Aminoasitler-proteinler Flashcards

1
Q

1 aa yapısı nelerden oluşur?

A

NH3
COO
R grubu
H iyonu

Ortada bir C atomuna bağlı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Amfoterik nedir?

A

Hem asit hem baz özellik gösterebilen maddeler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Optik olarak inaktif aa kimdir? Neden?

A

Glisin

Asimetrik C atomu bulunmaz. R grubunda H iyonu vardır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

D/L izomer nedir?

İnsanda şeker ve aaler hangi izomerdendir?

A

-OH/NH3 grubunun bulunduğu yöndür. Diğer adı enantiyomerdir.
İnsanda aalar L, şekerler D izomerdir.
Bunun sebebi enzimlerin izomere spesifik olmasıdır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

İmino asit grubu aa?

A

Prolin
OH prolin

Serbest amin grubu yok. Halka oluşturmuş.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

İnsandaki D yapısındaki aaler neler?

A

D serin

D aspartat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

İnsanda L yapısındaki şekerler nelerdir?

A

L iduronik asit

L fruktoz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Selenosistein nedir?

A

UGA stop kodonunun farklı okunmasıyla translasyon sırasında oluşmuş aa dir. Kendi tRNAsı vardır.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Selenosistein/selenyum içeren enzimler nelerdir?

A

Glutatyon redüktaz
Deiyodinaz
Tüm redüktaz enzimler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Fizyolojik pHda en iyi tampon aa nedir?

A

Histidin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Alifatik zincirli aalar?

A
Valin
Lösin
İzolösin
Glisin
Alanin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

OH grubu içeren aaler?

A

Serin
Treonin
Tirozin

O glikolizasyonda önemliler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Bazik grup içeren aalar?

A

Arginin
Lizin
Histidin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Aromatik halka içeren aalar?

A

Histidin
Fenilalanin
Tirozin
Triptofan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Külürt içeren aalar?

A

Sistein

Metionin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Ketojenik aaler?

A

Lizin

Lösin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Desmozin bağı içeren aa?

A

Lizin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Işığı absorbe eden aaler?

A
Aromatik aalerdir
Fenilalanin
Tirozin
Triptofan
Histidin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Peptid bağının özellikleri nelerdir?

A

Amid bağı (kovalent)
Kısmi çift bağ (dönemez)
Trans

Yüksek ısı + asit/alkali ile yıkılır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Protein elektroforezi hangi yapısal özelliği gösterir?

A

R grubu toplam yükü

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Protein ayrıştırma yöntemleri nelerdir?

A

Tuzla çöktürme-salting out
Kromatografi
Elektroforez
İzoelektrik odaklanma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Denatüre edici ajanlar nelerdir? Ne yaparlar?

A
Üre
Guanidin hidroklorür
UV
Kuvvetli asit baz
Isı

Tersiyer ve sekonder yapıyı bozarlar
Disülfid ve H bağlarını yıkarlar
Geri dönüşümlüdür

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Siyonejen bromür proteine ne yapar?

A

Metionin kalıntısını karbonil ucundan kırar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Tripsin ne yapar?

A

Arjinin ve lizini karbonil ucundan koparır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Proteinin aa dizilimi belirleme yöntemi nedir?

A

Edman/sanger yöntemi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Tamdem mass spektrometri ne işe yarar?

A

Yenidoğan metabolik hastalık tanısı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

a heliks(sarmal) proteinin özellikleri nelerdir?

A
Proteinin en kararlı en düşük enerjili halidir
H bağları kurulur
Sağ el dönüşlüdür
Spontan oluşur
Her dönüş 3,6 aa içerir
Hepsi L izomerdir
Prolin(halka) glisin(küçük) bulunmaz
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Sekonder protein yapı tipleri nelerdir?

A

a heliks
B tabaka
B dönüşler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Sekonder yapının kuvvetini ne belirler?

A

H bağları

Polar aa miktarı

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

B kıvrımlar/dönüşler nedir?

A

a heliks ve B tabakanın köşe yerleridir
Prolin ve glisin çoğunluktadır
Enzim etkileşim yerleridir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Quartener yapı nedir?

A

Bir arada çalışan birden fazla proteinin beraber oluşturduğu yapıdır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

a-hemoglobin stabilizing protein (AHSP) nedir?

A

a-hemoglobin katlayan şaperon proteinidir

Bu az ise B talasemide a lar çökelir. Prognoz kötüleşir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

“Hem” yapısı içeren molekül ve enzimler nelerdir?

A
Katalaz
Glutatyon peroksidaz
Sitokrom c
       "      P450
Miyoglobin
Hemoglobin
Triptofan pirolaz
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Hemoglobindeki “distal histidin”in görevi nedir?

A

Bağlanan O2 nin stabilizasyonunu sağlar

COnin daha geniş olan bağlanma açısına engel oluşturur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Kooperatif bağlanma nedir?

A

Hemoglobin ne kadar O2 bağlarsa O2ye ilgisi o kadar artar

O2 Hb nin pozitif allosterik efektörüdğr

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Hb nin T ve R formları nelerdir?

A
T: taut/gergin form
Deoksijene
Afinite düşük
R: relaxed form
Oksijene
Afinite yüksek
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Hemoglobinin allosterik efektörleri nelerdir?

A

Pozitif: O2
Negatif: CO2, H, 2,3-BPG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

CO2 Hbnin neresine bağlanır?

A

N terminal ucu

Bağlanınca Hbyi T forma sokar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

H iyonun Hbnin neresine bağlanır?

A

Distal histidin
Tampon özellik gösterir

Bohr efekti: H ve O2 zıt afiniteye sahip

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

HbF neden yüksek afiniteli?

A

Distal histidini yok. H iyonu bağlamaz. 2,3BPG bağlamaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

2,3-BPG düzeyini artıran etkenler?

A

Yükseklik***
Hipoksi
KOAH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

CO Hb satürasyon eğrisini ne yapar?

A

Sola kaydırır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Siyanür zehirlenmesinin tedavisi nedir?

A

Amilnitrat verilerek metHb yapılır. MetHb siyanürü sıkı bağlar
Daha sonra metilen mavisi verilerek MetHb düzeltilir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Polar aaler?

A

Yüksüz: asparjin, glutamin, ser, tre, tirozin, sistein. Asidik: glutamat ve aspartat. Bazik: histidin arginin lizin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Polar aaler?

A

Yüksüz: asparjin, glutamin, ser, tre, tirozin, sistein. Asidik: glutamat ve aspartat. Bazik: histidin arginin lizin

46
Q

SCAda oraklaşmayı artıran faktörler nelerdir?

A
Düşük O2
Artmış CO2
Yüksek irtifa
Artmış 2,3- BPG
Azalmış pH
47
Q

Kollajenin yapısı nasıldır?

A

3 tane a sarmalın sağ el dönüşü ile oluşturduğu tropokollajen yapısındadır.
Her bir a sarmalı 1000 aadan oluşan sol el dönüşlü proteindir.

48
Q

Kollajenin tipik aa sırası nedir?

A

Glisin-X-OHprolin

49
Q

Tropokollajenin sağlamlığını ne sağlar?

A

OHprolinlerin H bağları
OHlizinlerin kovalent ALDOL çapraz bağları
Sistein Disülfid çapraz bağları

50
Q

Kollajenin Posttranslasyonel modifikasyonu nasıl olur?

A

Prolin/Lizin hidroksilaz enzimi ile
GER’de gerçekleşir
-OH grubu katılır
Kofaktör olarak: O2, Askorbik asit, Fe, a keto glutarat gerekir

51
Q

C vit eksikliğinde ne olur?

A

Kollajen yapısı bozulur

Yara iyileşmesinde gecikme-Skorbüt

52
Q

Kollajen yapısındaki Aldol çapraz bağlar nasıl oluşur?

A

ECMde bulunan lizil oksidaz enzimi ile
Oksidatif deaminasyon yapar
Kofaktör Cu kullanır
3lü yapı içinde ve diğer liflerle arasında çapraz bağ oluşur.

53
Q

Fibronektin ne işe yarar?

A

ECMde kollajenin organizasyonunu sağlar

54
Q

Ehler-Danlos Sendromu nedir?

A

Kollajen yapı bozukluğu

tip 4: Lizil hidroksilaz eksikliği

55
Q

Osteogenezis imperfekta nedir?

A

Tip 1 kollajen yapı bozukluğu

56
Q

Tip 7 kollajen yapısında bozuklukla giden hastalık nedir?

A

Epidermolizis bullosa

57
Q

Tip 4 kollajen yapısında bozuklukla giden hastalık nedir?

A

Alport Sendromu

58
Q

Menkes Sendromu nedir?

A

Bakır transport bozukluğuna bağlı lizil oksidaz aktivitesi bozulur. Kollajen sentezi bozuk

59
Q

Elastinin elastikiyetinden sorumlu aa nedir?

A

Lizin

60
Q

Elastinin kollajenden farkı nedir?

A

Elastin saf proteindir, karbonhidrat içermez
-OH lizin içermez
DESMOSİN çapraz bağı içerir

61
Q

Desmozin çapraz bağı hangi enzim ile yapılır?

A

Lizil oksidaz

62
Q

Marfan sendromu nedir?

A

Fibrillin geni mutasyonu (elastik liflerin erken çocukluktaki yapısı fibrilinden oluşur)

63
Q

Williams sendromu nedir?

A

Elastin defektidir.

64
Q

Kollajen defekti ile giden hastalıklar nelerdir?

A
Skorbüt
Ehler-Danlos
Osteogenezis İmperfekta
Alport Syn.
Epidermolizis Bulloza
Menkes Syn.
65
Q

Elastin defekti ile giden hastalıklar nelerdir?

A

Williams

Marfan

66
Q

Keratin proteininin en önemli yapısal özelliği nedir?

A

Sistein- Disülfid çapraz bağları

67
Q

Miyozin I nerede bulunur?

A

Hücre membranındaki mikrofilamanlarda

68
Q

Miyozin II nerede bulunur?

A

Sarkomer yapısında

69
Q

Troponinler ne işe yarar?

A

Trop T: tropomiyozin
Trop C: Kalsiyum
Trop I: Aktine bağlanır

70
Q

İskemi kas kasılmasına nasıl etki eder?

A

Ca’un SR içine pompalanması bozulur
Gevşeme için gerekli ATP sentezlenemez
Kas kasılı kalır

71
Q

L tipi Ca kanalının özelliği nedir?

A

Yavaş(Low) Ca kanalları
Myosite ana Ca girişini sağlar
Ca kanal blokörü tarafından inhibe edilir.

72
Q

F tipi Ca kanalının özelliği nedir?

A

Erken fazda Ca yükselmesinden sorumludur

73
Q

NO hangi aaden nerede sentezlenir?

A

Arginin

Endotel hc.

74
Q

NO görevleri nelerdir?

A
Vasodilatör
Trombosit agg. inhibe eder
Makrofaj bakterisidal etki
İskelet kası gevşemesi
Penil ereksiyon
İmmun modulator
İnfantil hipertrofik pilor stenozu patolojisinde
75
Q

Kas hc.de Ca’un metabolik etkisi nedir?

A

Glukojen fosforilaz aktivasyonu

Glukojenoliz

76
Q

Hapten nedir?

A

5000 daltondan küçük, kendi başına Ag etki oluşturamaz, protein ile birleşir.

77
Q

Serum Ig miktar sıralaması nasıldır?

A

G>A>M>D>E

78
Q

J-joining zincir içeren Ig’ler hangileridir?

A

IgM ve IgA

79
Q

Kompleman fiksasyonunda görevli Igler nelerdir?

A

IgM ve IgG

80
Q

Opsonizasyon yapan Ig nedir?

A

IgG

81
Q

Pepsin/Papain Ig’e ne yapar?

A

Fc ve 2xFab ayırır

82
Q

IgD nedir?

A

Olgunlaşmış B hc. yüzey reseptörüdür

83
Q

Protein elektroforez yöntemleri nelerdir?

A
Spesifik protein elektroforezi
İzoenzim analizleri
İmmünoelektroforez
Western Blot tekniği
Southern ve Northern blot teknikleri
84
Q

Western blot tekniği ne işe yarar?

A

Spesifik protein gösterilmesi

85
Q

Southern-Northern blot ne işe yarar?

A

DNA, RNA dizisi göstermeye

86
Q

Plazma protein elektroforezinde en önde giden protein hangisidir?

A

Prealbümin ve Retinal bağlayıcı protein

Ancak çok düşük miktarda oldukları için görülmezler

87
Q

Elektroforezde beta-gamma köprüleşmesi ne zaman olur?

A

Siroz

Sebebi diğer proteinlerin azalıp Ig’lerin azalmaması

88
Q

Plazma proteinleri nerede sentezlenir?

A

Karaciğer

Ig’ler hariç

89
Q

Plazmada a1 bandını oluşturan proteinler nelerdir?

A

a1 antitripsin
a1 asit glikoprotein
a1 lipoprotein (HDL)
a1 fetoprotein

90
Q

Plazmada a2 bandını oluşturan proteinler nelerdir?

A

a2 makroglobulin
Seruloplazmin
Haptoglobulin

91
Q

Plazmada beta bandını oluşturan proteinler nelerdir?

A
Fibrinojen
Transferrin
Hemopeksin
Beta lipoproteinler(LDL)
B2 mikroglobulin
MHC I
92
Q

Plazmada gamma bandını oluşturan proteinler nelerdir?

A

Ig G,A,M

CRP

93
Q

Fibrinojen plazma elektroforezinde hangi bantta bulunur

A

Beta ile gamma arası

94
Q

Negatif akut faz reaktanları nelerdir?

A

Transferrin
Prealbümin
RBP

Onkotik basıncı dengelemek için düşerler.

95
Q

İlk ve en çok yükselen AFR nedir?

A

CRP

96
Q

Cerrahi hastasının nütrisyon takibinde kullanılan plazma proteinleri nelerdir?

A

Prealbümin

RBP

97
Q

Albümin artışının sebebi nedir?

A

Dehidratasyon

98
Q

Antiproteaz aktivitesi olan enzimler nelerdir?

A

Anti-tripsin
Anti-kemotripsin
a2 makroglobulin

99
Q

a1 antitripsin eksikliğinde ne görülür?

A

AC’de elastin yıkan elastaz inhibisyonu yapılamaz, amfizem oluşur
KC’de önce hepatit, zamanla siroz gelişir.

100
Q

Nefrotik sendromu hastada plazma onkotik basıncı nasıl dengelenir?

A

Renal kaçağı mümkün olmayan büyük haptoglobulin ve a2 makroglobulin sentezi artar.
a2 bandı belirginleşir.

101
Q

Haptoglobulin ne bağlar?

A

Hemoglobin

102
Q

Hemopeksin ne bağlar?

A

Hem

103
Q

En büyük/küçük plazma proteini nedir?

A

a2 makroglobulin/albümin

104
Q

En son artan AFR nedir?

A

Seruloplasmin

105
Q

Seruloplasmin’in diğer isimleri nelerdir?

A

Bakır oksidaz

Ferro oksidaz

106
Q

Seruloplasmin ne taşır?

A

6 tane Cu iyonu

107
Q

Bakır kullanan enzimler nelerdir?

A
Lizil oksidaz
Sitokrom oksidaz
MAO
Askorbat oksidaz
Tirozinaz
Süperoksid dismutaz
108
Q

İntestinal lümende demiri indirgeyen etkenler nelerdir?

A
Ferroredüktaz (enzimatik)
Vit C (nonenzimatik)
109
Q

Enterositte demir oksidasyonu yapan etkenler nelerdir?

A

Hephaestin

Seruloplasmin

110
Q

Hepsidin nedir?

A

KC’den sentezlenen, Fe metabolizmasını regüle eden protein

İntestinal Fe emilimi ve plasenta geçisini azaltır