C2. Compartiments cellulaires

Question 1

Qu’est-ce qui fait parti du système endomembranaire ?

Answer 1

• RE
• Golgi
• lysosome
• mb plasmique

Question 2

Quels sont les 2 types d’adressages des protéines?

Answer 2

• basé sur les peptides signaux vers divers organites
• voie sécrétoire, basée sur les vésicules depuis le RE vers leur destination

Question 3

A quoi à servit l’expérience de pulse-chase ?

Answer 3

Mise en évidence par traçage radioactif du cheminement intracellulaire des protéines: REG –> Golgi –> vésicules de sécrétion

Question 4

Quels sont les éléments de bases nécessaires à l’adressage ? (4)

Answer 4

• séquences signales
• protéines réceptrices
• Canal de translocation
• Transfert unidirectionnel (car énergétiquement favorable)

Question 5

De quelles protéines sont responsables les ribosomes libres ?

Answer 5

• cytosoliques
• nucléaires
• mitochondriales
• peroxysomes

Question 6

Comment se passe la translocation des protéines vers le RE?

Answer 6

• Phénomène co-traductionnelle
• peptide signal en N-term reconnu par SRP + ARN 7SL –> arrêt de la synthèse protéique
• Liaison SRP à sont récepteur (SRP) –> rapprochement du ribosome du translocon renforcée par GTP
• Libération SRP + hydrolyse GTP –> translocation du polypeptide
• Séquence signale clivé par peptidase

Question 7

Comment la translocation se passe pour les protéines membranaires ?

Answer 7

Même système que pour les autres protéines, sauf qu’elles ont une séquence hydrophobe qui s’intègre à la membrane

Question 8

Différent type de protéine à passage unique?

Answer 8

I: C-term cytosolique
II: N-term cytosolique (signal Arg/Lys toujours en cytosolique + pas de clivage de N-term)
III: C-term cytosolique mais comme pour II Arg/Lys en cytosolique et pas de clivage

Question 9

Quelles sont les modifications de maturations des protéines ?

Answer 9

• post-traductionnelle (glycosylation)
• liaison disulfure
• reploiement correct
• clivage protéolytique

Question 10

Quel est la séquence consensus de N-glycosylation?

Answer 10

N-X-S/T

Question 11

Quand et où se fait la N-glycosylation?

Answer 11

Durant la synthèse protéique dans le REG

Question 12

A quoi sert la N-glycosylation?

Answer 12

Reploiement correct, adressage, stabilité, impact sur fonction

Question 13

Où et comment se font les ponts disulfure ?

Answer 13

Dans la lumière du REG, avec une PDI, formation de liaison covalente après oxydation des groupement thiol

Question 14

Qu’advient-il des protéines mal repliées?

Answer 14

Dislocation du RE vers le cytosol par le complexe ERAD et la protéine p97 (hydrolyse ATP)
Ubiquitination
Dégradation par le protéasome

Question 15

Quel est le rôle de calnexine/claréticuline?

Answer 15

Surveiller le bon reploiement lorsqu’il ne reste qu’1 résidu glucose –> si mauvais reploiement ajout glucosyltransférase et nouvelle tentative de reploiement

Question 16

Quelle est la constitution du protéasome?

Answer 16

• 60 SU
• Coeur 20 SU
• 19 SU –> particules régulatrice

Question 17

Processus d’ubiquitination?

Answer 17

Ajout d’1 ubiquitine sur E1 (hydrolyse ATP)
Transfère à une cystéine de E2
Transfert sur une lysine de la protéine cible par E3 (spécificité de substrat assuré par E3)
Protéasome désubiquitine avant la dégradation

Question 18

Qui s’occupe de l’autophagie ?

Answer 18

Lysosomes

Question 19

Qui s’occupe de l’équilibrage des phospholipide entre les feuillets ?

Answer 19

Scramblase

Question 20

Comment les lipides membranaires sont-ils transportés?

Answer 20

• de manière vésiculaire avec fusion de membrane
• non vésiculaire avec contact de membrane

Question 21

Quelles molécules peuvent être exocytées?

Answer 21

Protéines, carbohydrates ou lipides

Question 22

Quelles sont les différentes voies de communication dans la cellule?

Answer 22

• sécrétoire: antérograde
• endocytose: rétrograde
• récupération: rétrograde

Question 23

Qu’est-ce que l’ERGIC?

Answer 23

Compartiment intermédiaire entre le RE et le Golgi

Question 24

Comment est orienté le Golgi?

Answer 24

FAae cis, vers le RE pour entrée des protéines
Face trans, face de sortie vers les lysosomes, milieu extracellulaire ou membrane plasmique

Question 25

Quelles sont les fonctions de l’appareil de Gogli ?

Answer 25

• Maturation séquentielle des protéines : oligosaccharides, phosphorylation sucres, hydroxylation, sulfatation, clivage des précurseurs,…
• tri et transferts des protéines selon leur destination

Question 26

Quelles sont les différentes maturations liées aux sucres dans le Golgi?

Answer 26

• O glycosylation: ajout de mono ou oligosaccharides sur sérine ou thréonine par glycosyltransférase
• maturation des glucides lié à N –> enlèvement mannose et ajout autres sucres

Question 27

Manteau vésiculaire

Answer 27

1) Vésicule recouverte d’un manteau protéique recruté par GTPases
2) COPI au départ du de Golgi
C0PII au départ du RE
Clathrine au départ du Golgi et de la membrane plasmique

Question 28

Quelle séquence indique un adressage vers le peroxysome?

Answer 28

Ser-Lys-Leu-COOH

Question 29

Les peroxines ont un rôle de dégradation.

Answer 29

Faux, ce sont des transporteurs pour importé les protéines vers le peroxysome

Question 30

A quoi est due la maladie de Zellweger ?

Answer 30

Mutation autosomique récessive dans le gène Pex1 –> maladie peroxysomale

Question 31

Comment se fait l’import de protéines dans la mitochondrie?

Answer 31

1) Reconnaissance par une préséquence
2) Entrée par une translocase TOM,
- pour la matrice passe ensuite par TIM23
- pour la membrane interne insertion par TIM22 après transport par chaperonnes TIM9 et TIM10
Pour membrane externe, si protéine en conformation bêta tonneau –> TIM + SAM
Si protéine en hélice alpha –> mécanisme non connu