Altklausuren Flashcards
Wer widerlegte die endgültige Ursprungstheorie? (Name) Mittelchen Technik?
Louis Pasteur -> Swan Neck bottle
a) Nennen Sie die Kochechten Postulate
b) Welche Probleme treten bei Viren im Vergleich mit Bakterien bei den Postulaten auf?
c) Nennen Sie einen Virus, bei dem der Nachweis besonders problematisch war. Warum?
a) 1. Erreger muss sich in allen erkrankten nicht aber in Gesunden nachweisen lassen.
2. Erreger muss sich in Reinkultur Anzüchten lassen.
3. Erreger muss dieselbe Krankheit auch in anderen auslösen.
4. Erreger kann von den neu Erkrankten wieder isoliert werden.
b) Viren sind obligat intrazellulär und lassen sich nicht ohne spezifisch passende Zellen Anzüchten.
c) Hepatitis C
Actinomycin inhibiert
- RNA Polymerase II
- Influenza A
- Herpesvieren
Wieso liefern die Methoden zur Influenzaquantifizierung unterschiedliche Ergebnisse?
Methoden liefern unterschiedliche Ergebnisse, da sie alle Vieren, nur infektiöse Viren oder Untereinheiten (HA) nachweisen (Unterschied egg-pfui -> egg lässt sich effizienter infizieren (ganzer Organismus))
Was war das erste identifizierte Virus?
Tabbak-Mosaic (Gelbfieber war das erste humane Virus)
Was war die entscheidende Eigenschaft, die die Abtrennung von Viren von Bakterien ermöglichte?
Ultrafiltrierbarkeit
Nennen Sie die Virusfamilie und -genera des Blauzungenvirus
Familie: Reoviridae
Genus: Orbivirus
Welcher Blauzungen-Serotyp war für den aktuellen Ausbruch verantwortlich?
Serotyp 8 -> Impfung vorhanden; Serotyp 6 (jetzt hier Weden illegaler Impfung)
Beschreiben Sie die Virionmorphologie vom Blauzungenvirus mit wenigen aussagekräftigen Stichpunkten
- kubisch
- behüllt
- 3 layer (Virion, ISVP, Core)
Beschreiben Sie den Aufbau des Genom des Blauzungenvirus
10-12 lineare dsRNA Segmente
Hat die Impfung gegen BTV geholfen, das Virus in Deutschland in den Griff zu bekommen? Reicht dies, um das Virus endgültig auszurotten?
Typ 8: ja im Griff, Virus aber dadurch nicht ausgerottet (Impfung verringert nur Virämie)
Was versteht man unter einem Viriod? Nennen Sie ein Beispiel
infektiöse RNA ohne codierte Proteine
Kann man gegen Viroide impfen? Wenn ja, wie?
ja, mit “Impfung” mit virulenten Formen
Nennen Sie drei cytopathische Effekte und jeweils ein Virus, das diesen Effekt hervorruft
Lyse: Polio
Transformation: Retro
riesige Zellen: Cytomegalo
Synzytien: Masern
inclusion bodies: Adeno
Which instrument/method enabled Iwanovski (1892) to differentiate viruses from the already known bacteria?
ceramic or chamberlain filter (Viren gehen durch; Bakterien bleiben hängen)
To which family and genus (correct phylogenetic names!) does Yellow Fever virus belong?
Familie: Flaviviridae
Genus: Flavivirus
Specify the structure of the genome and the virion of the Yellow Fever Virus
Virion: behüllt und kubisch (ikosaeder), ca 50 nm
Genom: linear, ss (+)-strand RNA, ca 10-12 kb, 1 ORF
When, how (method) and from whom was a vaccine (name of vaccine) for Yellow Fever Virus developed? Catchwords only
1930 Max Teiler 17D? attenuation in Mäusen
How can influenza virus particles be counted? Give short description of the four different methods and state what each of them actually measures!
Electron microscopy (EM): man zählt direkt alle Viren (übers Anhängen elektrodichter Partikel)
quantal infectivity assay in eggs: man zählt alle infektiösen Viren ( sichtbar werden z.B. Hemorrhages)
quantitation by plaque forming units (pfu): man zählt alle infektiösen Viren (immer wenn ein Loch im Zellrasen entsteht, wurde dieses durch ein infektiöses Virus verursacht)
Hemaglutinin assay (HA): hier zählt man Partikel die HAs enthalten
What is a viroid (definition)?
infektiöse RNA, die keine Proteine codiert
Give an example of a viroid with economical relevance
Crysanthenum stunt viroid
Is protective vaccination against viroids possible? if yes, how?
möglich durch “Impfung” mit virulenter Form
Erkläre kurz, warum Polioviren nicht von Antimycin D und warum Influenza Viren von Antimycin D inhaliert werden
Polio: hat seine eigene Polymerase und repliziert im Cytoplasma
Influenza: hat zwar eigene Polymerase, repliziert aber im Kern und nutzt zelluläre Präsentation-mRNA für das Cap Snatching
Ankreuzaufgabe
- Nackte (+) Strang RNA Viren sind infektiös
- Visions of negative-strand RNA viruses contain a viral RdRp
Which molecules may contain “kissing-loop interactions” and “pseudoknots”?
RNA
In which regulatory mechanism is the “pseudo knot” of functional importance?
ribosomal frameshifting
Name two viruses from different families which use ribosomal frameshifting
SARS-Coronavirus
die meisten Retroviren
What is a CRRE-element and what is it function in the replication of Poliovirus?
- intragenomic cis-active replication element
- das Vpg bindet zusammen mit der 3D-Pol an das Credo und wird dort uridinyliert, woraufhin es im Komplex mit der polymerase an das Poly-A binden kann
Which mechanisms of posttranscriptional translational regulation does Sendaivirus use? Name and describe (shortly!) the mechanisms
ribosome shunting
durch Sekundärstrukturen der RNA wird der gesamte Polymerasekomplex woanders hin gebunden und startet erst dort die Suche nach dem AUG
leaky scanning
kein Start am 1.AUG, da dieses in einem schlechten “Kontext” steht und somit gar nicht als solches erkannt wird -> nächstes AUG = Start cotranscriptionales RNA editing (Insertionen, Basenaustausche)
Insertionen: RNA-Pol pausiert in der Nähe einer U-C-junction nachdem 2C eingebaut wurden -> die Pol und gebundenen mRNA rutschen ein Stück zurück -> zusätzliche Nucleotide werden eingebaut (1-2)
List 4 viruses or virus-like agents involved in hepatitis in humans. Also state to which virus family they belong.
HAV: Picornaviridae
HBV: Hepadnaviridae
HCV: Flaviviridae
HDV: nicht klassifiziert (ist ein Virosoid und HBV-abhängig)
Explain the transcription mechanism of the members of the family Coronaviridae.
Nidovirales -> nested set -> 3’ coterminale mRNAs mit identischem 5’ werden generiert: zwischen den einzelnen ORFs befinden sich TRS (transcription regulating sequence) -> vom Poly-A aus werden die (-)-Stränge transkribiert; die Synthese kann auch an den TRS abbrechen oder reinitiiert werden -> das endständige TRS bindet nach Abbruch ans leader-TRS (direkt nach dem Cap) und die (-)-Strang Synthese wird beendet (alle haben also dieselbe 5’ Cap Region) -> von jeder mRNA wird immer nur das 5’ proximale ORF translatiert
Ankreuzaufgabe Picornavirus
Picornaviruses possess a protein primer
What does the abbreviation ARBO virus stand for? Give one example (family, genus, species)
Arthropode borne virus
Familie: Reoviridae
Gattung: Orbivirus
Spezies: Blue-Tongue-Virus
Explain the mechanism “attenuation of transcription” for the negative strand RNA virus VSV.
Polymerase bindet ans 3’ vom N-Gen, dieses wird transkribiert in den Ig’s findet die Termination über 7U’s (stottern und Polyadenylierung) statt -> die Polymerase ist nicht sehr prozessiv und Reinitiation findet somit nur in wenigen Fällen statt
somit werden die mRNAs in folgendem Mengenverhältnis hergestellt:
N > P > M > G > L
Influenzavirus Ankreuzaufgabe
- PB1 is the cap binding protein
- Viral proteins contain nuclear localization signal
Influenzavirus Ankreuzaufgabe
- PB1 is the cap binding protein
- Viral proteins contain nuclear localization signal
Influenzavirus Ankreuzaufgabe
- PB1 is the cap binding protein
- Viral proteins contain nuclear localization signal
Nennen Sie Kriterien nach denen Viren eingeteilt werden.
- Vorhandensein einer Lipidumhüllung
- Natur des viralen Genom (DNA oder RNA)
- Symmetrie des Kapsids
- Größe von Virion und Kapsid
Definieren Sie Serotyp und nennen Sie zwei Beispiele
- Variation innerhalb einer Subspezies, die mit serologischen Tests unterscheidbar sind
- Beispiel: Blue tongue disease -> Pathogen is very variable
Definieren Sie Serotyp und nennen Sie zwei Beispiele
- Variation innerhalb einer Subspezies, die mit serologischen Tests unterscheidbar sind
- Beispiel: Blue tongue disease -> Pathogen is very variable
Nennen Sie die Funktion von IRES-Strukturen
- allow binding of ribosomes without scanning
- mediate internal entry of the 40S ribosomal subunit on some eukaryotic and viral messenger RNAs upstream of a translation initiation codon
Welches Institut ist für die Klassifizierung von Viren zuständig (Abkürzung und voll ausgeschrieben)
ICTV: international committee on the taxonomy of Viruses
Virology Division of the International Union of Microbiological Societies
Aus welchem Tier stammt SARS?
Civet cat
Nennen Sie Rezeptorproteine von HCV, welche beim Eindringen in den Wirt beteiligt sind.
- CD81
- Low density lipoprotein (LDL) receptor
- Scavenger (SR-BI) receptor
- Claudin 1 (CLDN1)
- Occluding (OCDN)
Wofür steht die Abkürzung MOI, was wird damit gezählt?
= multiplicity of infection
- median number of infectious virus particles per cell
Nennen Sie Gründe, weswegen das Mimivirus ein Virus ist und kein intrazelluläres Bakterium
- capsid protein (double jelly-roll fold)
- ikosahedral strucutre
- eclipse phase (“disappearance”) as part of life cycle
- absence of genes for ribosomes (but for aminoacyl tRNA synthetases), energy production or energy conversion
- phylogeny
Nennen Sie zwei Viren mit großen RNA-Genom (mit Genus und Familie!)
Nidovirales: Coronaviruses, Toroviruses, Androniviruses
Nennen Sie zwei Viren mit großen RNA-Genom (mit Genus und Familie!)
Nidovirales: Coronaviruses, Toroviruses, Androniviruses
Nennen Sie zwei Viren mit großen RNA-Genom (mit Genus und Familie!)
Nidovirales: Coronaviruses, Toroviruses, Androniviruses
Beschreiben Sie die Terminale Sequenz von Adenoviren!
- invertierte, terminale Repetitionen von 50-200 Basenpaare
a) Aus welchen Tieren und welchem Organ wurde Influenza das erste mal isoliert?
b) In welchem Produktionssystem wird Influenza vermehrt für die Vaccineherstellung?
a) Wasservögel
b) Hühnereier
Welches war die erste humane Zelllinie, welche konstant im Labor gewachsen ist?
HeLa Zellen
Nennen Sie drei verschiedene Formen des cytopathischen Effekts mit je einem Virus
1) Schwellung und Abrundung der Zellen mit nachfolgender Zytolyse
2) Loslösung vom Zellverband
3) Transformation von Zellen, z.B. Bildung mehrkerniger Riesenzellen (Synzytien)
4) Bildung von Einschlusskörperchen (Proteinaggregate bei exzessiver Proteinsynthese)
5) Vakuolisierung des Zytoplasmas