BLAST Flashcards
Es la herramienta más utilizada para búsqueda de secuencias en bases de datos
BLAST
Objetivo final de BLAST
Inferir las relaciones evolutivas y funcionales entre dos secuencias de ADN o proteínas
Una secuencia de nucleótidos es contrastada contra otra secuencia de nucleótidos de referencia
BLASTn
Qué es BLASTp
Contraste entre secuencias proteínicas
Qué es BLASTx?
Todos los marcos de lectura de una secuencia de nucleótidos se contrastan contra una secuencia de proteínas de referencia
Una secuencia proteínica es contrastada contra todos los marcos de lectura de secuencias de nucleótidos de referencia
tBLASTn
Las traducciones de seis marcos de la secuencia de nucleótidos se buscan contra seis marcos
traducciones de una base de datos de secuencias de nucleótidos
tBLASTx
Adecuado para encontrar alineación entre secuencias estrechamente relacionadas
megaBLAST
psiBLAST se usa para…
Buscar homólogos remotos o miembros de una familia de proteínas
Es adecuado para encontrar secuencias de proteínas con un patrón específico en la base de datos
phiBLAST