Acides nucléiques Flashcards
Les acides nucléiques sont des polymères de ________.
nucléotides
Un nucléotide est composé de quoi?
1 Sucre à 5 carbones (ribose ou desoxyribose)
1 Phosphate
1 Base (purines ou pyrimidines)
Un nucléoside est composé de quoi?
1Sucre
1 Base
PAS DE PHOSPHATE
Les riboses et les désoxyriboses des nucléotides sont les sucres, bases ou phosphates?
Sucres
Quoi la différence structurelle entre le ribose et le désoxyribose?
La présence (ribose) ou non (désoxyribose) d’un OH sur le carbone 2
Quoi les 2 purines?
Adenine
Guanine
Quoi les 3 pyrimidines?
Cytosine
Uracil/Thymine
Vrai ou faux
Les purines sont plus grosses que les pyrimidines?
Vrai
Ils sont deux cycles, alors que les pyrimidines en ont qu’un seul
Vrai ou faux
La thymine est retrouvé dans les ARN
Faux
Ce sont les uracils qui sont retrouvés dans les ARN
Comment s’appelle les liens entre les bases azotés et les sucres d’un nucléotides?
Lien BetaN glycosidiques
Quel azote de la purine se lie avec quel carbone du sucre dans un lien glycosidique?
N9 de la purine avec C1 du sucre
Quel azote de la pyrimidine se lie avec quel carbone du sucre dans un lien glycosidique?
N1 de la pyrimidine avec le C1 du sucre
La liaison phosphodiester entre deux nucléotides se fait entre quoi et quoi?
Entre le groupe phosphate et le carbone 3 du sucre
(C3)—- OH OH —–(P)
——»
——O—— + H2O
Comment appelle-t-on la liaison entre 2 phosphates?
Une liaison phospho-anhydride
Permettent d’emmagasiner de l’É pour lier ensuite deux nucléotides ensembles
Quoi la terminaison des noms des nucléoTides selon la nomenclature?
…ate
Quoi la terminaison des noms des nucléoSides selon la nomenclature?
…ine
Vrai ou faux
Il existe des nucléoSides appelé Thymidine et desoxythymidine
Vrai
Il n’existe pas de desoxyuridine?
Vrai
Uracile –» ARN –» RIBOSE, pas de désoxyribose
Comment faire pour nommer une structure avec seulement sa structure (schema de la molécule)?
- Nucléoside ou nucléotide? –» DÉpend de la présence ou non de phosphate (NucéoSide –» …ine, NucléoTide –» …ate)
- ADN ou ARN?
Dépend de la présence ou non de OH ou le carbone 2 du sucre. - Quoi l abase azotés
Quelle structure des nucléotides sont les unités de reconnaissance?
Les bases
Que sont les nucléotides cycliques?
DEs messagers intracellulaire et des régulateurs du métabolisme cellulaire et de la reproduction
Quels sont les rôles de…
ATP
GTP
CTP
UTP
Adénine…, Guanosine…, Cytosine… et Uracil…
… tri-phosphate
ATP = É par excellence
GTP = Participe à la synthèse des protéines
CTP = Participe à la synthèse des lipides
UTP = impliqué dans le métabolisme des glucides
Quel protéine est la plus stable?
Protéine 1 avec un ratio C/G de 40% et A/T de 60%
Protéine 2 avec un ration C/G de 80% et A/T de 20%?
Pourquoi?
Protéine 2 est plus stable, car sa proportion de C/G est plus grande, et que la liaison C-G, contrairement à liaison A-T, possèdent pas moins de 3 liaisons H, vs 2 liaisons H
Lorsqu’on parle d’orientation 5’ et 3’, dequoi on parle?
Extrémité 1 du carbone 5 du sucre –» Phosphate
Extrémité 2 du carbone 3 du sucre essentiellement
L’ADN se lie toujours de ….
5’ (phosphate) à 3’ (sucre)
Vrai ou faux
Il y a toujours une association entre une purine et une pyrimidine?
Vrai
Vrai ou faux
Bases azotés sont toujours perpendiculaire à l’hélice d’ADN?
Vrai
Le sens de la polymérisation d’une double hélice se fait de _____ à _____.
5’ à 3’
Dans une double hélice, les ADNss (ADN _____ brin) sont associés de manière _______.
Dans une double hélice, les ADNss (ADN simple brin) sont associés de manière antiparallèle.
Vrai ou faux
Les brins complémentaire d’un simple brin peuvent servir de matrice l’un pour l’autre
VRAI
Qu’est-ce qui engendre la torsion de la double hélice?
Le noyau hydrophobes que sont les bases, orienté perpendiculaires aux montants
Quelles sont les 4 forces stabilisants la double hélice?
Où sont chacune de ses forces?
Force hydrophobe (bases au centre)
Force de Van de Waals (entre les bases, empilement
Liaisons hydrogènes entre les bases complémentaires
Intéractions électrostatiques entre les groupes phosphates et Mg ou protéines cationiques.
Qu’est-ce que la dénaturation de l’ADN?
Détorsion complète d’une double hélice suivie de la séparation des 2 brins
Ce serait quoi par exemple 2 agents dénaturants IN VIVO?
IN VIVO = dans le vivant
Réplication et transcription
Ce serait quoi par exemple 2 agents dénaturants IN VITRO?
IN VITRO = en dehors du milieu naturel
1. Augmentation de la température –» désappariement des bases (bris des liaisons H entre les bases complétaires)
2. Agents chaotropiques = urée ou chlorure de guanidium
Dans une double hélice, qu’est-ce qui va faire que ta courbe de température de dénaturation va se déplacer vers la droite (donc que ta température nécessaire pour défaire ta double hélice va augmentée?)
La proportion de lien G-C ou C-G, puisqu’ils sont liés ensemble par 3 ponts H, contraitement à A-T ou A-U qui sont liés par 2 ponts H
Plus tu as de G-C, plus tu es solide, plus tu à une température de dénaturation élevée
Vrai ou faux
L’ADNdb (double brin) est hyperchromique tandis que l’ADNsb (simple brin) est chromique?
Faux
L’inverse
Simple Brin = hyperchromique –» exposé bcp plus –» peut capter plus de lumière
Double brin = chromique
Quelles sont les 3 conformations de l’ADN double brins? Laquelle est la plus tordue et laquelle est la moins tordue?
A –» + tordu (+ serrée) –» base plus difficile à lire pour les protéines
B –» NORMALE
Z –» - tordue (+ lache)–» bases plus facile à lire pour les protéines
Quoi les 3 types d’ADN
-» ADN génomique
-» ADN mitochondrial
-» ADN chloroplaste
Quoi une épingle à cheveux?
À quoi ca sert?
Une struture secondaire d’un polynucléotides monocaténaires dans laquelle une séquence répétée inversée de bases complémentaires s’apparient de manière anti-parallèle.
Permet d’augmenter la stabilité du brin et donc d’éviter sa dégradation
Qu’est-ce qu’un duplex sur un ARN?
Un appariement d’un brin monocaténaires en une régiosn bicaténaires
Comme une petite région local de double hélice
Aussi appelé une Épingle à cheveux
Quoi les 4 principaux ARN?
Lequel est le principal?
- ARNr (80%) –»le plus répendu
- ARNt (15 %)
- ARNm (3 %)
- snRNA (activités catalytiques, maturations des grands ARN)
La condensation de l’ADN chez les eucaryotes permettent de rapetisser de combien?
100 000 fois plus petit
Vrai ou faux
Durant les 3 stades de l’ADN en interphase, il est toujours possible de lire l’ADN?
Vrai
Le lecture d’ADN est possible à tout moment durant l’interphase
Quoi les 3 stades de compression de L’ADN nucléaire en interphase?
- Collier de perle
- Solénoïde
- Boucle de chromatine
Pourquoi est-ce que les histones sont un choix parfait pour condenser l’ADN en nucléosome?
Parce que les histones sont riches en Lysine et en arginine, des aa basiques à charge positive, ce qui permet de neutraliser les phosphates 5’ de l’ADN et donc permet de lier l’ADN et de la condenser
Quoi les 5 types d’histone?
H1
H2A
H2B
H3
H4
Quoi la composition en histone d’un nucléosome?
2 x H2A
2 x H2B
2 x H3
2 x H4
4 paires = 8 histones
1 x H1 –» agit comme une épingle pour garder l’ADN enroulé sur le nucléosome
Quelle est l’histone la plus grande?
La H1 –» logique c’est l’épingle pour tout tenir en place
Elle vient coincé le double enroulement d’ADN sur l’octamère d’histone
Combien y-t-il de nucléosome par tour dans un solénoïde?
6 nucléosomes par tour
Le stade solénoïde de compression de l’ADN est = à quoi?
= la chromatine (Flemming)
Vrai ou faux
Le 3e stade de compression de l’ADN nucléaire à l’interphase sont des boucles de chromatine associés à des protéines histoniques?
Faux
Associés à des protéines
NON-histoniques?
Vrai ou faux
L’ADN des bactéries et des archéobactéries est associés à des protéines histoniques égalements
FAUX
BActéries ont même pas de noyau, y’auront pas d’histone non-plus
Vrai ou faux
Dans les solénoïdes, le histone H1 se retrouvent au centre?
Vrai
