Bioch Flashcards
A.A à chaîne latéral polaire neutre : hydrophile ?
Glutamine (Gln,Q) cysteine (Cys,C) threonine (Thr,T) Tyrosine (Tyr,Y)
Serine (Ser,S) Asparagine (Asn,N)
A.A à chaîne latéral apolaire ? Hydrophobe
Glycine (Gly,G) ; Valine(Val,V) ; Alanine (Ala,A) ; Phenylalanine (Phe, F) ; Isoleucine (Ile,I) Leucine (Leu, L) ; proline (Pro,P) ; Methionine (Met, M) ; Tryptophan (Trp;W)
A.A à chaîne latéral polaire et ionisable ? Hydrophile
Aspartate (Asp,D) ; Glutamate (Glu,G) ; Lysine (Lys,K) ; Arguinine (Arg, R) ; Histidine (His,H)
Le brin matrice de l’ARNm est le brin anti sens ?
Oui
Quel ARN polymerase produit ARNm ?
ARN polymerase II
2 premières bases intron ?
GU
Plusieurs triplets codent le même acide aminé sauf ?
Met, Trp
Transition
Purique -> purique
Transversion
Purique -> pyrimidique
Purine
Adénine guanine
Pyrimidine
Thymine cytosine
Codon initiateur ?
AUG -> methionine
Codons STOP?
UAG UAA UGA
Parmi ARN polymérase II, Primase, Hélicase, PolyA polymérase, Ligase lequel dépendants de la séquence de l’ADN matrice ?
ARN polym II, Primase
Procaryotes cb ARN polym?
1
ADN mitochondrial ?
Bicatenaire, circulaire, non compacté, non associé aux histones
Réplication ADN?
Semiconservative , bidirectionnel
ADN polymerase ?
ADN polymerase, ADN dépendante
Cb ADN polymerase procaryotes ?
ADN POLYM I(brin tardif), ADN POLYM II(réparation) ADN POLYM III( brin direct)
Cb ADN POLYM chez eucaryotes ?
5 principaux sur 26
Primase ?
ARN POLYM ADN DÉPENDANTE
amorce ARN
Telomerase ?
ADN POLYM ARN DÉPENDANTE
CB ARNr?
4 : 28S, 18,5,8,5
Synthèse ARNm ?
Recopiage du brin ADN matrice ou brin antisens
ARN POLYM?
ARN POLYM ADN DÉPENDANTE
ARN POLYM procaryotes ?
1
ARN POLYM eucaryotes ?
3
ARN POLYM I
Arnr (5,8 18,28)
ARN polym II
ARNm
ARN polymerase III?
Arnr 5S, Arnt
ARNm prématuré -> ARNm mature ?
Coiffe + queue polyadenylee + Exscision intron
2 dernière bases introns ?
AG
Glycine
(GLY,G)
R: un H -> Calpha non asymétrique
Isoleucine
(Ile,I)
R: 2e carbone asymétrique
Phenylalanine, tryptophane
(Phe,F) (Trp,W)
R: absorbe 280nm
Chaîne aromatique
AA fonction alcool ?
Serine (Ser,S)
threonine (Thr,T)R: 2e carbone asymétrique
tyrosine (Tyr,Y)R: aromatique 280nm
R: phosphorylable -> active Prot
Fonction soufrée
Cysteine (Cys,C)
Pont disulfure
AA fonction amide ?
Glutamine (Gln,Q)
Asparguine (Asn,N)
AA Fonction acide ?
(Glu,E) (Asp,D)
Négatif à pH 7,4
AA fonction basique ?
(His,H) neutre ph7,4
(Lys,K) (Arg,R) positif ph7,4
Structure primaire AA liaison peptidique?
Liaison covalente, plane rigide polaire
Conformation trans plus stable
Hélice alpha Prot ?
Structure secondaire
Riche alanine
Pauvre glycine et proline
Structure secondaire type de liaison ?
Liaison hydrogène !
Feuillet Bêta Prot ?
Structure secondaire
Pauvre en glycine et proline
Riche valine phenylalanine, Tyrosine
Coudes boucle Prot ?
Structure secondaire non reguliaires et non répétitive.
Riche glycine proline
Structure quaternaire ( assemblage monomère) : Prot?
Le plus souvent non covalent
Structure quaternaire Collagène ?
Riche glycine et proline,
2 AA inhabituelle : hydroxyproline et hydroxylysine.
Oxyhémoglobine ?
État relâché appelé R
Chymotripsine ?
Trp,Tyr,Phe
Trypsine ?
His
Homodimere ?
Deux même sous unité
Epissage alternatif ?
Exon élimine chez eucaryote
Amine df ?
1
Nitrile df ?
Df=3
Df amide ?
Df= 4
Df en fonction oxydation et réduction ?
Df monte avec oxydation et baisse avec réduction