Bactéries et virus marins

Question 1

Comment définir le plancton?

Answer 1

ensemble des êtres vivants (animaux et végétaux) évoluant dans l’eau et qui se laissent dériver dans le courant

Question 2

Quelle est l’importance (en biomasse) du plancton dans les océans?

Answer 2

90%

Question 3

Nommer les différents types de micro-organismes que l’on retrouve dans les océans?

Answer 3

Virus
Bactéries
Archaea
Petits eucaryotes (picoeucaryotes et microalgues)

Question 4

Qu’est ce qu’un virus?

Answer 4

Agent infectieux nécessitant un hôte pour se répliquer.

Question 5

Quel organisme est entourée d’une paroi rigide de peptidoglycane lui permettant de résister à la forte pression osmotique interne

Answer 5

Bactéries (Archaea exclus)

Question 6

Quel groupe de virus est abondant en milieu marin?

Answer 6

Les bactériophages
Virus reconnu pour infecter les bactéries.

Question 7

Sous quel forme se retrouve le matériel génétique des virus?

Answer 7

Fragments d’acide nucléique (ADN ou ARN)

Question 8

Quel sont les nom donnés aux bactéries et aux virus pour faire référence à leur taille?

Answer 8

Bactéries = picoplancton (0,2 à 2 micro m)

Virus = femtoplancton (0,02 à 0,2 micro m)

Question 9

Quel groupe est le plus dominant en terme de biomasse?

Answer 9

Bactéries

Question 10

Comment mesure-t-on la croissance bactérienne?

Answer 10

Efficacité de croissance (Ygr ou BGE) = Production bactérienne / (production bactérienne + respiration bactérienne)

Ygr = 10 à 30 %

Question 11

Quels sont les deux grands groupes de virus?

Answer 11

Virus lytiques (entraine la lyse de l’hôte)
Virus lysogéniques (se maintient en dormance dans l’hôte)

Question 12

Décrire les phases du cycle de propagation virale :

Answer 12

1. Phase extracellulaire
   - virus inerte en suspension dans l’eau
2. Phase intracellulaire
   - Introduction du matériel génétique du virus dans l’hôte
   Lytique = induction de reproduction virale jusqu’à la lyse de la cellule et au largage

Lysogénique = intégration des acides nucléiques viraux dans la cellule sous forme de prophage persistant (transfert de génération en génération) = latence

Question 13

Quels facteurs peuvent déclenchées la fin du cycle de latence et mener à la lyse cellulaire?

Answer 13

Stress externe (ex : température, radiation UV, etc.)

Question 14

Quels sont les avantages de la lysogénie?

Answer 14

Pour l’hôte : ++ capacité métabolique et immunité vis-à-vis les phages similaires

Pour le virus : survie prolongée en conditions de faible abondance d’hôtes ou de faible taux de croissance

Question 15

Quelles sources d’énergie peuvent être utilisées par les bactéries?

Answer 15

Chimique et lumineuse

Question 16

On distingue deux types de photoautotrophe.

Answer 16

Ceux à photosynthèse oxygénique (production d’O2)

et ceux non-oxygénique (production de sulfate)

Question 17

Avantage et inconvénient de la chimioautotrophie :

Answer 17

• = moins efficace que la photosynthèse (croissance plus lente)

+ = permet de proliférer en absence de lumière

Question 18

Quels sont les deux rôle majeurs des bactéries hétérotrophes?

Answer 18

Production de biomasse = BP
Respiration bactérienne (production de C inorganique = BR

Question 19

Vrai ou faux.
Les bactéries hétérotrophes peuvent consommer de 20 à 40 % du carbone fixé par le phyto.

Answer 19

vrai

Question 20

Quel événement est à l’origine de la formation d’un ciment minéral entre la particules qui favorise la sédimentation (neige marine)?

Answer 20

Association des bactéries hétérotrophes sur les particules en suspension

Question 21

Que permet la boucle microbienne?

Answer 21

• Utilisation de la DOM (produite par les prod. primaires)
• Recyclage de la POM pour former une biomasse utilisable par les prédateurs supérieurs
• Régénération de nutriments essentiels à la production primaire du réseau trophique

Question 22

Qu’est ce qui permet de produire de la nouvelle biomasse et de régénérer des nutriments essentiels (C, N, P) pour les producteurs?

Answer 22

Décomposition

Question 23

Quels sont les modes de contrôle de la décomposition?

Answer 23

Top-Down : prédation, lyse virale
effet de sélection

Sideways : Interaction entre les différentes espèces formant la communauté (Compétition)

Buttom-up : Qualité et quantité de la ressource

Question 24

Qu’est que le viral shunt?

Answer 24

Processus permettant d’augmenter le temps de rétention de la matière organique labile dans la couche euphotique et augmentation de la respiration oxydative

Question 25

Qu’est ce que le viral shuttle?

Answer 25

Processus qui facilite l’exportation du carbone vers les grands fonds océaniques

Broutage des particules
Agrégation
= Sédimentation facilitée

Question 26

Quel processus est favorisé lorsqu’il y a formation de neige marine?

Answer 26

Viral shuttle