Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Mikrobiologi For Biologer > 7) Virus > Flashcards

7) Virus Flashcards

1
Q

Hvad hedder viras ekstracellulære form?

A

Virion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hvordan er vironer opbygget?

A

De har en kapsid - en protein skal

Kapsiden indeholder genomet

De fleste virioner/viruser er nøgne uden yderligere lag.

Mange dyrevira har dog en envelope med proteiner i udenpå kapsiden - et dobbelt fosfolipidlag snuppet fra værtscellens membran.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hvad er nucleocapsidet?

A

Kapsiden og nicleinsyrene i en enveloped virus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hvilke former for viral infektion kan ske?

A

Lytisk infektion - cellens metabolisme omprogrammeres fra at have fokus på vækst til fokus på virus replikering og sammensætning af nye virioner.

Lysogenisk infektion - cellen ødelægges ikke. Virus henomet bliver en del sf cellens genom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hvilke typer virus genom er det?

A

ssDNA
dsDNA

ssRNA
dsRNA

RNA og DNA men på forskellige tidspunkter i livscyklussen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvad er kapsiden bygget af?

A

Proteiner kaldet kapsomer der optræder i et repetitivt mønster

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvor er der flere enveloped vira blandt dem der angriber dureceller end dem der angriber planteceller og bakterier?

A

Fordi dyrecellerne har deres CM direkte eksponeret overfor omgivelserne i modsætning til planteceller og bakterier der er beskyttet af en cellevæg

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hvordan kommer enveloped vira ind i og ud af dyreceller?

A

Ind: deres envelope fusionerer med durecellens CM.

Ud: de pakkes ind i en ny envelope lavet af dyrecellens CM når den forlader værtscellen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hvor foregår viras metabolske processer?

A

De har ikke metabolske processer og er derfor obligat intracellilære parasitter der bl.a . snylter på værtcellens metabolitter og intermediære (mm.??)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hvilke enzymer kan findes i vironer af RNA vira og hvorfor er de der?

A

RNA afhængige RNA polymeraser kaldet RNA replikaser.

De replikere virussens RNA genom og danner virus specifik mRNA.

De er nødvendige fordi DNA polymeraser ikke kan lave RNA og celler mangler enzymer der kan danne RNA ud fra RNA templates.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvis virionen rummer enzymer hvad bruges de så til?

A

Inficering af værtscelle (eks lysozymer)

Nødvendige enzymer for replikeringen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Nævn de 5 trin i virussens replikarionscyklus.

A

1) attachment

2) penetration

3) syntese

4) assembly

5) lelease

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hvad er forskellen i de initiere trin når en virus angriber en eukaryot og en prokaryoter?

A

I prokaryoter er det kun nukleinsyren/genomet der sendes ind i værtscellen.

I eukaryoter er det hele virionet det optages.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvad er brudt size?

A

Antallet af virioner frigivet pr. Celle. Varierer fra virus til virus.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hvilke fader består den latente periode af?

A

Eclipse fasen
+
Modningsfasen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvad sker der i modningsfasen?

A

Nukleinsyrene pakkes ind i kapsiderne. I denne fase stiger antallet af modne virioner kraftigt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hvsd sker der i eclipse fasen?

A

Virus nukleinsyrene replikeres og proteiner dannes gennem translation.

Der ses ikke nogen modning af virioner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hvad hedder en virus der angriber en bakterie?

A

Bakteriofag

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hvad skal være ril stede op værtscellens overflade før en virus kan attache?

A

En receptor - en specifik komponent op værtscellens overfladen som skal virussen interagere med.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvordan kan en celle blive resistent overfor en bestemt virus?

A

Den kan lave en mutation af den komponent som virussen bruger som receptor. Nu kan virussen nemlig ikke længere genkende komponenten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvad består en receptor af?

A

Det kan være alt muligt. Eksempelvis:
Proteiner
Carbonhydratter
Glycoproteiner
Lipider
Lipoproteiner
Andre cellestrukturer lavet ud fra disse makromolekyler.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hvad er receptoren for T4 virussen?

A

Carbonhydratter i lipopolysaccharider (LPS) på den ydre membran i gram-negative bakterier.

T4 er en fag der binder til LPS i E. coli.

23
Q

Hvordan foregår penetrationen af bakteriofagen T4?

A

I enden af halen sidder der nogle halefibre og “tail pins”.

Først hæfter den sig på E. coli med sine halefibre ved at bruge lipidpolysaccharider (LPS) som recepter.

Halefibrene trækkes tilbage så selve halen får kontakt til cellens cellevæg med sine “tail pinns”.

T4s lysozymer danner en lille pore i peptidoglycanen.

Halen trækker dig sammen og DNA fra bakteriofagen sprøjtes ind i cellen gennem halerøret (som en indsprøjtning??)

Capsiden efterlades uden på cellen.

24
Q

Hvordan kan prokaryoter beskytte sig mod fager?

A

1) toxin-antitoxin modules

2) CRISPR

3) restriktions endonucleaser

25
Q

Hvordan forsøger e coli at beskytte sig mod bakteriofager?

A

De bruger restriktions enzymer (restriktions endonukleaser) der targeter bestemte steder i dsDNA.

Deres eget DNA beskyttes ved at modificerer de steder på DNAet hvor resteiktionsenzymerne klipper - ofte ved methylering af nucleotiderne.

26
Q

Hvilke ryper af fremmedartet arvemateriale virker restriktions endonukleaserne mod?

A

dsDNA

Ikke ssDNA, dsRNA og ssRNA

27
Q

Hvordan beskytter T4 vira sig mod e colis selvforsvar?

A

De beskytter sig mod restriktions enzymerne ved også at modificere deres eget dsDNA.

De methylerer det dog ikke. I stedet substitueres en bestemt base der derefter glycosileres (påsætning af et glucose molekyle).

28
Q

Hvor kommer viras replikations maskineri/replisom komplekser?

A

Små DNA vira bruger cellen egen DNA polymerase.

Mere komplekse vira - eks bakteriofagen T4 - koder selv for sit eget 8-proteins DNA replisom kompleks til at faciliteter den fag-specifikke DNA syntese.

29
Q

Hvad hedder fænomenet hvor samme gener optræder hos vira i en population men de er arrangeret forskelligt?

A

Cirkulær omdannelse (cirkular permutation)

30
Q

Hvad hedder den lange sekvens af virus DNA bestående af en sammensætning af flere “headfull” DNA sekvenser?

A

En concatemer

31
Q

Forklar processen cirkulær omdannelse (circular permutation) i T4 virussen.

A

1) virus genomet replikeres først flere gange.

2) replikaterne rekombineres (forstår ikke hvordan) resulterende i at de sættes sammen i forlængelse af hinanden og danner en concatemer.

3) concatemeren klippes i mindre sektioner af T4 endonucleaser. Endonukleaserne cutter ikke bestemte steder i concatemeren men efter bestemte længder.
Derved dannes der sekvenser svarende til hvad en kapsid kan rumme - aka en headfull T4 DNA sekvens.

4) så sker der en headfull pakning hvor sekvenserne pakkes ind i hovederne/kapsiderne.

NB: fordi det kan være lidt mere end én kopi af hvert gen i en headfull DNA sekvens for T4 vira, ændre cuttingstedet sig for endonukleaserne og det dannes derved DNA sekvenser med forskellige terminaler.

32
Q

Hvor lang tid går det efter infektionen af en T4 virus før cellens egen DNA og RNA syntese stopper?

A

Inden for et minut efter virussen kommer ind i cellen.

33
Q

Hvilke tre protein sæt koder T4 virussens genomet for og hvilke proteiner kommer ud sf hvilke sæt?

A

Tidlige proteiner
- enzymer til at syntetiserer den usædvanlige base det bruges i base-substitutionen. Enzymerne bruges også til selve glycosyleringen af den usædvanlige base.
- enzymer til T4 replisomet
- proteiner der modificere værtens RNA polymerase.

Midt proteiner

Sene proteiner

Midt og sene proteiner indkluderer:
- proteiner der yderligere modificerer værts RNA polymerasen
- strukturelle virion proteiner der bl.a. bruges i virus hovedet og halen
- frigivelsesproteiner

34
Q

Hvor kommer RNA polymerasen som virussen skal bruge fra?

A

Værts cellens RNA polymeraser highjackes.

35
Q

Hvordan overtales værtscellens RNA polymeraser til udelukkende at transkribere for T4 virussen?

A

T4 specifikke proteiner modificerer RNA polymerasen så den kun genkender fagens promotere.

Disse proteiner transkriberet af værtens egen RNA polymerase og kort efter at de er danner lukkes der ned for værtcellens egen transskription med en fag-kodet antisigma faktor.

Den binde til RNA polymerasen sigma faktor så værtens egne promotere ikke længere kan genkendes.

Senere i processen modificeres RNA polymerasen igen så der nu er midt protein kodende sekvenser der genkendes og til sidst modificeres den så den kun genkender sene protein kodende sekvenser.

36
Q

Hvad hedder precursors til virionens hovede?

A

Proheads

37
Q

Hvordan kommer der en headfull dsDNA ind i T4 virussens hoved?

A

En pakke motor kobles på peohovedet. Pakningen sker under forbrug af ATP.
Bagefter afkobles pakke motoren igen oh kapsiden forsejles.

38
Q

Hvornår i processen påsættes hale og halefibre og andre komponenter?

A

Efter DNAet er pakket, motoren er væk og kapsiden forsejlet.

39
Q

Hvor lang tid tager T4 virussens replikationscyklus?

A

Ca. 25 min

40
Q

Hvad heder de to veje vira kan tage for at få deres dna replikeret?

A

Lytisk pathway

Lysogenisk pathway

41
Q

Hvad hedder vira der bruger lysogenisk pathway til replikation?

A

Temporate viruses (midlertidige vira???)

42
Q

Nævn to temporate phager?

A

Lambda

P1

43
Q

Hvor placeres virussens DNA i cellen af den midlertidige phage?

A

Enten indeni cellen eget DNA eller i cytoplasma som et pladmid

44
Q

Hvad hedder viralt dna i en celle?

A

En prophage

45
Q

Hvilken type gentransfer er lambdas lyriske pathway en form for?

A

Tranduktion - en vigtig form for horisontal genoverførsel.

I lambdas lyriske pathway tages der nogle kromosomer gener med fra værtscellen der derved overføres til de næste celler som virussen inficerer.

46
Q

Hvad er Rolling circle replication?

A

En streng i det dobbeltstrengede genom (dna - ved ikke om det også kan være RNA.) klippes over. Den inderstes stadigt sammenhængende cirkel fungere nu som template så der kan bygges på den frie 3’OH-ende. Den yderste nu åbne cirkel bygges længere og længere og dens komplimentere streng syntetiseres som en typisk lagging strand.

Herefter klippes koncentameren i headfull størrelse stykker og bliver pakket i kapsider så nye virioner kan frigives ved lysering.

47
Q

Hvad afgør om den lytiske eller lysogeniske pathway forekommer i en celle inficeret med lambda (bakteriofag)?

A

Mængden af repressor proteinerne lambda repressor/cI-protein og Cro.

Proteinet der hurtigst akkumulerer afgør pathwayen.

Lambda repressor/cI protein = bakteriofagens genom inkorporere i cellens dna og bliver en profag. Udtrykkelse af alle andre lambda kodede proteiner, Cro inklisiv.

Cro akkumulering = lytisk pathway

48
Q

Hvad er de to hovedforskelle mellem bakteriofager og vira der angriber dyreceller?

A

1) hele virionen kommer ind i dyrecellen - ikke bare arvematerialet.

2) dyreceller har cellekerne hvori mange af dens vira replikeres

49
Q

Hvordan kommer en dyrecelle virus ind i cellen?

A

Den binder til specifikke receptore på værtscellen og kommer ind ved endocytose.

50
Q

Hvordan får de enveloped dyrevira deres kappe?

A

Fra værtscellen:
Enten ved at de frigives gennem knopskydning,
Ellers ved lyseringen hvor nogen af cellen CM samles op

51
Q

Ses retrovira bland surecellens vira eller bakteriofager?

A

Dyrecellens vira

52
Q

Hvordan replikeres arvematerialet i retrovira?

A

Virussen kommer ind i cellen og kappen fjernes.

Reverse transkriptase danner dsDNA ud fra de to identiske +sRNA strenge. Det sker i kapsiden.

dsDNA og integrase protein transporteres tranporteres fra kapsiden til nucleus.

dsDNA integreres i værtsgenomet og bliver til en provirus.

Herfra kan virussens arvemateriale transkriberet af cellen egen RNA polymerase og to nye kopier kan puttes i nye virioner der så kan frigives.

53
Q

Hvad betydning har det for tranlationspeocessen hvis en virus er bære af en +RNA streng vs. en -RNA streng?

A

En +RNA streng kam bruges direkte som mRNA.

En -RNA streng skal først bruges som aftryk for at lave en +RNA streng som så kan bruges som mRNA. En RNA replikase bruges til dette.

Jeg ved ikke om der også skal bruges en RNA replikase et sted i processen +RNA strenget genom. Jeg kan ikke se hvordan den kan undværes når der skal laves RNA replikationer…

Mikrobiologi For Biologer (9 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions