biologia molecular 1 Flashcards
formas alternas de un gen
alelo
DNA a D NA
replicación
DNA a RNA
transcripción
RNA a AA
traducción
RNA a DNA
retro-transcripción
occure de manera extraordianaria en virus
en que enzima ocurre la retro transcripción
telomerasa
diametro o ancho del adn
2 nm
cada cuantas bases hace un gire el adn y cuanto mide ese giro
cada 10 bases 3.4 nm
dirección de las cadenas antiparalelas
5´a 3´y la otra 3´a 5´
cuanto mide el surco menor
.34nm
con que se compactan los cromosomas bacterianos
con poliaminas
cuantas bases tiene un duplex de adn
10 bases
cuantas bases tiene un nucleosoma
150 pares de bases
de que depende del empaquetamiento del ADN
proteinas llamadas histonas
cual es la estructura basica de emoaquetamiento del adn
nucleosoma
que contiene un nucleosoma
octamero de histonas + 200 pares de bases enrolladas alrededor de estas proteinas
solenoide
enrollamiento de nucleosomas mediante la cohesina que mide 30 nm de diametro
que sigue despues del solenoide
forma una fibra de cromatina y luego ya el cromosoma
que forman 6 nucleosomas
un arreglo helicoidal llamado soleniude
de 30 nm
cromatina que permanece compactada durante la interfase
heterocromatina
que forma una cromatide
bombinas empalmadas
secuencia que muestran los centromeros humanos
170 pares de bases repetidas entre 500 a 3,000 veces
secuencia telomerica para todos los vertebrados
TTAGGG-AATCCC
en que fase mitotica se encuentra mas compactada el cromosoma
en metafase 15,000x mas compacto
cromosoma bacteriano sin cromatina
genoforo
tipos de capsides
filamentosas/helicoidalos y icosaedricas
en donde se localizan los genes
locus
como se dice que es la molecula del adn
bicatenaria o duplex, antiparalela y complementaria
purinas
adenina y guanina
tiene dobles anillos
genoma más grandes
amoeba/ polychaos dubia
pirimidinas
timina, citosina y uracilo
como se sabe si es una desoxi ribosa o una ribosa
la desoxiribosa solo tiene un OH abajo y la ribosa 2
que es responsable de la migracion durante la electroforesis
la carga del fosfato negativa
capacidad del adn en separarse en dos cadenas
desnaturalización
que conformación del adn es la más tipica
la B y la forma A es la deshidratada
que contiene la region reguladora de un gen
un promotor y un potenciador o un enhancer
en donde se encuentra la region regulador en un gen
se encuentran up stream al codon de iniciacion ATG en el extremo 5 ´
ADN transposones
una parte del adn se mueve a otra parte cuasando enfermedadis como hemofilia, scid
exones
partes de un gen que codifican aminoacidos en polipeptido codificante; secuencias de adn que son exportadas del nucleo en forma de arn para ser traducidas en proteinas
intrones
conforman part del ARN primario pero se quedan dentro del nucleo
retrotransposones
ADN transcribe y produce un ARN, el cual produce un adn de doble cadena que se inserta en el adn blanco
poliformismo génetico
existencia de multiples alelos para un gen
histonas
H2A, H2B, H1, H3 Y H4
histona de sello o enlazadora
H1
tipo de cromatina que contiene material genético activo
eucromatina
que es la heterocromatina facultativa
cromosomas enteros que son inactivados
en donde se encuentra la heterocromatina constitutiva
en el centromero o telomero
ejemplo de heterocromatina facultativa
cromosoma x y cuerpo de barr
heterocromatina constitutiva
secuencias expecificas no codificantes
cuando se heterocromatiza un cromosoma x
durante el desarollo embronario y se desactivan los genes en ese cromosoma
que gen es responsable de la inactivación del cromosoma x
Xist RNA no codificante
verdadero o falso; no importan cuantos cromosomas X existan, solamente uno permanace activo y los demas inactivos
verdadero
como es que se inactiva el cromosoma x
condensación, por modificaciones en las histonas, y la metilación del adn
que diferencia la heterocromatina de la eucromatina
que en la hetercromatina hay metilacion y desacetilacion de histonas mienstra que en eu las histonas estan acetiladas
que paso asegura la inactivacion del cromosma x
desacetilación de H4 y metilacion de sec CpG
verdadero o falso: la metilación se hereda
proteina implicada en la formacion y mantenimiento de la heterocromatina
HP1
como se replica el adn
de forma semiconservativa
replicación semiconservativa
cada hija debe consisitir en una hebra completamente heredada del duplex parental y una complementaria recien sintetizada
sitio donde incia la realización del adn
horiquilla de replicación
en que fase del ciclo ceular inicia la replicación en eucariotas
fase s
tres etapas de la replicación
iniciación, elogacion y terminacion
funcion de DNA polimerasas
enzimas que sintetizan nuevas hembras de adn
hacia que direccion avanzan las horiquillas de replicación
hacia afuera en ambos lados osea bidireccional
pequeñas porciones de genoma para la replicación
replicones
ORC
complejo que se une a los sitios donde se origina la repliacion de adn
paso 2 de la iniciacion de la replicacion
se crea un pre-RC o complejo de replicacion en el cual llegan Cdc6 que cargan al adn con MCM que se encargan de desarollar al adn
paso 3 de la iniciacion de
CDKs activan al complejo pre RC
Funcion de las Mcm en la repliacion de adn
DNA helicasa que denrolla al duplex orginal de adn
requisitos para repliacion de adn
una plantilla para copiar y una hebra primaria para agregar nucleotidos
polimerasa másimportante para la replicacion
dna polimerasa III
en que direccion se deben sintetizar el adn
de 5´ a 3´
como se sinetiza la hebra que crece alejada de la horiquilla de replicacion
de una forma discontinua o en fragmentos
porque se dice que la repliacion es semidisocntinua
porque una hembra crece hacia la horiquilla entonces es conyinua y la otra no, crece alejada y en fragmentos
como comienza la síntesis de los fragmentos okazaki
por una polimerasa llamada primasa
pasos para sintesis de la hebra retrasada
se sintetiza rna primario por primasa cerca de la horiquilla y tambien en la parte lejos de
se elonga por medio de adn polimersasa III
se elimina el primario y se llenan espacios por dna polimerasa 1
y dna ligasa sella hebras
funcion de la dna ligasa
sella fragmentos de okazaki
que tan frecuente es una base equivocada en genereaciones bacterianas
1 base por cada 10 generaciones
tipos de errores en los cromosomas
inversiones, substituciones, deleciones, insertion
funcion de la DNA pol 1
reparacion de DNA dañado
que tipo de activiada tiene la DNA POL 1 procariota y en que sentido va
exonucleasa y en sentido 5 a 3 o de 3 a 5
que puede eliminar la DNA pol 1
tramos de RNA que dejo la primasa en el extremo 5`
funcion de la DNA pol 1
esta involucrada en la replicacion de DNA dañado
en que sentido trabaja la DNA pol II polimerasa
5´a 3´
en que sentido trabaja la DNA pol II exonucleasa
que tipo de problemas causa la ataxia telangiectasia
trastorno motor ya que afecta cerebelo y dilatacion de vasos pequeños
en que gen se encuentra una mutacion en el sindrome de bloom
gen BLM que esta involucrado en la desnaturalizacion del dna
que sindrome presenta un rash cutaneo en forma de mariposa
sindrome de bloom
que sndrome es caracterizado por envejecimiento precoz a etepas tempranas de la infancia
hutchinson-gilford o progeria y sindrome de werener
en que gen se encunetra una mutacion para la progeria
gen LMNA
sitio del adn que se une al ARN polimerasa antes de la transcripcion
promotor
en que sentido se mueve RNA POLIMERASA
3´ a 5´
peptidos no ribosomlaes que inhiben activiadad de RNA pol
amanitinas
transcripcion en bacterias
factor sigma se una a rna pol para que aumente afinidad de enzima para los sitios promotores y se una a ellos y se empieza la transcripcion abriendo las hebras adn y copiando bases complementarias
como se terina la transcripcion en bacterias
la proetian rho rodea al RNA sintetizado y se mueve hacia RNA polimerasa y separa la RNA del ADN
RNA pol 1
involucrado en sintetsis de rRNA grandes y pesados
RNA polimerasa III
sintesis de tRNA y rRNA pequeño
RNA polimerasa 2
sintesis de mRNA
en que parte del gen se unen los factores de transcripcion para ayudar en la transcripcion
en los enhancers
como empieza la trancripcion
primero TFIID se une a TATA y este reculta a TFII A y B y se permite que RNA 2 se una al ADN, y luego se reculta a TFIIH o helicasa, fosforila a la enzima y empieza transcripcion
que da inicio a la transcripcion en bacteria y eucariotas
en bacterias es el factor sigma y en eu es la RNA pol II
factor de transcripcion que esta involucrado en desarollo y morfogensis
homeobox
Zinc fingers
uno es cisteina - histamina
y el otro es cisteina - cisteina
que tipo de factor de transcripcion es homeobox
helix-turn-helix
que causan mutaciones en homeobix MSX-2
craniosintosis
caja TATA
determina el sitio de inicio para la trnscripcion y se encuentra en el promotor nuclear
en que parte del gen se unen los factores de transcripcion
en la caja GC y CAAT que se encuentran corriente arriba y son parte del promotor regulador
que ensambla rna polimerasa II
transcripcion primaria que es complementaria al adn
que se debe de añadir para que el transcrito primario se convierta en mensaje maduro
tapa 5y una cola en 3(poli A) en los extremos
que contiene la tapa 5’
nucleotido de guanosina metilado unido por un puente 5’-5’ al arn
funcion de la tapa de metilguanosina
evita degradacion de arn, ayuda a transportar arn m fuera del nucleo
como se forma la poli
una polimerasa agrega adenosina en el extremo 3’ sin necesidad de una plantilla de adn
cola de CCA
extremo 3’ de la tRNA
forma del tRNA
DATA
enzima que une el aa al extremo 3’ del tRNA
aminoacil-tRNA
en que cromosomas no se encuentra el gen de la tRNA
en el 22 y el Y
sitios de union del ribosoma eucariota
A- aminoacil tRNA
P- peptidyl- tRNA
codon de inicio
AUG o metionina
codon de terminacion
UAA - ocre
UAG ambar
UGA opalo
subunidad de inicicacion de la traduccion en procariotas
30s
factores accesorios o factores de iniciacion para la traduccion
IF en pro
eIF en eu
como inicia la traduccion en eucariotas
eIFs se unen a subunidad 40s que prepara al ribosoma para unirse a mRNA y la tRNA-met junto con eIF2 -GTP también se une a subinidad 40 s en el sitio P
en que parte del mRNA se una la subunidad 40S
a la tapa 5’
iniciacion de la traduccion
ribosoma de 40S escanea el mRNA por el codon de inicio AUG, luego eIF2 se desplaza (estaba unido al tRNA) y asi se puede unir la subunidad 60s para completar el ribosoma
secuencia de Kozak y su importancia
las bases antes del codon de iniciacion
GCCagAUGG
y las mas imp son la A y G antes del codon
funcion del eIF4A
elimina region en mRNA que puede intervenir con mov de complejo 40S
IF4G
une extremo 5’ y 3’, hacineod el mRNA circular
IF4E
se une a tapa 5’ en mRNA
que debe estar presente en la subunidad 40S para que se pueda unir al mRNA
tRNA unido a metionina
que se necesita remover de codon de inicio para que se une la subinidad 60s a la 40s
eIF-2
en que parte del ribosoma se une tRNA-Met o el inicidaor
en el sitio P
primer paso de la elongacion
eEF1A le entrega un aminoacil-tRNA al sitio A de la ribosoma
que factor de elogancion le entrega el aminoacil al ribosoma
en pro es EF-Tu y en eu eEF-1A
paso 2 de la elongacion
peptidil transferasa crea un enlace peptidico transfiriendo un polipeptido de sitio P al A
translocacion
ribosoma se mueve un codon en direccion 3’, moviendo lo que estaba en el sitio A al sitio P y lo que estaba en el P al citosol
diferencia de la translocacion en procariotas
e vez de mover lo que estaba en el sitio P al citsol se va al sitio E
factor de elongacion esencial para la translocacion
EF-G
codon de terminacion en eucariotas
UAG o ambar
codon de terminacion en procariototas
UAA ocre
