Approches moléculaire en écologie microbienne

Question 1

ARN 16S

Answer 1

à la même fonction chez tout les êtres vivant donc même pression évolutive

Question 2

partie conservé de l’ARN 16S

Answer 2

celle qui participent a l’activité du ribosome.

Question 3

partie variable de l’ARN 16S

Answer 3

subissent moins de pression évolutive et varient dans le temps

Question 4

Barcoding

Answer 4

associe une sequence à un organisme

Question 5

Metabarcoding

Answer 5

séquence tout variant de gènes présent dans une communauté.

Question 6

Amplicon

Answer 6

Les amplicons sont des fragments d’ADN généralement amplifiés par PCR. Contrairement à la métagénomique, ces produits PCR sont marqués individuellement (tag) etséquencés en grand nombre après mélange. Il est ainsi possible de rechercher des mutations (SNP communs ou rares, insertion et délétion).

Question 7

Diversité alpha

Answer 7

indice pour comparé les communauté, dans 1 espèce

Question 8

Diversité beta

Answer 8

indice pour comparé les communauté, tout ce qui permet de comparer 2 communauté, mesure la distance écologique entre 2 communautés.

Question 9

Ordination

Answer 9

réordonne les axes en fonctions de qui représente le plus de variance