Bakteriegenetik Flashcards

1
Q

Skillnad mellan kromosom och plasmid?

A

Kromosom - singel, cirkulär DNA-molekyl, ligger fritt i cytoplasman i en nukleoid region.
Större antal gener.
Vertikal genöverföring.

Plasmid = DNA-molekyler som replikeras autonomt. Cirkulärt DNA
Innehåller ett litet antal gener som lätt kan överföras. Ex. resistensgener, virulensgener.
Horisontell genöverföring.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad är ett operon?

A

En DNA-sekvens som driver transkriptionen. Grupp besläktade gener som ligger tätt intill varandra och vars avläsning gemensamt regleras av samma styrenhet (operator).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad gör en promotor och operator?

A

Promotorn känner igen och binder till RNA-polymeras.
Operatorn är ett regulatoriska element av operon. Hit kan både aktiverade och suppressorer binda och där stimulera eller blockera transkription.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad är binär fission?

A

En vertikal genöverföring mellan modercell och dottercell hos bakterier.
En modercell kopieras till två exakta kopior.
Stor mängd genetiskt material överförs mellan generationer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad menas med generationstid?

A

Den tid som krävs för att en population ska rördubbla sitt antal.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad är en vertikal genöverföring?

A

Binär fission. Stor mängd genetiskt material överförs mellan generationer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad är en horisontell genöverföring?

A

En genöverföring som kan ske mellan besläktade arter.
Ger diversitet i genom och proteom.

Vid en horisontell genöverföring sker en överföring av en mindre mängd dna via transformation, transduktion eller konjugation.

En horisontell överföring gynnas av miljöer där olika arter har stor chans att stöta på varandra - Ex. tarm.

Kräver mobila genetiska segment.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Beskriv transformation, transduktion och konjugation.

A

Transformation - Bakterie plockar upp genetiks material från omgivning.

Transduktion - Genetiskt material överförs via bakteriofager.

Konjugation - Överföring via sex-pili.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad är mobila genetiska segment?

A

DNA-sekvenser som kan flyttas inom (plasmid-kromosom) och mellan arter –> krävs för horisontell överföring.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Ge exempel på mobila genetiska segment.

A

Plasmider
Transposoner
Insertion sekvenser

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är en transposon?

A

DNA som kan hoppa mellan kromosom och plasmid.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är en Insertion sekvens?

A

En IS-sekvens är en DNA-sekvens som kodar för transposas - enzym som kanaliserar förflyttningen av transposoner.

IS-segment kan förflytta sig inom genomet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad menas med en profag?

A

En bakteriofags arvsmassa då det är inbyggt i en bakteries genom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad är en genomic island?

A

En enhet i vissa bakteriegenom som utgör ett rörligt element och kommer från en horisontell genöverföring.
Innehåller mobila genetiska segment och “anpassningsgener” som ex. resistens, symbios ect.

Dessa segment gör att två bakterier av samma art kan ha olika genom och proteom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad menas med en zoonos?

A

patogen som kan spridas mellan djur och människor.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad menas med en opportunist?

A

Patogen som orsakar sjukdom när möjligheten uppkommer. Ex. då patient är immunsuppresserad eller har bristande normalflora efter en antibiotikabehandling.

17
Q

Redgöt för Koch’s postulat.

A

För att en patogen ska kunna kopplas till en specifik sjukdom krävs det att:

  1. Patogen hittas i insjuknad organism.
  2. Mikroben ska kunna odlas i renkultur.
  3. Mikrob från renkultur orsakar samma sjukdom om organsim infekteras.
  4. Man ska åter kunna isolera mikroben från smittad organism.
18
Q

Vad är virulent och virulensfaktorer?

A

Virulens- Graden av hur väl en patogen kan orsaka sjukdom.

Virulensfaktorer - Beteenden och egenskaper hos patogener som bidrar till dess förmåga att orsaka sjukdom.

19
Q

Vad är Quorum sensing?

A

Bakteriers sätt att kommunicera. “En kommunikation och koordination via ansamling av signalmolekyler som bildas i vävnader”
Möjliggör en ökning i antal av bakterier - vid en viss koncentration av signalmolekyler kan bakterier tillsammans börja producera specifika toxiner eller uttrycka gener för biofilm.

Ger: Samarbete, ökad tolerans mot yttermiljö/immunsystem, koordinerad produktion av toxiner, möjlighet till biofilm - stark virulensfaktor.

20
Q

Vad är en flagell?

A

Virulensfaktor för rörlighet och adhesion.

Extracellulärt utskott fäst i bakteriens cellvägg och membran. Består av proteinet flagellin.

21
Q

Hur är en flagell uppbyggd?

A

Filament - extern del.
Hook - Del av flagell som är fäst i cellväggen.
Basal body - Del av flagella som är fäst i membran. Fästning och antal ringar är olika hos G+ och G-.

Finns även endocellulära flageller, ex. hos spiroketer.

22
Q

Vad är fimbrier?

A

Virulensfaktor för mobilitet, adhesion och kolonisation.

Hårliknande struktur utanför membran. Består av proteinet pillin och adhesiner. Fimbrier ger en bättre adhesion till slemhinnor vilket även gynnas dess kolonisering och förmåga att bilda biofilmer.

23
Q

Vad är pili?

A

Virulensfaktor som används vid konjunktion. Används för att föra över exempelvis resistensgener.

24
Q

Vad är adhesiner?

A

Bakteriella ytkomponenter som underlättar vidhäftning till andra celler/slemhinnor/ytor. Bidrar därav kraftigt till bildning av biofilmer.

Hos G- kan fimbrier fungera som adhesiner då de kan ha en adhesionsmolekyl på änden.

Hos G+ är adhesinerna ytproteiner.

Adhesiner interagerar med proteiner som ex. selektiner, integraler, cadheriner som bl.a. finns hos värdceller.

25
Q

Vad är lipopolysackarider?

A

Exotoxiner som finns på ytan av gramnegativa bakterier.

LPS har tre strukturdelar:
O-antigen - Mycket variabel.
Core oligosackarid - Något varierande.
Lipid A del - konservativ.

Antikroppar bildas mot O-antigenet och LPS är därav virulensfaktorer då de kan inducera inflammatoriska processer hos värd. Känns igen av PRRs ex TLRs.
Modifikationer av LPS ger ökad virulens och resistens.

26
Q

Vad är exoenzymer?

A

Biologiska gifter som utsöndras av vissa bakterier och kan ge vävnadsskada, näring för bakterier, ökar överlevnad, stör/undviker immunförsvaret, främjar vidare spridning ecr. receptormedierat. tillverkas av både G+ och G- och letal dose är ofta låg för detta toxiner.

Exotoxiner är därmed virulensfaktorer för invasion och toxicitet.

27
Q

Ge exempel på exotoxiner.

A
AB-toxiner.
Cytolysiner och hemolysiner
Enterotoxiner
Neurotoxiner
Cytotoxiner
Superantigener
28
Q

Vad är ett AB-toxin?

A

Ett exotoxin som förekommer som en dimer.
A= aktiv toxisk del.
B=receptorbindande del.

B delen binder till värdcellens receptor och hela toxiner tas upp av värdcellen via endocytos. A - delen klyvs bort och aktiveras i endosomen till följd av ett förändrat pH. A-delen verkar sedan toxiskt.

Många olika exotixiner förekommer som AB-toxiner.

29
Q

Vad är ett superantigen?

A

Ett antigen hos bakterier som kopplar ihop MHC-II molekyler med T-cellsreceptorer och tvingar fram en kraftig inflammatorisk respons. Ca. 20% av alla kroppen T-celler aktiveras –> väldigt kraftig immunrespons –> toxic chock syndrom (TSS).

30
Q

Vad är ett proteinsekretionssystem?

A

Ett proteinkomplex i bakteriers cellvägg som används för transport av exotoxiner, enzymer och liknande från cytoplasman och exempelvis in i värdceller.

Det finns olika system för G+ respektive G- samt system som gemensamma för båda och transporten kan ske antingen i ett eller i två olika steg.

1 steg - Produkter transporteras ut ur bakterien och in i värden i ett och samma steg (både G+ och G-).

2 steg - Produkt transporteras först från cytoplasma till periplasman. Transporteras sedan från periplasma till värdcell (Endast hos G-).

Sekretionssystem är virulensfaktorer för patogena bakterier.

31
Q

Vad är en kapsel och vad används den till?

A

En kapsel består oftast av polysackarider och omsluter bakterier och ger underlättas adhesion och förmåga att undkomma kroppens försvar.

32
Q

Ge exempel på virulensfaktorer som underlättar överlevnad och anpassning.

A
  • Kapsel
  • Endosporer (endast G+).
  • Järnupptag via siderofor/hemofor
    Siderofor =Molekyl som med hög affinitet binder till fritt järn.
    Hemofog = Kan stjäla järn bundet till hemoglobin.
  • Biofilm
33
Q

Vad är en biofilm?

A

En biofilm är då bakterier lever som i ett samhälle. Biofilmer skyddas av en matrix som även förser bakterierna med näring. Biofilmen får en slags tolerans mot ettermiljö, läkemedel, immunförsvar. I en biofilm har även bakterier en koordinerad produktion av exempelvis toxiner vilket gör att biofilmen även är en virulensfaktor för toxicitet och invasion.

34
Q

Ge exempel på virulensfaktorer för invasion och toxicitet.

A

Exotoxiner
Endotoxiner
Proteinsekretionssystem
Biofilm

35
Q

GE exempel på virulensfaktorer för motilitet, adhesion och kolonisation.

A

Flagell
Fimbrie
Pili
Adhesiner