BLAST Variantes

Question 1

¿Cuál es la funcion de BLAST?

Answer 1

Encontrar una región similar y conservada entre las secuencias de referencia y las secuencias de consulta de nucleótidos para formar una proteína o ADN

Question 2

Variante de BLAST en la cual se contrasta una secuencia de nucleotidos contra otra secuencia de nucleotidos de referencia

Answer 2

BLASTN

Question 3

Variante de BLAST en la que se contrasta una secuencia proteínica contra otra secuencia proteínica de referencia

Answer 3

BLASTP

Question 4

Variante de BLAST en la que todos los marcos de lectura de una secuencia de nucleotidos se contrastan contra una secuencia de proteinas de referencia

Answer 4

BLASTX

Question 5

Variante de BLAST en la que se compara una secuencia proteínica contra todos los marcos de lectura de secuencias de nucleótidos de referencia

Answer 5

TBLASTN

Question 6

Variante de BLAST en la que las traducciones de 6 marcos de la secuencia de nucleotidos se buscan contra 6 marcos de traducciones de una base de datos de secuencia de nucleotidos

Answer 6

TBLASTX

Question 7

Variante de BLAST adecuado para encontrar alineación entre secuencias estrechamente relacionadas

Answer 7

MEGABLAST

Question 8

Variante de BLAST adecuado para buscar homólogos remotos o miembros de una familia de proteínas

Answer 8

PSI-BLAST

Question 9

Variante de BLAST adecuada para encontrar secuencias de proteínas con un patrón especifico en la base de datos

Answer 9

PHI-BLAST