Biochimie 1 Flashcards
Qu’est-ce que la biochimie?
Étude des processus moléculaires qui sont à la base du Vivant
Qu’est-ce qui est l’origine de la vie sur Terre?
Eau
Quelle est la théorie la plus plausible sur l’origine de la vie?
Abiogenèse/ chimie prébiotique
soit à partir de la matière non vivante (eau, carbone, etc)
Qu’est-ce qui a été combiné pour créer des composés organiques hydrosolubles, dont les acides aminés?
Eau + Atmosphère + Décharges électriques
Les premiers organismes proviennent de cheminées hydrothermales. Dans quelles conditions devaient-ils survivre?
- Température extrême
- pH acide
- Enrichies en sels minéraux et sulfure d’hydrogène
VRAI OU FAUX
La transition entre des systèmes statiques générés de manière aléatoire vers des systèmes auto-réplicatifs a été un moment clé dans l’évolution de la vie.
VRAI
Il s’agit de la réplication par complémentarité.
Car cela démontre que l’environnement des molécules les rend aptes à se répliquer et qu’elles sont plus stables
Qu’est-ce que la condensation?
Union de 2 molécules avec l’élimination d’une molécule H2O
Qu’est-ce que l’hydrolyse?
Destruction d’une substance chimique par l’ajout d’une molécule H2O (OH- et H+)
Quels sont les 4 éléments principaux (des 60) qui composent 96% de la masse du corps?
Oxygène
Carbone
Hydrogène
Azote
À quoi a servit la compartimentation des premières cellules?
Protection et augmentation des concentrations internes
Pourquoi la cellule doit être un système fermé?
Pour pouvoir avoir une composition différente à l’intérieur de la cellule vs l’extérieur
Quelles sont les principales différences entre la cellule procaryote et la cellule eucaryote?
Eucaryote peut être uni ou pluricellulaire
Son organisation est plus complexe que la procaryote
Son noyaux et ses organites sont délimités (compartimentation avec un cytosquelette plus développé)
Sa taille est plus grande
Quelle est la base de la thermodynamique?
La thermodynamique est l’étude de la transformation d’énergie qui est impliquée dans toutes les réactions chimiques dans une cellule. “Conservation de l’Énergie”
La thermorégulation est essentielle pour les fonctions biologiques, soit:
1) ___________
2) __________
3) __________
4) __________
1) Réplication
2) Division
3) Photosynthèse
4) Respiration mitochondriale
Univers est composé d’un____(1)____ et d’un ___(2)___
système et environnement
Quels sont les 3 types de système et quelles sont leurs différences?
1) Ouvert: échange de matière ET d’énergie
2) Fermé: échange d’énergie seulement
3) Isolé: AUCUN échange
Quel est le premier principe de la thermodynamique?
“L’énergie interne d’un système isolé est constante”
Pas d’énergie, pas de travail (mouvement perpétuel grâce à la conservation d’énergie)
Quel est le second principe de la thermodynamique?
“L’univers tend SPONTANÉMENT vers un désordre maximum.”, soit l’entropie (ordre vers désordre)
Que permet de déterminer l’énergie libre de Gibbs? (delta G)
Si la réaction chimique est spontanée ou non
Mesure la variation d’énergie d’un système qui est utile (n’est pas dissipée sous forme de chaleur)
Que signifie un delta G négatif?
Réaction exergonique: dégage de l’énergie
Que signifie un delta G positif?
Réaction endergonique: requiert un apport énergétique
Que signifie un delta G = 0?
Réaction à l’équilibre: autant de formation que de dissociation
Qu’est-ce qui peut faire varier l’énergie libre?
La concentration des réactifs et des produits
La température
Quelles sont les conditions standards biochimiques d’une réaction à l’équilibre?
- Concentration des R et P à 1 mol/L
- T 25 degrés C
- pH 7
- Pression 1 atm
Qu’est-ce que l’équilibre chimique?
Vitesse de la réaction directe = vitesse de la réaction inverse (2 réactions opposés s’effectuent au même moment à la même vitesse)
VRAI OU FAUX
Une liaison hydrogène entre les molécules d’eau se font par interactions entre les dipôles (lien entre + et -) avec un maximum de 4 liaisons possible sur 1 molécule. Ces liaisons sont faibles.
VRAI
VRAI OU FAUX
Pour favoriser la solubilité, l’interaction entre le solvant et les molécules de soluté doit être inférieure aux interactions entre les molécules de soluté elles-mêmes.
FAUX
Doit être supérieure
Les molécules polaires et ioniques sont-elles hydrophiles ou hydrophobes?
Hydrophiles
Dans quel processus est utilisé l’effet hydrophobe?
Le processus de repliement des protéines
VRAI OU FAUX
Les substances polaires sont hydrophobes en raison de leurs charges symétriques, ce qui rend impossible la dissolution d’ions dans l’eau.
VRAI
Qu’est-ce qu’une molécule amphiphile? Que forment les agrégats structurés?
La molécule amphiphile possède à la fois un groupement hydrophile et un groupement hydrophobe. Ils forment des micelles, un double couche lipidique et les liposomes.
Qu’est-ce que l’osmose?
Mouvement du solvant à travers une membrane perméable du moins concentré vers le plus concentré
Qu’est-ce que la pression osmotique? À quoi sert-elle?
Pression qu’il faut appliquer à une solution concentrée pour éviter l’entrée du solvant. Sert à maintenir une cellule dans son intégrité quand on ne veut pas diluer une certaine solution qui est plus dense en soluté
Qu’est-ce que la dissolution?
Lorsque le soluté et le solvant se déplacent aléatoirement jusqu’à l’atteinte d’une concentration à l’équilibre.
VRAI OU FAUX
On retrouve l’ion hydronium H3O+ plutôt que H+.
VRAI
Pourquoi l’eau est-elle une molécule amphotère?
Parce qu’elle est base et acide
Quelle est la constante de dissociation de l’eau?
Ke= 10 à la -14 (concentration de l’eau ne varie pas, quantité équimolaire des ions H+ et OH-)
Qu’elle est la différence entre un acide et une base?
L’acide libère en solution aqueuse un ou plusieurs protons alors que la base libère un ou plusieurs ions hydroxyles.
Qu’elle est la relation entre la constante d’acidité (Ka) et la force de l’acide?
Si Ka est petit, l’acide est faible (s’ionise mal, HF).
Si Ka est grand, l’acide est fort (s’ionise bien, HCl).
Pourquoi est-il important que le pH sanguin agisse comme solution tampon?
Lorsque le pH sanguin sort de cette zone, il interfère avec presque tous les processus biologiques.
Qu’est-ce qu’une solution tampon?
Solution aqueuse capable de maintenir le pH malgré l’ajout d’un acide ou d’une base
Quelle est la composition d’un nucléotide?
- base azotée (purine ou pyrimidine)
- sucre (ribose ou désoxyribose)
- groupement phosphate (un ou plusieurs)
Quels sont les nucléotides de l’ARN?
Adénine
Uracile*
Guanine
Cytosine
Quels sont les nucléotides de l’ADN?
Adénine
Thymine*
Guanine
Cytosine
VRAI OU FAUX
Les nucléotides sont reliés par des liaisons hydrogène.
FAUX
Liaisons phopshodiesters
Quels brins d’acides nucléiques sont complémentaires?
A et T (U)
G et C
Quelle est la différence entre la transcription et la traduction?
- Transcription: de l’ADN vers l’ARN dans le noyau
- Traduction: de l’ARN vers la protéine dans le cytoplasme
VRAI OU FAUX
Dans le code génétique, plusieurs combinaisons de codons permettent d’apporter le même AA à la chaîne.
VRAI
VRAI OU FAUX
Il n’y a plus de brin parental lors de la réplication de l’ADN.
FAUX
Il y a un brin parental et un brin néoformé. Il s’agit d’une réplication semi-conservatrice.
Quelle est la structure d’un AA?
Groupement amine primaire (NH2)
Groupement carboxyle (COOH)
Atome d’H
Chaine latérale (R)
VRAI OU FAUX
Les acides aminés sont à la fois acide et basique. On les nomme des amphotères.
VRAI
Qu’est-ce qu’une liaison peptique?
CO-NH entre les AA pour former des chaines (peptide), par déshydratation (sortie d’une molécule d’eau)
Qu’est-ce qu’un pont disulfure?
Réaction de 2 groupements thiol qui permet la formation de ce point par déshydratation, joue un rôle dans la stabilisation de la protéine
VRAI OU FAUX
Les acides aminés ne peuvent pas avoir d’arrangement spatial 3D et avoir une activité optique car ils sont trop petits.
FAUX
Stéréoisomère (image non superposable).
Arrangement spatial 3D des atomes dans la molécule, ont tous une activité optique sauf la glycine car symétrique (chaine latérale = H)
Qu’est-ce qu’est la projection de Fisher?
Projection à plat de l’AA, l’identifie comme étant de forme L ou D
Qu’est-ce qu’un mélange racémique?
Quantité égale des 2 isomères
