Adn prot 2 Flashcards
quelles sont les 3 possibilités imaginées pour la réplication ?
- Modèle conservatif : «photocopie» des deux brins à la fois
- Modèle semi-conservatif : Copie de chacun des deux brins
- Modèle dispersif : mélange un peu tout
(Cf: cours 2 p.7)
La réplication est ….
Semi-conservative
expérience de Matthew Meselson et Frank Stahl + conclusion
ADN se trouve dans milieu lourd (N15) -> initiation de la réplication, changement de milieu -> mtn dans milieu léger (N14) -> donne :
lourd -> intermédiaire (première génération) -> intermédiaire + léger (2e génération)
conclusion : la réplication est semi-conservative
définition de la réplication :
Synthèse d’acide désoxyribonucléique qui reproduit très exactement le génome d’une cellule au cours du cycle cellulaire afin de préparer la division de cette cellule.
Où commence la réplication ?
l’origine de réplication
qu’est-ce qui sépare les deux brins pour permettre la réplication ?
Les hélicases (fourches de réplication)
qui est en charge de la synthèse du nouveau brin d’ADN ?
l’ADN polymérase
combien d’origines de réplication ont lieu au même moment ?
il y a de très nombreuses origines de réplication réparties sur la totalité du génome, ce qui exige un minimum de coordination
synthèse : …->…
matrice lue : …->…
S: 5’->3’
M: 3’->5’
de quoi a besoin l’ADN polymerase pour pouvoir commencer la synthèse ? Où trouve-t-elle cela ?
Elle a besoin d’une amorce (une extrémité 3’OH), chez l‘ARN polymérase (qui elle n’as pas besoin d’amorce)
comment les nucléotides se lient-ils les uns aux autres ?
En formant une liaison phosphodiester entre leur sucre et groupement phosphate
à quel carbone se lie un phosphate lors d’une liaison phosphodiester ?
au carbone 5’ du sucre correspondant au nucléotide entrant au groupement hydroxyl (OH) lié au carbone 3’ du sucre du dernier nucléotide en place sur la chaine en cours d’élongation
qu’est-ce que l’ADN polymérase ADN dépendante ?
elle synthétise de l’ADN et utilise l’ADN comme matrice
Il existe aussi des ADN polymerase qui sont …. dépendante et elles se nomment….
ADN polymérase ARN dépendante et elles se nomment les reverses transcriptase, (synthétise de l’ADN à partir d’ARN)
La synthétisation a un sens opposé selon le brin qu’elle synthétise, en quoi cela pose-t-il problème ?
Cela engendre une synthèse continue (pas de soucis) et une synthèse discontinue (celle qui ne va pas dans le même sens que la fourche)
Comment fait la synthèse discontinue pour fonctionner ?
elle doit constamment refaire des amorces, elle est donc plus lente que la synthèse continue
quels autres noms portent les synthèses continue et discontinue ?
continue : brin précoce
discontinue : brin tardif
qu’est-ce qu’un fragment Okazaki ?
un bout d’ADN synthétisé contenant une amorce + les nucléotides
Comment les «trous» de la synthèse discontinue sont-ils bouchés à la fin ?
étape 1 : destruction de l’amorce d’Arn; combinaison endonucléase (RNaseH) et exonucléase
étape 2 : élongation de la chaine d’ADN (par l’ADN polymérase)
étape 3 : ligation des deux fragments (par une ligase) par la création d’une liaison phosphodiester, énergie fournie par l’hydrolyse de l’ATP
Qu’est-ce que le replisome complex ?
Une boucle est formée sur le brin discontinue pour donner l’impression aux deux brins qu’ils avancent dans le même sens et ils sont attachés par des «sliding clamp» pour synchroniser leur vitesse par rapport à celle du plus lent
Que se passerait-il si les vitesses de la synthèse des brins ne sont pas synchronisées ?
Au bout d’un moment il y aurait trop d’ADN simple brin -> fragile -> risque
Quelles sont les enzymes de la réplication et quelles sont leur fonction ?
- L’ADN polymérase (adn dépendante) : accroche un nucléotide via le phosphate porté par le nucléotide entrant au niveau du carbone 5’ et de l’accrocher au niveau de l’amorce au carbone 3’ qui porte le groupement OH qui va servir pour faire la liaison phospho-diester
- l’ARN polymérase (ADN dépendante), primase : fait l’amorce ARN-ADN pour que la synthèses d’ADN puisse commencer
- hélicase : elle est chargée d’ouvrir les deux brins (casse liaisons H -> besoin d’énergie -> hydrolyse de l’ATP)
Comment agit l’ADN polymérase ?
l’ADN polymérase, ADN dépendante
Elle accroche un nucléotide via le phosphate porté par le nucléotide entrant au niveau du carbone 5’ et de l’accrocher au niveau de l’amorce au carbone 3’ qui porte le groupement OH qui va servir pour faire la liaison phospho-diester
Comment est faite l’amorce lors de la réplication ?
Complexe primase : l’ARN polymérase fait l’amorce et est directement suivie de l’ADN polymérase qui synthétise l’ADN
Qu’est-ce qui aide à relâcher la tension due aux divers super-enroulement de l’ADN ?
Les topoisomérases
Comment agit la toposisomérase I ?
Elle coupe un des deux brins :
- Détruit une liaison phospho-diester
- Stocke l’énergie libérée par la rupture de cette liaison en recréant une liaison covalente au niveau de la topoisomérase I (elle se lie à l’ADN->peut pas partir) 3. Un déroulement a lieu en avale (au delà) de cette topoisomérase -> libère les tensions
- Rétablit l’intégrité de la molécule d’ADN en refaisant la liaison phosphodiester ; l’énergie est stockée ds la liaison covalente avec la topo1 -> la liaison phosphodiester est rétablie -> topo1 libérée
Pourquoi les topo-isomérase humaines sont-elles la cible de certains agents de chimiothérapie anti-tumorale ?
Par définition : une cellule cancéreuse est une cellule qui se divise beaucoup —> activité topoisomérase extrêmement élevée -> donc c’est un moyen de détruire ces cellules cancéreuses
Que fait la topoisomérase 2 ?
Elle libère deux molécules entrelacées (noeuds) :
- Se fixe au niveau de l’entrelacement
- Se lie de façon covalente aux brins entrelacés
- Besoin d’ATP pour avoir de l’énergie -> elle l’hydrolyse
- Coupe les 2 brins entrelacés
- Défait le noeud
- Re-formation des liaisons phosphodiester
- Topo2 libérée
Comment ne pas perdre les infos qui se trouvent à l’extrémité 3’ du brin qui supporte la synthèse discontinue ?
L’extrémité est allongée :
Allongement fait par la télomérase
Amorce : l’extrémité 3’ OH
Matrice : une molécule d’ARN associée à l’ADN polymérase ( ADN polymérase ARN dépendant —> reverse transcriptase) —> télomérase
Chaque cellule a un stock de télomérase définit, pourquoi ?
—> instaure une horloge, la cellule finit par mourir quand les stocks sont terminés et que les séquences perdues sont des infos important
Une cellule qui ne cesse de se diviser est une cellule destinée à devenir cancéreuse (accumule mutation etc)
Un des moyens pour limiter la réplication des virus est d’enlever les extrémités 3’ (l’amorce), comment ça marche ?
Fabrique des analogues de nucléotides dans lesquels les extrémités 3’ ont été enlevées, puis on les injecte ds l’organisme, le virus ne pourra pas de répliquer car pas d’amorce
On les appelle aussi des terminateur d’élongation
Contre quels virus sont utilisés les analogue de nucléotides (terminateur d’élongation) ?
Contre certains virus herpétiques et contre le SIDA
