Acides Nucleiques Flashcards

1
Q

Différence nucleoside et nucleotide ?

A
Nucleoside = pentose + base 
Nucleotide = nucleoside + phosphate
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Q

Quels sont les bases purines ?

A

Adénine (pas de O)
Guanine

2 cycles insaturés

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3
Q

Quels sont les bases pyrimidines ?

A

Cytosine
Thymine
Uracil

1 cycle

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4
Q

Quel est le rôle d’un des N des bases ?

A

Liaison N-Beta-glycosidique

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5
Q

Différence ARN et ADN ?

A
Ribonucleotides = ARN (AGUC)
Deoxyribonucleotides = ADN (AGTC)
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6
Q

À quelle longueur d’onde absorbent les acides nucléiques ?

A

260 nm

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7
Q

Quelles est la liaison qui assemble les nucleotides ? Quelles sont les extrémités ?

A

Liaisons phosphodiesters

5’ : P
3’ : OH

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8
Q

Qui a découvert la structure de l’ADN ?

A

Watson, crick, Wilkins eeet Rosalind Franklin

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9
Q

Un pas de l’hélice

A

Un pas de l’hélice = 36 Angström -> 10 paire de base

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10
Q

Combien de liaisons hydrogènes entre chaque bases ?

A

AT - 2

GC - 3

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11
Q

Donnez deux conditions dénaturantes :

A

Modification du pH
Augmentation de la température

Réversible

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12
Q

Chromatine

A

Association d’ADN et de protéines(«collier de perles»)

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13
Q

Nucleosome :

A

Unité de base de la chromatine
8 histones
146 paires de bases

-> protection et 1er niveau de compaction de l’ADN

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14
Q

Comment se compacte l’ADN ?

A
Double hélice 
Chromatine 
Nucléosome 
Fibre de 30 nm par association histone 1 
Boucle 
Rosette (6boucles)
Super enroulement (30 rosettes) 

Chromosomes compaction x10000

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15
Q

Topo-isomères

A

Molécules d’ADN ne différant que par le nombre d’enlacements

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16
Q

ADN topo-isomérases :

A

Enzymes contrôlant la structure topo de l’ADN par coupures transitoires et catalysant le passage des segments dADN à travers ses coupures

17
Q

Plasmide

A

Molécule d’ADN surnuméraire (généralement circulaire) distincte de l’ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la bactérie.

18
Q

Gène

A

Séquence d’ADN qui spécifie la synthèse d’une chaîne polypeptidique ou d’un ARN fonctionnel

19
Q

Génome

A

Ensemble du matériel génétique d’une espèce

20
Q

Génotypes

A

Ensemble des gènes d’un individu

21
Q

Phénotype

A

Somme des caractères morphologiques, physiologique et comportementaux d’un individu qui sont discernables de l’extérieur

22
Q

Séquences régulatrices

A

Commandent ou et quand les gènes sont activés

23
Q

Gêne mosaïque

A

Gêne contenant un ou plusieurs introns.

24
Q

Donnez les différentes altérations de l’ADN et leur cause

A

Cassure double brin : rayonnements
Dimère de thymine : UV
Pontage interbrin : Agents alkylants/pontants
Cassure simple brin : rayonnements
Pontage intrabrin : Agents pontants
Addition d’un groupe : Agents alkylants
Perte de base : lyse spontanée
Erreur de réplication : Agents intercalants ou erreurs physiologiques
Bases modifiées : Analogue de bases, stress oxydatif, deamination/depurinarion

25
Q

Causes physiques d’altérations ?

A

Chaleur
Rayonnement
UV
Radioactivité

26
Q

Causes physiologiques d’altération

A

Erreur de réplication, stress oxydatif, deamination, depurination

27
Q

Causes chimiques d’altérations

A
Agents alkylants (dimethylnitrosamine)
Agents pontants (cisplatine)
Agents intercalants (doxorubicine)
Analogue de bases (gemcitabine, pentostatine)
28
Q

Déamination

A

Perte groupement amine d’une base. Corrigé par excision amine.

La plus courante 100/j/cellule :
Cytosine -> Uracile 
Autre:
Adénine -> Hypoxanthine 
Guanine -> Xanthine

Agents favorisants : Nitrite de sodium, Nitrate de sodium, nitrosamine

29
Q

Depurination

A

Perte d’une purine Guanosine ou Adénosine

Remplacer par n’importe quelle base si pas corrigée

10 000/j/cellule

30
Q

Agents alkylants

A

addition d’un groupe ou pontage interbrins

Guanine -> O-methylguanine

Ex: dimethylsulfate
Nitrogen mustard
Dimethylnitrosamine
S-Adenosylmethionine

31
Q

Que peut causer la methylation d’une guanine?

A

Mutation car se lié avec T et non C

32
Q

Quels sont les caractéristiques de la methylation ?

A

Methylation des A et des C
Phénomène peut être physiologique
Phénomène réversible
Transmission au cours des divisions cellulaires

33
Q

Que permet la methylation?

A

Repérage des agents infectieux
Réparation des erreurs de réplication (L’ADN neosynthétisé n’est pas méthylé)
Régulation de l’expression des gènes

34
Q

Donnez les 4 étapes de la réparation de l’ADN

A
  • Détection de l’ADN endommagé
  • Excision (nuclease) de la base ou nucleotide
  • synthèse (polymérase)
  • ligation (ligase)
35
Q

Réparation directe ?

A

Par DNA methyltransferase

O-methylguanine -> Guanine

36
Q

Nucléases

A

Coupure des liaisons phosphodiesters

Ribonucleases ARNase
Désoxy-ribonuclease ADNase

Endonuclease : attaque au milieu de la chaîne
Exonuclease : Attaque des nucleotides aux extrémités

37
Q

Enzyme de restriction

A

Nuclease visant un site de restriction précis généralement palindromique