Aminoasitler-proteinler Flashcards
1 aa yapısı nelerden oluşur?
NH3
COO
R grubu
H iyonu
Ortada bir C atomuna bağlı
Amfoterik nedir?
Hem asit hem baz özellik gösterebilen maddeler
Optik olarak inaktif aa kimdir? Neden?
Glisin
Asimetrik C atomu bulunmaz. R grubunda H iyonu vardır.
D/L izomer nedir?
İnsanda şeker ve aaler hangi izomerdendir?
-OH/NH3 grubunun bulunduğu yöndür. Diğer adı enantiyomerdir.
İnsanda aalar L, şekerler D izomerdir.
Bunun sebebi enzimlerin izomere spesifik olmasıdır
İmino asit grubu aa?
Prolin
OH prolin
Serbest amin grubu yok. Halka oluşturmuş.
İnsandaki D yapısındaki aaler neler?
D serin
D aspartat
İnsanda L yapısındaki şekerler nelerdir?
L iduronik asit
L fruktoz
Selenosistein nedir?
UGA stop kodonunun farklı okunmasıyla translasyon sırasında oluşmuş aa dir. Kendi tRNAsı vardır.
Selenosistein/selenyum içeren enzimler nelerdir?
Glutatyon redüktaz
Deiyodinaz
Tüm redüktaz enzimler
Fizyolojik pHda en iyi tampon aa nedir?
Histidin
Alifatik zincirli aalar?
Valin Lösin İzolösin Glisin Alanin
OH grubu içeren aaler?
Serin
Treonin
Tirozin
O glikolizasyonda önemliler
Bazik grup içeren aalar?
Arginin
Lizin
Histidin
Aromatik halka içeren aalar?
Histidin
Fenilalanin
Tirozin
Triptofan
Külürt içeren aalar?
Sistein
Metionin
Ketojenik aaler?
Lizin
Lösin
Desmozin bağı içeren aa?
Lizin
Işığı absorbe eden aaler?
Aromatik aalerdir Fenilalanin Tirozin Triptofan Histidin
Peptid bağının özellikleri nelerdir?
Amid bağı (kovalent)
Kısmi çift bağ (dönemez)
Trans
Yüksek ısı + asit/alkali ile yıkılır
Protein elektroforezi hangi yapısal özelliği gösterir?
R grubu toplam yükü
Protein ayrıştırma yöntemleri nelerdir?
Tuzla çöktürme-salting out
Kromatografi
Elektroforez
İzoelektrik odaklanma
Denatüre edici ajanlar nelerdir? Ne yaparlar?
Üre Guanidin hidroklorür UV Kuvvetli asit baz Isı
Tersiyer ve sekonder yapıyı bozarlar
Disülfid ve H bağlarını yıkarlar
Geri dönüşümlüdür
Siyonejen bromür proteine ne yapar?
Metionin kalıntısını karbonil ucundan kırar
Tripsin ne yapar?
Arjinin ve lizini karbonil ucundan koparır
Proteinin aa dizilimi belirleme yöntemi nedir?
Edman/sanger yöntemi
Tamdem mass spektrometri ne işe yarar?
Yenidoğan metabolik hastalık tanısı
a heliks(sarmal) proteinin özellikleri nelerdir?
Proteinin en kararlı en düşük enerjili halidir H bağları kurulur Sağ el dönüşlüdür Spontan oluşur Her dönüş 3,6 aa içerir Hepsi L izomerdir Prolin(halka) glisin(küçük) bulunmaz
Sekonder protein yapı tipleri nelerdir?
a heliks
B tabaka
B dönüşler
Sekonder yapının kuvvetini ne belirler?
H bağları
Polar aa miktarı
B kıvrımlar/dönüşler nedir?
a heliks ve B tabakanın köşe yerleridir
Prolin ve glisin çoğunluktadır
Enzim etkileşim yerleridir
Quartener yapı nedir?
Bir arada çalışan birden fazla proteinin beraber oluşturduğu yapıdır
a-hemoglobin stabilizing protein (AHSP) nedir?
a-hemoglobin katlayan şaperon proteinidir
Bu az ise B talasemide a lar çökelir. Prognoz kötüleşir
“Hem” yapısı içeren molekül ve enzimler nelerdir?
Katalaz Glutatyon peroksidaz Sitokrom c " P450 Miyoglobin Hemoglobin Triptofan pirolaz
Hemoglobindeki “distal histidin”in görevi nedir?
Bağlanan O2 nin stabilizasyonunu sağlar
COnin daha geniş olan bağlanma açısına engel oluşturur
Kooperatif bağlanma nedir?
Hemoglobin ne kadar O2 bağlarsa O2ye ilgisi o kadar artar
O2 Hb nin pozitif allosterik efektörüdğr
Hb nin T ve R formları nelerdir?
T: taut/gergin form Deoksijene Afinite düşük R: relaxed form Oksijene Afinite yüksek
Hemoglobinin allosterik efektörleri nelerdir?
Pozitif: O2
Negatif: CO2, H, 2,3-BPG
CO2 Hbnin neresine bağlanır?
N terminal ucu
Bağlanınca Hbyi T forma sokar
H iyonun Hbnin neresine bağlanır?
Distal histidin
Tampon özellik gösterir
Bohr efekti: H ve O2 zıt afiniteye sahip
HbF neden yüksek afiniteli?
Distal histidini yok. H iyonu bağlamaz. 2,3BPG bağlamaz
2,3-BPG düzeyini artıran etkenler?
Yükseklik***
Hipoksi
KOAH
CO Hb satürasyon eğrisini ne yapar?
Sola kaydırır
Siyanür zehirlenmesinin tedavisi nedir?
Amilnitrat verilerek metHb yapılır. MetHb siyanürü sıkı bağlar
Daha sonra metilen mavisi verilerek MetHb düzeltilir
Polar aaler?
Yüksüz: asparjin, glutamin, ser, tre, tirozin, sistein. Asidik: glutamat ve aspartat. Bazik: histidin arginin lizin
Polar aaler?
Yüksüz: asparjin, glutamin, ser, tre, tirozin, sistein. Asidik: glutamat ve aspartat. Bazik: histidin arginin lizin
SCAda oraklaşmayı artıran faktörler nelerdir?
Düşük O2 Artmış CO2 Yüksek irtifa Artmış 2,3- BPG Azalmış pH
Kollajenin yapısı nasıldır?
3 tane a sarmalın sağ el dönüşü ile oluşturduğu tropokollajen yapısındadır.
Her bir a sarmalı 1000 aadan oluşan sol el dönüşlü proteindir.
Kollajenin tipik aa sırası nedir?
Glisin-X-OHprolin
Tropokollajenin sağlamlığını ne sağlar?
OHprolinlerin H bağları
OHlizinlerin kovalent ALDOL çapraz bağları
Sistein Disülfid çapraz bağları
Kollajenin Posttranslasyonel modifikasyonu nasıl olur?
Prolin/Lizin hidroksilaz enzimi ile
GER’de gerçekleşir
-OH grubu katılır
Kofaktör olarak: O2, Askorbik asit, Fe, a keto glutarat gerekir
C vit eksikliğinde ne olur?
Kollajen yapısı bozulur
Yara iyileşmesinde gecikme-Skorbüt
Kollajen yapısındaki Aldol çapraz bağlar nasıl oluşur?
ECMde bulunan lizil oksidaz enzimi ile
Oksidatif deaminasyon yapar
Kofaktör Cu kullanır
3lü yapı içinde ve diğer liflerle arasında çapraz bağ oluşur.
Fibronektin ne işe yarar?
ECMde kollajenin organizasyonunu sağlar
Ehler-Danlos Sendromu nedir?
Kollajen yapı bozukluğu
tip 4: Lizil hidroksilaz eksikliği
Osteogenezis imperfekta nedir?
Tip 1 kollajen yapı bozukluğu
Tip 7 kollajen yapısında bozuklukla giden hastalık nedir?
Epidermolizis bullosa
Tip 4 kollajen yapısında bozuklukla giden hastalık nedir?
Alport Sendromu
Menkes Sendromu nedir?
Bakır transport bozukluğuna bağlı lizil oksidaz aktivitesi bozulur. Kollajen sentezi bozuk
Elastinin elastikiyetinden sorumlu aa nedir?
Lizin
Elastinin kollajenden farkı nedir?
Elastin saf proteindir, karbonhidrat içermez
-OH lizin içermez
DESMOSİN çapraz bağı içerir
Desmozin çapraz bağı hangi enzim ile yapılır?
Lizil oksidaz
Marfan sendromu nedir?
Fibrillin geni mutasyonu (elastik liflerin erken çocukluktaki yapısı fibrilinden oluşur)
Williams sendromu nedir?
Elastin defektidir.
Kollajen defekti ile giden hastalıklar nelerdir?
Skorbüt Ehler-Danlos Osteogenezis İmperfekta Alport Syn. Epidermolizis Bulloza Menkes Syn.
Elastin defekti ile giden hastalıklar nelerdir?
Williams
Marfan
Keratin proteininin en önemli yapısal özelliği nedir?
Sistein- Disülfid çapraz bağları
Miyozin I nerede bulunur?
Hücre membranındaki mikrofilamanlarda
Miyozin II nerede bulunur?
Sarkomer yapısında
Troponinler ne işe yarar?
Trop T: tropomiyozin
Trop C: Kalsiyum
Trop I: Aktine bağlanır
İskemi kas kasılmasına nasıl etki eder?
Ca’un SR içine pompalanması bozulur
Gevşeme için gerekli ATP sentezlenemez
Kas kasılı kalır
L tipi Ca kanalının özelliği nedir?
Yavaş(Low) Ca kanalları
Myosite ana Ca girişini sağlar
Ca kanal blokörü tarafından inhibe edilir.
F tipi Ca kanalının özelliği nedir?
Erken fazda Ca yükselmesinden sorumludur
NO hangi aaden nerede sentezlenir?
Arginin
Endotel hc.
NO görevleri nelerdir?
Vasodilatör Trombosit agg. inhibe eder Makrofaj bakterisidal etki İskelet kası gevşemesi Penil ereksiyon İmmun modulator İnfantil hipertrofik pilor stenozu patolojisinde
Kas hc.de Ca’un metabolik etkisi nedir?
Glukojen fosforilaz aktivasyonu
Glukojenoliz
Hapten nedir?
5000 daltondan küçük, kendi başına Ag etki oluşturamaz, protein ile birleşir.
Serum Ig miktar sıralaması nasıldır?
G>A>M>D>E
J-joining zincir içeren Ig’ler hangileridir?
IgM ve IgA
Kompleman fiksasyonunda görevli Igler nelerdir?
IgM ve IgG
Opsonizasyon yapan Ig nedir?
IgG
Pepsin/Papain Ig’e ne yapar?
Fc ve 2xFab ayırır
IgD nedir?
Olgunlaşmış B hc. yüzey reseptörüdür
Protein elektroforez yöntemleri nelerdir?
Spesifik protein elektroforezi İzoenzim analizleri İmmünoelektroforez Western Blot tekniği Southern ve Northern blot teknikleri
Western blot tekniği ne işe yarar?
Spesifik protein gösterilmesi
Southern-Northern blot ne işe yarar?
DNA, RNA dizisi göstermeye
Plazma protein elektroforezinde en önde giden protein hangisidir?
Prealbümin ve Retinal bağlayıcı protein
Ancak çok düşük miktarda oldukları için görülmezler
Elektroforezde beta-gamma köprüleşmesi ne zaman olur?
Siroz
Sebebi diğer proteinlerin azalıp Ig’lerin azalmaması
Plazma proteinleri nerede sentezlenir?
Karaciğer
Ig’ler hariç
Plazmada a1 bandını oluşturan proteinler nelerdir?
a1 antitripsin
a1 asit glikoprotein
a1 lipoprotein (HDL)
a1 fetoprotein
Plazmada a2 bandını oluşturan proteinler nelerdir?
a2 makroglobulin
Seruloplazmin
Haptoglobulin
Plazmada beta bandını oluşturan proteinler nelerdir?
Fibrinojen Transferrin Hemopeksin Beta lipoproteinler(LDL) B2 mikroglobulin MHC I
Plazmada gamma bandını oluşturan proteinler nelerdir?
Ig G,A,M
CRP
Fibrinojen plazma elektroforezinde hangi bantta bulunur
Beta ile gamma arası
Negatif akut faz reaktanları nelerdir?
Transferrin
Prealbümin
RBP
Onkotik basıncı dengelemek için düşerler.
İlk ve en çok yükselen AFR nedir?
CRP
Cerrahi hastasının nütrisyon takibinde kullanılan plazma proteinleri nelerdir?
Prealbümin
RBP
Albümin artışının sebebi nedir?
Dehidratasyon
Antiproteaz aktivitesi olan enzimler nelerdir?
Anti-tripsin
Anti-kemotripsin
a2 makroglobulin
a1 antitripsin eksikliğinde ne görülür?
AC’de elastin yıkan elastaz inhibisyonu yapılamaz, amfizem oluşur
KC’de önce hepatit, zamanla siroz gelişir.
Nefrotik sendromu hastada plazma onkotik basıncı nasıl dengelenir?
Renal kaçağı mümkün olmayan büyük haptoglobulin ve a2 makroglobulin sentezi artar.
a2 bandı belirginleşir.
Haptoglobulin ne bağlar?
Hemoglobin
Hemopeksin ne bağlar?
Hem
En büyük/küçük plazma proteini nedir?
a2 makroglobulin/albümin
En son artan AFR nedir?
Seruloplasmin
Seruloplasmin’in diğer isimleri nelerdir?
Bakır oksidaz
Ferro oksidaz
Seruloplasmin ne taşır?
6 tane Cu iyonu
Bakır kullanan enzimler nelerdir?
Lizil oksidaz Sitokrom oksidaz MAO Askorbat oksidaz Tirozinaz Süperoksid dismutaz
İntestinal lümende demiri indirgeyen etkenler nelerdir?
Ferroredüktaz (enzimatik) Vit C (nonenzimatik)
Enterositte demir oksidasyonu yapan etkenler nelerdir?
Hephaestin
Seruloplasmin
Hepsidin nedir?
KC’den sentezlenen, Fe metabolizmasını regüle eden protein
İntestinal Fe emilimi ve plasenta geçisini azaltır