Aula 2

Question 1

O que é a filogenia?

Answer 1

Hipótese da relação evolucionária entre genes e/ou organismos.
Inferência de hipotéticos ancestrais comuns

Question 2

Describe Maximum Parsimony:

Answer 2

This method seeks to find the tree topology that requires the fewest number of evolutionary changes to explain the observed data.

Question 3

Describe Maximum Likelihood:

Answer 3

This method involves finding the tree topology and branch lengths that maximize the likelihood of the observed data under a given model of evolution.

Question 4

Basta a árvore de um gene para inferir a árvore de espécies?

Answer 4

Não, pois devido a situações de transferência horizontal de genes ou hibridização, a árvore do gene pode não corresponder à realidade das espécies. É necessário sempre mais que um gene.

Question 5

Qual a região de rDNA que se deve utilizar para fazer árvores de espécies:

Answer 5

Regiões variáveis

Question 6

Parâmetros nos modelos de evolução molecular?

Answer 6

• G: indica regiões variáveis
• I: indica regiões invariáveis
• Jukes cantor: probabilidade igual para qualquer substituição
• Kimura: transições têm mais probabilidade de ocorrer do que transversões

Question 7

Quando ocorre politomia?

Answer 7

Situação em que os dados não são suficientes para colocar a ordem dos ramos, e não se sabe qual divergiu primeiro

Question 8

Recetores de sabores e quais eles identificam:

Answer 8

• T1R - sweet/unami (nutrientes)
• T2R - bitter (toxinas)

Question 9

T1R e T2R existem em forma de dímero:

Answer 9

• T1R+T3R
• T2R + T3R

Question 10

Diferenças entre genes putativos funcionais, funcionais e pseudogenes:

Answer 10

• putativos: sequências incompletas
• funcionais: sequência intacta (com os 7 domínios intramembranares intactos)
• pseudogenes: genes que no decurso da evolução perderam a sua função