Aminoácidos y proteínas Flashcards
Cual es único aminoácido aquiral?
La glicina
Cómo es mayormente la configuración de los aminoácidos?
L, con el grupo amino a la izquierda
Cómo es el triptófano?
Aminoácido esencial
Neurotransmisor
Sueño de forma natural
Para que se utiliza la tirosina?
Para obtener catecolaminas
Cómo funciona la fenilanina?
Es un psicoactivo precursor de las catecolaminas
Que es zwiterion?
Aminoácidos escritos como sal interna o ion doble
Como tiene que estar siempre un aminoácido?
Con carga
Que es el punto isoelectrico?
pH donde el aminoácido tiene carga neta igual a cero
Cómo es el grupo amino terminal?
El aminoácido tiene el lado amina libre
Como es el grupo carboxilo terminal?
El aminoácido termina con el lado carboxilo libre
Cómo es la geometría del enlace Peptídico?
4 átomos con ángulos de 120 entre C y N
A qué se debe la estabilidad de la proteína?
La rotación del enlace debe estar restringida, por lo que la proteína no está rotando
Que son los péptidos?
Polímeros de 2-50 unidades de aminoácidos, más de 50 son de proteínas
Como se dibujan los peptidos?
Con el N terminal del lado amino al lado izquierdo y el C terminal del lado derecho
Como es el enlace peptídico amida?
Sp2
Enlace doble C-N y se dificulta la rotación
Planos
Grupos R opuestos al plano
Cómo es el puente de disulfuro?
Enlace covalente entre dos unidades de cisteína, permite conectar cadenas de polipéptidos o ciclarse en ella misma, enlazan de forma cruzada las porciones de un péptido
Cómo se lee la estructura primaria?
Se lee de N terminal a C terminal
Como se da la hidrolisis de peptidos?
HCl 6M a elevadas temperaturas
Describa la estructura secundaria
Arreglo ordenado de los aminoácidos en regiones localizadas del polipéptido o proteína
Como son los enlaces peptidicos de la estructura secundaria?
En el mismo plano y en configuración trans
Cómo es le plegamiento de los segmentos en la estructura secundaria?
Polaridad regional y doble enlace
Cómo es la minimización de la energía en la estructura secundaria?
Al maximizar el número de grupos peptidicos que se unen por enlaces de H
Cómo es la adecuada separación de los grupos R en la estructura secundaria?
Es para evitar el impedimento estérico
Evitar repulsión de cargas iguales
Cómo es la zona sin estructura de la estructura secundaria?
Lazos, hilos, bucles
Describa la hélice alfa en la estructura secundaria?
Minimiza el impedimento esterico
Se estabiliza por Puentes de hidrógeno
La hélice alfa tiene orientación a la derecha
Gira en sentido a las agujas del reloj
Como son los enlaces peptidos en la hélice alfa?
Trans y Plano
Como son los grupos N-H de la hélice alfa?
Todos apuntan en la misma dirección, es aproximadamente paralelo al eje de la hélice
Hacia donde apuntan los grupos R en la hélice alfa?
Hacia la parte externas
Cómo es también llamada la hoja beta?
También llamada lámina plegada B
Como se forman los Puentes de hidrógeno en la hoja beta?
Entre aminoácidos vecinales, cadenas adyacentes
Por qué los grupos R son pequeños en la hoja beta?
Para maximizar interacciones y disminuir el efecto esterico
En qué consiste la hoja antiparalela B?
En una cadena adyacente de polipéptido que va en dirección opuesta
Como se acomodan los grupos R en las hoja beta?
Alternamente, primero sobre y luego debajo de la hoja
Las hojas B y hélices alfa respecto a la flexibilidad?
Las hojas B no son flexibles
Las hélices alfa son flexibles
Que define la estructura terciaria de una proteína?
Orientación 3D de todos los átomos de la proteína
Qué pasa en la estructura terciaria?
Cada vez qué hay interacción se estabiliza la proteína ya qué hay liberación de energía
Cuales son los enlaces que mantienen la estructura terciaria y son los únicos enlaces covalentes?
Enlaces de disulfuro
Cuales son interacciones estabilizantes de la estructura terciaria?
Enlaces de disulfuro
Puentes de H
Atracciones electrostáticas
Atracciones hidrofóbicas
Como se comporta la estructura terciaria en agua?
Se pliegan de manera que la mayor cantidad de grupos polares estén expuestos y los no polares escondidos
Como son las interacciones hidrofóbicas en la estructura terciaria?
Entre grupos no polares
Aumentan estabilidad al aumentar entropía
Que es la desnaturalización de las proteínas?
Destruir la estructura terciaria
Enlaces débiles y fáciles de romper
Como se logra la desnaturalización de las proteínas?
Cambiando el pH
Con Urea
Disolventes orgánicos
Calor o agitación
Como se desnaturalizan las proteínas al cambiar el pH?
Se modifican las cargas de muchos de las cadenas laterales, esto interfiere en la atracciones electrostáticas y los Puentes de hidrógeno
Como desnaturaliza las proteínas la Urea?
Forma Puentes de hidrógeno en los grupos proteicos, los cuales son más fuertes que los que ya hay en la molécula
Como desnaturalizan las proteínas los solventes orgánicos?
Interfieren con las interacciones hidrofóbicas
Como desnaturalizan las proteínas el calor y la agitación?
Se aumenta el movimiento molecular y esto interfiere con las fuerzas de atracción
Defina la estructura cuaternaria
Arreglo de cadenas de polipéptidos dentro de un agregado no enlazado covalentemente
Como se llaman las cadenas en la estructura cuaternaria?
Subunidad
Como se unen las subunidades en la estructura cuaternaria?
Interacciones hidrofóbicas
Puentes de H
Atracciones electrostáticas
Cual es el mayor factor que estabiliza las estructuras cuaternarias?
El efecto hidrofóbico
Defina el efecto hidrofóbico
Tendencia de un grupo no polar a aglomerarse de tal forma que se proteja del contacto con ambientes acuosos
Que es el sinergísmo en una estructura cuaternaria?
Se da positivo o negativo entre las subunidades a raíz de cambios confirmacionales de una subunidades y su efecto en las otras