Ácidos nucleicos Flashcards
Para el estudio de la secuencia del ADN y la gentoxicidad se hacen procesos de —- y —- del ADN
Desnaturación y renaturación
¿Cuáles son algunos daños exógenos del ADN?
- Radiación ionizante (gamma,x,etc)
- Radiación UV
- Químicos (quemas, humo, cigarrillo)
- Toxinas, biológicos
¿ A qué se refiere que el ADN tiene cadenas antiparalelas y complementarias?
Antiparalelas: tienen orientaciones opuestas, una va de 5’ a 3’ y otra va de 3’ a 5’.
Complementarias: sus nucleótidos son complementarios. A-T y C-G
¿Qué son SSB y DSB?
Single Strand Breaks
Double Strand breaks
¿Cuáles son algunos daños endógenos del ADN?
- Errores en la replicación
- Mal apareamiento de bases
- Topoisomerasas (cortan, desenredan y unen, a veces unen mal)
- ROS (especies reactivas del oxígeno)
- Espontáneos (pq sí)
¿Qué son los SNP sinónimos y no sinónimos?
No sinónimos: el cambio de nucleótido induce cambio en el aminoácido → cambio en proteínas → grandes cambios
Sinónimos: el cambio de nucleótido no induce cambio en el aminoácido
¿ Qué significan las siglas MMR?
Mis-Match Repair
mal apareamiento
repara MSH
¿ Qué significan las siglas NER?
Nucleotide Excision Repair
repara XP
¿Qué enlaces son más fuertes, A-T o C-G?
Los enlaces C-G son más fuertes ya que forman 3 puentes de hidrógeno, en cambio, los enlaces A-T forman 2 puentes.
¿ Qué es alquilación? de un ejemplo
Agentes alquilantes añaden grupos alquilo (etilo o metilo) a las bases nitrogenadas y alteran su patrón de apareamiento parando la replicación.
Uno de los sitios más propensos a la alquilación es el oxígeno del carbono 6 de la guanina, lo cual forma O6-metilguanina, que se aparea de modo incorrecto con la timina y provoca transiciones de un par de bases GC por un par AT.
¿Qué es condensación de grupos?
Es la unión por enlaces covalentes de bases nitrogenadas del mismo grupo.
ejemplo: pirimidina-pirimidina, timina-timina.
¿ Qué significan las siglas BER?
Reparación por incisión de bases
Base Excision Repare
Ejemplo de proteína reparadora: XRCC1
Explique el proceso de transformación desde el ADN hasta el cromosoma
- ADN se une a histonas → nucleosoma (collar de perlas) 4 pares de histonas forman un octámero
- Unión o condensación de varios nucleosomas → fibra de cromatina
- Cromosoma de forma extendida (bucles de la fibra de cromatina) → solenoide
- Plegamiento de la cromatina de orden superior (sección condensada del cromosoma)
- Cromosoma interfásico (que luego se vuelve mitótico en la mitosis)
¿Qué es el SNP?
Polimorfismo de nucleótido único. Single Nucleotide Polymorphism
Son cambios en la secuencia del ADN que afectan una sola base de la secuencia. Ocurren en el 1% de la población
¿De qué lado se agregan más nucleótidos 3’ o 5’?
Sólo se agregan nucleótidos del lado 3’
¿En qué consiste la depurinación de nucleótidos?
Se rompe hidrolíticamente el enlace gluosídico entre la base nitrogenada y la ribosa, dando como producto la base nitrogenada y aparte la ribosa unida al grupo fosfato.
¿Qué es PCR y cuál es su función?
Reacción en Cadena de la Polimerasa
Lee la secuencia de ADN
¿Cómo se le llama a la superorganización del ADN?
Cromosomas
¿Qué factores pueden causar la desnaturación del ADN? (3)
- Calor
- pH
- Sal
¿Cuáles son las 4 alteraciones que puede tener la estructura del ADN?
- Desaminación de las bases nitrogenadas
- Depurinación y depiriminación de los nucleótidos
- Condensación de grupos
- Alquilación
Muchas enzimas requieren de […] para oxidar sus sustratos
FAD+
Los receptores tienen actividad […] intrínseca
enzimática
¿Cómo actúan los receptores intracelulares? ¿cómo deben ser sus ligandos?
A diferencia de los receptores de membrana, se encuentran al interior de la célula, por ello, sus ligandos deben ser liposolubles para atravesar la membrana, ej las hormonas esteroides.
Al llegar el ligando, entran a la célula, lo llevan al núcleo donde regula procesos de transcripción génica.
Cuando GTP activa a la AC, pierde un fosfato y se vuelve a convertir en […]
GDP
Los segundos mensajeros como el AMPc’ y el GMPc’ actúan en las […]
cascadas de señalización
Estructura de la Coenzima A. ¿de qué se deriva?
Se compone de Adenina Difosfato unida a pantotenato y mercaptoetilamina.
Se deriva del pantotenato (ácido pantoténico) o vitamina B5
Cuando la proteína G se activa, GDP se convierte en […] que a su vez activa a la Adenil Ciclasa
GTP
Función del NAD+
Es el donante de la ADP-ribosa el cual regula la señalización, pues puede aumentar o disminuir la producción de AMP
El NAD+ oxida los alcoholes a….. (2)
aldehídos o cetonas
Estructura base de los nucleótidos
- Grupo fosfato (por lo menos uno)
- Base nitrogenada
- Azúcar pentosa (ribosa o desoxiribosa)
Tanto el NAD+ como el FAD+ son importantes en procesos de […]
oxido-reducción
¿Cómo se nombran los nucleótidos? de ejemplos
Igual que nucleósidos más el número de fosfatos
ej: Adenosina monofosfato (AMP), Guanosina difosfato (GDP), deoxiuridina monofosfato (dUMP)
¿Qué enlace forman los grupos fosfato entre ellos?
Enlaces anhídrido o pirofosfato, que son de alta energía, su ruptura está relacionada a la liberación de energía
Función de la Coenzima A
- Transferencia de grupos acilo (CO)
- Componente del Acetil CoA
- Metabolismo de ácidos grasos
¿Cuáles son las pirimidinas? ¿qué las caracteriza?
Son Citosina, Timina y Uracilo.
Tienen un anillo de nitrógeno y 6 carbonos
¿Qué son los nucleósidos? ¿cómo son los nombres de las bases cuando son nucleósidos?
Nucleótidos sin el grupo fosfato.
Adenosina o deoxiadenosina Guanosina o deoxiguanosina Citidina "" Timidina "" Uridina ""
¿Cuáles son las purinas? ¿por qué se caracterizan?
Adenina y Guanina (amparo grisales).
Tienen 2 anillos de nitrógeno y 9 carbonos