Biomolekyler och processer i kroppen Flashcards
Vad är gemensamt för reaktioner i levande organismer?
Att de sker vid 40 grader och vid pH nära 7.
Vad är kolhydrater?
Flervärda alkoholer med en aldehydgrupp och en ketogrupp. De skrivs allmänt Cn(H2O)n.
I vilka tre grupper delas kolhydrater in?
Monosackarider, disackarider och polysackarider.
Vad kännetecknar en monosackarid?
Att den har 5 eller 6 kolatomer.
Hur delas monosackarider in?
I pentoser och hexoser, efter hur många kolatomer de har (5 eller 6).
Vilka pentoser ingår i DNA och RNA?
Ribos, C5H10O5, och deoxiribos, C5H10O5.
Vad har hexoserna glukos, fruktos och galaktos gemensamt?
Molekylformeln C6H12O6.
Vilka viktiga disackarider finns det och vilken är deras molekylformel?
Sackaros, maltos, laktos och cellobios, C12H22O11.
Hur kan disackarider sönderdelas till sina monosackaridenheter?
Med hjälp av enzymer eller kokning med saltsyra.
Vilka två polysackarider bildar växter vid fotosyntesen?
Cellulosa och stärkelse.
Var finns polysackariden glykogen?
Som reservnäring i levern.
Vad är lipider?
Ämnen som är olösliga i vatten.
Vad är triglycerider?
En sorts lipid som är en ester av en glycerolmolekyl och tre fettsyramolekyler.
Vad har triglycerider för funktion?
De är en energireserv och ett skydd för organismer.
Vad är fosfolipider?
En lipid som är en ester av två fettsyror och glycerol med en fosfatgrupp i molekylen. Till fosfatgruppen är en alkoholmolekyl bunden och innehåller en hydrofil grupp.
Vad är proteiner?
Polymerer som består av många aminosyrarester.
Vilka två grupper delas proteiner in i?
Funktionella proteiner som får processer att ske och strukturella proteiner som ger stadga, skydd och form.
Vad består aminosyror av?
Två funktionella grupper, en aminogrupp och en karboxylgrupp.
Vilken är den enklaste aminosyran?
Glycin eller aminoetansyra
NH2CH2COOH
Vad är aminosyrornas assymetriska centrum?
Kolatom nummer två, som aminogruppen är bunden till.
Vad är en aminosyras R-grupp?
En av väteatomerna till kolatom nummer två är substitutierad mot en unik sidogrupp som ger aminosyran dess egenskaper. Detta kallas för R-gruppen.
Vilka fyra grupper delas aminosyror in i på grund av deras R-grupper?
De som har en opolär, oladdad polär, negativt laddad eller positivt laddad R-grupp.
Varför är aminosyror amfojoner?
Eftersom karboxylgruppen har sura egenskaper och aminogruppen har basiska egenskaper.
Vad är en aminosyras isoelektriska punkt?
Den pH-värde där en aminosyras nettoladdning blir 0.
Vad är en peptid?
Då en aminosyras aminogrupp reagerar med en annan aminosyras karboxylgrupp bildas en dipeptid och en vattenmolekyl i en kondensationsreaktion.
Vad är en peptids N- och C-terminal?
N-terminalen är den del av molekylen där aminosyragruppen sitter och C-terminalen är delen med karboxylgruppen.
Varför är det inte fri rörlighet kring en peptidbindning?
Bindningen mellan kolatomen och kväveatomen har dubbelbindningskaraktär vilket gör att den får olika resonansstrukturer.
Vilka strukturnivåer delas proteiners struktur in i?
Primärstruktur, sekundärstruktur, tertiärstruktur och kvartärstruktur.
Vad menas med proteinets primärstruktur?
Ordningsföljden av aminosyraresterna från N- till C-terminalen. Det är starka kovalenta peptidbindningar som håller ihop strukturen.
Hur ser en peptidbindning ut?
markerad med blått
Vad menas med proteinets sekundärstruktur?
Molekylen börjar bestämma sin tredimensionella rymdstruktur med hjälp av vätebindningar. Det kan ske genom att det bildas alfahelixar eller betastrukturer beroende på hur långt bort väteatomen sitter som syreatomen i peptidbindningen binder till.
Vad menas med proteinets tertiärstruktur?
Då olika sekundärstrukturer binds till varandras R-grupper uppstår sekundärstrukturen.
Vad menas med proteinets kvartärstruktur?
När de olika polypeptidkedjorna, subenheterna, binds till varandra med bindningar mellan R-grupperna.
Vilka faktorer beror proteineras egenskaper av?
Om de hydrofila R-grupperna är på utsidan är proteinet globulärt, lösligt i vatten. Det beror också på pH, temperatur, salthalt m.m. eftersom proteiner kan denatureras.
Vilka två grupper delas nukleinsyror in i?
Deoxiribonukleinsyror och ribonukleinsyror.
Vad består nukleinsyror av?
Långa rader av nukleotider.
Vad består nukleotider av?
En pentosenhet, en kvävebas och 1-3 fosfatgrupper.
Vad är en gen?
Ett specifikt avsnitt i DNA. En gen beskriver en sekvens av aminosyror.
Vilka möjliga kvävebaser finns det?
Adenin, cytosin, guanin, tymin och uracil.
Vad är kvävebaser?
Cykliska kolföreningar som innehåller aminogrupper.
Vilka kvävebaser är komplementära?
A och T, C och G.
Vilka slags RNA finns det?
mRNA - överför information
tRNA - transporterar aminosyror
rRNA - bygger upp ribosomer
Vad är metabolismen?
De reaktioner som sker i en organism.
Vad är anabola reaktioner?
Reaktioner som är uppbyggande.
Vad är katabola reaktioner?
Reaktioner som är nedbrytande.
Vad är ett enzym?
Ett protein som verkar som en katalysator i reaktioner i kroppen.
Vad är ett substrat?
Det ämne som enzymet får att reagera.
Vad är enzymets aktiva centrum?
Den del av det som fäster vid substratet.
Vad innebär ett enzyms omsättningstal?
Dess arebtsförmåga uttryckt i substratmolekyler som reagerar per sekund och enzymmolekyl.
Vad gör en inhibitor?
Hindrar enzymet från att göra sitt jobb genom att binda till dess aktiva centrum.
Vad är en kofaktor?
Ett ämne som hjälper ett enzym att reagera med substratet.
Vilka två grupper delas kofaktorer in i?
Koenzymer - binder till enzymet medan reaktionen pågår
Prostetiska grupper - bunden i molekylen
Vad kallas mellaprodukterna i metabolismens reaktionskedjor?
Metaboliter.
Vad kan metaboliter användas till?
Till anabola reaktioner som bygger upp celler.
Vad är den centrala dogmen?
Informationsflödet mellan DNA, RNA och bildningen av proteiner.
Vilka är de viktigaste skillnaderna mellan DNA och RNA?
- DNA består av två nukleotidkedjor hopbundna med vätebindningar
- Tymin finns i DNA och uracil finns i RNA
- DNA byggs upp av pentosen deoxiribos, RNA byggs upp av ribos
Vad innebär replikation, och hur går det till?
DNA bygger två kopior av sig själv innan celldelning.
Med hjälp av enzymet helikas bildas en replikationsgaffel när vätebindningarna i dubbelspiralen bryts. Enzymet DNA-polymeras binder nya nukleotider som motsvarar den existerande strängen.
Vad innebär transkription, och hur går det till?
Det innebär att en DNA-sträng kopieras till mRNA.
Ribonukleotider som komplementerar kvävebaserna i DNA-strängen sätts samman av DNA-polymeras och en mRNA-sträng bildas. Delar av kedjan, intronerna, måste sedan splitsas bort eftersom de inte kodar för ett protein. Exonerna binds samman till en mRNA-molekyl.
Vad innebär translation, och hur går det till?
Att ett protein bildas genom proteinsyntesen i ribosomerna.
En kvävbas triplett, ett kodon, motsvarar en aminosyra. mRNA kommer till ribosomen och matas in. En tRNA-molekyl med ett komplementärt antikodon fäster vid kodonet och nästa kodon matas in. En ny tRNA anländer med en aminosyra som binds samman med den tidigare molekylens aminosyra. Så fortsätter det tills proteinet bildats.
Vad innebär en mutation, och vad är en mutagen effekt?
En mutation är en förändring i arvsmassan. Mutagen effekt är ett ämnes förmåga att orsaka mutationer.
Vad är ATP?
ATP bär energi i cellen, och kallas för cellens energivaluta. Det är en nukleotid som heter adenintrifosfat och som vid förbränning i kroppen frigör mycket energi som kan användas i endoterma anabola reaktioner.
Vad är reaktionsformeln för förbränning av ATP?
ATP + H2O <—> ADP + Pi + 30,5 kJ
Vad är NAD+ och FAD?
De är koenzym som är bärarmolekyler. De kan bära elektroner och väteatomer genom att reduceras till NADH och FADH2.
Hur går reduktionerna av NAD+ och FAD till? Skriv reaktionsformel.
NAD+ + SH2 —> S + NADH + H+
FAD + SH2 –> S + FADH2
Vad visar blodsockernivån?
Koncentrationen av glukos i blodet.
Genom vilka reaktionskedjor sker glukoskatabolismen?
Genom glykolysen, citronsyracykeln och andningskedjan.
Var och hur sker glykolysen?
Den sker i cytoplasman. Varje glukosmolekyl sönderdelas till två pyruvatjoner CH3-CO-COO-. Det bildas också 2 ATP och 2 NADH.
Efter glykolysen, på vilka tre sätt kan pyruvatjoner brytas ned?
Genom aeroba reaktioner i citronsyracykeln, genom anaeroba jäsningsreaktioner i svampar och genom bildning av laktatjoner i muskelceller.
Hur bryts neutralfetter ned?
De bryts ned i tarmen till glycerol och fettsyror.
Var och hur sker citronsyracykeln?
Det sker i mitokondriernas matrix. Pyruvatjoner reagerar med koenzym A och det bildas acetylkoenzym A. Acetylkoenzym A reagerar med oxalacetatjoner och det bildas en citratjon. Det spjälkas av en koldioxidmolekyl från citratjonen, NAD+ reduceras och det bildas ketoglutarat. Ytterligare en koldioxid spjälkas av och NAD+ reduceras och ATP avgår, det bildas succinat. Nu reducerad FAD och det bildas fumarat, sedan malat och efter ytterligare en reduktion av NAD+ har oxalacetat återbildats.
Vad bildas i citronsyracykeln?
1 ATP, 2 CO2, 3 NADH och 1 FADH2.
Var och hur sker andningskedjan?
I mitokondriernas inre membran oxideras NADH och FADH2. Protonerna och elektronerna skiljs åt. Elektronerna transporteras av cytokromer. I slutet av kedjan möts elektroner och protoner igen och det bildas syreatomer.
Vilken är totalreaktionen för andningskedjan?
NADH + H+ + 1/2 O2 –> NAD+ + H2O + 220 kJ
Vilka produkter bildas i andningskedjan?
För varje NADH som oxideras bildas 3 ATP och för varje FADH2 bildas 2 ATP.
Hur beräknas energin som frigörs när en mol NADH oxideras i andningskedjan?
W = (Ered - Eox) * n * F
W är energin som frigörs, n är antalet elektroner som avges av NADH och F är laddningen hos 1 mol elektroner. Ered och Eox är redoxparens normalpotentialer.
Hur många mol ATP bildas i citronsyracykeln och i andningskedjan?
38 mol ATP för varje mol glukos.
