Acides nucléiques Flashcards by Iliana Triai

Qu’est-ce qu’un acide nucléique ?

Un polymère de nucléotides impliqué dans le stockage et la transmission de l’information génétique.

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Quels sont les deux types d’acides nucléiques ?

L’ADN et l’ARN.

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Quels sont les précurseurs des acides nucléiques ?

Les nucléotides.

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Quels sont les trois composants d’un nucléotide ?

Une base azotée, un sucre (ribose ou désoxyribose) et un phosphate.

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Dans quel sens s’effectue la synthèse des acides nucléiques ?

Toujours de 5’ vers 3’.

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Quelle extrémité d’un acide nucléique possède un groupement phosphate libre ?

L’extrémité 5’.

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Pourquoi les nucléotides doivent-ils être sous forme triphosphorylée avant d’être incorporés dans un acide nucléique ?

Pour fournir l’énergie nécessaire à la polymérisation.

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Comment sont reliés les nucléotides entre eux dans la structure de l’ADN ?

Par des liaisons phosphodiester entre le carbone 3’ d’un nucléotide et le phosphate en 5’ du suivant.

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Quelle est la structure de l’ADN ?

Une double hélice formée de deux brins antiparallèles.

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Pourquoi les régions riches en AT se dénaturent-elles plus facilement que les régions riches en GC ?

Parce que les paires A-T ont seulement 2 liaisons hydrogène contre 3 pour G-C.

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Quels sont les trois conformations possibles de l’ADN ?

ADN B (forme classique), ADN A (plus compact), ADN Z (hélice gauche en zigzag).

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Qu’est-ce que la température de fusion (Tm) de l’ADN ?

La température à laquelle l’ADN est dénaturé (passage d’un double brin à un simple brin).

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Quels sont les principaux types d’ARN ?

ARN messager (ARNm), ARN de transfert (ARNt), ARN ribosomal (ARNr), ARN non codants (ARNnc).

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Quel ARN transporte les acides aminés pendant la traduction ?

L’ARN de transfert (ARNt).

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Quel ARN sert de matrice pour la synthèse des protéines ?

L’ARN messager (ARNm).

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Quel ARN constitue les ribosomes ?

L’ARN ribosomal (ARNr).

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Quels ARN sont impliqués dans la maturation des ARNm ?

Les ARNsn (small nuclear RNA) qui participent à l’épissage.

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Quel ARN est impliqué dans la régulation de l’expression des gènes ?

Les micro-ARN (miARN).

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Quelle est la structure caractéristique de l’ARNt ?

Une structure en trèfle avec un anticodon et un site de liaison à un acide aminé.

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Quel est le rôle de l’anticodon ?

Il permet la reconnaissance spécifique du codon sur l’ARNm par l’ARNt.

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À quelle extrémité l’acide aminé est-il fixé sur l’ARNt ?

À l’extrémité 3’.

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Quels sont les trois sites du ribosome impliqués dans la traduction ?

Site A (entrée de l’ARNt), site P (formation de la liaison peptidique), site E (sortie de l’ARNt déchargé).

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Quelle molécule fournit l’énergie nécessaire à la traduction ?

Le GTP.

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Quels sont les éléments ajoutés à un ARNm mature ?

Une coiffe en 5’ et une queue polyA en 3’.

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Quel est le rôle de l'épissage ?

Éliminer les introns et assembler les exons pour produire un ARNm fonctionnel.

Qu'est-ce que l'épissage alternatif ?

Un processus permettant de produire plusieurs protéines différentes à partir d'un même gène.

Quels sont les deux types de nucléases et leurs rôles ?

Exonucléases : coupent les extrémités des acides nucléiques.

Endonucléases : coupent au milieu des chaînes d'ADN ou d'ARN.

Quelle technique permet de séparer les fragments d'ADN selon leur taille ?

L'électrophorèse sur gel d'agarose.

Quel composé est souvent utilisé pour révéler les acides nucléiques sur un gel ?

Le bromure d'éthidium (ou SYBR Safe).

Pourquoi l'ADN et l'ARN migrent-ils vers l'anode (+) lors d'une électrophorèse ?

Parce qu'ils sont chargés négativement à cause des groupements phosphate.

Qu'est-ce que la loi de Beer-Lambert appliquée aux acides nucléiques ?

Une relation entre l'absorbance et la concentration en ADN/ARN (ex : 1 DO = 50 ng/µL d'ADN double brin).

Qu'est-ce que la régulation des gènes ?

C'est l'ensemble des mécanismes qui contrôlent l'expression des gènes afin d'adapter la production de protéines aux besoins de la cellule.

Qu'est-ce qu'une région auto-complémentaire ?

Une séquence d'un brin d'ARN qui peut s'apparier avec elle-même par complémentarité des bases, formant ainsi des structures secondaires comme des épingles à cheveux.

Pourquoi les régions auto-complémentaires sont-elles importantes ?

Elles permettent la formation de structures tridimensionnelles complexes nécessaires à la fonction de nombreux ARN, comme les ARNt, ARNr et certains miARN.

Quel est le rôle de l'acide aminé chez l'ARNt ?

L'acide aminé est fixé à l'extrémité 3' de l'ARNt et est transporté jusqu'au ribosome pour être incorporé dans une protéine lors de la traduction.

Comment l'ARNt reconnaît-il le bon codon sur l'ARNm ?

Grâce à son anticodon, une séquence de trois nucléotides complémentaire au codon correspondant sur l'ARN messager.

Qu'est-ce qu'un cluster d'ARNr ?

Un groupe de gènes codant pour les ARN ribosomaux, organisés en répétitions multiples dans le génome pour permettre une forte production d'ARNr.

Pourquoi les gènes codant pour les ARNr sont-ils organisés en clusters ?

Parce que les cellules ont besoin de beaucoup de ribosomes pour assurer la synthèse des protéines. Cette organisation en copies multiples permet une transcription efficace et rapide.

Combien de clusters d'ARNr possède le génome humain ?

Environ 10 clusters, chacun contenant environ 50 répétitions d'unités de transcription.

Quels sont les trois types d'ARNr contenus dans chaque unité de transcription ?

18S, 5.8S et 28S, qui sont transcrits ensemble à partir d'un même précurseur.

Qu'est-ce que l'IGS (Intergenic Spacer) dans un cluster d'ARNr ?

Une séquence non codante située entre les unités répétées, qui peut jouer un rôle dans la régulation de la transcription des ARNr.

Qu'est-ce que le TS (Transcription Spacer) dans un cluster d'ARNr ?

Une région située entre les différents ARNr dans une unité de transcription, impliquée dans leur maturation après transcription.

Qu'est-ce que l'épigénétique ?

L'épigénétique est l'ensemble des modifications héréditaires et réversibles de l'expression des gènes qui ne modifient pas la séquence de l'ADN.

Donne la forme d'un ribose et d'un désoxyribose

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Donne la forme d'un noyau d'une base purique et d'un noyau d'une base pyrimidique

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Comment nommer un nucléotides ?

∅ ou (d)

A, T, C ou G

MP, DP ou TP

Quelle est la masse d'un désoryribose ?

340g/mol environ

Quelle est la masse d'un ribose

500g/mol environ

De quoi dépend la charge de l'ADN et de l'ARN ?

Adn : dépend uniquement des phosphates du squelette ribose-phosphate

Arn : dépend des phosphates du squelette ribose-phosphate et des bases azotées

Comment varie la solubilité de l'ADN et de l'ARN selon le pH du solvant (et la nature du solvant) ex : extraction phénol-chloroforme ?

A pH neutre à légèrement basique : ADN et ARN sont solubles dans une phase aqueuse

A pH acide : ADN migre vers la phase organique et dans l'interphase, tandis que ARN reste dans la phase aqueuse.

Comment sont organisés les nucléotides dans l'ADN ?

Les bases sont à l'intérieur de l'hélice, les phosphates et les désoxyriboses sont à l'extérieur.

Quel est le diamètre d'une hélice ?

Entre 20-34 A

Que représente un pas d'hélice ?

10 nucléotides

Qu'influence la conformation de l'ADN ?

- La régulation de l'expression des gènes

- L'organisation du génome

- L'intégrité du génome

De quoi dépend la conformation de l'ADN ?

- De la séquence nucléotidique (purine-purine, pyrimidine-pyrimidine, purine-pyrimidine, pyrimidine-purine)

- Des modifications chimiques des nucléotides (épigénétique), surtout les cytosines (de l'ADN et de l'ARN)

Qu'est-ce qu'une hybridation ?

Processus au cours duquel les régions auto-complémentaires s'apparient.

Qu'est-ce qu'un codon ?

Triplet de nucléotides dans la séquence de l'ARNm. Chaque codon correspond à un acide aminé ou à un signal d'arrêt de la traduction.

Qu'est-ce que les IGS ?

Intergenic Spacer : Séquences intergéniques entre les unités répétées.

Qu'est-ce que les TS

TS (Transcription Spacer) : Région entre les unités de transcription qui joue un rôle dans leur régulation.

De quoi sont composés les ribosomes ?

- Grande sous-unité : Environ 50 protéines.

- Petite sous-unité : Environ 33 protéines.

Quel est le sens de lecture d'un brin d'ADN ?

3' vers 5'

Qu'est-ce q'une séquence promotrice ?

ATG : Premier codon de la séquence codante (initie la synthèse de la protéine).

Qu'est-ce que des exons et des introns ?

Exons : Segments codants d'un gène contenant les informations nécessaires à la synthèse des protéines. Ils sont conservés dans l'ARNm mature après épissage.

Introns : Segments non codants éliminés de l'ARN pré-messager (pré-ARNm) au cours de l'épissage.

Qu'est-ce qu'un site de polyadénylation ?

Site dans le dernier exon et reconnu par la poly(A) polymérase pour ajouter une queue polyA.

Quel est le complexe enzymatique qui clive les introns ?

Le spiceosome