2) Metabolisme 1: Fermentation Flashcards
Hvilke fore grundstoffer udgør hoveddelen af cellers tørvægt?
C - 50%
O + H - 25%
N - 13%
Hvilke 3 former optræder nitrogen hovedsageligt på i naturen?
Ammonia NH3
Nitrat NO3-
Nitrogen gas N2
Hvad hedder de metaller såsom jern og andre metaller der metaboliseres af microorganiamer?
Trace metals
Hvad kaldes de organiske micronæringsstoffer som microoeganismer optager?
Growth factors.
Hvilke 3 transportmekanismer findes det inden for aktiv transport i prokaryoter?
Simpel transport - består af et transmembranprotein
Group translokation - igangsætter en række proteiner i transportsammenhængen
ABC-transportsystemet - 3 komponenter; et substratbondende protein, et transmembranprotein og et ATP-hydrolyserende protein.
Hvilken energi driver simpel transport?
Proton gradienten
Proton motive Force
Hvad hedder transportproteiner der transportere substrat i samme eller modsat retning som en proton der løber med sin gradient?
Samme retning: symporter
Modsat retning: antiporter
Hvilken energirype driver transporten?
Energirige compounds
Hvilke to vigtigt punkter adskiller group translokation fra simpel transport?
1) det transporterede substrat er kemisk modificeret under transportprocessen
2) energien kommer ikke fra protongradienten men fra fra energirige compounds
Beskriv den basale opbygning af ABC-transportsystemet.
Uden for CM er der substrat binding proteiner der er karakteristiske ved at have en meget høj substrat affinitet.
Derudover er der et transmembranprotein samt et ATP-hydrolyserende protein.
Hvor er de substratbindende proteiner placeret fra ABC transportsystemet i hhv. gram-negative og -positive bakterier?
Og findes dette system i archaea?
Gram-negativt: i det periplasmatiske rum findes de periplasmatiske binding proteins.
Gram-positiv: de substratbindende proteiner sidder fasthæftet på ydersiden af CM.
Nævn de 5 “-tropher”.
Chemoorganotropher: katabolisme (energiuddrivelse) fra organisk kemiske stoffer.
Chemolithoteopher: tapper energi ved oxidering af uorganiske stoffer. (H2, H2S, NH4+, Fe2+.
Phototropher: indeholder klorofyl og andre pigmenter der kan omdanne solenergi til ATP og behøver dermed ikke optage kemiske stoffer for at få energi.
Heterotropher: deres C-optag kommer fra en eller anden organiske kilde.
Autotropher: har CO2 som sin Carbon-kilde.
Hvad er aktiveringsenergi?
Kan ses som det minimum af energi der skal til at for at begynde en bestemt kemisk proces.
Hvad dr enzymers funktion?
De sænker aktiveringsenergien.
Hvor på enzymet binder substratet?
I active sitet.
Bliver elektrondoneren eller elektronaccepteren oxideret eller reduceret?
Elektronaccepteren bliver reduceret
Elektrondoneren bliver oxideret
Hvad er et reduktionspotentiale?
En substans’ villighed til at acceptere eller donere elektroner.
Det er en enhed målt i volt der sammenlignes med en anden substans’ reduktionspotentiale.
Hvor energirig skal fosfathydrolysen være før cellen bil bruge den som en energi cirrency?
Delta G0’ < -30 KJ/mol
Hvorfor er coenzym A vigtig?
Derivater af coenzym A indeholder energirige bibdinger - thioester bindinger. Coenzym A er ikke en fosforyleret enhed men energien fra de energirige thioesterbindinger kan overføres til ATP:
Acetyl-S-CoA + H2O + ADP + Pi —> acetate- + HS-CoA + ATP + H+
Coenzym A derivater er særligt vigtige for anaerobe microorganismer.
Hvordan kan celler forberede sig på starvation i perioder med næring nok?
Der dannes storage polymere såsom:
glycogen
Poly-beta-hydroxybutyrat
Andre polyhydroxyalkanoater
Elemental sulfur (fra oxidation af H2S hos sulfur chemolithotropher)
Det gemmes i cellen som granulater.
Nævn en anaerob catabolsk pathway
Fermentering
Nævn en katabolsk pathway der kan være anaerob eller aerob.
Respiration.
Hvad er forskellen på pyruvats rolle når glukose hhv respireres og fermenteres?
Respiration: pyruvat oxideres til CO2 i CAC
Fermentering: pyruvat oxideres ikke fuldstændigt til CO2 men bliver brugt som elektronacceptor for st opretholde redox-balance i glycolysen.
Hvilke stadier kan glycolysen inddeles i og hvor optræder der redox-reaktioner?
Glycolysen kan inddeles i 3 stadier:
I: forberedende. Ingen redox. Indtil glucosemolekyler er blevet splittet til to næsten ens molekyler - glyceraldehys-3-P (GAP) og dihydroxyacetone-P.
II: redox-reaktioner optræder (enzymet GAP dehydrogenase danner produktet NADH. Desuden laver enzymerne lactat dehydrogenase, pyruvat decarboxylase og alkohol dehydrogenase), energi konserveres og der dannes 2 pyruvat molekyler.
III: redoxbalancen genoprettes og fermenteringsprodukter dannes (lactate eller ethanol + CO2)
Hvor mange ATP dannes totalt i glycolysen?
2 stk
Hvor mange NADH-molekyler dannes der i glycolysen og hvor meget ATP omdannes de ril ved kompleks I i respirationen?
Der dannes 2 NADH og de kan omdannes til 6 ATP molekyler.
Hvor meget ATP, FADH2, NADH og CO2 dannes der i CAC og hvad svare disse energienheder til til sammen i ATP?
ATP: 2 ATP eller GTP
NADH: 8 (= 24 ATP)
FADH2: 2 (= 4 ATP)
Total: 30 ATP
CO2: måske 6???
Hvor meget ATP resulterer glycolyse + CAC i? Aka hvor meget ATP bliver ét glucose molekyle til ved respiration?
Glycolyse: 8 ATP
CAC: 30 ATP
Total: 38 ATP
