Adn prot 2

Question 1

quelles sont les 3 possibilités imaginées pour la réplication ?

Answer 1

1. Modèle conservatif : «photocopie» des deux brins à la fois
2. Modèle semi-conservatif : Copie de chacun des deux brins
3. Modèle dispersif : mélange un peu tout

(Cf: cours 2 p.7)

Question 2

La réplication est ….

Answer 2

Semi-conservative

Question 3

expérience de Matthew Meselson et Frank Stahl + conclusion

Answer 3

ADN se trouve dans milieu lourd (N15) -> initiation de la réplication, changement de milieu -> mtn dans milieu léger (N14) -> donne :

lourd -> intermédiaire (première génération) -> intermédiaire + léger (2e génération)

conclusion : la réplication est semi-conservative

Question 4

définition de la réplication :

Answer 4

Synthèse d’acide désoxyribonucléique qui reproduit très exactement le génome d’une cellule au cours du cycle cellulaire afin de préparer la division de cette cellule.

Question 5

Où commence la réplication ?

Answer 5

l’origine de réplication

Question 6

qu’est-ce qui sépare les deux brins pour permettre la réplication ?

Answer 6

Les hélicases (fourches de réplication)

Question 7

qui est en charge de la synthèse du nouveau brin d’ADN ?

Answer 7

l’ADN polymérase

Question 8

combien d’origines de réplication ont lieu au même moment ?

Answer 8

il y a de très nombreuses origines de réplication réparties sur la totalité du génome, ce qui exige un minimum de coordination

Question 9

synthèse : …->…

matrice lue : …->…

Answer 9

S: 5’->3’
M: 3’->5’

Question 10

de quoi a besoin l’ADN polymerase pour pouvoir commencer la synthèse ? Où trouve-t-elle cela ?

Answer 10

Elle a besoin d’une amorce (une extrémité 3’OH), chez l‘ARN polymérase (qui elle n’as pas besoin d’amorce)

Question 11

comment les nucléotides se lient-ils les uns aux autres ?

Answer 11

En formant une liaison phosphodiester entre leur sucre et groupement phosphate

Question 12

à quel carbone se lie un phosphate lors d’une liaison phosphodiester ?

Answer 12

au carbone 5’ du sucre correspondant au nucléotide entrant au groupement hydroxyl (OH) lié au carbone 3’ du sucre du dernier nucléotide en place sur la chaine en cours d’élongation

Question 13

qu’est-ce que l’ADN polymérase ADN dépendante ?

Answer 13

elle synthétise de l’ADN et utilise l’ADN comme matrice

Question 14

Il existe aussi des ADN polymerase qui sont …. dépendante et elles se nomment….

Answer 14

ADN polymérase ARN dépendante et elles se nomment les reverses transcriptase, (synthétise de l’ADN à partir d’ARN)

Question 15

La synthétisation a un sens opposé selon le brin qu’elle synthétise, en quoi cela pose-t-il problème ?

Answer 15

Cela engendre une synthèse continue (pas de soucis) et une synthèse discontinue (celle qui ne va pas dans le même sens que la fourche)

Question 16

Comment fait la synthèse discontinue pour fonctionner ?

Answer 16

elle doit constamment refaire des amorces, elle est donc plus lente que la synthèse continue

Question 17

quels autres noms portent les synthèses continue et discontinue ?

Answer 17

continue : brin précoce

discontinue : brin tardif

Question 18

qu’est-ce qu’un fragment Okazaki ?

Answer 18

un bout d’ADN synthétisé contenant une amorce + les nucléotides

Question 19

Comment les «trous» de la synthèse discontinue sont-ils bouchés à la fin ?

Answer 19

étape 1 : destruction de l’amorce d’Arn; combinaison endonucléase (RNaseH) et exonucléase

étape 2 : élongation de la chaine d’ADN (par l’ADN polymérase)

étape 3 : ligation des deux fragments (par une ligase) par la création d’une liaison phosphodiester, énergie fournie par l’hydrolyse de l’ATP

Question 20

Qu’est-ce que le replisome complex ?

Answer 20

Une boucle est formée sur le brin discontinue pour donner l’impression aux deux brins qu’ils avancent dans le même sens et ils sont attachés par des «sliding clamp» pour synchroniser leur vitesse par rapport à celle du plus lent

Question 21

Que se passerait-il si les vitesses de la synthèse des brins ne sont pas synchronisées ?

Answer 21

Au bout d’un moment il y aurait trop d’ADN simple brin -> fragile -> risque

Question 22

Quelles sont les enzymes de la réplication et quelles sont leur fonction ?

Answer 22

• L’ADN polymérase (adn dépendante) : accroche un nucléotide via le phosphate porté par le nucléotide entrant au niveau du carbone 5’ et de l’accrocher au niveau de l’amorce au carbone 3’ qui porte le groupement OH qui va servir pour faire la liaison phospho-diester
• l’ARN polymérase (ADN dépendante), primase : fait l’amorce ARN-ADN pour que la synthèses d’ADN puisse commencer
• hélicase : elle est chargée d’ouvrir les deux brins (casse liaisons H -> besoin d’énergie -> hydrolyse de l’ATP)

Question 23

Comment agit l’ADN polymérase ?

Answer 23

l’ADN polymérase, ADN dépendante

Elle accroche un nucléotide via le phosphate porté par le nucléotide entrant au niveau du carbone 5’ et de l’accrocher au niveau de l’amorce au carbone 3’ qui porte le groupement OH qui va servir pour faire la liaison phospho-diester

Question 24

Comment est faite l’amorce lors de la réplication ?

Answer 24

Complexe primase : l’ARN polymérase fait l’amorce et est directement suivie de l’ADN polymérase qui synthétise l’ADN

Question 25

Qu’est-ce qui aide à relâcher la tension due aux divers super-enroulement de l’ADN ?

Answer 25

Les topoisomérases

Question 26

Comment agit la toposisomérase I ?

Answer 26

Elle coupe un des deux brins :

1. Détruit une liaison phospho-diester
2. Stocke l’énergie libérée par la rupture de cette liaison en recréant une liaison covalente au niveau de la topoisomérase I (elle se lie à l’ADN->peut pas partir) 3. Un déroulement a lieu en avale (au delà) de cette topoisomérase -> libère les tensions
3. Rétablit l’intégrité de la molécule d’ADN en refaisant la liaison phosphodiester ; l’énergie est stockée ds la liaison covalente avec la topo1 -> la liaison phosphodiester est rétablie -> topo1 libérée

Question 27

Pourquoi les topo-isomérase humaines sont-elles la cible de certains agents de chimiothérapie anti-tumorale ?

Answer 27

Par définition : une cellule cancéreuse est une cellule qui se divise beaucoup —> activité topoisomérase extrêmement élevée -> donc c’est un moyen de détruire ces cellules cancéreuses

Question 28

Que fait la topoisomérase 2 ?

Answer 28

Elle libère deux molécules entrelacées (noeuds) :

1. Se fixe au niveau de l’entrelacement
2. Se lie de façon covalente aux brins entrelacés
3. Besoin d’ATP pour avoir de l’énergie -> elle l’hydrolyse
4. Coupe les 2 brins entrelacés
5. Défait le noeud
6. Re-formation des liaisons phosphodiester
7. Topo2 libérée

Question 29

Comment ne pas perdre les infos qui se trouvent à l’extrémité 3’ du brin qui supporte la synthèse discontinue ?

Answer 29

L’extrémité est allongée :

Allongement fait par la télomérase

Amorce : l’extrémité 3’ OH

Matrice : une molécule d’ARN associée à l’ADN polymérase ( ADN polymérase ARN dépendant —> reverse transcriptase) —> télomérase

Question 30

Chaque cellule a un stock de télomérase définit, pourquoi ?

Answer 30

—> instaure une horloge, la cellule finit par mourir quand les stocks sont terminés et que les séquences perdues sont des infos important

Une cellule qui ne cesse de se diviser est une cellule destinée à devenir cancéreuse (accumule mutation etc)

Question 31

Un des moyens pour limiter la réplication des virus est d’enlever les extrémités 3’ (l’amorce), comment ça marche ?

Answer 31

Fabrique des analogues de nucléotides dans lesquels les extrémités 3’ ont été enlevées, puis on les injecte ds l’organisme, le virus ne pourra pas de répliquer car pas d’amorce
On les appelle aussi des terminateur d’élongation

Question 32

Contre quels virus sont utilisés les analogue de nucléotides (terminateur d’élongation) ?

Answer 32

Contre certains virus herpétiques et contre le SIDA