Biofilms : Grande résistance Flashcards
Nommer un exemple de résistance
Caulobacter crescentus (colle la plus puissante de la nature maintenant efficace en milieu humide et salé, ne peut e décoller jusqu’à sa mort).
Dentiste peut-il guérir un patient d’une parodontite?
Non, il s’agit d’une clientèle qu’il reverra, impossible de déloger le biofilm à 100%
Pourquoi on dit que les biofilms sont mixtes?
Espèces différentes et aussi 4 sous-population : classique, persistante, résistante, tolérante
Facteurs influençant hétérogénéité des populations
- Biofilm sont mixtes
- Coopération nutritionnelle
- Protections mutuelles
- Multiplicité des cibles
- Variété des polysaccarides matriciels
Nommer des éléments influençant hétérogénéité d’un biofilm a/n physiologique et métabolique
- Zones anaérobiques et aérobiques (si antibiotiques agit juste si O2, sera pas efficace avec bactérie anaérobique)
- Zones de pH différents
- Certaines bactéries en croissance lente et en arrêt complet : dormance (si antibiotiques pour bactérie active, n’agit pas si bactérie en dormance)
Vrai ou faux?
La résistance est un facteur génétique
Vrai, si non génétique = tolérance ou autre
Quelle est la concentration minimale de bactéricide pour tuer espèce bactérienne?
75 CMB
Expliquer comment différencier tolérance d’un bioclimatique VS résistance
Tolérance d’un biofilm est p/r à pleins d’éléments. Il s’agit d’une particularité d’un biofilm et non pas des bactéries elles-mêmes.
La résistance est particulière au bactérie (héréditaire).
Donc si on prend bactéries d’un biofilm sous la forme planctonique celles résistantes le resteront. Mais tolérantes ne le seront plus.
Quels sont les éléments à considérer lorsqu’on choisit un antibiotique et pourquoi?
- Taille de la molécule (+ molécule petite, + elle pourra diffuser partout)
- Composition du biofilm (biofilm mixte limite la diffusion)
- Limite de l’antibiotique : temps de diffusion (combien de temps pour arriver et jusqu’où il se rend)
Décrire un bon antibiotique selon le temps de diffusion
- Pas de limitation pour la diffusion (où il se rend)
- Temps de diffusion bas (pas longtemps pour atteindre plusieurs bactéries0
Combien de temps pour que rince bouche chlorexidine atteint coeur de la plaque?
298 secondes (5 minutes)
Expliquer ce qu’est l’hétérogénéité génétique
Lorsque une espèce de bactérie se sent en danger, capacité pour cette espèce de générer à un taux accélérer des variants génétiques (mutation qui entraîne résistance).
Sous direction gène red A chez le P. aeruginosa (cette prof a un effet indirect sur résistance puisque réparer ADN endommagé par les agents antimicrobiens ce qui augmente survie de la bactérie)
Nom = effet d’assurance
Expliquer ce qu’est l’hétérogénéité phénotypique
Caractéristique clé qui permet aux bactéries de survivre et de prospérer dans des environnements hostiles.
L’expression différentielle de gêne combiné à des facteurs environnementaux spécifique conduit à l’émergence d’un phénotype biofilm distinct. Ce phénotype qui confère tolérance aux antimicrobiens.
Quelle est la source des antibiotiques et qu’est-ce qui explique ce phénomène?
Bactérie ou champignon dû à la compétition
Nommer 2 effets d’un antibiotiques
- Bactériostatique (empêche croissance)
- Bactéricide (cause la mort de la bactérie)
Nommer un concept important de prendre en considération lorsqu’on découvre un antibiotique
Biocompatibilité
Antibio peut-il avoir les 2 effets (bactéricide et bactériostatique)?
En théorie oui mais pas en pratique dû à la biocompatibilité
Si j’ai à choisir entre bactéricide ou bactériostatique je prend quoi?
Bactéricide
Si ça prend grosse quantité d’un antibiotique bactéricide pour qu’il fasse effet, ça signifie quoi?
Il s’agit plutôt d’un bactériostatique
Nommer 2 éléments importants d’un antibiotique
- Pharmacodynamie (action)
- Spectre d’activité (agit sur qui et sur quoi)
Indiquer si ces antibiotiques sont temps ou concentration dépendants : bactéricide et bactériostatique
Bactéricide : concentration et temps dépendant
Bactériostatique : concentration dépendant
Comment reconnaitre si concentration vs temps dépendant?
Concentration dépendant : chute drastique dès le début en moins de 24h
Temps dépendant : fini par éliminer mais prend plus de temps
Vrai ou faux? Bactériostatique réduit la charge bactérienne
Faux, elle stop la multiplication
Pourquoi il est important d’utiliser des bactériostatique même s’ils ne sont pas les plus efficaces?
Diminue la croissance donc diminue la résistance
*Pour éviter résistance donner la concentration exacte/idéal si non résistance (effet doit être immédiate)
Décrire un antibiotique idéal selon temps et concentration
+ grosse concentration en moins de temps possible
Quels sont les 5 mécanismes d’action des antibiotique?
- Inhibition du peptidoglycane (destitution de la paroi)*
- Inhibition de la synthèse protéique
- Inhibition de la réplication et de la transcription (synthèse ADN)
- Synthèse de l’acide tétrahydrofolique
- Désorganisation de la membrane (perméabilité)*
Décrire le mécanisme d’action qui inhibe la formation de la paroi
- Inhibe la transpeptidase (enzyme) donc inhibe formation de peptidoglycane (chez les gram +) donc inhibe formation paroi donc entraîne lyse bactéries
- EFFET BACTÉRICIDE
- Pénicilline et vancomycine
*Péniciline = analogue (imite) structurale du substrat de la transpeptidase
Pourquoi inhibition transpeptidase n’a pas d’action sur les gram -?
Peptidoglycane chex gram - est interne et donc protéger par des LPS ce qui empêche diffusion de l’antibiotique dans la bactérie (alors que peptidoglycane est externe chez gram +)
Décrire le mécanisme d’action qui modifie la perméabilité de la membrane cytoplasmique (désorganisation de la membrane)
- Molécule se lie au LPS ce qui entraîne mal agencement de la membrane ext et entraîne formation de pores ce qui entraîne diffusion des éléments interne (fuite des composantes intracellulaires)
- EFFET BACTÉRICIDE
- Polymyxine
- Très toxique (neuro et néphrologies toxique)
- Gram -
- Bon locale, systémique (septicémie) = dernier recours
Décrire le mécanisme d’action qui inhibe la synthèse des protéines
- Antibio se fixe sur les ribosomes
- Streptomycine : BACTÉRICIDE puisque modifie la conformation de la sous-unité 30 S, entraînant une mauvaise lecture de l’ARNm pour toute la séquence donc sécrétion d’une protéine non fonctionnelle
- Chloramphénicol : BACTÉRICIDE puisque se lie à la sous-unité 50 S et inhibe la formation du lien peptique donc pas de formation de protéine puisque protéine est non fonctionnelle
- Érythromycine : BACTÉRICINE et BACTÉRIOSTATIQUE puisque se lie à la sous-unité 50 S empêchant le déplacement du ribosome sur l’ARNm. Dépend on est où dans la lecture (si 80% lu = bactériestatique) si début lecture = bactéricide
- Tétracycline : BACTÉRICINE et BACTÉRIOSTATIQUE puisque nuit à la fixation de l’ARNt au complexe ribosome-ARNm. Dépend aussi de quant transcription de la protéine est arrêtée
Décrire le mécanisme d’action qui inhibe la fonction des acides nucléiques
- Métronidazole : inhibe la réplication de l’ADN (agit sur bactérie anaérobique). Brain ADN se casse donc BACTÉRICIDE
- Rifampicine : inhibe transcription de l’ADN en ARNm
- Bactéricide ou bactériostatique
Décrire le mécanisme d’action qui fait de l’inhibition compétitive (antimétabolistes)
- Sulfamides miment la structure des molécules naturelles utilisées dans le métabolisme bactérien (analogue PABA) donc inhibe synthèse de l’acide tétrahydrofolique donc inhibe production des acides nucléiques (ADN et ARN) ce qui inhibe croissance bactérienne (donc bactériostatiqe)
- BACTÉRIOSTATIQUE
Décrire la différence si spectre d’activité d’un antibiotique est étroit ou large
Étroit : agit sur spécificité
Ex : metronidazole = pour bactérie anaérobiques
Ex : pénicilline = pour gram +
Large : agit sur quelque chose commun aux bactéries (facteur commun)
Ex : tétracycline et érythromycine
Expliquer différence entre monothérapie et multithérapie
Mono = 1 antibio si on sait quelle bactérie en cause exactement
Multi = 2 antibio, large spectre qui ont fonctions différentes. Lorsqu’on sait pas vraiment quelles bactérie (ex : lors de septicémie)
Quelles sont les principales classes d’antibiotique + les décrire
- Pénicillines :
Action = synthèse paroi (bactéricide)
Présence groupement B-lactame
Naturelle ou modifié
Peut -> réaction hypersensibilité - Métronidazole :
Action = réplication de l’ADN (bactéricide)
Spectre d’activité restreint aux bactéries anaérobies
Comment fonctionne un antibiogramme?
On dépose des pastille d’antibiotique sur une boite de pétri.
Meilleur antibiotique = celui avec plus grande superficie d’absence de développement bactérien.
Donne indication sur la sensibilité de l’antibiotique.
Permet de tester efficacité des antibiotiques et trouver le plus efficace contre une bactérie donnée
Expliquer définition CMI et CMB dans antibiogramme
CMI : concentration minimale inhibitrice (concentration la plus faible capable d’empêcher apparition croissance bactérienne visible
CMB : concentration minimale bactéricide (plus petit concentration en antibiotique capable de tuer 99,99% d’une population bactérie en 18-24h)
Interpréter analyser antibiogramme selon diamètre inhibition et concentration antibiotique
a) plus grand que 18 mm
b) entre 10 et 18 mm
c) entre 0 et 10 mm
d) entre 1 et 5 mg
e) entre 5 et 10 mg
f) entre 10 et 20 mg
a) sensible
b) intermédiaire
c) résistant
d) sensible
e) intermédiaire
f) résistant
Expliquer la méthode de diffusion en gélose bandelettes e-test
Permet de mesurer la diffusion en mesurant à la fois sensibilité et concentration minimale inhibitrice (CMI) de l’antibiotique
Expliquer la méthode de diffusion en liquide
On dilue un antibiotique pour avoir différente concentration et on y fait croître bactéries.
On identifie la CMI en trouvant quelle concentration minimale faut-il pour avoir absence de croissance bactérienne à l’oeil nu.
Couleur = croissance
Blanc = absence de croissance
Ensuite on prend la CMI et la dilue pour trouver CMB. Plus bas pourcentage de bactérie retrouver = CMB (meilleur concentration pour tx)
Donc si on utilise la CMI : effet sera davantage bactériostatique
Si on utilise CMB : effet bactéricide
Quels sont les 4 principaux mécanismes de résistance aux antibiotiques
- Décomposition des antibiotiques par les enzymes (pénicillinase)
- Modification de la perméabilité membranaire par réduction du nombre de potines (empêche antibiotique de pénétrer)
- Expulsion des antibiotiques hors de la cellule bactérienne grâce à des pompes d’efflux (dès qu’il entre, il est expulsé)
- Modification ou remplacement de la cible thérapeutique
Différencier la résistance naturelle de l’acquise
Naturelle :
Acquise : Transfert de gêne par mutation chromosomique (rare) ou acquisition de gènes de résistance par transfert (transformation, conjugaison et transduction). Échange de gênes entre elles.
Bactérie ne naît pas multirésistance, elle le devient parce qu’elle a acquis des gènes à force d’être confronter par des antibiotiques
Laquelle entre la résistance naturelle et acquise est la plus puissante?
Acquise
Lorsqu’une bactérie a une résistance naturelle, est-ce que toute la sous population a cette résistance?
Oui
Lorsqu’une bactérie a une résistance acquise, est-ce que toute la sous population a cette résistance?
Non, n’est pas résistance naturellement elle le devient donc c’est pas toute la sous population
Vrai ou faux?
Toutes les bactéries peuvent devenir résistante
Vrai
Comment éviter la résistance?
Utiliser de nouveaux antibiotiques, alterner
Ex : pénicilline pour un monsieur qui a un infection. 3 mois plus tard revient infection pas guérit. Prescrire autre chose que pénicilline
Quels sont les 5 conséquences liées à l’arrêt prématuré d’un traitement antibiotique?
- Durée et gravité de l’infection
- Augmentation de la résistance des antibiotiques
- Échec du traitement
- Impact sur la flore microbienne, disbio
- Impact sur la santé publique
Comment contrôler l’apparition de résistance? (4)
- Éviter l’usage abusif d’antibiotique
- Respecter la posologie de l’antibiotique
- Prendre un combinaison d’antibiotiques efficaces (synergie et antagonisme)
- Changer l’antibiotique quand apparaît un organisme résistant
Vrai ou faux?
Plus la CMI est élevée, + l’antibiotique est bon
Faux, plus CMI est bas plus l’antibiotique est bon
La CMI de A=1 et la CMI de B=1. CMI A + CMI B = 4. Est-ce une bonne combinaison d’antibiotique?
Non, les 2 annule l’effet d’un et l’autre. Ils ont un effet antagoniste. CMI élevée = pas bon
La CMI de A=1 et la CMI de B=1. CMI A + CMI B = 2. Est-ce une bonne combinaison d’antibiotique?
Pas mauvais, ils ont chacun leur effet. Ils ont un effet indifférent
La CMI de A=1 et la CMI de B=1. CMI A + CMI B = 0,5. Est-ce une bonne combinaison d’antibiotique?
Très bonne combinaison. Ils ont un effet synergique.
CMI basse = bon
Pourquoi on veut CMI bas?
- Biocompatibilité
- Affecte moins la flore commensale
*CMI bas veut dire plus petite concentration possible pour avoir meilleur effet
Qu’est-ce qui explique qu’un pt peut alterner entre phases rémission et rechûtes, c’est du à quoi?
Antibiotique utilisé agissent lors des cycles de réplication / multiplication.
Bactérie peut donc entrer en dormance même si sont sensible à l’antibiotique.
Il s’agit de bactéries PERSISTANTES (persistante sont tolérante, mais pas tous les tolérantes sont persistantes)
Bactéries sensibles un peu peuvent être tolérantes.
Bactéries tolérantes un peu peuvent être persistantes.
Quels sont les 4 mécanismes qui permettent à une bactérie d’être persistante?
1- Se mettent en sommeil (lors de conditions hostiles)
2- S’abritent des agressions (cachés dans des macrophages)
3- Renforcent leur ADN (acquissent gènes résistance)
4- Prolifèrent à nouveau (lorsque conditions propice revienent)
Expliquer phénomène de persistante en comparant avec résistance
Si résistance il resterait aucune bactérie donc pas d’arrêt de multiplication pendant certains jours.
Danger= antibiotics pendant 5 jours mais bactérie capable d’être en dormance pendant 7-10 jours, va être ne mesure de se réveiller lorsque perturbateur va partir et se remultiplier.
Résistance et persistance peuvent mener à échec antibiotique
Contrairement à résistance, persistant à pas de lien avec l’agent antibiotique. C’est aléatoire peut importe l’antibiotique et peut importe la bactérie. Et une même bactérie ayant déjà été persistance le sera pas nécessairement encore.
Persistance = biofilm et planctonique
Les bactéries qui sont persistantes sont celles les plus stressées
La résistante va continuer à se multiplier alors que la persistance va se mettre en dormance
La résistante va éliminer l’antibiotique alors que la persistante s’en échappe
Même si on change d’antibiotique ça va pas annuler ou influencer la persistance
phénomène de neurtralisation
Comment différencier visuellement si persistance et non résistance
Charge bactérienne diminue drastiquement avec les persistances
3 principales différences entre persistance et résistance
- Résistance se multiplie, persistance arrête de croître
- Facteur génétique dans résistance
- Résistance se transfert (à toute la population) alors que pour persistance la progéniture restent sensible à l’antibiotique
Quelles sont les 5 caractéristiques du concept de dormance?
1- Arrêt de l’activité cellulaire
2- Réponse condition stress
3- Reprise croissance
4- Stratégie survie
5- Permet bactérie de devenir persistante
Expliquer le mécanisme toxine-antitoxine
Toutes les bactéries ont le gène hip qui code pour l’opération toxine-antitoxine
Les facteurs extérieurs déclenche le gène (pas actif dans toutes les bactéries)
Rôle dans régulation apoptose, dormance et multiplication
Toxine inhibe les fonctions cellulaires lors de stress et induit dormance
Antitoxine neutralise toxine en condition normale
Toxine stable
Antitoxine est instable (doit constamment être produite)
Indiquer quelle type de bactérie ça correspond
a) Pu de bactérie du tout après tx
b) Augmentation du nombre de bactérie après tx
c) Moins de bactérie pendant un moment après tx mais multiplication
a) Sensible/susceptible
b) Résistante
c) Persistante