Acides Nucleiques Flashcards

1
Q

Différence nucleoside et nucleotide ?

A
Nucleoside = pentose + base 
Nucleotide = nucleoside + phosphate
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Q

Quels sont les bases purines ?

A

Adénine (pas de O)
Guanine

2 cycles insaturés

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3
Q

Quels sont les bases pyrimidines ?

A

Cytosine
Thymine
Uracil

1 cycle

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4
Q

Quel est le rôle d’un des N des bases ?

A

Liaison N-Beta-glycosidique

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5
Q

Différence ARN et ADN ?

A
Ribonucleotides = ARN (AGUC)
Deoxyribonucleotides = ADN (AGTC)
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6
Q

À quelle longueur d’onde absorbent les acides nucléiques ?

A

260 nm

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7
Q

Quelles est la liaison qui assemble les nucleotides ? Quelles sont les extrémités ?

A

Liaisons phosphodiesters

5’ : P
3’ : OH

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8
Q

Qui a découvert la structure de l’ADN ?

A

Watson, crick, Wilkins eeet Rosalind Franklin

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9
Q

Un pas de l’hélice

A

Un pas de l’hélice = 36 Angström -> 10 paire de base

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10
Q

Combien de liaisons hydrogènes entre chaque bases ?

A

AT - 2

GC - 3

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11
Q

Donnez deux conditions dénaturantes :

A

Modification du pH
Augmentation de la température

Réversible

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12
Q

Chromatine

A

Association d’ADN et de protéines(«collier de perles»)

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13
Q

Nucleosome :

A

Unité de base de la chromatine
8 histones
146 paires de bases

-> protection et 1er niveau de compaction de l’ADN

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14
Q

Comment se compacte l’ADN ?

A
Double hélice 
Chromatine 
Nucléosome 
Fibre de 30 nm par association histone 1 
Boucle 
Rosette (6boucles)
Super enroulement (30 rosettes) 

Chromosomes compaction x10000

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15
Q

Topo-isomères

A

Molécules d’ADN ne différant que par le nombre d’enlacements

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16
Q

ADN topo-isomérases :

A

Enzymes contrôlant la structure topo de l’ADN par coupures transitoires et catalysant le passage des segments dADN à travers ses coupures

17
Q

Plasmide

A

Molécule d’ADN surnuméraire (généralement circulaire) distincte de l’ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la bactérie.

18
Q

Gène

A

Séquence d’ADN qui spécifie la synthèse d’une chaîne polypeptidique ou d’un ARN fonctionnel

19
Q

Génome

A

Ensemble du matériel génétique d’une espèce

20
Q

Génotypes

A

Ensemble des gènes d’un individu

21
Q

Phénotype

A

Somme des caractères morphologiques, physiologique et comportementaux d’un individu qui sont discernables de l’extérieur

22
Q

Séquences régulatrices

A

Commandent ou et quand les gènes sont activés

23
Q

Gêne mosaïque

A

Gêne contenant un ou plusieurs introns.

24
Q

Donnez les différentes altérations de l’ADN et leur cause

A

Cassure double brin : rayonnements
Dimère de thymine : UV
Pontage interbrin : Agents alkylants/pontants
Cassure simple brin : rayonnements
Pontage intrabrin : Agents pontants
Addition d’un groupe : Agents alkylants
Perte de base : lyse spontanée
Erreur de réplication : Agents intercalants ou erreurs physiologiques
Bases modifiées : Analogue de bases, stress oxydatif, deamination/depurinarion

25
Causes physiques d’altérations ?
Chaleur Rayonnement UV Radioactivité
26
Causes physiologiques d’altération
Erreur de réplication, stress oxydatif, deamination, depurination
27
Causes chimiques d’altérations
``` Agents alkylants (dimethylnitrosamine) Agents pontants (cisplatine) Agents intercalants (doxorubicine) Analogue de bases (gemcitabine, pentostatine) ```
28
Déamination
Perte groupement amine d’une base. Corrigé par excision amine. ``` La plus courante 100/j/cellule : Cytosine -> Uracile Autre: Adénine -> Hypoxanthine Guanine -> Xanthine ``` Agents favorisants : Nitrite de sodium, Nitrate de sodium, nitrosamine
29
Depurination
Perte d’une purine Guanosine ou Adénosine Remplacer par n’importe quelle base si pas corrigée 10 000/j/cellule
30
Agents alkylants
addition d’un groupe ou pontage interbrins Guanine -> O-methylguanine Ex: dimethylsulfate Nitrogen mustard Dimethylnitrosamine S-Adenosylmethionine
31
Que peut causer la methylation d’une guanine?
Mutation car se lié avec T et non C
32
Quels sont les caractéristiques de la methylation ?
Methylation des A et des C Phénomène peut être physiologique Phénomène réversible Transmission au cours des divisions cellulaires
33
Que permet la methylation?
Repérage des agents infectieux Réparation des erreurs de réplication (L’ADN neosynthétisé n’est pas méthylé) Régulation de l’expression des gènes
34
Donnez les 4 étapes de la réparation de l’ADN
* Détection de l’ADN endommagé * Excision (nuclease) de la base ou nucleotide * synthèse (polymérase) * ligation (ligase)
35
Réparation directe ?
Par DNA methyltransferase | O-methylguanine -> Guanine
36
Nucléases
Coupure des liaisons phosphodiesters Ribonucleases ARNase Désoxy-ribonuclease ADNase Endonuclease : attaque au milieu de la chaîne Exonuclease : Attaque des nucleotides aux extrémités
37
Enzyme de restriction
Nuclease visant un site de restriction précis généralement palindromique