BIOLOGIE CELL&MOLECULAIRE Flashcards
LE NOYAU (caract, compo, fonctions)
CARACT
- existe des cellules sans noyaux present chez l’humain (G.R. et plaquettes)
- procaryotes ne comporte pas de noyau - eucaryote comporte un noyau
- les levures sont des eucaryotes unicellulaires avec des particularités qui lui sont propres
COMPO
- enveloppe nucléaire constituee d’une membrane nucléaire interne et externe
- membrane du RE
- la lumière du RE
- la lamina nucléaire (donne la structure au noyau.)
- les pores nucléaires
- l’espace plurinuclaire
- nucleole :
*Le nucléole est la région du noyau dans laquelle sont produits les ARN ribosomiques 28S, 18S et 5,8S (ARNr), mais pas l’ARN ribosomique 5S.
*Cette région regroupe les organisateurs nucléolaires
(= les régions du génome portant les gènes codant pour l’ARN précurseur des ARN ribosomiques 28S, 18S et 5,8S).
*Il se désagrège pendant la mitose, lorsque les chromosomes se compactent:
il n’est donc pas visible pendant cette période du cycle cellulaire.
*C’est une région fonctionnelle du noyau, ce n’est pas un compartiment délimité par une membrane ou une enveloppe.
FONCTIONS
- contient notre genome (ADN)
- regulation interactions genome-cytoplasme (noyau delimite par une membrane, ponctuée de pores qui contrôlent les échanges moléculaires entre le noyau et le cytoplasme (ARNm)
- produit les ribosomes (biogenèse dans le nucléole (structure interne du noyau)
- disparait durant la mitose
- importance clinique (maladies dues au dysfonctionnement du transport entre les pores et. le noyau)

LE COMPLEXES DES PORES NUCLEAIRES (NPC) (caract, compo, loca, fonctions)
CARACT
- Les molecules > a 50 KDa ne peuvent pas franchir la barrière seule, sauf par l’aide des molecules d’importation
- 2000 a 6000 pores par noyau
- 2 anneaux (face nucléaire et face cytoplasmique =) sont constituées de fibrilles qui se rejoignent et forment une cage (la cage sera en relation avec le cortex nucléaire (lamina nucléaire) sous membranaire)
COMPO
- l’intérieur des pores est hautement obstrue par des fribilles de nucleoporines contenant des phenylalanine- glycine
- NUCLEOPORINES
- bi-couche lipidiques
LOCA
- complexe protéique traversant l’enveloppe nucléaire
FONCTIONS
- permettent les échanges entre le noyau et le cytoplasme (TRSPT PASSIF=) 5KDa les molecules petites qui passent par les pores nucléaires sans aides)
- transport dans les 2 sens grace a des molecules d’importation (TRSPT ACTIF=) >50KDa les molecule plus larges qui sont aidées par des molecules cargos ou prot permettant le passage des diff molecules par les pores nucléaires)
- regent les échanges entre noyaux/cytoplasme NOYAU -> CYTOPLASME (ARNm; ARNtransfert; particules pre ribosomiques) CYTOPLASME -> NOYAU (histones; lamines; facteurs de regulation de la transcription; ADN; ARNpolymerase)
- L’importation des Protéines se fait grace au NUCLEAR LOCALISATION SIGNAL (NLS)

NLS (NUCLEAR LOCALISATION SIGNAL) (caract, compo, loca, fonctions, mécanisme)
CARACT
- signal present uniquement chez les protéines nucléaires
- sa phosphorylation induit sont inactivation et la dephosphorylation pour la réactiver
COMPO
- sequence variable selon les prot nucléaires mais riches en acides amines (LYSINE; ARGININE)
LOCA
- peut être localise n’importe ou dans la sequence de la protéine (courte sequence)
FONCTIONS
- la cell peut contrôler l’exportation des prot par phosphorylation et dephosphorylation des NLS
MECANISME
- la prot avec le signal de localisation nucléaire de base ne possède pas la taille pour passer. Elle va interagir avec un RECEPTEUR D’IMPORTATION NUCLEAIRE (prot hydrophobe) Ils vont créer un complexe d’hydrophobicite passant tous deux a travers les pores nucléaires. Une fois dans le noyau, se détachent

TRANSPORT NUCLEAIRE ACTIF ( 3mecanismes)
MECANISME
- *IMPORTATION : la proteine ayant un NLS va se lier a un recepteur d’importation nucleaire. Un fois fixes, le complexe passe dans le pore nucleaire. Arrive dans le noyau, la RAN-GTP va prendre la place de la proteine sur la molecule cargot. En prenant sa place, la prot est delivree dans le noyau. La RAN-GTP et la molecule cargot vont ressortir ensemble du noyau. La RAN-GTP va prendre un groupement PHOSPHATE et va devenir RAN-GDP. En devenant, RAN-GDP ell va se dissocier du recepteur pour le rentre libre a nouveau. (Le cycle recommence)
- *EXPORTATION : dans le cytosol se trouve le recepteur d’exportation nucleaire seul. Il va rentre dans le noyau par les pore nucleaires. Dans ke noyau une RAN-GTP et une prot possedant le NES vons se fixer sur la molecule cargot (il faut que les deux soient liees pour que le complexe fonctionne sinon pas fonctionement). Le complexe va resortir du noyau vers le cytosol. Arrive dans le cytosol, la RAN-GTP va perdre un groupement phosphate et devenir RAN-GDP. En devenant RAN-GDP elle va se liberer de la molecule cargot et la proteine va elle aussi se liberer du recepteur d’exportation nucleaire (le cycle recommence)
- *TRANSPORT : c’est une suite d’importation et d’exportation de protéines gouvernée par la RanGTP (faiblement concentrée dans le cytoplasme et fortement dans le noyau). Pour maintenir la concentration de RanGTP dans le noyau, une enzyme, la RanGEF convertie la RanGDP en RanGTP. Pour le cytoplasme, l’enzyme, RanGAP convertie la RanGTP en RanGDP

La grande exception de export (mecanisme)
l’export des ARNm n’utilise pas le système de Ran-GTP.
Sur la terminaison 5’ de l’ARNm est liee à une coiffe (CBC)et sur l’ARNm se trouve le RECEPTEUR D’EXPORTATION NUCLEAIRE.
Toutes les proteines qui sont exclusivemetn nucleaires restent dans le noyau, les autres vont etre exportees vers le cytosol.
Munie de cette coiffe, l’ARNm va etre exportee en passant par les pores nucleaires.
En arrivant dans le Cytosol, le recepteur d’exportation nucleaire se detache de l’ARNm et les FACTEURS D’INITIATION DE LA SYNTHESE PROTEIQUES (eIF4G et eIF4E) viennent se fixer sur la terminaison 5’ de la molecule. La coiffe se detache et laisse place au facteur d’initiation de la synthese proteique eIF4E sur la terminaison 5’ qui elle meme attache eIF4G.
Grace a ce complexe, l’ARNm va s’enrouler pour debuter la traduction (synthese des proteines) et avoir en bout de chaine le codon STOP.
La difference entre la MITOSE et la MEIOSE
LA MITOSE : est un moyen fondamental par lequel les organismes vivants se propagent, se renouvellent, se reparent. Avec une repluication de l’ADN, une segregation des chromosomes et une CYTOKINESIS ou une cell mere devient deux cell filles. Elle est constituée de 4 phases. =) DIVISION CELLULAIRE LA MEIOSE : elle est composée d’1 cycle de duplication de l’ADN (PHASE S) et de 2 cycles due segregation de l’ADN MEIOSE 1 (REDUCTIONELLE) &2 (EQUATIONELLE)). On part initialement avec un HOMOLOGUE paternel et un HOMOLOGUE maternel et la résultante est de 4 gametes haploïdes genitiquements non identiques. =) DIVISION CELLULAIRE AVEC FORMATION DES GAMETES A sa resultante, on a une importance au nv du brassage du materiel génétique.
Donnez les différentes étapes de la MEIOSE (les noms)
MEIOSE 1 :
- PROPHASE 1 :
(1) LEPTOTENE
(2) ZYGOTENE
(3) PACHYTENE
(4) DOPLOTENE
(5) DIACINESE - PROMETAPHASE 1
- METAPHASE 1
- ANAPHASE 1
- TELOPHASE 1
- CYTOCINESE 1
MEIOSE 2 :
- PROPHASE 2
- PROMETAPHASE 2
- METAPHASE 2
- ANAPHASE 2
- TELOPHASE 2
- CYTOCINESE 2
LA PHASE S (fonctions, mécanismes)
FONCTIONS
- phase de Synthese ou l’ADN de la cellule est réplique dans le noyau (10-12h)
- permet a la cell de dupliquer a l’identique son materiel génétique (1 chromosome a 1 chromatide -> 2 chromatides)
MECANISME
- la replication de l’ADN comporte 3 caractéristiques
(1) SEMI CONSERVATRICE : les deux brins dADN sont séparés par une enzyme =) HELICASE.
Cette separation permet a une autre enzyme, l’ADN POLYMERASE de synthétiser 2 brins complémentaires au regard des brins d’ADN de la molecule mere en respectant l’appariement des bases (ATCG)
Ainsi, chaque cell fille conservera la MOITIE du matériel génétique de la mere (constitue d’un brin MATERNEL et un brin NEOFORME)
(2) BI-DIRECTIONELLE : la replication commence au niveau de sequences de nucleotides spécifiques, ORIGINES DE REPLICATION.
La formation des brins complémentaires se fait dans le sens 5’P –> 3’OH.
Or les brins de l’ADN sont ANTIPARALLELES. Donc la synthèse des brins complémentaires se fait dans les deux sens a partir des points initiaux, OEIL DE REPLICATION.
(3) ASYMETRIQUE : l’un des 2 brins, le brin DIRECTEUR, va être synthétisé de façon CONTINUE, tandis que le brin DISCONTINUE (retarde) va être fabrique a l’aide de plusieurs fragments, LES FRAGMENTS D’OKAZAKI
LEPTOTENE (caract, compo, loca, mécanismes)
CARACT
- l’ADN est répliqué
- les 2 copies (2 chromatides) sont liées l’une a l’autre par les COMPLEXES DE COHESINES
COMPO
- centrosomes
- paires de chromosomes homologues
- enveloppe nucléaire
- chromosomes homologues ont leurs telomeres attaches a l’enveloppe nucléaire
LOCA
- lors de la MEIOSE 1 en PROPHASE 1
MECANISME
- debut de l’attachement des telomeres a l’enveloppe nucléaire
- les chromosomes homologues se condensent, s’apparient et la recombinaison génétique commence

ZYGOTENE (loca, caract, fonctions, mécanismes)
LOCA
- meiose 1 en prophase 1
CARACT
- les TELOMERES sont lies a ma face interne de l’enveloppe nucléaire.
FONCTIONS
- mettre les chromosomes en BOUQUET
- debut de l’appariement des chromosomes par la formation du COMPLEXE SYNAPTONEMALE
MECANISME
- le complexe synaptonemale commence a s’assembler localement le long des homologues.
L’assemblage commence sur les sites ou les homologues sont etroitements associés et ou la recombinaison se produit.
- formation du complexe SYNAPTONEMALE tout le long des chromosomes : en direction de ZIPPERING le long des PROTEINACEOUS AXIS

PACHYTENE (caract, loca, fonctions, mécanisme)
CARACT
- les NODULES (lieu de C.O des paires homologues pour former de TETRADES) de recombinaison sont VISIBLES
LOCA
- M1, Prophase 1
FONCTIONS
- le complexe synaptonemal entre chaque paire de chromosomes homologue est MATURE (APPARIEMENT COMPLET)
MECANISME
- avant la formation du complexe synaptonemal, le complexes de RECOMBINAISONS s’assemblent sur les cassures de l’ADN double brin des chromatides soeurs, et facilitent les C.O entre les boucles de chromatides non soeurs provenant des cotes opposes au complexe
- les deux chromosomes apparies forment un BIVALENT
Tétrade = groupe de 4 chromatides Bivalent = groupe de chromosomes homologues enchevêtrés.
- le processus d’assemblage est acheve et les homologues sont réunis sur toute leur longueur.

DIPLOTENE (caract, compo, loca, mecanisme)
CARACT
- les chromosomes “PLUMEUX” montrent leur decondensation traduisant une forte transcription (ARN)
COMPO
- CHIASMA complex present entre les chromatides non soeurs pour maintenir ensemble les chromosomes homologues
- C.O s’est fait au niveau du chiasma (bivalent ayant subi 3 C.O donnant 3 chiasmas) normalement 1 C.O pas chromosomes mais en moyenne 2-3 CO
LOCA
-M1 prophase 1
MECANISME
- “desynapsis” (=dissolution (désassemblage) des complexes synaptonémaux)
- chaque croisement est visible sous forme d’un chiasma
- décondendation dans les ovocytes
- le CO est un mécanisme ou une chromatide “1” a subi des échanges avec la chromatide “3”.
Suite a ca, la presence du chiasma et l’attachement fort l’un a l’autre des bras des chromatides soeurs (par les COMPLEXES DE COHESINE) maintiennent les 2 homologues ensembles après la dissociation du complexe synaptonemal.

DIACINESE (compo, loca, fonctions, mécanismes)
COMPO
- centromere
- 4 chromatides visibles
- chiasma
- l’extremite des chromosomes se detachent de l’enveloppe nucleaire
LOCA
-M1 en Prophase 1
FONTIONS
- marque la fin de la PROPHASE 1
- étape de transition vers la METAPHASE 1
MECANISMES
- terminaison des chiasmas (glissent vers les telomeres cad les chiasmas se trouvent plus vers le bouts des chrosomes et pas au centre des bivalents)
- les telomeres se détachent de l’enveloppe nucléaire
- dans les ovocytes, les chromosomes se recondensent

METAPHASE 1 (mechanism)
MECANISMES - commence par la rupture de l’enveloppe nucléaire. Les chromosomes peuvent s’attacher aux microtubules du fuseau via leurs KINETOCHORES et se mobiliser activement. Se sont retenus ensemble pas les CHIASMAS Ils sont alignes sur l’EQUATUER du fuseau a mi chemin des poles du fuseau Les microtubules des KINETOCHORES attachent les chromatides soeurs d’un homologue , se fixent aux microtubules émanant du meme pole du fuseau méiotique 1 et donc segregent ensemble dans la meme cellule fille en anaphase 1
KINETOCHORES (caract)
CARACT - complexe protéique associe aux centromeres sur les deux chromatides soeurs d’un homologue, ,se fixent aux microtubules provenant du meme pole du fuseau méiotique 1 et donc segregent ensemble dans la meme cellule fille en anaphase 1. (contrairement a la mitose et méiose 2. ou les kinetochores de deux chromatides soeurs se fixent aux poles opposes du fuseau et se repartissent a l’anaphase en 2 cellules filles diff)
METAPHASE 1. ANAPHASE 1. TELOPHASE 1. CYTOCYNESE 1
très similaire a la mitose, mais les cohésines pres des centromeres sont proteges de la SEPARASE et donc les chromatides soeurs restent attachees.
ANAPHASE 1 (mecanisme)
MECANISMES -separation des chromosomes homologues - chaque cellule fille hérite d’un seul chromosome par paire , chaque cellule fille est haploïde
MEIOSE 2 (carat, compo, mechanism)
CARACT -meiose equationelle COMPO -PROPHASE II - PROMETAPHASE II - METAPHASE II - ANAPHASE II - TELOPHASE II - CYTOCYNESE II MECANISMES - en anaphase II, l’APC/C déclenche le clivage des cohesines des centromeres (separation des chromatides soeurs de chaque chromosomes)
LA LAMINA (carat, campo, loca, fonction, mécanismes)
CARACT - alteration de la lamina a cause d’un vieillissement premature =) LA PROGERIA (maladie génétique) COMPO - maillage fibrillaire dense - compose de polypeptides =) LES LAMINES (A/B1/B2/C) (ou A/C sont identiques) LOCA - borde l’enveloppe nucléaire d’une cell (cote nucleoplasmique) FONTIONS - reseat protéique fibreux, homologue aux filaments intermédiaires qui doubles la membrane interne de l’enveloppe nucléaire formant une couche de faible épaisseur et interompue par les pores nucléaires - donne la forme au noyau (support structurel) - rend rigide l’enveloppe nucléaire - role dans la disparition et la reconstruction de la membrane nucléaire lors de la division cell - fixation des chromatides a la periphery du noyau - MECANISMES/SYNTHESE - est uns structure dynamique ou la POLYPEPTIDE DE LAMINE s’assembler en DIMERE DE LAMINE qui permet une association de ces dimere a la queue leu leu formant un POLYMERE et l’association cote a cote des polymères forment les FILAMENTS - par un processus de desphosphorylation (PHOSPHATASES =) enzyme ayant comme fonction d’enlever un groupe kinase d’une molecule) et phosphorylation (KINASES=) catalyse les reactions de phosphorylation parr l’ajout d’un ion phosphate a une molecule cible a partir de l’ATP) Cela permet la dissociation et la reformation de l’enveloppe nucléaire
LA PROGERIA (caract, meccanisme)
CARACT - alteration de la lamina a cause d’un vieillissement premature MECANISMES - une lamina intacte est composée d’un gene LMNA intact. Or, dans le cadre de la PROGERIA, le gene LMNA est mute. la gene lamine A sur le chromosome 1 est le responsable ce qui résulte d’une cell qui ne peut plus migrer dans le noyau, reste attachée a la membrane nucléaire entraînant sa deformation.
LE NUCLEOLE (caract, compo, location, fonctions)
CARACT
- le plus gros sous compartiment du noyau des cell eucaryotes
- n’est pas délimité par une membrane
(pas presence d’organites)
- son evolution : en G2 =) nucleole
: en PROPHASE …-> ANAPHASE =) dissociation du nucléole
: en TELOPHASE -> G1 =) association du nucléole
: en phase S =) presence du nucléole
COMPO
- prot
- ADN
- ARN
LOCA
- se forme autour de regions chromosomiques
(NOR =) nucleolar organizing région)
- dans le noyau de la cell
FONCTIONS
- centre de synthèse des ribosomes
- Synthese des ARNribosomiques
(croissance de proliferation des cell)
- efficacité de la maturation des ARNr
- assemblage des sous unites ribosomiques
- transport des sous unites ribosomiqiues vers le cytoplasme
- disparition avant la division cellulaire et réapparition ensuite
- domaine nucléaire multi-fonctions jouant un role dans l’organisation nucléaire
LE RIBOSOME (caract, compo, loca, synthese, fonctions)
CARACT - complexe ribonucléique (RNP) de très grande taille qui a les protéines d’un ribosome =) ARNr possède l’activité catalytique du complexe RNP COMPO - compose de 2 sous unites (1) la petite (40S) =) porte l’activité de décodage de l’ARNm. Elle est requise pour la reconnaissance codon/anti-codon et assure une traduction correcte de l’information génétique Elle est composée de l’ARNr 18S et de 33 prot (2) la grande sous unite (60S) =) responsable de la formation de la liaison peptidique. La prot naissant sort du ribosome par le tunnel de sortie, ou il est pris en charge par des chaperons pour la replier. Elle est constituee de 3 ARNr (5S, 5.8S, 28S) et de 47 prot LOCA - dans le nucléole ou il est synthétisé - apporte des fonctions dans le cytoplasme SYNTHESE - les ARNp I et III transcrivent le précurseur d’ARNr 35S et 5S, qui s’associent dans le nucléole aux prot ribosomiques et aux facteurs pre-ribosomiques pour former la particule 90S. La pre-60S produira la grande sou suite ribosomique et la pre-40S a la petite. Une séquence de reactions de maturation des ARNr, conjointe a l’association et a la dissociation de facteurs protéiques, accompagne le transport des particules vers le nucleoplasme -> le cytoplasme ou les 2 sous unites matures s’associent a un ARNm pour former un ribosome 80s lors de la traduction FONCTIONS - traduction de l’information génétique codée par l’ARNm en prot
LA CHROMATINE (caract, compo, loca, fonctions, mécanismes)
CARACT
- présente dans les cell eucaryotes
- materiel génétique -
divisee en
EUCHROMATINE
( structure decondenssee pendant l’interphase et est active pour la transcription. Localisee a l’intérieur du nucloplasme)
et
HETEROCHROMATINE
(structure qui ne change pas d’état de condensation au cours du cycle cellulaire, la chromatine non transcrite, qui est plus condensée que l’euchromatine et contient de l’ADN codant et non codant. Localisee en périphérie du noyau et du nucléole)
COMPO
- constituee d’ADN et prot
- son unite fondamentale est le NUCLEOSOME
(compose d’ADN et d’histones. 1er nv de compaction de l’ADN dans le noyau)
LOCA
- dans le noyau de chaque cell
FONCTIONS
- permettre son interaction avec les machinerie protéiques régulant les fonctions de la chromatine (
replication, reparation, recombinaison)
- l’organisation dynamique de la structure chromatinienne influence les fonctions du genome
MECANISMES
- le NUCLEOSOME constitue le 1er nv de compactación de l’ADN dans le noyau.
La structure est répétée pour former des NUCLEOFILAMENTS qui peut adopter un niveau d’organisation plus compacte.
La nv de condensation le plus élevé est atteint en METAPHASE.
En INTERPHASE la chromatine est organisée en territoires fonctionnels
EUCHROMATINE
structure decondenssee pendant l’interphase et est active pour la transcription.
Localisee a l’intérieur du nucloplasme



































