Bakterier och arkéer Flashcards
Beskriv bakteriernas membran och cellvägg.
Bakterier och eukaryoter har likadana cellmembran med fettsyror bundna till glycerol med esterbindning och har alltid tvåskitsmembran. Bakterieceller har alltså alltid tvåskiktsmembran. Cellväggen består i huvudsak av peptidoglykaner. Bakterier kan vara grampositiva (saknar yttermembran) eller gramnegativa (med yttermenbran).
Beskriv cellvägg och membran för Arkéer.
Arkéceller har cellmembran med kolväten bundna till glycerol med eterbindning. Vissa har enskiktsmembran och vissa har tvåskitsmembran. Arkéceller har ingen peptidoglykan och saknar yttermembran.S-lager är den vanligaste formen av cellvägg hos arkéer, detta består av protein eller glykoprotein och kan bilda ett kristallint lager.
Ange sex likheter mellan arkéer och bakterier.
Båda lever i många olika miljöer, har väldigt små genom, ingen cellkärna, cirkulär kromosom, operoner och transkription och translation hänger ihop.
Varför är artbegreppet problematiskt för bakterier och arkéer?
För att artbegreppet utgår ifrån att två olika arter inte kan föröka sig könligt med varandra, men eftersom bakterier och arkéer inte förökar sig könligt funkar inte riktigt artbegreppet. Bakterier och arkéer får genvariation på andra sätt och det behöver inte bara ske mellan samma “art”.
Begreppet “art” brukar inte användas får bakterier och arkéer, men för att gruppera använder man olika strategier. Ge exempel på två st.
Vilka problem finns med nuvarande metoder?
Idag använder man en metod som tittar på om organismerna har >97% likhet i genen 16S rRNA, men det är inte nog. Tex E-coli och salmonella är mer än 97% lika i den genen.
En annan strategi är att titta på operational taxonomic unit (OTU), någonting som finns i alla celler (i ribosomen) och har en jämn mutationstakt som indikerar evolutionärt avstånd.
Redogör för hur man idag studerar bakterier vs arkéer och vilka utmaningar dagens metoder medför.
Idag odlar man bakterier på agarplattor och studerar kolonierna som växer på plattorna. Detta är dock inte optimalt för att alla bakterier inte växter på agarplattor (svårt att skapa optimal miljö).
Arkéer kan inte odlas (har bara lyckats vid ett fåtal tillfällen) och därför studerar man arkéer med genomsekvensering.
Redogör för två bakteriegrupper och vad som är typiskt för dem.
Cyanobakterier: Den enda gruppen som utför oxygen fotosyntes. Ursprunget till kloroplasten/plastiden. Kan leva i symbios (tex lavar) eller vara kvävefixerare.
Proteobakterier: En jättestor grupp med flera undergrupper. Grupperna är baserade på 16srRNA gener, vilket leder till stor diversitet i gruppen med lite gemensamt. Ursprunget till mitokondrien. Världens vanligaste organism ingår i gruppen.
Aktinobakterier: Bildar doftrika organiska ämnen ( de ger tex upphov till jordlukten) och kan växa ungefär som mycel (inte alla). Många producerar antibiotika och de flesta är grampositiva.
Firmicutes: Har en del grampositiver. Bacillus som ingår i gruppen kan bilda tåliga sporer som ger extremt långsiktig överlevnad, detta kan leda till att “gamla” sjukdomar resurface/komma igång efter lång tid.
Clostridiumbakterier kan producera ett nervgift som orsakar botulism.
Spiroketerna: spiralformat utseende, tex borrelia och syfilis.
Vart lever arkéer? Ge två exempel.
I princip överallt! Kända för att leva i extrema miljöer, tex i syra eller i vatten med extremt höga salthalter.
Vad innebär följande extremofila arkéer: Halo-, termo-, acido- och alkalofiler?
Halofiler: Lever i extremt höga salthalter.
Termofiler: Lever i extremt höga temperaturer.
Acidofiler: Lever i extremt lågt PH (gillar syra).
Alkalofiler: Lever i extremt högt PH (gillar baser)
Vad innebär fototrofi och fotoautotrofi?
Fototrofi: att en organism får energi från solljus.
Fotoautotrofi: En fototrof organism som får sitt kol från koldioxid.
Vad innebär kemoorganotrofi?
Att en organism får energi från oxidation av ett organiskt ämne.
Vad innebär kemolitotrofi?
Att en organism får energi från oxidation av ett icke-organiskt/oorganiskt ämne.
Vad innebär heterotrofi och autotrofi?
heterotrofi - får energi av att äta andra organismer.
autotrofi - Får energi av fotosyntes.
Förklara aerob och anaerob respiration .
Aerob respiration - metabolism med syrgas som elektronacceptor. (Kemoorganotrofi med syrgas)
anaerob respiration - metabolism med antingen organiskt eller oorganiskt ämne som elektronacceptor (Kemoorganotrofi utan syrgas).
aerob vs anaerob respiration, vilken av dem är mest energieffektivt och varför?
Aerob respiration är med energieffektivt för att reduktion av syre har mycket hög reduktionspotential.
