Biotechnologies - outils enzymatiques Flashcards
endonucléase (def et ex)
- hydrolyse liaison phosphodiester entre 2 nt à l’intérieur de la molécule d’ADN
- enzyme de restriction
exonucléase (def)
dégrade ADN à partir de l’une des extrémités
enzyme de restriction (but)
- hydrolyse liaison phosphodiester entre 2 nt à l’intérieur de la molécule d’ADN
- restreint l’infectiosité des phages vis-à-vis de la souche bactérienne
- ne coupe pas une sqc méthylée
méthyltransférase (but)
- reconnaît la même sqc que l’enzyme de restriction
- transfert un méthyl sur au moins une des bases du site de reconnaissance
- protège la bactérie de l’enzyme de restriction qu’elle code
enzyme de restriction de type II
Site de restriction :
- sqc de 4 à 8 pb
- axe de symétrie inversée : palindrome
Produit des extrémités 5’-P et 3’-OH
extrémité sortante (def et synonymes)
- quand les coupures sont décalées l’une par rapport à l’autre sur les 2 brins
- extrémité cohésive
- sticky end
extrémité franche (def et synonyme)
- quand la coupure se fait exactement au milieu du palindrome
- bouts francs
- blunt end
enz isoschizomères
- enz de restriction qui reconnaissant la même sqc et la coupent de façon identique
enz néoschizomères
- enz de restriction qui reconnaissant la même sqc mais la coupent de façon différente
enz compatibles
enz de restriction qui
- reconnaissent des sites de restriction différents
- génèrent des fragments aux extrémités cohésives et complémentaires
- qui pourront être ligaturées
nucléase S1 (def)
- dégrade spécifiquement des acides nucléiques simples brins
- pas les ADN bicaténaires, ni les hybrides ARN-ADN
nucléase S1 (ex d’application)
peut être utilisée pour convertir les extrémités cohésives et extrémités franches
phosphatases alcalines
- éliminent le P en 5’
- évite la ligation des fragments d’ADN entre eux
- fonctionnent à pH alcalin
- origine : muqueuse intestinale veau, souches d’E.cli ou souches de crevettes
ligase (def)
catalyse la formation d’une liaison phosphodiester entre 2 brins d’ADN (entre 3’OH et 5’P)
ADN ligase
- extraite de E.coli
- catalyse la formation de Pdiester
- entre 2 extrémités cohésives
- nécessite NAD
- intéressant pour clonage cellulaire