Caractérisation et classification des microorganismes

Question 1

En quoi consiste la taxonomie?

Answer 1

L’établissement des groupes naturels d’organismes présentant des caractères communs

Question 2

Un organisme peut-il appartenir à plusieurs taxons?

Answer 2

Non, il appartient à un seul taxa (non chevauchement)

Question 3

Établissez la hiérarchie taxonomique.

Answer 3

Espèce - Genre - Famille - Ordre - Classe - Phylum (embranchement et sous-embranchement) - Règne - Domaine

Question 4

Qu’est-ce qu’une culture pure?

Answer 4

Population de microorganismes où tous les individus ont les mêmes caractéristiques

Question 5

Qu’est-ce qu’une souche-type?

Answer 5

Souche possédant toutes les caractéristiques représentatives de l’espèce. (Souche-mère)

Question 6

Qu’est-ce qu’une espèce?

Answer 6

Un groupe de souche dont les caractéristiques sont PRESQUE identiques.

Question 7

Qu’est-ce qu’un taxon de base?

Answer 7

Groupe homogène différent des autres groupes.

Question 8

Nommez les caractères de type servant à l’identification des microorganismes.

Answer 8

Morphologie - Composition chimique - Physiologique - Métabolique - Génétique - Interactions avec l’hôte - Écologique - Moléculaire

Question 9

Quelles sont les caractères morphologiques servant à l’identification?

Answer 9

Taille - Forme - Arrangement
Structure cellulaire
Réaction aux colorants

Question 10

Comment peut-on identifier un microorganisme par sa composition chimique?

Answer 10

Par ce qui compose la membrane et la paroi cellulaire.

Question 11

Quels sont les éléments de l’identification physiologique des microorganismes?

Answer 11

• Éléments nutritifs ( Milieu de culture, source de carbone, facteurs de croissance
• Conditions d’incubation (T°, O2 lumière)

Question 12

De quelle manière est-t’il possible d’identifier un microorganisme métaboliquement parlant ?

Answer 12

Avec les produits finaux de fermentation ou encore les enzymes extracellulaires (protéases, exotoxines, hémolysines)

Question 13

Avec la génétique, comment peut-on identifier les microorganismes?

Answer 13

Grâce à :

• la composition G-C %
• les séquences de nucléotides
• au nombre de chromosomes
• Les plasmides (extrachromosomiques)

Question 14

Quel outil est utilisé pour vérifier la composition G-C%

Answer 14

Un spectrophotomètre émettant dans le UV (260 nm)

Question 15

Quelle est la composition G-C% des animaux et des plantes?

Quelle est celle des microorganismes?

Answer 15

Animaux et plantes: 30 - 50%

Microorganismes: 25 - 80%

Question 16

Quelles interactions sont vérifiées pour l’identification?

Answer 16

La pathogénicité et la symbiose

Question 17

Comment identifie-t’on les microorganismes d’un point-de-vue moléculaire ?

Answer 17

Par la comparaison des séquences protéiques et nucléique. On vérifie l’homologie des séquences par analyse bio-informatique de l’hybridation d’acides nucléiques.

Question 18

Quelles sont les étapes de l’hybridation d’acides nucléiques?

Answer 18

1. Marquage
2. Chauffage
3. Hybridation

Question 19

Qu’attribue-ton à Carl von Linnaeus ?

Answer 19

La nomenclature des microorganismes

Question 20

La classe du microorganisme est-elle inclue dans la nomenclature ?

Answer 20

Non, seuls l’espèce et le genre le sont.

Question 21

Vrai ou faux?

La 1re lettre de l’espèce doit être minuscule tandis que la 1re lettre du genre, majuscule ?

Answer 21

Vrai

Question 22

Vrai ou faux?

On nomme le genre avant l’espèce?

Answer 22

Vrai

Question 23

Sur quoi base ton le nom du genre?

Answer 23

Le descriptif, le découvreur généralement

Question 24

Lors de l’hybridation d’ADN, quel est le seuil minimal à respecter pour dire que deux organismes appartiennent à la même espèce?

Answer 24

80 %

Question 25

Sur quoi base-t’on la classification taxonomique des microorganismes ?

Answer 25

Sur les caractères communs (des liens évolutifs sont établis)

Question 26

En quoi consistent les classifications naturelle, phénétique et numérique?

Answer 26

Naturelles nature biologique des organismes
Phénétique: sur la similarité des caractères phénotypiques (morphologie, métabolisme, génétique)
Numérique: nombre de caractères communs. Les microorganismes sont comparés 2 par 2. Représentation avec un dendrogramme

Question 27

Quelle est la limite de la classification numérique?

Answer 27

La pondération des caractères

Question 28

Nommez 3 aspects de la phylogénétique.

Answer 28

Comparaison d’espèces distantes
Comparaison de séquence de gènes/protéines observés
Mutation au hasard

Question 29

Vrai ou faux? Les mutations n’altèrent pas la fonction de l’ARN ribosomal

Answer 29

Vrai

Question 30

Les régions conservées de l’ARN ribosomal sont elles essentielles à sa fonction?

Answer 30

Oui elles le sont.

Question 31

Vrai ou faux? Le nombre de différences chez l’ARN ribosomal est indépendant du temps depuis la divergence d’un ancêtre commun.

Answer 31

Faux, le nombre de différence est proportionnel au temps.

Question 32

Dans un dendrogramme, comment nomme-t’on les événements de divergence et qu’est-ce qui détermine la longueur des branche ?

Answer 32

Les noeuds sont les événements de divergence et la longueur des branches est proportionnelle au nombre de changement moléculaire subit par le microorganisme

Question 33

Qui a ajouté le 3e règne (les protistes) à la classification des microorganismes? Que comprennent les protistes?

Answer 33

Haeckel en 1865.

à cette époque, les protistes comprennaient les bactéries, les levures, les protozoaires et les algues.

Question 34

Sur quoi est basé le concept de nutrition pour la classification des microorganismes (Whittaker, 1969)?

Answer 34

Sur la photosynthèse, l’absorption (soluble) et l’ingestion (solide)

Question 35

Encore selon Whittaker, les microorganismes se divisaient en 5 règnes. En plus des plantes, des animaux et des protistes, quels sont les deux autres règnes ajoutés?

Answer 35

Le règne fungi et celui des monères.

Principe d’évolution unidirectionnelle

Question 36

L’approche phylogénétique (voies évolutives divergentes) qu’a utilisé Woes (1977) lui a permis de classer les microorhganismes et 3 domaines, quels sont-ils?

Answer 36

Eucarya, Bactéria, Archaea

Les deux derniers sont apparentés aux procaryotes

Question 37

Quelle serait l’origine des mitochondries et des chloroplastes?

Answer 37

• Autoréplication
• Chromosome circulaires uniques
• Gènes ARNr apparentés aux eubactéries

Question 38

En quoi consiste l’endosymbiose?

Answer 38

Ingestion par la cellule de bactéries respiratoires ou de cyanobactéries photosynthétiques

Question 39

Vrai ou faux? Il y a très peu d’échanges entre les domaines du monde vivant dans l’arbre de la vies.

Answer 39

Faux, les échanges sont nombreux.

Question 40

Le point de fusion (Tm) augmente-t’il avec le % de liaisons G-C ?

Answer 40

Oui