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Biologie moléculaire > Bio Mol 2 > Flashcards

Bio Mol 2 Flashcards

1
Q

Vrai ou faux.Les cellules eucaryotes n’ont que 2 copies de chaque chromosomes.

A

Faux. ( mais majorité oui - diploides) Ovule et sperm haploides et mégacaryocytes polyploides (28 copies de chaque chromo!)

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2
Q

Vrai ou faux.Les plasmides font partie du génome des bactéries.

A

Faux

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3
Q

Vrai ou faux. Les cell. Procaryotes ont généralement 1 copie de leur chromosomes

A

Vrai

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4
Q

Vrai ou faux. La taille du génome n’a rien à vour avec la complexité de l’organisme.

A

Faux, corrélé mais pas parfaitement

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5
Q

Vrai ou faux. La nombre de gènes est plus représentatif que la taille du génome pour déterminer la complexité d’un organisme.

A

Vrai.

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6
Q

Vrai ou faux. La densité des gènes est la même pour les procaryotes.

A

Faux, varie selon les organismes

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7
Q

Vrai ou faix. La densité des gènes de singes est plus élevée que celle d’E. Coli., puisqu’il y a plus de gènes codant.

A

Faux! La densité des gènes diminue avec la complexité des organismes

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8
Q

Pourquoi la densité des gènes diminue chez les eucaryotes?

A
  • augmentation de la taille des gènes à cause des introns

- augmentation des séquences intergéniques

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9
Q

Comment enlève-t-on les introns?

A

Épissage

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10
Q

Vrai ou faux. Les introns sont la séquences non codante d’un gène tandis que les extrons sont la séquence codante d’un gène.

A

Faux. Exons

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11
Q

Quel est le role des introns?

A

Influ sur l’expression génique

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12
Q

Vrai ou faux. Les séquences intergéniques constituent la majorité des gènes humains.

A

Faux. De l’adn humain.

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13
Q

Quelle est la fonction des séquences intergéniques?

A

Aucune

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14
Q

Vrai ou faux. On parle de répétition dispersée lorsqu’une sequence unique ou des regroupements de séquences sont répétés plus de 50 fois.

A

Faux. Plus de 100fois, parfois 1000

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15
Q

Vrai ou faux. L’adn microsatellite et moins présent (3% du genome) que les répétitions dispersées(44% ).

A

Vrai

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16
Q

Comment obtient on des adn microsatellites?

A

Erreur de replication de l’adn

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17
Q

Combien est le max de pb répétées dans l’adn pour qu’on ait un adn microsatellite?

A

En dessous de 13 pb répétées ; generalement repetitions de dinucléotides (CACACA)

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18
Q

Voici une sequence données: AGAGAGAGAGAG. De quel type de séquences s’agit il?

A

Microsatellite

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19
Q

Qu’est-ce qui différencie un pseudogène d’un gène?

A

Pseudogène est un gène sans intron donc non fonctionnel car pas de sequences de regulation les précèdent

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20
Q

Vrai ou faux. Les origines de réplications se trouvent généralement dans les regions. Non codante.

A

Vrai

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21
Q

Vrai ou faux. Les origines de réplications se trouvent à chaque 30-40 kb le long de tous les chromosomes des procaryotes et des eucaryotes.

A

Faux. Bactérie 1 unique site

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22
Q

Qu’est-ce que l’origine de réplication?

A

Site d’assemblage de la machinerie de la réplication de l’adn

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23
Q

Qu’est-ce qu’un centromère?

A

Site d’assemblage des kinétochores (lors de la division cell)

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24
Q

Qu’est-ce que les télomères?

A

Séquences de trouvant aux extrémités de chaque chromosome linéaire

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25
Q

Vrai ou faux. Les telomères agissent comme origines de réplication.

A

Vrai. Permette a la telomerase de copier la fin des chromosomes

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26
Q

Vrai ou faux. La télomérase est une ADN polymérase.

A

Vrai, mais particulière

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27
Q

À quoi servent les protéines télomériques?

A

Identifient la fin des chromosomes (telomère) et empechent leur degradation ou recombinaison

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28
Q

Vrai ou faux. Il est possible d’avoir plusieurs centromères sur un chromosomes.

A

Faux. 1 seul. L’adn se briserait

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29
Q

Qu’arriverait-il aux chromosomes s’il n’y avait pas de centromère?

A

Ils se repartiraient au hasard dans les cell filles.

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30
Q

Nommez 3 exemples de compositions d’un centromère.

A
  • séquences non repetitives uniquement
  • melange séquences non repetitives et repetitives
  • séquences repetitives uniquement (ex humains et drosophiles)
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31
Q

Vrai ou faux. La taille et la conposition des centromères varie en fonction des organismes.

A

Vrai.

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32
Q

Vrai ou faux. Les telomeres sont constitués d’une sequences repetitive riche en T et A.

A

Faux. T et G

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33
Q

Vrai ou faux. Les telomères est un simple brin.

A

Faux. Une portion est en simple brin.

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34
Q

De quoi est composé un nucléosome?

A

8 protéines histones et adn de coeur ( enroulé 1,65 fois)

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35
Q

Vrai ou faux. Tous les segments d’adn sont associés à des protéines.

A

Vrai. Soit histones ou protéines non histones quk regulent l’expression genique, replication, recombinaison

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36
Q

Vrai ou faux.

La majorité de l’adn est dans les nucléosomes.

A

Vrai

37
Q

Comment est nommé l’adn qui relie deux nucleosomes?

A

Adn de liaison ou adn linker

38
Q

Le nucléosome correspond à quel niveau de compaction de l’adn?

A

1 er

39
Q

Vrai ou faux. Les eucaryotes ont une taille semblable d’adn de liaison?

A

Faux. Chaque organisme à une taille propre d’adn de liaison

40
Q

Vrai ou faux. L’adn polymérase est la protéine associée à l’adn la plus abondante.

A

Faux. C’est les histones.

41
Q

Quels sont les 4 histones de coeurs ?

A

H2A, H2B, H3, H4

42
Q

Quelle est l’histone de liaison?

A

H1

43
Q

Quels résidus(a.a) sont les plus importants dans les histones?

A

Arginines et lysines (chargés positivement (donc interagit avec adn negatif (phosphate)))

44
Q

Qu’est-ce qui permet au histones d’interagir avec l’adn?

A

Les histones contiennent beaucoup de charges positives (adn negatif)

45
Q

Vrai ou faux. Les histones s’associent ensemble en octomère et l’adn s’attache par la suite.

A

Faux. L’adn est necessaire a l’assemblage complet du coeur du nucléosome.

  1. Tetramere H3•H4 se lie à l’adn
  2. 2 dimeres H2A•H2B se joignent au complexe
46
Q

Comment sait-on que les queues N-terminales des histones ne sont pas necessaires à l’association avec l’adn?

A

Digestion des queues par la trypsine montre que le nucléosome est quand meme viable (mais elles ont d’autres roles!)

47
Q

Vrai ou faux. Le nucléosome est parfaitement symétrique, l’axe de symétrie est appelé axe dyade

A

Faux. Pas parfaitement. Pseudo axe de symetrie

48
Q

Quel histone de coeur se lie aux extrémités de l’adn?

A

H3

49
Q

Comment les histones H3 lie l’extrémité des adn de coeur?

A

La région histone-fold forme une 4e hélice alpha capable de se lier aux 13 pb terminales (région amino-terminale de l’adn) (pas certain)

50
Q

Combien y a t-il de sites de contacte entre l’adn et les histones?

A

14 (1 site pour chaque fois qu’un sillon mineur fait face à l’ocatamère d’histones)

51
Q

Combien y a t-il de ponts H entre l’adn et les histones?

A

40 (se forment entre les histones et l’atome d’oxygène des liaisons phosphodiester près des sillons mineurs ; seulement 7 pont H avec b.a)

52
Q

Qu’est-ce qui permet la courbure de l’adn sur les histones?

A
  • nombre important de pont H (40)

- protéines basique (+) masque les charge - des gr. Phosphate

53
Q

Quel type de liaison retrouve t on entre les histones et l’adn?

A

Pont H ET liaison ionique (avec phosphate (- +)

54
Q

Qu’est ce qui engendre le surenroulement negatif chez les procaryotes?

A

Adn gyrase ; surenroulement positif par adn gyrase inverse

55
Q

Quel type de liaison retrouve t on entre les queues des histones et l’adn?

A

Pont H

56
Q

Vrai ou faux. Les queues des histones H3 et H4 emergent au dessus et en dessous des helices d’adn.

A

Faux. H2A et H4

57
Q

Vrai ou faux. Les queues des histones H3 et H2B emergent au dessus et en dessous des helices d’adn.

A

Faux. Emergent autour de l’ocatamère

58
Q

Quel est le role des queues des histones?

A

Dirigent l’enroulement de l’adn autour de l’octamere (supertour toroidaux negatif)

59
Q

Pourquoi les nucleosomes stabilise l’adn?

A

Surenroulement negatif , reduit tension (diminue Lk)

60
Q

Vrai ou faux. Le surenroulement negatif de l’adn circulaire stabilise celui-ci en diminuant le Lk.

A

Faux. Le Lk global de l’adn circulaire demeure le même( adn linker doit compenser en augmentant le Lk -> seul la topoisomerase peut relacher l’adn c)

61
Q

Vrai ou faux. La topoisomerase est necessaire pour ajouter un nucleosome à de l’adn circulaire.

A

Vrai. Car seul facon de changer Lk

62
Q

Pourquoi l’enroulement engendré par un nucléosome sur l’adn observé est de -1,2 alors qu’il est surenroulé de -1,65?

A

À cause que le nombre de paires de bases par tour de l’adn associé au nucléosome est reduit à 10,2 au lieu de 10,5 (plus enroulé, augmente Lk)

63
Q

Vrai ou faux. L’histone H1 s’associe à l’ADN linker à l’extrémité du nucléosome et à l’octomère de coeur.

A

Faux. Et à l’ADN de l’hélice centrale

64
Q

Qu’est-ce que H1 provoque?

A
  • entoure 20 pb de plus autour du nucléosome
  • change l’angle d’entré ou de sortie de l’adn dans le nucléosome
  • permet la formation de la fibre 30 nm
65
Q

Vrai ou faux. Il y a deux H1 par nucléosome (un à l’entré et à la sortie de ladn).

A

Faux. Seulement un H1 par nucléosome.

66
Q

Vrai ou faux. L’histone H1 permet à l’adn d’être plus accessible au protéines.

A

Faux. Elle met l’adn plus compacte, donc moins accessible.

67
Q

Quels sont les deux modeles de la fibres 30 nm?

A

Solénoïde (adn linker encercle l’axe longitudinale)

Zig-zag (forme plus compacte, nucléosome disposé en zigzag, adn linker traverse axe longitu., favorisé par adn linker plus long)

68
Q

De combien de fois la fibre de 30 nm permet de compacter l’adn?

A

40fois

69
Q

Qu’est-ce que fait les queues des histones dans la formation de la fibre 30 nm?

A

Stabilise la structure en etablissant des liens entre differents histones (ex; H4 avec H2A)

70
Q

Vrai ou faux. La fibre de 30 nm peut se former quand même si les histones n’ont pas de queues.

A

Faux. Peut pas

71
Q

L’armature centrale du niveau supérieur de l’enroulement de l’adn est composé de quoi?

A
  • Topoisomerase 2

- Protéines SMC (maintenance structurelle des chromosomes)

72
Q

À quoi sert la topoisomerase 2 dans l’armature du niveau superieur d’enroulement de l’adn?

A

Si une boucle isolé éjecte nucléosome (pour pouvoir avoir acces aux infos par exemple), augmente Lk, tension, doit relacher donc topo à chaque boucle

73
Q

À quoi servent les protéines de l’armature centrale du niveau supérieur d’enroulement de l’adn?

A

Organisation des fibres de 30nm en boucle

Maintient de la base des boucles

Maintient les boucles isolées les unes des autres

74
Q

Vrai ou faux. Les bouts des boucles de niveaux supérieurs sont plus propices à l’expression génique?

A

Vrai. Bout des boucles: fibre de 10nm, plus facile à derouler

75
Q

Qu’est-ce qui différencie H2A.X de H2A?

A

H2A.X possède un résidu de sérine

76
Q

Vrai ou faux. L’intersction de l’adn avec l’octamère d’histones est dynamique.

A

Vrai.

77
Q

Qu’est-ce qu’un complexe de remodelage des nucléosomes?

A

Con’mexes protéiques facilitant le deplacement des nucléosomes en utilisant l’atp

78
Q

Quels sont les 3 types de changements produits par les complexes de remodelage des nucléosomes?

A

Glissement de l’adn

Transfert de nucleosomes d’une helice à une autres

Échange du dimère H2A/H2B par H2A.X/H2B

79
Q

Vrai ou faux. Certaines séquences d’adn ont une affinité plus grande pour les nucléosomes.

A

Vrai. A:T a tendance à se courber vers le sillon mineur
G:C à tendance à faire courber le sillon mineur dans le sens opposé
= plus facile de courber dans un certain sens donc plus facile pour l’histone

80
Q

Vrai ou faux. Les queues N-terminales des gistones sont fréquemment modifiées .

A

Vrai

81
Q

Quelles sont les conséquences associées à la modification des queues d’histones?

A
  • favorise l’expression génique
  • inhibe l’expression génique
  • marque les histones nouvellement synthétisées
82
Q

Vrai ou faux. Le queues d’histones non-modifiées ou méthylées s’associent plus fermement à l’adn des nucléosomes que les queues d’histobes acétylées.

A

Vrai

83
Q

Vrai ou faux. L’acérylation et la phophorylation des queues d’histones favorisent l’expression génique.

A

Vrai car acé et phospho neutralise charge positives ce qui diminue leur affinité avec l’adn

84
Q

Vrai ou faux. Après une division cellulaire, les nucléosomes sont créés à des endroits aléatoires des nouveaux adn.

A

Faux. Ont tendance à s’associer au même endroit que l’adn mere (entre autres grace au dimere H3H4 qui demeure associé à l’un des adn fils)

85
Q

Vrai ou faux. Après réplication cellulaire, l’octomère des nucléosomes sont réformés à partir de vieux et de nouveaux monomères.

A

Faux. Les tétramères H3•H4 et les dimères H2A et H2B ne sont pas mélangés (soit neuf soit vieux)

86
Q

Vrai ou faux. Pendant la réplication, Les dimères H2A•H2B reste accroché à l’adn étant plus petit et les tetramères H3•H4 sont relachés, servant à l’assemblage de nouveaux nucléosomes.

A

Faux. H3H4 demeure associé (au hazard sur l’un des brins) et H2AH2B sont relaché

87
Q

Vrai ou faux. Au moins 50% des histones sont nouveaux après une réplication cellulaire et ceux-ci sont répartis aléatoirement sur chaque chromosome.

A

Vrai

88
Q

Quel est le rôle des chaperonnes d’histones(prot chargé -)?

A

Empêchent les histones de s’associer à l’adn de manière non productive en formant un complexe avec un dimère h3.h4 ou h2a.h2b

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