Acides Nucleiques Flashcards
Différence nucleoside et nucleotide ?
Nucleoside = pentose + base Nucleotide = nucleoside + phosphate
Quels sont les bases purines ?
Adénine (pas de O)
Guanine
2 cycles insaturés
Quels sont les bases pyrimidines ?
Cytosine
Thymine
Uracil
1 cycle
Quel est le rôle d’un des N des bases ?
Liaison N-Beta-glycosidique
Différence ARN et ADN ?
Ribonucleotides = ARN (AGUC) Deoxyribonucleotides = ADN (AGTC)
À quelle longueur d’onde absorbent les acides nucléiques ?
260 nm
Quelles est la liaison qui assemble les nucleotides ? Quelles sont les extrémités ?
Liaisons phosphodiesters
5’ : P
3’ : OH
Qui a découvert la structure de l’ADN ?
Watson, crick, Wilkins eeet Rosalind Franklin
Un pas de l’hélice
Un pas de l’hélice = 36 Angström -> 10 paire de base
Combien de liaisons hydrogènes entre chaque bases ?
AT - 2
GC - 3
Donnez deux conditions dénaturantes :
Modification du pH
Augmentation de la température
Réversible
Chromatine
Association d’ADN et de protéines(«collier de perles»)
Nucleosome :
Unité de base de la chromatine
8 histones
146 paires de bases
-> protection et 1er niveau de compaction de l’ADN
Comment se compacte l’ADN ?
Double hélice Chromatine Nucléosome Fibre de 30 nm par association histone 1 Boucle Rosette (6boucles) Super enroulement (30 rosettes)
Chromosomes compaction x10000
Topo-isomères
Molécules d’ADN ne différant que par le nombre d’enlacements
ADN topo-isomérases :
Enzymes contrôlant la structure topo de l’ADN par coupures transitoires et catalysant le passage des segments dADN à travers ses coupures
Plasmide
Molécule d’ADN surnuméraire (généralement circulaire) distincte de l’ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la bactérie.
Gène
Séquence d’ADN qui spécifie la synthèse d’une chaîne polypeptidique ou d’un ARN fonctionnel
Génome
Ensemble du matériel génétique d’une espèce
Génotypes
Ensemble des gènes d’un individu
Phénotype
Somme des caractères morphologiques, physiologique et comportementaux d’un individu qui sont discernables de l’extérieur
Séquences régulatrices
Commandent ou et quand les gènes sont activés
Gêne mosaïque
Gêne contenant un ou plusieurs introns.
Donnez les différentes altérations de l’ADN et leur cause
Cassure double brin : rayonnements
Dimère de thymine : UV
Pontage interbrin : Agents alkylants/pontants
Cassure simple brin : rayonnements
Pontage intrabrin : Agents pontants
Addition d’un groupe : Agents alkylants
Perte de base : lyse spontanée
Erreur de réplication : Agents intercalants ou erreurs physiologiques
Bases modifiées : Analogue de bases, stress oxydatif, deamination/depurinarion
Causes physiques d’altérations ?
Chaleur
Rayonnement
UV
Radioactivité
Causes physiologiques d’altération
Erreur de réplication, stress oxydatif, deamination, depurination
Causes chimiques d’altérations
Agents alkylants (dimethylnitrosamine) Agents pontants (cisplatine) Agents intercalants (doxorubicine) Analogue de bases (gemcitabine, pentostatine)
Déamination
Perte groupement amine d’une base. Corrigé par excision amine.
La plus courante 100/j/cellule : Cytosine -> Uracile Autre: Adénine -> Hypoxanthine Guanine -> Xanthine
Agents favorisants : Nitrite de sodium, Nitrate de sodium, nitrosamine
Depurination
Perte d’une purine Guanosine ou Adénosine
Remplacer par n’importe quelle base si pas corrigée
10 000/j/cellule
Agents alkylants
addition d’un groupe ou pontage interbrins
Guanine -> O-methylguanine
Ex: dimethylsulfate
Nitrogen mustard
Dimethylnitrosamine
S-Adenosylmethionine
Que peut causer la methylation d’une guanine?
Mutation car se lié avec T et non C
Quels sont les caractéristiques de la methylation ?
Methylation des A et des C
Phénomène peut être physiologique
Phénomène réversible
Transmission au cours des divisions cellulaires
Que permet la methylation?
Repérage des agents infectieux
Réparation des erreurs de réplication (L’ADN neosynthétisé n’est pas méthylé)
Régulation de l’expression des gènes
Donnez les 4 étapes de la réparation de l’ADN
- Détection de l’ADN endommagé
- Excision (nuclease) de la base ou nucleotide
- synthèse (polymérase)
- ligation (ligase)
Réparation directe ?
Par DNA methyltransferase
O-methylguanine -> Guanine
Nucléases
Coupure des liaisons phosphodiesters
Ribonucleases ARNase
Désoxy-ribonuclease ADNase
Endonuclease : attaque au milieu de la chaîne
Exonuclease : Attaque des nucleotides aux extrémités
Enzyme de restriction
Nuclease visant un site de restriction précis généralement palindromique