Analyses morphométriques Flashcards
Que permettent les analyses morphométriques (la morphométrie) ?
Ce sont des approches pour quantifier la morphologie du cerveau avec des données d’IRM anatomique. L’IRM anatomique permet de contraster la matière grise, la matière blanche et le liquide céphalo-rachidien. Ces contrastes lorsque combinés avec des outils d’analyse automatique d’images deviennent l’étude de la morphologie computationelle.
Qu’est-ce que la morphométrie ?
L’étude de la forme du cerveau et des ses structures
La morphométrie compare des individu / groupes sur la _______ de leur cerveau
Forme
2 types de volumétrie
Manuelle et automatique
Qu’est-ce que la segmentation manuelle en volumétrie ? Nomme moi 3 limites de cette méthode
On délimite visuellement une aire du cerveau sur chaque image (ex : hippocampe), puis on fait la moyenne des dessins, ce qui nous donne le volume de la structure.
Elle prend beaucoup de temps puisqu’il faut dessiner à la main sur chaque coupe.
Elle nécessite également des critères anatomiques clairs, ce à quoi nous n’avons pas toujours accès, et même à ce moment-là il est difficile d’être sur du volume qu’on obtient.
Il existe une variabilité importante dans les résultats puisque les analyses sont subjectives.
Pourquoi un protocole de segmentation rigoureux est-il nécessaire en volumétrie manuelle ?
Pour avoir un bon accord interjuges
Qu’est-ce qu’on utilise en segmentation automatique ?
Des segmentations déjà faites au préalable par des chercheurs (atlas). On met cet atlas dans l’espace stéréotaxique
Qu’est-ce qu’un espace stéréotaxique
Le cerveau “moyen” qui vient de plusieurs individus recalés / moyennés en une image.
L’atlas doit être choisi selon quoi ?
Les structures étudiées
Les images structurelles du participant sont __________ automatiquement vers ________ ________________ de référence. On adapte ainsi l’atlas à l’anatomie de chaque sujet
Recalées
espace stéréotaxique
En quoi consiste le recalage
Il s’agit d’une déformation de l’image pour un individu pour l’ajuster à l’espace stéréotaxique
V ou F. La segmentation automatique est plus objective que la segmentation manuelle.
VRAI
La segmentation automatique est arbitraire et il y a possibilités d’erreurs, mais elle est plus objective parce que le processus est automatique
En volumétrie, comment peut-on obtenir des résultats aberrants ?
- Des erreurs de recalage
- Des artéfacts d’acquisition
- Mouvement du participant
2 types de recalage et en quoi consistent-ils
Affine / linéaire : Inclue notamment la translation, la rotation et la mise à l’échelle
Non-linéaire : déplacement dans n’importe quelle direction de l’espace (vidéo Michael Jackson)
Comment fait-on des analyses statistiques en volumétrie ?
On extrait le volume de la structure segmentée (mm3). On compare statistiquement le volume moyen entre 2 groupes ou on test l’association entre le volume et la variable étudiée (ex : âge)