Cellule eucaryote cours 8 Flashcards
Quelles sont les deux niveaux de la régulation de l’expression des gènes
Principalement la transcription de l’ADN en ARN et la traduction des ARN en protéines.
Nomme moi les principales différences entre l’adn et l’arn
ARN (petit message périodique si on veut protéine) : ribose au lieu de désoxyribose
Base azoté pyrimidine différente Uracile au lieu de thymine (U à la place de T), simple brin d’ARN
ADN (bibliothèque) : Désoxyribose, thymine, double brin
C’est quoi la traduction en bref
Traduction: – Action de polymérisation d’acides aminés en protéines à partir de l’ARNm (messager)
C’est quoi la transcription en bref
Transcription: – Action de polymérisation de l’ARN à partir de l’ADN
L’ARN simple brin est capable de faire quoi au niveau de sa structure
Capable de se replier pour former des myriades de structures secondaires (e.g tiges-boucles) et tertiaires (repliement tridimensionnel) qui sont importantes pour leur fonction
Comment s’appelle les ARNs qui ont une activité catalytique
Ribozymes
Quelles sont les trois types majeurs d’ARNs dans la cellule
ARNs messagers, ARNs de transfert et ARNs ribosomiaux.
C’est quoi un ARNt
ARNt (transferts): indispensables au processus de traduction. Ils sont impliqués dans l’incorporation des acides aminés dans la protéine en cours de synthèse.
C’est quoi un ARNm
Ils véhiculent l’information contenue dans l’ADN vers le cytosol où ils seront pris en charge par la machinerie traductionnelle. Sont les seuls qui sont codants pour les protéines.
C’est quoi un ARNr
Nécessaires à la traduction puisqu’ils entrent dans la composition des ribosomes et coordonnent, positionnent l’ARNm et les ARNt
Nomme moi les trois types d’ARN polymérases dans la cellule humaine et leurs cibles transcriptionnelles.
Pol I : gros ARNs ribosomiaux (28S/18S/5.8S),
Pol II : ARNs messagers,
Pol III ARNt et ARNr 5S (petits).
Quelle sont les principales caractéristiques de la polymérisation de la chaîne d’ARN par les polymérases.
Toujours dans le sens 5’ vers 3’ (5’-phosphate du nucléotide entrant réagit avec le 3’-OH de la chaîne d’ARN en élongation)
Pas besoin d’amorce pour la synthèse
Synthétise la chaîne d’ARN complémentaire au brin matrice (non-codant
L’ARN est antiparallèle par rapport au brin du bas
Connaître les trois grandes étapes de la transcription
Initiation, élongation, terminaison
Décrit moi en bref les étapes de l’initiation de la transcription
- Liaison au promoteur 2. Fusion de l’ADN (Séparation des brins), formation d’une bulle de transcription
- Ajout des 2 premiers nucléotides du transcrit (souvent abortif à cette étape)
Décrit moi en bref les étapes de l’élongation et de la terminaison de la transcription
Élongation1. Polymérisation de l’ARN à partir du brin matrice
Terminaison: 1. Rencontre de la séquence de terminaison dans l’ADN et relâchement de l’ARN
Les ARN polymérases ont besoin de quoi pour trouver leurs promoteurs.
Facteurs de transcription
Qu’est ce qui se fait aussi reconnaitre par les facteurs généraux de la transcription
Éléments de contrôle distaux
Les éléments de contrôle distaux sont liés par quoi ensemble et ils permettent quoiiii
Des facteurs (activateur) de transcription et ils aident à stabiliser le complexe de transcription au niveau du promoteur, détermine le moment et l’intensité de l’expression d’un gène
Qu’est ce que les domaines d’activation de la transcription peuvent permettre de recruter
l’ARNpol II (via le complexe protéique Médiateur)
Des facteurs généraux de transcription,
des enzymes de remodelage de la chromatine
Des enzymes de modification des histones
L’activateur sert à quoi
L’activateur sert de pont entre l’ADN et la machinerie de transcription : recrutement
L’ARN pol 2 possèdes un queue de quel type
C-terminale
La queue C-terminale que possède l’ARN pol 2 c’est quoi en fait?
une plateforme d’interaction protéine-protéine.
Qu’est ce qui permet de transitionner entre l’initiation et l’élongation des ARNs en permettant l’interaction avec des facteurs de maturation des ARNs
Phosphorylation de la queue de l’ARN pol 2
La phosphorylation de la queue de l’ARN pol 2 permet quoi
Transitionner entre l’initiation et l’élongation des ARNs en permettant l’interaction avec des facteurs de maturation des ARNs.
Quelles sont les principales étape de la maturation des ARNs
Ajout de la coiffe
Clivage au site poly A Polyadénylation Épissage
C’est quoi un élément de réponse
Séquence spécifique d’DN
Qu’est ce que l’ajout d’une coiffe lors de la maturation fait?
Protège l’extrémité contre la dégradation
Permet la traduction de l’ARNm
C’est quoi de la polyadénylation
Ajout queue plus ou moins longue pour augmenter stabilité pour que l’ARN puisse être mis
Quelles sont les types de régions d’activation
- Acides (riches en acides aminés Asp, Glu)
-Riche en acides aminés Gln
Riches en acides aminés Pro
Défini l’étape de l’épissage
Épissage des exons
Les introns sont excisés
La terminaison de la transcription arrive en même temps que quoi?
l’étape de maturation finale
Qu’est que permet l’épissage des ARNs
Permet de rabouter les exons entre eux en enlevant les introns.
L’épissage est fait par quoi?
L’épissage est effectué par un complexe ribonucléoprotéique: le spliceosome.
Épissage du pré-ADN implique quoi
Implique la formation d’un lien phosphodiester non-conventionnel
Qu’elle est la fonction la plus importante de l’épissage
L’épissage alternatif
Qu’est que l’épissage alternatif permet?
Permet de générer plusieurs ARN messagers matures différents à partir d’un même gène.
Cela permet de produire plusieurs isoformes d’une protéine particulière.
C’est quoi un ribosome eucaryote
Une ribonucléoprotéine composée de protéines et d’ARNr formée de deux sous-unités de 40S et 60S (petite et grosse sous-unité).
Les ribosomes contiennent combien de cavités? +nom
3 cavités importantes: site A (aminoacyl), site P peptide et site E (exit).
ARNs de transfert matures ont un structure qui comporte quoi?
Portion CCA-OH en 3’ sur laquelle des ARNt synthétases spécifiques ajoutent un acide aminé.
Qu’est ce qui permet au ARNt de s’apparier aux codons complémentaires syr les ARN messagers à l’intérieur du ribosome
Boucle anticodon
Qu’est ce que appariement de l’ARNt et ARNm à l’intérieur du ribosome permet
lls permettent de traduire le message de l’ARN et par conséquent du gène dont il est issu en protéine.
Bout CCA sert à attacher quoi et est à quelle extrémité
bout 3’ et site de liaison de l’acide aminé (aminoacyl-ARNt) via carboxyle de l’acide aminé
Quel est le nom des protéines spécialisées qui ajoute les bons acides aminés aux bons ARNt
Les aminoacyl synthétases.
Traduction se déroule en combien d’étape
Initiation, élongation, terminaison
L’assemblage des protéines requiert quoi
ARNts attachés à leurs acide aminés
Ribosome
ARN messager
Protéines de traduction
Énergie (GTP)
Les cellules eucaryotes ont besoin de combien de facteur d’initiation de la traduction
12
C’est quoi le complexe 43s
contient sous unité 40 S (petite) du ribosome, Arnt méthionine initiatrice, elF2 lié au GTP
elF2, elF4E, elF3 c’est quoi çaaa
Sont tous des facteurs d’initiation de la traduction chez les eucaryotes
elF4E est impliqué dans la liaison de la coiffe de l’ARNm
elF3 interagit avec elF4G pour forcer l’interaction entre deux complexes, ce qui permet de scan ribosomique pour trouver le codon AUG initiateur
Savoir toutes les choses qui se passe durant l’initiation de la traduction (genre dit tout ce que tu sais, car j’ai tout mis) You got itttttt
- le complexe 43S comprenant la sous unité 40S (petite) du ribosome, l’ARNt Methionine initiatrice et le facteur eIF2 lié au GTP. vont s’associer avec 2. le complexe ARN messager lié par d’autres facteurs d’initiation de la traduction. S’ensuit un scan du ribosome jusqu’à l’AUG initial.
Ensuite l’hydrolyse du GTP par eIF2 permet de recruter la SU 60S et la traduction peut débuter. à Une fois que le complexe 43S a trouvé le codon AUG initiateur, eIF2-GTP s’hydrolyse, eIF2-GDP et autres facteurs d’initiation sont relâchés et la grosse sous-unite 60 S se joint au complexe pour compléter la phase d’initiation.
Décrit moi l’étape 1 de l’élongation lors de la traduction
C’est lorsqu’il y a sélection de l’aminoacyl-ARNt
Le nouvel aminoacyl ARNt complexé à un facteur d’élongation (eEF1A) lié à du GTP arrive dans le site A (l’ARNt Met initiateur est dans le site P). L’arrivée du bon aminoacyl ARNt induit un changement conformationnel dans ribosome ce qui forme une bonne interaction avec l’ARNm qui stabilise l’aminoacyl ARNt au site A. Cette stabilisation est favorisée par l’hydrolyse de GTP par le facteur d’élongation eEF1A
Décrit moi l’étape deux de l’élongation
Formation lien peptidique
De manière spontanée(sans apport d’énergie), la fonction amine de l’acide aminé au site A attaque le carboxyl de l’acide aminé au site P, cette réaction est catalysée par la peptidyl transférase: une portion catalytique du ribosome.
Un ribosome catalyse l’incorporation de combine d’acide aminés par seconde dans la chaine peptidique
environ 10
Décrit moi étape 3 de l’élongation de la traduction
La translocation
Une fois le lien peptidique formé, le ribosome pivote grâce à l’activité GTPase de eEF2 et glisse de 3 nucléotides sur l’ARNm (du 5’ vers 3’) l’ARNt sans aminoacyl se retrouve dans le site E et quitte le ribosome, le peptide-ARNt se retrouve au site P et un nouvel ARNt aminoacyl complexé au facteur d’élongation + GTP peut entrer dans le site A.
Les codons stop dans l’arn sont reconnus par quoi et ça favorisent quoi
Reconnus par des facteurs de relâchement (eRF1) qui favorisent l’hydrolyse du lien ester entre la chaîne peptidique et l’ARNt. = Relâchement de l’ARNm, de la protéine et dissociation du ribosome
Explique moi les particularité du facteur de transcription TFIIH 9
9 sous unités
Détruit pont hydrogène
Trois activités enzymatiques:
- Kinase (phosphoryle la pol) –>Phosphorylation –>joue un rôle important (déclenche élongation)
- Hélicase (déroule l’ADN)
- ATPase (déroule l’ADN)
Les facteur généraux de transcription permettent quoi
Le recrutement
Le bon positionnement de l’ARN polymérase II au niveau du promoteur grâce à la reconnaissance d’éléments conservés dans l’ADN
Permettent d’ouvrir l’ADN grâce à des activités hélicases garce à des co-facteur.
Nomme moi les trois structure générale des activateur de transcription + fonction générale
Domaine de liaison à l’ADN
* Plusieurs familles
* Reconnaissance d’une séquence spécifique
– Région d’activation
* Interaction avec un ou des composants de la machinerie de transcription
– Domaine de dimérisation (souvent)
* Permet l’association de facteurs en dimères
Ressemble a 4 YOYO attachés ensemble
