CE-7 Flashcards
bioinformática
A bioinformática é uma ciência interdisciplinar que combina biologia, ciência da computação, estatística e
matemática para organizar, analisar e interpretar grandes volumes de dados biológicos.
certo.
O que é a bioiformática clássica?
Bioinformática Clássica: Trata da análise de sequências de nucleotídeos e aminoácidos, como DNA,
RNA e proteínas, identificando padrões e relações evolutivas.
O que é a Bioinformática Estrutural?
Bioinformática Estrutural: Enfoca a estrutura tridimensional das biomoléculas, utilizando técnicas de
modelagem molecular e química computacional para compreender suas funções e interações.
A bioinformática trabalha apenas com DNA,RNA e proteínas?
errado.
Embora os ácidos nucleicos e as proteínas tenham sido tradicionalmente o foco, a bioinformática está se
expandindo para incluir biomoléculas como lipídios e carboidratos,
A bioinformática lida com diferentes tipos de dados biológicos, que podem ser classificados em dois grandes
grupos. Quais são eles?
- Sequências de biomoléculas:
- Estruturas de biomoléculas:
Estruturas de biomoléculas: Refere-se à forma tridimensional (3D) das moléculas biológicas, como
proteínas e RNA, que define suas funções.
certo.
Sequências de biomoléculas: Trata-se da organização linear dos “blocos de construção” que
compõem as moléculas biológicas.
certo.
O dobramento das proteínas depende de quais fatores?
sequência de aa.
O ambiente celular (temperatura, pH, concentração de íons).
* Modificações químicas antes, durante ou após a tradução (co- e pós-traducionais).
* Interações com proteínas auxiliares, chamadas chaperonas, que ajudam no dobramento.
Por que as estruturas 3D são mais complexas?
o As estruturas tridimensionais exigem maior poder de processamento para serem modeladas,
manipuladas e analisadas.
O estudo das sequências de biomoléculas
permite que tipo de análises?
1.Alinhamento de sequências
2. Identificação de padrões
3. Filogenia
4. Anotação de genomas
5. Construção de redes moleculares
Qual a diferença de processamento em PCU e GPU?
A CPU, ou Unidade Central de Processamento, é o componente principal responsável por executar as
instruções dos programas em um computador.
As GPUs, ou Unidades de Processamento Gráfico, foram inicialmente desenvolvidas para processar gráficos
em computadores, sendo parte essencial das placas de vídeo.
Quais os desafios da validação experimental?
- Ausência de Dados Experimentais Disponíveis
- Adequação dos Dados Experimentais ao Estudo Computacional
- Consideração da Margem de Erro Experimental
- Condições Experimentais
Apesar da ideia amplamente difundida de que validações experimentais são indispensáveis para estudos
computacionais, há situações em que os dados computacionais apresentam maior precisão do que os
experimentais.
certo.
QUAIS OS PRINCIPAIS SOFTWARES E PLATAFORMAS DE BIOINFORMÁTICA?
1.BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)
2.Clustal
3.MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)
4.Uniprot
5.PDB (Protein Data Bank)
6.Galaxy
7.R E Bioconductor
O Blast realiza comparações entre
sequências biológicas, como DNA, RNA e proteínas, para identificar similaridades?
certo.
O Clustal é projetado para alinhar sequências biológicas como DNA, RNA e proteínas.
certo.
Receber como entrada: Três ou mais sequências de DNA, RNA ou proteínas.
O que é heruística?
Em termos simples, uma heurística é uma técnica para resolver problemas que
busca soluções boas (próximas da ideal), mas não necessariamente a melhor
solução possível. Ela é usada quando encontrar a solução ótima é muito
demorado ou computacionalmente inviável. As heurísticas são como “atalhos
inteligentes” que oferecem um bom compromisso entre tempo de
processamento e qualidade da solução.
O MEGA serve para facilitar estudos de evolução molecular e análise filogenética.
certo.
O PDB (Protein Data Bank) é um dos principais bancos de dados para armazenamento e compartilhamento
de estruturas tridimensionais de biomoléculas.
certo.
O Galaxy é uma plataforma web de código aberto projetada para criar e executar workflows (fluxos de
trabalho) em bioinformática. Ele é amplamente utilizado por cientistas para analisar grandes volumes de
dados biomédicos, abrangendo áreas como genômica, proteômica, metabolômica e análise de imagens.
certo.
Qual a composição de um nucleotídeo?
Uma base nitrogenada: adenina (A), guanina (G), citosina (C), uracila (U) ou timina (T).
* Um carboidrato: ribose (RNA) ou desoxirribose (DNA).
* Um grupo fosfato.
Qual a composição de um aa?
Um grupo amino (-NH₂).
* Um grupo carboxílico (-COOH).
* Um átomo de carbono central (Cα) ligado a uma cadeia lateral, que varia entre os diferentes
aminoácidos.
Qual a classificação das biomacromoléculas em
níveis de organização estrutural?
estrutura primária, secundária, terciária e quaternária.
Qual a estrutura primária?
A estrutura primária é o nível mais básico, representando a sequência linear dos monômeros que formam a
biomacromolécula:
* Proteínas: sequência de aminoácidos.
* Ácidos nucleicos: sequência de nucleotídeos.
* Carboidratos: sequência de monossacarídeos
A estrutura secundária surge de interações entre monômeros vizinhos e com o ambiente ao redor, como o
solvente. Essas interações resultam em padrões espaciais repetitivos, como:
* Proteínas: hélices α, folhas β e alças (Figura 06).
* Ácidos nucleicos: estruturas como fitas paralelas e antiparalelas no DNA ou alças e grampos no
RNA.
* Carboidratos: hélices formadas por polissacarídeos lineares
certo.
A estrutura terciária é processo de enovelamento (ou dobramento, tradução do termo inglês “folding”).
Durante esse processo, uma combinação de forças atua para que a biomolécula atinja uma conformação de
menor energia e, consequentemente, maior estabilidade no ambiente biológico em que se encontra.
certo.
