Basal Virologi II Flashcards
Nämn de åtta stegen i virusens generella replikationscykel.
- adhesion
- penetration
- uncoating
- transkription
- translation
- proteinsyntes
- Assembly - ihopsättning av nya viruspartiklar
- egress - avknoppning
Nämn tre egenskaper som skiljer virus och bakterier åt.
- Bakterier kan växa utanför cellen - virus måste ha en värdcell.
- Bakterier kan behandlas med antibiotika - det kan inte virus (kräver antivirala medel eller vaccin).
- Bakterier har både DNA och RNA - virus har antigen eller.
Namnge de olika komponenterna som ett virus består utav. (Minst 6 st, max 8)
- Virion - fysisk viruspartikel.
- Kärnan (core) - innehållande nukleinsyra /RNA/DNA) omgiven av tät proteinstruktur.
- kapsid - proteinstrukturen som utgör kärnan, utan nukleinsyran.
- Kapsomer -proteinsubenheterna som bygger uppkapsiden.
- Nukelokapsomer - kärnan + kapsiden.
- Matrixprotein - stödjande hölje under yttre hölje.
- Hölje (yttre hölje= envelope) - lipidmembran som finns hos VISSA virus.
- Peplomer - morfologisk proteinenhet som sticker ut ur virion-ytan.
Vad måste man tänka på då man genomför en Westwrn-Blot på viruspartiklar?
Att vaccin också kan ge utslag. Då framträder oftast få antal proteiner, som tecken på en icke-genomgådd infektion.
Samtliga virus, oavsett virustyp, är beroende av enzymer. Ange de tre virala enzymerna som är av värde, samt para ihop dem med vilken typ av virus de hör ihop med.
vRNA-beroende RNA-polymeras –> RNA-virus (oavsett +/-strängat).
vDNA-polymeras –> DNA-virus.
vOmvänt RNA-polymeras (omvänt transkriptas - gör RNA till DNA) –> retro- och hepadnavirus.
Det finns virus med olika egenskaper. Hur kan dessa virus påverka sin värdcell?
- Transformation: manupulering som leder till utveckling ac tumörcell (herpes B–> B-cellslymfom).
- Lysering: akuta virus (förkylning, diarré): direkt skada på cellen - destruktion.
- Persistent infektion: virus lever i “symbios” med värdcell samtidigt som den hela tiden reproducerar viruspartiklar.
- Latent infektion: virus finns inne i värdcellen men är avstängd - producerar inga viruspartiklar. Kan dock reaktiveras vid immunsuppression. (Ligger ofta gömd för immunförsvaret).
Vad betyder ordet virulensfaktor? Vilka 2 olika saker beror virulensen på?
Virulensfaktor är en egenskap hos en mikroorganism som ger denna möjlighet att manipulera sin värdcell - etc: förmåga att undvika immunsystemet.
Virulensen beror på:
1. viral dos - hur kraftigt mikroorganismen angriper.
2. försvar - hur cellen kan försvara sig mot organismens virulensfaktorer.
Ge exempel på minst 7 virulensfaktorer. (max 9)
- Adhesionsfaktorer (höljeprotein) - kommer inte viruset in i cellen kan vi inte bli infekterade.
- Invasionsfaktorer.
- Viroporiner.
- Replikationsfaktorer/enzymer - det blir inte mycket till infektion om viruset ej kan replikeras.
- Toxiner.
- Resistensfaktorer - gör det lättare för viruset att komma undan immunsystemet.
- Cytotoxiska enzymer.
- Immunmodulerande faktorer.
- Frisättningsegenskaper.
Ange de två huvudtyperna av virulensproteiner, samt vad de fyller för funktion.
Strukturella proteiner (S) - bygger upp själva viruspartikeln. Är viktig för struktur som är nödvändig för överlevnad. Icke-strukturella proteiner (NS) - ej så viktig för överlevnad och replikation, men VIKTIGT i infekterad cell: innefattar manipulerande proteiner som leder till skydd mot det innata immunsystemet.
I vilken miljö kan många individer bli smittade av samma indexindivid? - Hur kommer det sig?
Torr och kall miljö - små aerosoler kan stanna i luften som en dimma, som sedan blir inandade.
Vad beror fördelningen av viruskoncentrationen i våra kroppsvätskor på?
Var infektionen sitter/vilken typ av infektion det är. En urogenitalinfektion leder ofta till hög infektionsdos i sperma/vaginalvätska.
Virusinfektioner kan vara akuta eller kroniska. Nämn 2 virusfamiljer som leder till en kronisk infektion, samt 2 st som leder till en akut infektion.
Kronisk - Herpesvirus, retrovirus.
Akut - paramyxovirus, orthomyxovirus.
Virus kan vara humanspecifika, ekobiologiska eller både och. Vad innebär dessa begrepp?
Ange specificiteten för mässling, retrovirus, herpesvirus och orthomyxovirus.
- Ange även vilken typ av nukleinsyra dessa virus har.
Humanspecifika virus: endast människor har detta virus, smittar från människa till människa.
Ekobiologiska virus: virus som finns hos djur och som kan smitta människor - från djur till människa.
Mässlingen - -RNA - Humanspecifikt.
Retrovirus - +ssRNA - Humanspecifikt och Ekobiologiskt.
Herpesvirus - dsDNA - Humanspecifikt.
Orthomyxovirus - -ssRNA - ekobiologiskt.
Både paramyxovirus och ortomyxovirus är minus-ss-RNA-virus, men det är något som skiljer dem åt. Nämn en sak.
Paramyxovirus är Icke-segmenterat medan orthomyxo är segmenterat.
I de flesta länder finns en hög vaccinteckning för mässling (ofta >90%), men trots detta förekommer många utbrott. Vad kan detta bero på?
Antigen är inte vaccinet så robust att det skapar det starka immunologiska skydd som behövs, eller så finns det grupper i samhällen som inte vaccinerar sig (kan ej pga immunsupression eller pga att de ej vill –> räcker för initiering av epidemi).
Till vilken virusfamilj tillhör mässlingviruset? Beskriv kortfattat (men med detaljer av betydelse) virusets replikationscykel.
Mässlingvirus är ett paramyxovirus (helikal kapsidstruktur).
Viruset adhererar, via sina höljeproteiner (hemagglutinin +fusionspeptid), till ytmolekyler på värdcellen: CD150 (vilka finns på många olika celltyper). En förändring av hemagglutinin+fusionspeptid-strukturen sker, och fusionspeptiden penetrerar cellmembranet och kapsiden transporteras in i cytoplasman. Avklädning, transkription, translation (mha RNA-beroende RNApolymeras), replikation - plusRNA till minusRNA (detta används in de nya viruspartiklarna). assembly och egress (avknoppning eller lys beroende på vilken cell det gäller).
Vad innebär en bred celltropism? Vad avgör bredden?
En bred celltropism innebär att virus/mikroorganism väljer en receptor som finns presenterad på många olika typer av celler, vanligt förekommande -> kan initiera stor infektion.
Cellreceptorer är alltså det som avgör bredden.
Vilket är mässlingvirusets initiala virulensfaktor?
Höljeprotein - receptorinbindning.
Beskriv mässlingens patofysiologi:
- inkubationstid
- symtomperiod
- exantemperiod
- återhämtning
- inkubationstid på 10-14 dagar (dock dosberoende)
- prodormal period (symtomatisk period) under ca 3-7 dagar (hög feber, hosta, konjunktivit, nästäppa - rinnande näsa, enantem - mukusrodnad - kommer sist!).
- exantem - 4 dagar (inkluderade i SYMTOM-3-7), där viruskoncentrationen är som högst.
- återhämtning - 10-14 dagar, kvarstående hosta.
Vilka profylax finns mot mässling?
MMR-vaccination (Measels-mumps-rubella vaccination) 18 mån, 12 år –> riktat mot CD46 8ytprotein på celler?).
Passiv immunoterapi - gammaglobulin (tar antikroppar från vaccinerad patient).
Vilka virusinfektioner är det vanligast att drabbas av? Nämn tre.
Influensavirus, förkylningsvirus och herpesvirus.
Det finns tre grupperingar som herpesvirus indelas i. Vad heter dessa grupper, och vilka herpesvirus tillhör dessa grupper?
Alfaherpesvirinae - HHV 1, 2, 3 (simplex typ 1, 2 och varicella-zoster virus).
Gammaherpesvirine - HHV 4, 8 (EBV, kaposi’s sacrom-relaterade virus)
Betaherpesvirinae - HHV 5, 6, 7 (cytomegalovirus, herpes lymfotropiskt virus, HHV7).
Beskriv strukturen på herpesvirus.
ds-linjärt DNA, ikosahedral kapsid, teugment (här finns alla NS), yttre hölje (envelope) med glykoproteiner.
Redogör för skillnader/likheter mellan de 3 olika herpesvirusgrupperna. (med avseende på replikationshastighet, tropism, latenslokalisation samt cellpåverkan)
Alfa: snabb replikation, bred celltropism, lytisk effekt, latens i sensoriska ganglier.
Beta: långsam replikation, smalare tropism än alfa, cellförstorande effekt (cytomegali), latens i sensoriska körtlar, njuren, lymforetikulära celler.
Gamma: långsam repilkation, smal tropism, latens i lymfoid vävnad (B-eller T-celler).
Redogör för herpesvirusens replikationscykel.
Virion transporteras till cellytan, binder in till heparansulfat som uttrycks på ytan via gC/gB, rullar över cellen, gD binder till kofaktor Nektin och möjliggör entré: fusion. Kapsiden transporteras till kärnans nukleoporer mha mikrotubuli: dsDNA-virus skjuts in i cellkärnan. Här sker transkription av alfaRNA - translation av alfa-proteiner (immediate early) som går ut/in ur cellkärnan, deltar i translation av beta-proteiner (early) - ut/in i cellkärna - deltar i produktion av gammaproteiner (late) -eller går direkt till DNA-replikationen. gammaprot kan gå ut/in och sedan bida in till nybildad viruspartikel under assembly, för att sedan genomgå egress, eller så kan gammaprot ta sig ut helt ur cellen.
Hur kan herpesvirus initiera immunsuppression? Nämn minst tre olika sätt.
Hur gynnar detta viruset?
- Hämma transport av virala proteiner till proteasomen (EBV).
- Plocka in MHC klass I + viruspeptid från ytan och transportera komplexet till lysosomen. (HHV-8)
- Blockera TAP-systemet: förhindra att vitrala peptider transporteras in i ER för ihopsättning av MHC-peptid-komplex. (HSV) –> MHC klass I skickas till proteasomen.
Detta gynnar viruset genom att infektiösa viruspartiklar ej presenteras för immunförsvaret och därmed ej kan bekämpas.
Vad fyller virala cytokinhomologer för funktion?
De finns för att lura immunsystemet: stimulering av tillväxtfaktorer hos målcellerna som viruset skall infektera, anti-inflammatoriska cytokiner –> ingen utveckling av cytotoxiska T-celler.
Epstein-Barrvirus tillhör herpesvirusfamiljen. Hur lång inkubationstid har virusinfektionen och vilka symtom ger denna infektion upphov till?
EBV har en inkubationstid på ca 2 veckor och sprids via saliv. symtomen är: - Trötthet - Svullna lymfnoder - Inflammerad hals/svalg - Utslag: hals, mukosa - Splenomegali - Hepatomegali
EBV-infektion: hur ser infektionscykeln ut?
få med primär infektion, persistant infektion med reaktiver, zebraprotein, latens i B-celler.
vid primärinfektion drabbas slemhinna - lytiskt: epitelcellerna brister - B-celler infekteras - B-cellstillväxt, angrips av T-celler. Vissa B-celler utvecklas till minnesceller, förvarar virus latent (G0) som EBNAS, utanför arvsmassan. Immunsuppression leder till reaktivering av EBV: Zebraprotein deltar - samlar ihop transkriptionsfaktorer som startar replikationen och avläsning av virus –> virionbildning!
Vilka herpesvirus ligger latenta i sensoriska ganglier?
De herpesvirus som tillhör alfaherpesvirinae: HSV1, HSV2, HHV3 (varicella-zoster).
Herpes varicella-Zoster-virus kan ge upphov till två sjukdomar - vilka? När är det vanligast att de förekommer?
Varicella - vattkoppor, främst barn men även vuxna.
Zoster - Bältros, äldre. Dock endast om pat redan har haft vattkoppor.
Profylax mot herpesvirus?
Vaccin mot varicella.
antivirala medel: Nukleosidanaloger (förhindrar virusreplikation).
