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Chap 11 - MARQUEURS GÉNÉTIQUES Flashcards

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Multiplication Tables flashcards
1
Q

Trois techniques de base des marqueurs génétiques

A
  • PCR
  • enzymes de restrictions
  • séquençage de l’ADN
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Q

quel type d’ADN est impliqué dans la PCR

A

ADN polymérase

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3
Q

technique d’amplification d’ADN

A

PCR

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4
Q

Qu’est ce que la taq polymérase

A

ADN polymérase, stable a T°C élevé

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5
Q

Technique qui coupe l’ADN (nucléases)

A

enzymes de restrictions

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6
Q

A quoi sert le séquençage d’ADN?

A

Déterminer l’ordre des nucléotides dans une molécule d’ADN

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7
Q

Qui suis-je? Séquence d’ADN avec une location connue qui peut être utilisée pour dentifier des individus dans une population

A

marqueurs génétiques

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8
Q

Quels sont les modifications possibles grâce aux marqueurs? (3)

A
  1. Différences dans la séquence de nucléotides (SNP)
  2. Délétion ou insertion d’un fragment d’ADN dans la séquence
  3. Variation dans le nombre de répétitions en tandem
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9
Q

Marqueurs qui reposent sur la PCR? (4)

A
  • CAPS
  • HRM
  • InDel
  • Microsatellite
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10
Q

nommer l’avantage et les 2 inconvénients des CAPs

A

avantage: facile d’utilisation

inconvénient:
* Nécessite un site de restriction à l’endroit précis de la différence dans la séquence (pas toujours possible)
* Un peu plus long et coûteux que les marqueurs InDel ou microsatellites (Ils ne nécessitent pas de digestion)

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11
Q

quels sont les deux marqueurs possible de détecter les mutations

A

CAPS
HRM

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12
Q

Qu’est ce que HRM implique?

A

La technique repose sur les différences de la température de dissociation

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13
Q

Les marqueurs InDel sont basé sur quoi?

A

sur la détection d’une insertion ou d’une délétion

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14
Q

Quel est l’avantage des marqueurs InDel?

A

Très facile et efficace

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15
Q

Les marqueurs InDel sont généralement utilisé:
* entre espèces
* à l’intérieur d’un même espèce

A

même espèce

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16
Q

Séquence d’ADN formée d’une répétition continue de courts motifs de nucléotides (2 à 10 nucléotides).

A

les microsatellites

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17
Q

Avantage des microsatellites

A

Hautement polymorphiques

18
Q

quels sont les deux utilisation du séquençage de nouvelle génération?

A
  • découvrir les différences qui servent à développer des marqueurs
  • utilisé directement pour génotyper les plantes
19
Q

le Séquençage complet du génome de chaque individu d’une population permet quoi?

A

de détecter toutes les variations

20
Q

les 2 avantages du séquençage partiel du génome de chaque individu

A
  1. Beaucoup plus économique
  2. S’applique à toutes les espèces peut importe la taille du génome
21
Q

qu’est ce que le multiplexage?

A

technique qui permet de séquencer plusieurs échantillons à la fois

22
Q

quels sont les avantages du séquençage de nouvelle génération comparer aux marqueurs traditionnelles? (2)

A
  1. Beaucoup plus rapide
  2. Peut être appliqué à des espèces dont on connaît peu la génétique
23
Q

Vrai ou faux:
La grande majorité des modifications de l’ADN que l’on utilise pour faire un marqueur est aussi responsable du phénotype observé?

A

F

24
Q

Quels sont les raisons d’avoir des cas où le phénotype ne correspond pas au génotype obtenu par le marqueur? (2)

A

mutations
recombinaison

25
Q

Quels sont les situation où un marqueur est fiable (2)?

A
  • Si les deux mutations sont apparues au même moment ou presque
  • s’il y a eu sélection et que les individus avec les deux mutations ont survécu aux dépens des individus avec la situation intermédiaire
26
Q

Vrai ou faux:
pour qu’un marqueur soit fiable, il ne peut pas y avoir aucune exception dans la population

A

F
il arrive parfois quelques exception

27
Q

Plus un marqueur est lié génétiquement à sa cible et plus il sera:

  • fiable
  • instable
A

fiable

28
Q

comment peut on diminuer les erreurs?

A

ajouter un marqueur à l’autre extrémité

29
Q

comment se nomme le type de marqueur pouvant être responsable du phénotype?

A

marqueur direct

30
Q

où sont conçu les marqueurs directs?

A

au site même de la mutation

31
Q

Pourquoi c’est difficile d’avoir un marqueur lié au phénotype (2)?

A
  • Difficile de déterminer le gène responsable d’un phénotype
  • Encore plus difficile de déterminer la mutation dans le gène ou autour du gène qui est responsable
32
Q

Vrai ou faux:
Le taux de recombinaison est très faible dans les régions avec beaucoup d’hétérochromatine

A

V

Cela veut dire que deux marqueurs éloignés de1cM près du centromère peuvent être à plus de 10 millions de paires de bases de chacun

À l’inverse, deux marqueurs dans une région d’euchromatine éloignés de 1cM pourraient être séparés par seulement 100 000 paires de bases

33
Q

une région avec beacoup d’hétérochromatine rend difficile… (3)

A
  1. D’identifier un gène (vaste zone à analyser)
  2. D’obtenir des recombinants
  3. De développer des marqueurs physiquement proches
34
Q

De quoi est constitué un gel pour faire migrer de l’ADN?
* gélatine
* amidon
* agarose

A

agarose

35
Q

vrai ou faux:
Un fragment d’ADN de 200 pb va migrer plus loin dans un gel qu’un fragment de 400 pb

A

V

36
Q

vrai ou faux:
Une enzyme de restriction a comme fonction de restreindre l’accès des protéases coupant l’ADN

A

F

37
Q

Le séquençage traditionnel de l’ADN est parfait pour le séquençage d’un génome, car il permet d’obtenir de grandes quantités d’informations (des millions de bases) avec une seule réaction

A

F

38
Q

Le polymorphisme des microsatellites s’explique par le glissage des répétitions lors de la réplication de l’ADN

A

V

39
Q

Le multiplexage permet de séquencer plusieurs échantillons en même temps avec le séquençage de nouvelle génération

A

V

40
Q

Pour avoir un marqueur fiable, on essaie de sélectionner un marqueur qui est très proche de notre cible et qui a été associé à notre cible au cours de la sélection

A

v

multiplication des végétaux (6 decks)

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