Aminoasitler-proteinler Flashcards
1 aa yapısı nelerden oluşur?
NH3
COO
R grubu
H iyonu
Ortada bir C atomuna bağlı
Amfoterik nedir?
Hem asit hem baz özellik gösterebilen maddeler
Optik olarak inaktif aa kimdir? Neden?
Glisin
Asimetrik C atomu bulunmaz. R grubunda H iyonu vardır.
D/L izomer nedir?
İnsanda şeker ve aaler hangi izomerdendir?
-OH/NH3 grubunun bulunduğu yöndür. Diğer adı enantiyomerdir.
İnsanda aalar L, şekerler D izomerdir.
Bunun sebebi enzimlerin izomere spesifik olmasıdır
İmino asit grubu aa?
Prolin
OH prolin
Serbest amin grubu yok. Halka oluşturmuş.
İnsandaki D yapısındaki aaler neler?
D serin
D aspartat
İnsanda L yapısındaki şekerler nelerdir?
L iduronik asit
L fruktoz
Selenosistein nedir?
UGA stop kodonunun farklı okunmasıyla translasyon sırasında oluşmuş aa dir. Kendi tRNAsı vardır.
Selenosistein/selenyum içeren enzimler nelerdir?
Glutatyon redüktaz
Deiyodinaz
Tüm redüktaz enzimler
Fizyolojik pHda en iyi tampon aa nedir?
Histidin
Alifatik zincirli aalar?
Valin Lösin İzolösin Glisin Alanin
OH grubu içeren aaler?
Serin
Treonin
Tirozin
O glikolizasyonda önemliler
Bazik grup içeren aalar?
Arginin
Lizin
Histidin
Aromatik halka içeren aalar?
Histidin
Fenilalanin
Tirozin
Triptofan
Külürt içeren aalar?
Sistein
Metionin
Ketojenik aaler?
Lizin
Lösin
Desmozin bağı içeren aa?
Lizin
Işığı absorbe eden aaler?
Aromatik aalerdir Fenilalanin Tirozin Triptofan Histidin
Peptid bağının özellikleri nelerdir?
Amid bağı (kovalent)
Kısmi çift bağ (dönemez)
Trans
Yüksek ısı + asit/alkali ile yıkılır
Protein elektroforezi hangi yapısal özelliği gösterir?
R grubu toplam yükü
Protein ayrıştırma yöntemleri nelerdir?
Tuzla çöktürme-salting out
Kromatografi
Elektroforez
İzoelektrik odaklanma
Denatüre edici ajanlar nelerdir? Ne yaparlar?
Üre Guanidin hidroklorür UV Kuvvetli asit baz Isı
Tersiyer ve sekonder yapıyı bozarlar
Disülfid ve H bağlarını yıkarlar
Geri dönüşümlüdür
Siyonejen bromür proteine ne yapar?
Metionin kalıntısını karbonil ucundan kırar
Tripsin ne yapar?
Arjinin ve lizini karbonil ucundan koparır
Proteinin aa dizilimi belirleme yöntemi nedir?
Edman/sanger yöntemi
Tamdem mass spektrometri ne işe yarar?
Yenidoğan metabolik hastalık tanısı
a heliks(sarmal) proteinin özellikleri nelerdir?
Proteinin en kararlı en düşük enerjili halidir H bağları kurulur Sağ el dönüşlüdür Spontan oluşur Her dönüş 3,6 aa içerir Hepsi L izomerdir Prolin(halka) glisin(küçük) bulunmaz
Sekonder protein yapı tipleri nelerdir?
a heliks
B tabaka
B dönüşler
Sekonder yapının kuvvetini ne belirler?
H bağları
Polar aa miktarı
B kıvrımlar/dönüşler nedir?
a heliks ve B tabakanın köşe yerleridir
Prolin ve glisin çoğunluktadır
Enzim etkileşim yerleridir
Quartener yapı nedir?
Bir arada çalışan birden fazla proteinin beraber oluşturduğu yapıdır
a-hemoglobin stabilizing protein (AHSP) nedir?
a-hemoglobin katlayan şaperon proteinidir
Bu az ise B talasemide a lar çökelir. Prognoz kötüleşir
“Hem” yapısı içeren molekül ve enzimler nelerdir?
Katalaz Glutatyon peroksidaz Sitokrom c " P450 Miyoglobin Hemoglobin Triptofan pirolaz
Hemoglobindeki “distal histidin”in görevi nedir?
Bağlanan O2 nin stabilizasyonunu sağlar
COnin daha geniş olan bağlanma açısına engel oluşturur
Kooperatif bağlanma nedir?
Hemoglobin ne kadar O2 bağlarsa O2ye ilgisi o kadar artar
O2 Hb nin pozitif allosterik efektörüdğr
Hb nin T ve R formları nelerdir?
T: taut/gergin form Deoksijene Afinite düşük R: relaxed form Oksijene Afinite yüksek
Hemoglobinin allosterik efektörleri nelerdir?
Pozitif: O2
Negatif: CO2, H, 2,3-BPG
CO2 Hbnin neresine bağlanır?
N terminal ucu
Bağlanınca Hbyi T forma sokar
H iyonun Hbnin neresine bağlanır?
Distal histidin
Tampon özellik gösterir
Bohr efekti: H ve O2 zıt afiniteye sahip
HbF neden yüksek afiniteli?
Distal histidini yok. H iyonu bağlamaz. 2,3BPG bağlamaz
2,3-BPG düzeyini artıran etkenler?
Yükseklik***
Hipoksi
KOAH
CO Hb satürasyon eğrisini ne yapar?
Sola kaydırır
Siyanür zehirlenmesinin tedavisi nedir?
Amilnitrat verilerek metHb yapılır. MetHb siyanürü sıkı bağlar
Daha sonra metilen mavisi verilerek MetHb düzeltilir
Polar aaler?
Yüksüz: asparjin, glutamin, ser, tre, tirozin, sistein. Asidik: glutamat ve aspartat. Bazik: histidin arginin lizin