CCC1 Flashcards
Combien d’électrons manque-t-il à O, C, H et N pour remplir leur couche de valence ?
O : 2
C : 4
H : 1
N : 3
Qu’est-ce qu’une liaison chimique ?
Quelles sont les différents types de liaisons chimiques ?
Une liaison chimique est un transfert ou un partage d’électrons entre 2 atomes
- Liaisons covalentes (polaires et non polaires: partage d’électrons (asymétrie et symétrie)
- Liaisons non-covalentes :
- liaison ioniques(3kcal/mol) : entre des atomes ayant des charges différentes (+/-) – transfert électron
- ponts d’hydrogène (1kcal1mol)
- interactions hydrophobes
- force de Van der Waals (0.52 kcal/mol) : asymétrie de charges dynamique résultant du mouvement des électrons
Qu’est-ce que l’électronégativité ?
Capacité d’un noyau à attirer les électrons (ex: H2O où O est plus électronégatif que H et donc O est partiellement (-) alors que H (+))
Pourquoi l’eau est-elle aussi importante dans le monde du vivant ?
L’eau est (1) polaire, (2) protique, i.e. forme des ponts d’hydrogènse +++ et (3) amphotérique, i.e peut se comporter comme un acide ou une base
Qu’est-ce que le pH et qu’est-ce qu’un pH neutre ?
Le pH peut se définir comme le -log de la concentration d’ion H+ dans une solution (-log10^-7) -(-7)=7, un pH neutre est égal à 7, ce qui correspond à une concentration réelle H+ (ion hydronium) de 10^-7 et OH- de 10^-7 (ion hydroxyle)
Qu’elle est la différence entre un acide et une base ?
Un acide a la capacité à libérer des ions H+ en solution; en présence d’eau, les ions H+ forment H3O+, donc un acide augmente [H3O+].
Au contraire, les bases vont libérer des OH- qui se combien aux H+ –> augmente la [H2O]
De plus, les acides et les bases existent par paires, i.e. un acide fort est une base faible (il cède ses protons et devient une base)
Qu’est-ce qu’un tampon biologique ? Et un système tampon ?
Ils minimisent les variations de pH. Ceci en agissant comme une base dans un milieu acide et comme un acide dans un milieu basique.
Un système tampon est un acide faible et son anion
Qu’est-ce que le pKa ?
C’est le pH de demi-dissociation où il y a 50% des deux formes (acide faible et sa base conjuguée)
Quels sont les groupements chimiques importants en biologie ? Quelles sont leur propriétés ? Nommez un exemples de chaque.
*Mettre les images
(1) Gr hydroxyle (-OH) : alcools ; composées polaires hydrophiles ; ex :éthanol
(2) Gr carbonyle (>C=O) : cétones (lorsque le gr est à l’intérieur d’une chaîne) et aldhéhyde ;
(3) Gr carboxyle (-COOH) : acides carboxyliques ; se comporte comme un acide (libère H+) ; ex : acide acétique
(4) Gr amine (-NH2) : se comporte comme une base (N peut accepté H) ; ex : glycine
+++thiol, phosphate, méthyle
Qu’est-ce qu’un groupement thiol ? Quelle a.a. contient un groupement thiol ?
- SH
- La cystéine, un a.a. important qui permet la formation des ponts disulfures (permettant la structure quaternaire chez certaines protéines)
Qu’est-ce qu’un groupement phosphate ? Pourquoi ce groupement est-il important ?
- 1 atome de phosphore est lié à 4 oxygène (dont 2 atome d’O porte une charge (-)
- Le gr phosphate contribue à donner une charge (-) à la molécule
- Les molécules ayant un gr phosphate ont la capacité de réagir avec l’eau et de libérer de l’énergie
Qu’est-ce qu’un groupement méthyle ?
Un atome de C lié à 3 atomes H
Qu’est-ce qu’un groupement amine ?
- 1 N lié à 2 H
- Se comporte comme une base, N a la capacité d’accepter union H+ (forme ionisée)
Pourquoi les interactions faibles sont-elles essentielles ?
(1) Stabilisent la structure macromoléculaire
(2) Confèrent une flexibilité essentielle aux macromolécules (ex: les molécules d’ADN se dissocient et se réassocient)
(2) Sont collectivement fortes, même si individuellement faibles
Qu’est-ce qu’un acide aminé ?
Un acide aminé est formé d’un Calpha avec un gr amine H2N (à gauche) et un groupement carboxyle COOH (à droite) et un groupement latéral variable, R
*Le gr amine est un mauvais donneur de proton, alors que le groupement carboxyle est un bon donneur de H+
Qu’est-ce que le pH physiologique ?
7.4
Qu’est-ce que le point isoélectrique d’un a.a. ?
Les a. a. sont doublement chargés à un pH physiologique (7.4) et le point isoélectrique est le pH auquel la charge résultante est neutre
Quels sont les a.a. polaires ? (6)
(1) Sérine
(2) Thréonine
(3) Cystéine (-SH)
(4) Tyrosine
(5) Asparagine
(6) Glutamine
Quels sont les a.a. électriquement chargé ? (5)
Les premières sont des bases (1-3) (1) Lysine (2) Arginine (3) Histidine Les dernières des acides (4) Acide asparitique (5) Acide glutamique
Qu’est-ce qu’une liaison peptidique ? Comment ces liaisons sont elles formées ? Quelles sont ces caractéristiques principales ?
- Liaison (double lien partiel) entre 2 a.a. entre une extrémité amino terminale et carboxyle terminal
- Par condensation (élimination de 2 atomes H à chaque des extrémités qui s’unissent à 1 atomes d’O pour former de l’eau)
- Caractéristiques :
(1) Plane à cause de la délocalisation électronique
(2) Rigide à cause de la double liaison partielle et polaire entre C=N
Quels sont les niveaux de structure des protéines ?
(1) Primaire : séq. a.a. unis par des liaisons peptidique (laison plante et rigide entre extrémité amino terminale et carboxyle terminale)
(2) Secondaire : arrangements réguliers et réccurents entre des a.a. adjacents d’une même chaine par des liaisons faibles (hélice alpha ou feuillet beta plissé)
(3) Tertiaire : arragement spatial de tous les a.a. d’une protéine lui conférant une forme
(4) Quaternaire : protéine composé de plus d’un polypeptide (laisons -SH (cystéine))
Quelles sont les méthodes permettant d’étudier les protéines ?
(1) SDS-PAGE
(2) Immunobuvardage
(3)
(4)
Comment l’activité des protéines est-elle régit ? (2)
(1) Liaison covalente réversible, i.e. phosphorylation - déphosphorylation
(2) Modulation allostérique d’une enzyme, où une substance x se fixe à un site autre que le site actif et modifie l’affinité de l’enzyme pour son substrat (activation ou inhibition) - implique des interactions faibles (non covalentes)
Quelles sont les fonctions des lipides ?
(1) Structure des membranes cellulaires
(2) Stockent l’énergie sous forme d’huile et de graisses
(3) Agissent comme coenzymes
…
(5) Seconds messagers
(6) Hormones
