cellule pour un infection productive?
- interaction spécifique protéine de surface et récepteur = entrée du virus dans la cellule
- expression des gènes viraux par la cellule hote
- protéines virales modifient la cellule, permet réplication du virus
- Assemblage des protéines du capside et inclusion du génome
- Relarguage des virus et reprise du cycle
Quelles sont les types d’infection possible?
productive (complète VS aigue)
abortive
latence
Infection lytique VS tempérée (virus dans génome) VS transformante (modifie fonctionnement de cellule)
Infection lytique VS tempérée (virus dans génome) VS transformante (modifie fonctionnement de cellule)
Quelles réactions sont observables au niveau de l’organisme ciblé?
- rx des cellules
- rx des tissus
- rx de l’organisme
Est-ce que les effets cytotoxiques d’un virus sont en lien avec ses effets pathologiques ou sa virulence?
Nan, vrm pas
Quels sont les types de défense non-spécifiques?
Barrière cutano-muqueuse
Interférons
Phagocytes et action de macrophages
Quels sont les types de défense spécifique de l’organsime?
Ac (IgM - IgG - IgA)
Lymphocytes T
Cellule K
Quels sont les moyens de dissémination des virus?
direct et indirect
Par les voies d’excrétion
Qu’est-ce que la pathogénicité?
Somme des fonctions virales qui contribuent à la propagation du virus dans les cellules infectées, organisme, population.
Quel est le facteur majeur de la pathogénicité?
génotype
Qu’est-ce que la virulence?
sévérité des symptômes d’une maladie
Quels facteurs influencent la virulence?
interaction entre gènes viraux et défenses de l’hôte, santé générale de l’hote, société et facteurs économiques
Quels sont les trois paramètre de l’épidémie?
Hote, environnement et pathogène
Qu’est-ce qu’une épidémie?
nombre de nouveau cas anormalement élevé sur une période et sur un territoire limités
Qu’est-ce qu’une endémie?
nombre de cas anormalement élevé sur une zone géographique limitée mais sans limite de temps
Qu’est-ce qu’une pandémie?
nombre de cas anormalement élevé sur une période limité mais non limitée dans l’espace
Qu’est-ce que la prévalence?
Mesure du nombre des cas existant de la maladie
Qu’est-ce que l’incidence?
Mesure du nombre de nouveau cas d’une maladie
Qu’est-ce que la contagiosité?
capacité du virus à déclencher une maladie chez une personne infectée
Qu’est-ce que le RO et que représente-t-il?
Taux de reproduction de base d’un virus, calculé sur une population sensible.
Si = 1 : 1 personne infecte une personne
Si moins de 1 n’égale pas une pandémie
Transmissibilité * nb de contact * duré de la période contagieuse.
Chaque moyen de transmission à son RO
Qu’est-ce que le RE?
RO * % de la population qui est susceptible (sans vaccin et qu’il la jamais eu)
Détection et diagnostic d’un virus selon des méthodes directes et indirectes
Détection et diagnostic d’un virus selon des méthodes directes et indirectes
Quelles sont les méthodes directes de détection des virus?
- microscope électronique
- propagation in vitro
- mesure de l’activité biologique - quantification
- mesure Ag viraux
- mesure génome viral
Quelles sont les méthodes indirectes de détection des virus?
Mesure des Ac
Autres (puces à ADN)
Quels sont les diverses méthodes de propagation in vitro?
- cellules primaires
- cellule en système semi-continu / lignées continues
- propagation dans l’oeuf
Quels sont les niveaux de sécurité associé aux virus?
1 : n’infecte pas les animaux ni les humains
2 à 4 augmente en fonction de la sévérité des symptômes
Cas A : premier qui amene la maladie
Cas index : premier documenté
Cas A : premiere qui amene la maladie
Cas index : premier documenté
