Acide aminé Flashcards
1
Q
impact du pH sur la charge de l’acide aminé
A
pH > pHi => charge —
pH < pHi => charge +
2
Q
liaisons non covalentes
A
- hydrogène
- hydrophobe
- Ionique
3
Q
liaisons covalentes
A
- pont disulfure (entre 2 Cys)
- peptidique (plane, composé de 6 atomes)
4
Q
peptide
A
2 aa
5
Q
polypeptide
A
moins de 50 aa
6
Q
protéine
A
plus de 50 aa
7
Q
propriété physoco-chimique des peptides
A
- chargées
- amphotère
- absorbe les UV entre 180 et 230 nm (grâce à la liaison peptidique et double liaison partielle)
- réaction de Biuret : CuSO4 en milieu alcalin donne un complexe violet avec las AA libres (absorbe 535 nm)
8
Q
caractéristique hélice alpha
A
- enroulée
- squelette carboné avec carbones à l’intérieur et radicaux à l’extérieur
- tourne majoritairement à droite (peut être gauche en présence de proline et glycine)
- 3,6 aa par tour
- 1,5 A°de hauteur entre 2 aa successifs
- 5,4 A° par tour
- 100° entre 2 aa successifs
- liaison H stabilisent le tout
entre un CO et NH d’un AA n+4
(parallèles à l’axe de l’hélice)
9
Q
caractéristiques feuillet bêta
A
- plusieurs brins bêta (chaînes polypeptidiques)
- alternance au dessus en dessous du plan au sein des brins
- 7A° entre 2 chaînes lalérales
- brins antiparallèles ou parallèles
- liaisons hydrogènes inter-chaines
- stabilisés par des interactions hydrophobes
10
Q
feuillet bêta parallèle
A
- NH du brin 1 connecté au CO de l’AA n du brin 2
- CO du brin 1 connecté au NH de l’AA n+2 du brin 2
(pas très stable)
11
Q
feuillet bêta antiparallèle
A
- NH du brin 1 connecté au CO du brin 2
- CO du brin 1 connecté au NH du même aa du brin 2
(très stable)
12
Q
différents coudes
A
- α : 4 liaisons peptidiques, 3 résidus
- β : 3 liaisons peptidiques, 2 résidus (+ fréquent)
- γ : 2 liaisons peptidiques, 1 résidus
- δ : 1 liaison peptidique, directement connecté
- π : 5 liaisons peptidiques, 4 résidus
13
Q
CATH
A
4 niveaux de classification structurale de domaines
(Class Architecture Topology Homologous)
