Biochimie Structurale: Cours 1 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que le vitalisme?

A

Croyance selon laquelle une force vitale est nécessaire à la formation de molécule organiques

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Q

Anabolisme?

A

Réactions de synthèse des biomolécules à partir de composés plus simples.

Consomme énergie

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3
Q

Catabolisme?

A

Réactions de dégradation des nutriments pour produire des biomolécules simples (unités de construction)

Produit énergie

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4
Q

Constante d’équilibre (Keq) ?

A

Ratio entre concentration des produits et celle des réactifs lorsque la réaction est à l’équilibre.

Peut être lié au changement d’énergie libre (G)

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5
Q

Enthalpie (H) ?

A

Fonction utilisée en thermodynamique –> CHALEUR contenu dans système

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6
Q

Entropie (S) ?

A

Fonction utilisée en thermodynamique —> degré de DÉSORDRE

J/mole*K (K=Kelvin)

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7
Q

Endergonique?

A

Mécanisme qui ABSORBE énergie (**pas chaleur, important) (G positif)

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8
Q

Exergonique?

A

Mécanisme qui LIBÈRE énergie (G négatif)

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9
Q

Groupement fonctionnel?

A

Partie réactive de la molécule

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10
Q

Hydrolyse?

A

Bris d’une liaison covalente à l’intérieur d’une molécule en ajoutant une molécule d’eau.

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11
Q

Biochimie?

A

Science qui étudie les molécules et les réactions chimiques de la vie. Pont entre chimie et biologie –> utilise vocabulaire de la chimie pour expliquer la logique des phénomènes biologiques.

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12
Q

Qui: Fin du vitalisme –> synthèse de l’urée?

A

Friedrich Wöhler

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13
Q

Qui: Enzymes = catalyseurs ?

A

Eduard Buchner et Emil Fischer

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14
Q

Qui: Enzymes = catalyseurs –> fermentation du glucose?

A

Eduard Buchner

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15
Q

Qui: Enzymes = catalyseurs –> hydrolyse du sucrose?

A

Emil Fischer

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16
Q

Qui: Mécanisme clé-serrure –> spécificité enzymatique ?

A

Emil Fischer

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17
Q

Qui: ADN=matériel génétique –> conjugaison bactérienne?

A

Avery, MacLeod, McCarty

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18
Q

Qui: Structure des protéines?

A

Kendrew et Perutz

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19
Q

Qui: Structure de l’ADN?

A

Watson et Crick

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20
Q

Caractéristiques des enzymes?

A
  • Catalyseurs (accélèrent réactions chimiques jusqu’à 10^20 fois)
  • Différence principale entre réactions biochimiques et réactions de chimie organique
  • Augmentent spécificité des réactions (complémentarité des surfaces entre enzyme et substrat –> mécanisme clé-serrure) explique petit nbre de produits intermédiaires + déchets
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21
Q

Information génétique est codée…

A

par l’ADN

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22
Q

ADN ____ en ARN

A

transcrit

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23
Q

ARN ____ en protéines

A

traduit

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24
Q

ADN —> ARN —> protéines est…

A

unidirectionnel + dogme central de la biologie moléculaire

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25
Q

Six éléments chimiques de la vie?

A

C, H, N, O, P et S (

  • 97% des éléments retrouvés dans le vivant
  • Capacité de former des liens covalents stables (plus légers à avoir cette propriété)
  • Essentiels aux espèces vivantes
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26
Q

V ou F : Toutes biomolécules contiennent du carbone

A

V

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27
Q

Pourquoi le carbone est-il à la base de la vie?

A
  • Capacité à former 4 liaisons covalentes (simples, doubles ou triples) –> propriété unique de former quasi une infinité de composés différents
  • Grâce aux liaisons C-C –> capacité de former de looooongues chaînes
  • Versatilité permet de former molécules linéaires, cycliques ou ramifiées
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28
Q

Chimie organique/biochimie=basée sur…

A

comportement des groupements fonctionnels

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29
Q

Membranes sont responsables de …

A

Force et forme de la cellule

30
Q

Énergie ultime de la vie?

A

Soleil

31
Q

Métabolisme?

A

Réactions chimiques permettant dégradation/synthèse des biomolécules

32
Q

L’énergie est stockée et transportée dans la cellule principalement sous forme…

A

d’ATP

33
Q

Constante de vitesse (k) ?

A

-Proportionnelle à la concentration des réactifs (chances d’entrer en collision)

34
Q

V ou F? Les réactions chimiques sont réversibles et spontanées dans les deux directions.

A

F

réactions chimiques sont réversible, mais PAS spontanée dans les deux sens.

35
Q

Une réaction est non spontanée lorsque…

A

-vitesse de transformation des produits en réactifs dépasse celle de la formation des produits
C+D–>A+B plus rapide que A+B–>C+D

-**tableau 1,4

36
Q

V ou F? Lorsque une réaction n’est pas spontanée dans ne direction elle l’est dans l’autre.

A

V

37
Q

Équation de Keq?

A

K eq = [Produits] / [Réactifs]

38
Q

Changement d’enthalpie?

A

Changement d’énergie interne sous forme de chaleur (J/mole)

39
Q

ΔH>0?

A

Réaction endothermique –> absorbe chaleur –> DÉFAVORABLE

40
Q

ΔH<0?

A

Réaction exothermique –> produit chaleur –> FAVORABLE

41
Q

ΔH=0?

A

Réaction isothermique –> aucune libération ou absorption de chaleur

42
Q

ΔS­<0?

A

DÉFAVORABLE

43
Q

ΔS>0?

A

FAVORABLE

44
Q

Organisation hiérarchique du vivant?

A

Atome –> Molécules inorganiques –> Biomolécules simples (acide aminé, monosccharide, acide gras, nucléotide) –> Macromolécules –> Complexes supramoléculaires –> Organites –> Cellule

45
Q

Groupement fonctionnel: R-OH?

A

Hydroxyle: ALCOOL

46
Q

Groupement fonctionnel: R-C-H
||
O

A

Carbonyle: ALDÉHYDE

47
Q

Groupement fonctionnel:
O
||
R-C-R’

A

Carbonyle: CÉTONE

48
Q

Groupement fonctionnel:
O
||
R-C-OH

A

Carboxyle: Acide carboxylique

49
Q

Groupement fonctionnel:

R-N-H ou R-N-H
| |
H R’

A

Amine

acides aminés –> primaires=tous sauf Proline (secondaire)

50
Q
Groupement fonctionnel: 
       O
        ||
R-O-P-O
        |
       O
A

Phosphate (-PO4)

Phosphoryle (-PO3)

51
Q

Groupement fonctionnel: R-SH

A

Sulfhydryle: Thiol

52
Q

Quel aa contient un composé imidazole?

A

Histidine

53
Q

Quel aa contient un composé indole?

A

Tryptophane

54
Q

Quel acide nucléique contient une pyrimidine?

A

T,C,U

55
Q

Quel acide nucléique contient une purine?

A

A,G

56
Q

Biomolécule simple et structure générale: Protéines?

A

Acide aminé

Grpmnt amine (NH3+) et grpmnt carboxyle (COO-)

57
Q

Biomolécule simple et structure générale: Glucides?

A

Monosaccharides

Grpmnt hydroxyle et grpmnt carbonyle (pas dans la forme circulaire)

58
Q

Biomolécule simple et structure générale: Lipides?

A

Acides gras

Chaine hydrocarbonée et grpmnt carboxyle

59
Q

Biomolécule simple et structure générale: Acides nucléiques?

A

Nucléotides

Monosaccharide, base azotée et grpmnt phosphate

60
Q

Liens amides?

A

carbonyle et amine

61
Q

Liens esters?

A

carboxyle et hydroxyle

62
Q

Liens éthers?

A

Oxygène=pont entre 2 composés

63
Q

Liens esters phosphoriques?

A

Phosphoester: phosphoryle et hydroxyle

64
Q

Liens phosphodiester?

A

Phosphoryle forme pont entre 2 grpmnt R

65
Q

Liens phosphoanhydrides?

A

2 phosphoryles liés par un O

66
Q

Encombrement moléculaire?

A

Concentration très élevée de biomolécules dans la cellule –> favorise rencontre entre réactifs et enzymes

67
Q

En quoi les cellules vivantes sont remarquablement similaires dans leur fonctionnement?

A
  • Même biomolécules
  • Même code génétique
  • Mêmes sentiers métaboliques
68
Q

Schéma Eucaryote vs Procaryote

A

https://www.canva.com/design/DACijjsxc8Y/share?role=EDITOR&token=wXdVeKp2VhLByohOge2HPQ&utm_content=DACijjsxc8Y&utm_campaign=designshare&utm_medium=link&utm_source=sharebutton

69
Q

Quels organites contiennent leur propre génome? Pourquoi?

A

Mitochondrie et chloroplaste

Endosymbiose: descendants directs de symbiotes d’origine bactérienne

70
Q

Encombrement moléculaire?

A

Concentration trèèès élevée des biomolécules favorise rencontre entre réactifs et enzymes.

71
Q

V ou F? Le cytosol est un mélange aléatoire

A

F. Le cytosol est un mélange hautement organisé.