chap3 Flashcards

1
Q

Qu’est ce qui cause la degradation des adn

A

Biotique: enzyme
Abio: radiation, oxyge, Hydro

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2
Q

Dans ces différents ecosystemes, Combien de temps dure les ADN

Marin
Eau douce
Sédiment
Pergelisol 
Glace
A
7j 
30J
3000 ans
600 000 ans
500 000 ans
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3
Q

Avec quel marqueur détecte on l’ADN ancien ?

Quel eput etre l’utilité

A

COI
Détecter extinction

Microsatellite et SNp possible aussi

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4
Q

Que sont les 4 composantes de L’AD N et leur influences

A

ORigine Primare: feces, decomposition, secretion mucus= vient de l’Animal
Secondaire; ;predateur secondaire, une carcasse, bruit de fond

Etat 
intramembranaire
Extramembranaire 
Particule 
Dissous 

Transport
Bio, bullaste, resuspension, aquarium , rviière
–>essentiel dispersion temps et espace

Durée 
= degradation 
Selon environnment (sédiment ou eau )
interaction biotiqu e
abiotique 
conformation 

-Caracterisation ADN (conform, longueur)
Environnement biotique et abiotique

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5
Q

Qu’est ce que la production Net

Selon l’articles, qu’est ce qui a un impact

A

Degrdation + production
Voir fueille
TEMPERATURE ET MASSE D’EAU

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6
Q

Que sont les aspects contributaires de L’ADNe

A

Écologie
Conservation
Espece invasive
Biomonitoring

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7
Q

Que sont les avantage de l’unitlisation de l’ADN e en ecologie

A
Avantage 
Utilise pour quantifier la ichesse
Diversité à dif echelles
Mesurer biodiv et ecosyst
Estimation biodiv 

Desavantage : pb technique estimation abondance

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8
Q

Que sont les avantage de l’unitlisation de l’ADN e en conservation

A
  • Non invasif
    Rapide
    Peu cher
    M marque, m protoco, standardiser= bonne base interprtation

Desavantage: on repond pas aux question demo, poplation, structure age

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9
Q

Que sont les avantage de l’unitlisation de l’ADN e en invasive

A

Dectetion en faible abondance avant dégat
Dispersion

faux neg ou faux postif

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10
Q

Que sont les avantage de l’unitlisation de l’ADN e en biomonitoring

A

Detection d’espce cryptique, stade de vie etc.
aps de dommages

Quantifier diversité dur

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11
Q

Que sont les ETape d’une étdue avec ADN e

A

1-Question:
on cherche quoi

2-Echantillonage : 
Ou ? 
Combien de sites 
Combien d'échantillon ? 
Quantité ADn ? 
Stockage 

3-Stockage:
ADn dans tampon, loin chaleur et lumière
- filtrer avant 24h, retirer filtre

4-Définir régions à amplifer
-Marqueur: pour quoi & 
Recup sequence dans Genbank ou blod
ADN mt ; quel ?
Si nv espèce; dvp amorce; alignement sequences 

5-Amplificaiton
ADn court ?
Quelle resoltion ? famille ? genre ?
Prendre une sequence qui varie et qui soit versatil

6-Analyse:
1 espèce ?
petite seq= sanger, peu seq
amorce spé

Plusieurs ; amorce
amorce universelle
seconde géné

8Bio info:
Nettoyer données, rechercher avec genbank
Blast si pas de ref; alignement

RÉSULTATS

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12
Q

COmment obtenir info sur réseau trophique

A

feces

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13
Q

Qu’est ce qui est important quand on utilie ADNe

A

Avoir comparaison avec visuel;

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14
Q

Si on veut detecter un espèce, qu’utilise on ?

Si on veut étudier l’écologie

A

visuel

ADNe

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15
Q

Quel est l’impact des chromosomes sexuels sur la diversité

A

La diversité génétique est réduite sur les chromosomes sexuels
(e.g. la taille efficace du X dans un système X/Y est de ¾ Ne = Il ne recombine que chez les femelles!)

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