Chap 2 notions de chimie indispensables Flashcards
atomes molécules et interactions
qu’est ce qu’un composé organique?
les composés dont un des éléments chimiques constitutifs est le carbone
ions inorganiques
correspondent à seulement 5% maximum de la masse de l’organisme. Ces éléments sont présents
presque exclusivement sous forme d’ions inorganiques (excepté le calcium qui existe sous les deux formes : organique et inorganique). Ce sont :
Le sodium (Na)
Le potassium (K),
Le magnésium (Mg)
Le calcium (Ca),
Le chlore (Cl)
Les éléments principaux ou macroéléments
95 à 99% de tous les atomes présents chez
les organismes vivants correspondent à seulement 4 éléments. Ce sont :
L’hydrogène (H)
L’oxygène (O)
Le carbone (C)
L’azote (N)
A ces quatre éléments principaux, nous ajouterons le phosphore (P) et le soufre (S), beaucoup moins
représentés mais très souvent associés aux 4 autres éléments dans les biomolécules.
liaison covalente
Pour être stables, d’autres éléments vont partager des électrons de leur couche périphérique avec d’autres atomes afin de « compléter » leur couche électronique externe
=> formation de liaisons covalentes => formation de molécules
electronégativité
C’est la « force » avec laquelle un atome attire les électrons. Plus un atome est
électronégatif plus il a tendance à capturer des électrons supplémentaires.
Celle-ci augmente du bas vers le haut et de gauche à droite du tableau : le francium est donc
l’élément le moins électronégatif et le fluor le plus électronégatif.
Concernant les macroéléments, N et O sont les plus électronégatifs
hétéro atome
est un atome d’une molécule organique
différent du carbone ou de l’hydrogène. Dans les biomolécules ce sont l’oxygène, l’azote, le soufre…
liaison polarisée
Si 2 atomes présentant des électronégativités différentes sont liés l’un à l’autre (comme
ici C et O), les électrons de liaisons sont attirés par l’atome le plus électronégatif, la répartition des
charges négatives et positives est alors asymétrique et la liaison est dite polarisée
dipole electrique
Pour une molécule poly atomique son moment dipolaire est la résultante de la somme
vectorielle des moments dipolaires de ses liaisons, c’est pourquoi le moment dipolaire global d’une molécule dépend de sa géométrie
dipole permanent = molécule polaire
Une molécule qui du fait de sa structure atomique et de sa géométrie présente une distribution
asymétrique des charges est un dipôle permanent (la molécule est dite polaire)
groupement polaire
Un groupement polaire est un groupe d’atomes qui contient au moins un atome électronégatif (O, N et éventuellement S) responsable du caractère polaire de la molécule.
Expliquer ce qui, dans la structure des molécules, leur permet par exemple d’interagir entre elles pour former
des structures plus importantes.
le caractère plus électronégatif de certains éléments permet d’expliquer la réactivité des groupements qui le contiennent (groupements
fonctionnels) et les mécanismes des réactions du métabolisme.
Cela va nous permettre également de comprendre les interactions que les biomolécules
peuvent établir, entre elles d’une part, avec leur environnement d’autre part.
groupement fonctionnel
Structures sub-moléculaires (une partie de la molécule) formées d’un assemblage d’atomes qui confère une réactivité propre à la molécule qui le contient déterminent les propriétés chimiques des molécules qui les contiennent.
amide (somme)
carboxyle + amine
ester (somme)
carboxyle + hydroxyle
ether (somme)
carboxyle + hydroxyle